Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,463,677 |
C→T |
G166G (GGC→GGT) |
hofD → |
leader peptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,463,677 | 0 | C | T | 99.5%
| 696.1
/ NA
| 195 | G166G (GGC→GGT) | hofD | leader peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (95/99); minor base A (1/0); total (96/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
ggTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGgtgc < 1:2647221/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCa < 1:1069597/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAt > 1:5355889/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAt > 1:3160212/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAt > 1:1879117/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGTGTGTTTGCTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATgg < 2:1296887/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATgg > 2:2301435/1‑93 (MQ=255)
gtggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtg < 1:4308892/93‑1 (MQ=255)
gtggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtg < 2:6299258/93‑1 (MQ=255)
tggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtgt > 1:5239369/1‑93 (MQ=255)
tggtgTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGgtgt < 1:6128542/93‑1 (MQ=255)
gtgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggct < 1:5527686/93‑1 (MQ=255)
tgtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctg > 1:4349517/1‑93 (MQ=255)
gtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctgg > 2:2772824/1‑93 (MQ=255)
gtTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTAATGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctgg > 1:800441/1‑93 (MQ=255)
gtTTACTGGGGCGTCTGGTAACTTTGTCACAAAGAGGTATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGtggctgg < 1:2208772/93‑1 (MQ=255)
ttACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCATAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCa > 1:1138325/1‑93 (MQ=255)
tACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCaa < 1:225770/93‑1 (MQ=255)
cTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAAc < 1:5033362/93‑1 (MQ=255)
gggCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGtt > 2:6230128/1‑93 (MQ=255)
gCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGc < 1:3299592/93‑1 (MQ=255)
gCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGc < 1:1232703/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGcc < 2:601727/92‑1 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGccca > 1:4066865/1‑91 (MQ=255)
tCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCaa < 1:2406079/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCAt > 2:1337845/1‑93 (MQ=255)
tGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCATg > 2:4861987/1‑93 (MQ=255)
tGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATg > 2:3343148/1‑93 (MQ=255)
tGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATg > 2:4786913/1‑93 (MQ=255)
ggTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGa < 2:1722529/93‑1 (MQ=255)
gTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTNTGGCTGGCAAACGNTNCCAATGAt > 2:1403509/1‑93 (MQ=255)
gTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGAt > 2:1187625/1‑93 (MQ=255)
ttAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATa < 2:195522/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActg > 1:5998442/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActg < 2:2404854/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATActg > 2:5218260/1‑93 (MQ=255)
gTCACAAAGAGTGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa < 1:544009/93‑1 (MQ=255)
gTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa > 1:3147975/1‑93 (MQ=255)
gTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGa < 1:5269664/93‑1 (MQ=255)
tCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAt < 2:3768958/93‑1 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAttt > 1:3830259/1‑92 (MQ=255)
acaAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTg > 1:5283697/1‑93 (MQ=255)
caAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGc > 2:2215650/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt > 1:4977409/1‑93 (MQ=255)
aaGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCt < 2:1731714/93‑1 (MQ=255)
gagGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGCTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCg < 1:4448938/93‑1 (MQ=255)
agGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGc < 2:5166531/93‑1 (MQ=255)
gggATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCt > 2:3551940/1‑93 (MQ=255)
ggATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTg < 2:260666/93‑1 (MQ=255)
gATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTgg > 1:2815091/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGANACTGCTGATTGCCTCGCTgngg > 1:5199725/1‑92 (MQ=255)
tGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTg > 1:852204/1‑93 (MQ=255)
tGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTg < 1:2948689/93‑1 (MQ=255)
gggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTgg < 1:1732922/93‑1 (MQ=255)
gggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTgg > 2:5814518/1‑93 (MQ=255)
ggCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGAGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGc > 1:2459665/1‑93 (MQ=255)
gCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGTCATACGGTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCa < 2:1973034/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCAtt < 2:5363205/93‑1 (MQ=255)
tACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCGCGCTGGGTGGCAtt < 1:682766/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTg > 2:3145922/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTg > 1:1789642/1‑93 (MQ=255)
cGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTgg > 1:893884/1‑93 (MQ=255)
ggTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGt > 2:5969063/1‑93 (MQ=255)
ggTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGGTGCCAATGATACTGGTGATTGGCTCGCTGGGTGGCATTTGt > 1:5611438/1‑93 (MQ=255)
gTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGtt > 1:5230951/1‑93 (MQ=255)
tGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTa < 1:3480923/93‑1 (MQ=255)
aTTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACg > 2:4722119/1‑93 (MQ=255)
tttCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGGCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGc > 2:1543840/1‑93 (MQ=255)
ttCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGcc > 2:4544060/1‑93 (MQ=255)
tCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCa < 1:1125088/93‑1 (MQ=255)
aaGCTACTGGCCGCTGCAGGTTCATGGGGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATc < 1:5017654/93‑1 (MQ=255)
aaGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATc < 2:614245/93‑1 (MQ=255)
aGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCg > 2:5503661/1‑93 (MQ=255)
gCTACGGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGt < 1:187009/93‑1 (MQ=255)
cTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGtt < 2:3630054/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt < 2:1006801/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt < 2:857109/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt < 1:1576229/93‑1 (MQ=255)
tACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGttt < 1:4005342/93‑1 (MQ=255)
aCTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTc < 2:4517032/93‑1 (MQ=255)
cTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTca > 1:631239/1‑93 (MQ=255)
tGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcac > 2:3867816/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcaca > 2:4359017/1‑93 (MQ=255)
ggCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcaca < 1:2381492/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTcaca > 1:267724/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAc < 1:1399149/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAAc < 2:5038045/93‑1 (MQ=255)
gCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACtt > 1:3402099/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACtt > 1:4137810/1‑93 (MQ=255)
ccggCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACtt < 2:1984463/90‑1 (MQ=255)
cTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACttt > 1:4368822/1‑92 (MQ=255)
cTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTc < 1:5754446/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTc < 1:957616/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTc < 2:4131469/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATCATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTc < 1:3573604/93‑1 (MQ=255)
cTGAAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATGCTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTc < 1:4887446/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt < 1:277022/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt > 2:3715840/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt > 1:2144366/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAGGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCt < 1:5818122/93‑1 (MQ=255)
|
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCA > NC_000913/3463587‑3463766
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACGC > NC_000913/3463585‑3463770
|
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG < SRR4302533.395919/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG < SRR4302533.5628198/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTG < SRR4302533.612478/94‑1 (MQ=60)
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTAAAGCTACTGGCCGCTGCAGGGG > SRR4302533.1158219/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCA < SRR4302533.2663485/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT > SRR4302533.5388039/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT > SRR4302533.3179659/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT > SRR4302533.1890568/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCAT < SRR4302533.1075896/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATG < SRR4302533.4086266/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATG > SRR4302533.526946/1‑94 (MQ=60)
GCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGG < SRR4302533.3471381/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTG > SRR4302533.720486/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGT < SRR4302533.4334829/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGT > SRR4302533.5270870/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTG < SRR4302533.6165475/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG < SRR4302533.1264450/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG > SRR4302533.4375739/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG < SRR4302533.2879498/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG > SRR4302533.5284519/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTG < SRR4302533.5561056/94‑1 (MQ=60)
TGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGG > SRR4302533.2398252/1‑94 (MQ=60)
TGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTAATGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGG > SRR4302533.805151/1‑94 (MQ=60)
GTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGTTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGC < SRR4302533.542991/94‑1 (MQ=60)
GTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGC < SRR4302533.2290291/94‑1 (MQ=60)
GTTTACTGGGGCGTCTGGTAACTTTGTCACAAAGAGGTATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGC < SRR4302533.2222395/94‑1 (MQ=60)
TTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCATAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCA > SRR4302533.1145099/1‑94 (MQ=60)
TTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCA < SRR4302533.5306323/94‑1 (MQ=60)
TACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAA > SRR4302533.871288/1‑94 (MQ=60)
TACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAA < SRR4302533.227177/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG > SRR4302533.1939342/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG < SRR4302533.5063852/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG > SRR4302533.5584121/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACG < SRR4302533.2257428/94‑1 (MQ=60)
TGGGGCGTCTGGTTAGTTTGACACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGT < SRR4302533.4443443/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTG < SRR4302533.2465692/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCC < SRR4302533.1240080/94‑1 (MQ=60)
GCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCC > SRR4302533.4102046/1‑94 (MQ=60)
GCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCC < SRR4302533.3319954/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCA > SRR4302533.4091623/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAA > SRR4302533.5719771/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAA > SRR4302533.4955409/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAT < SRR4302533.2420941/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATG > SRR4302533.3158527/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATG > SRR4302533.3207669/1‑94 (MQ=60)
GGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATTAT > SRR4302533.2777174/1‑94 (MQ=60)
TTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAC < SRR4302533.2831519/94‑1 (MQ=60)
TTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATAC < SRR4302533.1777242/94‑1 (MQ=60)
TAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACT < SRR4302533.1226778/94‑1 (MQ=60)
TAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACT > SRR4302533.1714702/1‑94 (