Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 256 total aligned reads displayed.
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA > NC_000913/3848294‑3848480
|
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AGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCT > SRR4302540.9297926/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCT > SRR4302540.9298163/1‑94 (MQ=60)
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GCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTA > SRR4302540.6580412/1‑94 (MQ=60)
GCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTA > SRR4302540.6580411/1‑94 (MQ=60)
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GCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTA > SRR4302540.5715495/1‑94 (MQ=60)
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CAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAA < SRR4302540.3415064/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAACACGCGCCTACCTTAA > SRR4302540.1563556/1‑94 (MQ=60)
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AAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACG < SRR4302540.7618193/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACG > SRR4302540.5196168/1‑94 (MQ=60)
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CGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAA < SRR4302540.10004825/94‑1 (MQ=60)
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GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG < SRR4302540.7560989/94‑1 (MQ=60)
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GGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGA > SRR4302540.4088875/1‑94 (MQ=60)
GGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGA > SRR4302540.987700/1‑94 (MQ=60)
GGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGAGATCATGGCCTTGTCCTGGCGGGAAAAAAAAATATGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGA > SRR4302540.973293/1‑94 (MQ=60)
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GATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTT > SRR4302540.2212168/1‑94 (MQ=60)
GATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTT > SRR4302540.7037617/1‑94 (MQ=60)
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TCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGA < SRR4302540.9839349/94‑1 (MQ=60)
TCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGA > SRR4302540.2218279/1‑94 (MQ=60)
CTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTCCCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAG > SRR4302540.9018075/1‑94 (MQ=60)
CTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAG < SRR4302540.4216805/94‑1 (MQ=60)
CTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGGAGAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGACTTGAG > SRR4302540.3781900/1‑94 (MQ=60)
TATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGC < SRR4302540.4933892/94‑1 (MQ=60)
TATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGC > SRR4302540.8652667/1‑94 (MQ=60)
TATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGC > SRR4302540.2167772/1‑94 (MQ=60)
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ATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTGCCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCG < SRR4302540.8447233/94‑1 (MQ=60)
ATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCG > SRR4302540.2918554/1‑94 (MQ=60)
ATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCG < SRR4302540.1993359/94‑1 (MQ=60)
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ATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCG > SRR4302540.5207890/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTTTTCAAGCCTTGGGCGG > SRR4302540.2041849/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGG > SRR4302540.1239842/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGGTGTTCAAGCCTTGAGCGGT > SRR4302540.1916269/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGT > SRR4302540.3992018/1‑94 (MQ=60)
AAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGT < SRR4302540.44302/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGT > SRR4302540.710833/1‑94 (MQ=60)
AGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTT > SRR4302540.8380285/1‑94 (MQ=60)
AGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTT > SRR4302540.4397959/1‑94 (MQ=60)
AGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTT < SRR4302540.6995962/94‑1 (MQ=60)
GGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGTGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTA < SRR4302540.3860882/94‑1 (MQ=60)
GGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTA < SRR4302540.934690/94‑1 (MQ=60)
GGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTA > SRR4302540.8751794/1‑94 (MQ=60)
gcaatggttatcaaggtgttggccttggaGGTAAAAAAAATACGCGCCTACGTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGCGCGGTTACT < SRR4302540.9825166/65‑1 (MQ=60)
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CAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTG > SRR4302540.8254457/1‑94 (MQ=60)
AACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGA > SRR4302540.2623930/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAANATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTNNTNNNNGNCTTGAGCNNTNNNTNNA > SRR4302540.1394590/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAA < SRR4302540.8022040/94‑1 (MQ=60)
GGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAA > SRR4302540.6381924/1‑94 (MQ=60)
GGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAA < SRR4302540.7940514/94‑1 (MQ=60)
GTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAA < SRR4302540.5680825/94‑1 (MQ=60)
GTGATCATGGTCGTGTCCTGGCGGGTAAAAATAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTCGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAA < SRR4302540.5680826/94‑1 (MQ=60)
TGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAA < SRR4302540.10084336/94‑1 (MQ=60)
TGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAA > SRR4302540.9414655/1‑94 (MQ=60)
TGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGAGCTTACCTTAAAGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAA > SRR4302540.9301705/1‑94 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302540.2456942/94‑1 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302540.8289188/94‑1 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC > SRR4302540.3865339/1‑94 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302540.4175973/94‑1 (MQ=60)
ATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACA > SRR4302540.3239485/1‑94 (MQ=60)
ATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACA > SRR4302540.3145868/1‑94 (MQ=60)
ATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACA > SRR4302540.5851292/1‑94 (MQ=60)
TCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACAC < SRR4302540.5096562/94‑1 (MQ=60)
TCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACAC > SRR4302540.798973/1‑94 (MQ=60)
CATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACC > SRR4302540.75522/1‑94 (MQ=60)
CATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACC > SRR4302540.6325880/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCG < SRR4302540.1165959/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGGTACTGAAAAAACACCG > SRR4302540.2825854/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGC > SRR4302540.9387492/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATAAGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTGCAAGCCTTGAGCGGTTGCTGAAAAAACACCGG > SRR4302540.5963985/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG > SRR4302540.2232017/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACTTTCACGCTACGCGCGATGTTGGTCAGGCCTTACGCGTTTACTGAAACAACACCGCG > SRR4302540.1457584/1‑94 (MQ=32)
GGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG > SRR4302540.1457585/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG > SRR4302540.3016471/1‑94 (MQ=60)
TCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAT > SRR4302540.2826893/1‑94 (MQ=60)
TCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAT > SRR4302540.2187820/1‑94 (MQ=60)
CTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATC > SRR4302540.9860708/1‑94 (MQ=60)
TTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCT > SRR4302540.283415/1‑94 (MQ=60)
TTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCT > SRR4302540.4067974/1‑94 (MQ=60)
TGTCGTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTT < SRR4302540.944004/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTT < SRR4302540.3380898/94‑1 (MQ=60)
TGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTT < SRR4302540.8771569/94‑1 (MQ=60)
GTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTG > SRR4302540.10141236/1‑94 (MQ=60)
GTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTG < SRR4302540.1268136/94‑1 (MQ=60)
TCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGT > SRR4302540.7231208/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTT > SRR4302540.267887/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTT > SRR4302540.6257422/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTT > SRR4302540.363248/1‑94 (MQ=60)
CCTGGCGGGGAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTGGAGCGGTTACTGCAAAAAAACCGCGctctgcgt > SRR4302540.267886/1‑86 (MQ=60)
CTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGTGGTTACTGAAAAAACAACGCGATCTTGTTA > SRR4302540.9724328/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAATGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTA > SRR4302540.4347472/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTATTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAA > SRR4302540.6896036/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAA > SRR4302540.5237795/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAA < SRR4302540.4541314/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAAC < SRR4302540.4376551/94‑1 (MQ=60)
GGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTGAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA < SRR4302540.3941447/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA < SRR4302540.1295573/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA < SRR4302540.8273907/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA > SRR4302540.3239663/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302540.3428973/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302540.6155507/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT > SRR4302540.167186/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT > SRR4302540.9483974/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT > SRR4302540.3917868/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302540.9854021/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302540.8040227/94‑1 (MQ=60)
AGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCTATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302540.8006005/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC < SRR4302540.7867252/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC < SRR4302540.9317557/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGGTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC < SRR4302540.7867253/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC > SRR4302540.8581546/1‑94 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC < SRR4302540.619658/94‑1 (MQ=60)
GGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGGTACTGACAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC > SRR4302540.9159018/1‑94 (MQ=60)
GTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG < SRR4302540.2196904/94‑1 (MQ=60)
GTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG > SRR4302540.8211434/1‑94 (MQ=60)
GTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG < SRR4302540.7374023/94‑1 (MQ=60)
GTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG < SRR4302540.6939560/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGT < SRR4302540.7355656/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGT > SRR4302540.5766440/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTC < SRR4302540.9947701/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCG > SRR4302540.2459941/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGG < SRR4302540.5528531/94‑1 (MQ=60)
AAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGG < SRR4302540.9680702/94‑1 (MQ=60)
AAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGA < SRR4302540.6603651/94‑1 (MQ=60)
AAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGAT > SRR4302540.7574050/1‑94 (MQ=60)
AAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATC > SRR4302540.9974368/1‑94 (MQ=60)
ATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGG > SRR4302540.9931486/1‑94 (MQ=60)
ATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGG > SRR4302540.181089/1‑94 (MQ=60)
TACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGA < SRR4302540.7349118/94‑1 (MQ=60)
ACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC > SRR4302540.10137256/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC > SRR4302540.3433495/1‑94 (MQ=60)
CGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACT < SRR4302540.9767990/94‑1 (MQ=60)
CGCGCCTAACTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACT < SRR4302540.8481308/94‑1 (MQ=60)
CGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGA > SRR4302540.3635879/1‑94 (MQ=60)
GCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302540.4809479/1‑94 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302540.4677766/1‑94 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302540.426376/1‑94 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302540.7550119/1‑94 (MQ=60)
CCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATT < SRR4302540.10052933/94‑1 (MQ=60)
|
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA > NC_000913/3848294‑3848480
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
