Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,848,387 |
T→C |
intergenic (‑34/+42) |
uhpA ← / ← ilvN |
UhpA/acetolactate synthase I small subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,848,387 | 0 | T | C | 100.0%
| 853.7
/ NA
| 263 | intergenic (‑34/+42) | uhpA/ilvN | UhpA/acetolactate synthase I small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (126/137); total (126/137) |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTG > NC_000913/3848297‑3848476
|
cTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTa > 1:4566929/1‑93 (MQ=255)
gcgcAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTAcc < 2:588658/93‑1 (MQ=255)
cAAGGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCAATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGCCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTa < 2:3519816/93‑1 (MQ=255)
cAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTa > 1:991929/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTaa < 1:3948275/93‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTaa > 2:4938756/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAAc > 2:1969641/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAAc < 1:1765964/93‑1 (MQ=255)
gCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGa > 2:3591944/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATa > 1:110621/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATa < 1:869591/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATa > 1:2578190/1‑93 (MQ=255)
ggAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATaa < 2:630649/93‑1 (MQ=255)
ggAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATaa > 2:4446083/1‑93 (MQ=255)
gAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAg > 1:3101106/1‑93 (MQ=255)
cGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAgcgc < 1:5431276/93‑1 (MQ=255)
cGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAgcgc > 1:5141353/1‑93 (MQ=255)
ggACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGcgcg < 1:2108820/93‑1 (MQ=255)
gACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGa > 1:5230975/1‑93 (MQ=255)
gACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGa < 2:4075226/93‑1 (MQ=255)
aCGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAt < 2:2159465/93‑1 (MQ=255)
aCGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAt < 1:4399310/93‑1 (MQ=255)
gATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAtgt > 1:759727/1‑93 (MQ=255)
gATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAtgt < 2:1220952/93‑1 (MQ=255)
aTGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAtgtt > 2:3247408/1‑93 (MQ=255)
tGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAtgttg > 2:3928780/1‑93 (MQ=255)
tGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGAtgttg < 1:3771089/93‑1 (MQ=255)
aGGGGATCGGCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATgttgtt < 2:5109654/93‑1 (MQ=255)
ggTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATCCGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTc < 1:1961919/93‑1 (MQ=255)
ggTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATgttgtta > 2:2311878/1‑92 (MQ=255)
ggTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTc > 1:5372475/1‑93 (MQ=255)
ggTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTc < 1:6010584/93‑1 (MQ=255)
tGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCaa < 2:5987510/93‑1 (MQ=255)
tGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCaa < 1:2855319/93‑1 (MQ=255)
tCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGcc < 1:843057/93‑1 (MQ=255)
tCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGcc > 2:5052097/1‑93 (MQ=255)
cGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCt < 2:3427149/93‑1 (MQ=255)
cGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGGTCAAGCCt < 2:6124929/93‑1 (MQ=255)
gTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCtt > 1:2447017/1‑93 (MQ=255)
gTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCtt > 1:5880088/1‑93 (MQ=255)
tCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTg > 1:422923/1‑93 (MQ=255)
tCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTg > 2:1548521/1‑93 (MQ=255)
cTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGa < 1:1830646/93‑1 (MQ=255)
tataAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAg > 1:4466279/1‑93 (MQ=255)
ataAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATCCGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGc < 2:4373736/93‑1 (MQ=255)
taAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCg < 2:109233/93‑1 (MQ=255)
aaGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCgg < 2:1337286/93‑1 (MQ=255)
aGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGt > 2:2544048/1‑93 (MQ=255)
aGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGt > 2:5650668/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTa < 1:1540563/93‑1 (MQ=255)
gCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTAc < 2:4572600/93‑1 (MQ=255)
cAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACt < 2:4264475/93‑1 (MQ=255)
cAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACt < 1:3017970/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTg < 1:6225062/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGa > 1:428389/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGGAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGa > 1:5934530/1‑93 (MQ=255)
gTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaa > 1:1016937/1‑93 (MQ=255)
gATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaaaa < 1:3071684/93‑1 (MQ=255)
gATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaaaa < 1:4744518/93‑1 (MQ=255)
gATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaaaa < 1:415362/93‑1 (MQ=255)
gATCATGGTCTTGACCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGaaaaaa > 2:6192251/1‑93 (MQ=255)
aTCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAac < 1:3262049/93‑1 (MQ=255)
cATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAacac < 2:4187576/93‑1 (MQ=255)
cATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAacac > 2:3809066/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcg > 2:2964431/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGGTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcg > 1:2728548/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAAAACGCGCCTACCTTAAAGATTAACGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACAccc > 2:5332257/1‑92 (MQ=255)
tGGTCTTGCCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcg < 1:5008458/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATAGGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcgc < 1:3679979/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcgc < 1:2648447/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcgcg > 2:5799914/1‑93 (MQ=255)
gTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACcgcg > 2:1433163/1‑93 (MQ=255)
gTCTTGTCCTGGCGGGCAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGGCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACAAcgcg > 2:2688881/1‑93 (MQ=255)
tCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGa < 2:5237355/93‑1 (MQ=255)
cTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAt < 1:626100/93‑1 (MQ=255)
cTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAt < 2:3871717/93‑1 (MQ=255)
ttGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATc > 2:552930/1‑93 (MQ=255)
ttGTCCTGGCGGGCAAAAAAACTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGCTACTGAACAACGACcgccgtc > 2:1589331/1‑89 (MQ=255)
tGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCt > 2:3560387/1‑93 (MQ=255)
gTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCtt < 2:3733065/93‑1 (MQ=255)
gTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCtt < 1:5769050/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGtt > 2:1300029/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTa > 2:5411517/1‑93 (MQ=255)
ggCGGGTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTaa < 1:3475325/93‑1 (MQ=255)
gCGGGTAAAGAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTaaa < 1:4002984/93‑1 (MQ=255)
gggTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACa < 2:4499566/93‑1 (MQ=255)
gggTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACa > 1:4022701/1‑93 (MQ=255)
ggTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAt < 2:463307/93‑1 (MQ=255)
ggTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAt > 2:2256369/1‑93 (MQ=255)
gTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAtc > 1:483908/1‑93 (MQ=255)
gTAAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAtc < 1:549318/93‑1 (MQ=255)
aaaaaaaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAtcgt > 2:2898978/1‑93 (MQ=255)
aaaaaaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAtcgtc < 2:688978/93‑1 (MQ=255)
aaaaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcgg > 1:1799486/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcgga < 1:4655224/93‑1 (MQ=255)
aaaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcgga < 2:2578190/93‑1 (MQ=255)
aaaTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcggat < 2:1714794/93‑1 (MQ=255)
aTACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGtcggatcg < 1:1576178/93‑1 (MQ=255)
cgcgCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAc > 1:1334302/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACt < 2:870503/93‑1 (MQ=255)
|
CTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGTAAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTG > NC_000913/3848297‑3848476
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA > NC_000913/3848294‑3848480
|
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCC > SRR4302533.6253170/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCC > SRR4302533.3268096/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCC > SRR4302533.2856709/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCC > SRR4302533.2773820/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCC > SRR4302533.1955311/1‑94 (MQ=60)
AGCTGGGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGGGATCATGGGCTTGGCCTGGGGGGTAAAAAAAAATACGCGCC < SRR4302533.4056499/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCT < SRR4302533.5704534/94‑1 (MQ=60)
TGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACC > SRR4302533.4925332/1‑94 (MQ=60)
GCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCT < SRR4302533.6240616/94‑1 (MQ=60)
CGCAAAGCGGGAGCGGACGATGAGGTAATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGCCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTT < SRR4302533.4373975/94‑1 (MQ=60)
GCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTA > SRR4302533.997727/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAA < SRR4302533.6343148/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAAC < SRR4302533.3972351/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAAC < SRR4302533.6054750/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACG < SRR4302533.2288842/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACG < SRR4302533.4687653/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACG < SRR4302533.1776717/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGA > SRR4302533.5072675/1‑94 (MQ=60)
CCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATA > SRR4302533.111322/1‑94 (MQ=60)
CCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATA > SRR4302533.2594056/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAA > SRR4302533.4495727/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAA < SRR4302533.874696/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG > SRR4302533.3120169/1‑94 (MQ=60)
GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG < SRR4302533.3893766/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG < SRR4302533.2358348/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG < SRR4302533.2200843/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGG‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAG > SRR4302533.2603033/1‑94 (MQ=60)
GCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGC > SRR4302533.5172424/1‑94 (MQ=60)
CGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCG > SRR4302533.5229622/1‑94 (MQ=60)
CGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCG < SRR4302533.6265991/94‑1 (MQ=60)
CGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCG < SRR4302533.5463984/94‑1 (MQ=60)
GGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGA < SRR4302533.2121828/94‑1 (MQ=60)
GGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGA > SRR4302533.5262440/1‑94 (MQ=60)
ACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATG < SRR4302533.4425871/94‑1 (MQ=60)
ACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATG > SRR4302533.3977970/1‑94 (MQ=60)
CGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGT > SRR4302533.764199/1‑94 (MQ=60)
GATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTT > SRR4302533.3457273/1‑94 (MQ=60)
TGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGT < SRR4302533.2521039/94‑1 (MQ=60)
TGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGT < SRR4302533.3794207/94‑1 (MQ=60)
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AGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTC > SRR4302533.417929/1‑94 (MQ=60)
AGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTC > SRR4302533.5404754/1‑94 (MQ=60)
AGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTC > SRR4302533.5410224/1‑94 (MQ=60)
AGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTC > SRR4302533.1459018/1‑94 (MQ=60)
GGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATCCGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCA < SRR4302533.1973895/94‑1 (MQ=60)
GGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCA > SRR4302533.2759451/1‑94 (MQ=60)
GGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCA < SRR4302533.6046999/94‑1 (MQ=60)
GGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCA < SRR4302533.5266786/94‑1 (MQ=60)
GTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAA < SRR4302533.4283739/94‑1 (MQ=60)
TGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAG < SRR4302533.2872889/94‑1 (MQ=60)
TGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAG < SRR4302533.1786548/94‑1 (MQ=60)
TCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCT < SRR4302533.847988/94‑1 (MQ=60)
CGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTT > SRR4302533.5915624/1‑94 (MQ=60)
CGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTT > SRR4302533.2462117/1‑94 (MQ=60)
CGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTT < SRR4302533.3090538/94‑1 (MQ=60)
CGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTT > SRR4302533.1553352/1‑94 (MQ=60)
GTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTG > SRR4302533.425454/1‑94 (MQ=60)
GTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTG > SRR4302533.5610534/1‑94 (MQ=60)
TCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGA < SRR4302533.1777713/94‑1 (MQ=60)
CTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAG < SRR4302533.1841820/94‑1 (MQ=60)
CTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAG > SRR4302533.4493291/1‑94 (MQ=60)
TATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGC > SRR4302533.547653/1‑94 (MQ=60)
TATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGC > SRR4302533.1723545/1‑94 (MQ=60)
ATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCG > SRR4302533.626717/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGG < SRR4302533.4173026/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGG < SRR4302533.1863130/94‑1 (MQ=60)
AAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACAATAGCCGCAATGTTGTTAAACCCTTGACCGGT > SRR4302533.957568/1‑94 (MQ=60)
GGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTA > SRR4302533.3091124/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTAC < SRR4302533.1549842/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACT < SRR4302533.1267029/94‑1 (MQ=60)
CAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTG < SRR4302533.3036429/94‑1 (MQ=60)
CAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTG > SRR4302533.1841262/1‑94 (MQ=60)
AACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGA < SRR4302533.6262361/94‑1 (MQ=60)
AACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGA > SRR4302533.430943/1‑94 (MQ=60)
AACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGG‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGA > SRR4302533.5970406/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAA < SRR4302533.1379907/94‑1 (MQ=60)
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GGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAA > SRR4302533.1022915/1‑94 (MQ=60)
GGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAA > SRR4302533.860192/1‑94 (MQ=60)
GTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAA > SRR4302533.2966896/1‑94 (MQ=60)
GTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAA > SRR4302533.4041918/1‑94 (MQ=60)
TGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGGTACTGAAAAAA > SRR4302533.4470756/1‑94 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302533.417858/94‑1 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302533.4773283/94‑1 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302533.2080406/94‑1 (MQ=60)
GATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAAC < SRR4302533.3090543/94‑1 (MQ=60)
ATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACA < SRR4302533.3282173/94‑1 (MQ=60)
ATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACA > SRR4302533.257288/1‑94 (MQ=60)
CATGGTCTTGTCCTGGCGGGG‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACC > SRR4302533.4678538/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTCCCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTAAGCGGTTACTGAAAAAAacccc > SRR4302533.3344311/1‑89 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCG < SRR4302533.4928167/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCG > SRR4302533.824998/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCG > SRR4302533.2745285/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGGTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCG > SRR4302533.2745286/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGC > SRR4302533.4338907/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTTGCCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGC < SRR4302533.5038805/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATAGGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG < SRR4302533.3702595/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG < SRR4302533.2664718/94‑1 (MQ=60)
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GGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG < SRR4302533.4793707/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCG > SRR4302533.5311960/1‑94 (MQ=60)
GTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGGCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGA > SRR4302533.4205968/1‑94 (MQ=60)
TCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAcaaccgagat > SRR4302533.2671489/1‑84 (MQ=60)
TCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAT < SRR4302533.5419237/94‑1 (MQ=60)
TCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGAT < SRR4302533.1069635/94‑1 (MQ=60)
CTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATC < SRR4302533.629776/94‑1 (MQ=60)
GTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTG < SRR4302533.5803877/94‑1 (MQ=60)
GTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTG < SRR4302533.4000386/94‑1 (MQ=60)
CCTGTCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGTGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTT < SRR4302533.3098967/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTA > SRR4302533.6043261/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTA < SRR4302533.2971604/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAA < SRR4302533.3496768/94‑1 (MQ=60)
GCGGGT‑AAAGAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAAC < SRR4302533.4027359/94‑1 (MQ=60)
CGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA > SRR4302533.4520591/1‑94 (MQ=60)
CGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA > SRR4302533.1310496/1‑94 (MQ=60)
CGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA > SRR4302533.4047194/1‑94 (MQ=60)
CGGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA < SRR4302533.4831030/94‑1 (MQ=60)
CGGAT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACA < SRR4302533.5887039/94‑1 (MQ=60)
GGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302533.4230267/94‑1 (MQ=60)
GGGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACAT < SRR4302533.4685814/94‑1 (MQ=60)
GGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC < SRR4302533.340508/94‑1 (MQ=60)
GGT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATC > SRR4302533.486800/1‑94 (MQ=60)
GT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG < SRR4302533.552577/94‑1 (MQ=60)
GT‑AAAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCG < SRR4302533.3258192/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCG > SRR4302533.859467/1‑94 (MQ=60)
AAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCG < SRR4302533.5961993/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCG > SRR4302533.2823429/1‑94 (MQ=60)
caacAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGATGTTCAAGCCTTGAGAGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACCTCGTCGG < SRR4302533.6346599/90‑1 (MQ=60)
AAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGG > SRR4302533.2050833/1‑94 (MQ=60)
AAAAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGG > SRR4302533.1810434/1‑94 (MQ=60)
AAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGAT < SRR4302533.5671279/94‑1 (MQ=60)
AAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGAT < SRR4302533.4683435/94‑1 (MQ=60)
AAAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGAT < SRR4302533.3676731/94‑1 (MQ=60)
AAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATC < SRR4302533.3763264/94‑1 (MQ=60)
AAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATC > SRR4302533.970132/1‑94 (MQ=60)
AAATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATC < SRR4302533.395253/94‑1 (MQ=60)
AATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCG > SRR4302533.4437373/1‑94 (MQ=60)
ATACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGG < SRR4302533.1585666/94‑1 (MQ=60)
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ACGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGAC > SRR4302533.1342309/1‑94 (MQ=60)
CGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACT < SRR4302533.1671945/94‑1 (MQ=60)
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CGCGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACT < SRR4302533.5212651/94‑1 (MQ=60)
CGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGT > SRR4302533.483395/1‑94 (MQ=60)
CGCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGA < SRR4302533.5876908/94‑1 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302533.2665169/1‑94 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGAT > SRR4302533.5403594/1‑94 (MQ=60)
GCCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGGTCTAGCCTTTAGCGGTTACGGAAAAAACACAGCGATCATGTTAAACATCGTCGGGTCGGACTGAT > SRR4302533.2847918/1‑94 (MQ=60)
CCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATT > SRR4302533.2865965/1‑94 (MQ=60)
CCTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCGTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATT > SRR4302533.6094147/1‑94 (MQ=60)
CTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA > SRR4302533.1075693/1‑94 (MQ=60)
CTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA < SRR4302533.490661/94‑1 (MQ=60)
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CAGCTGCGCAAAGCCGGAGCGGACGATGAGGTGATCGTCTATAAGGGCAACGGTGATCATGGTCTTGTCCTGGCGGGT‑AAAAAAAATACGCGCTTACCTTAACGATAAGCGCGATGTTGTTCAAGCCTTGAGCGGTTACTGAAAAAACACCGCGATCTTGTTAAACATCGTCGGATCGGACTGATTA > NC_000913/3848294‑3848480
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
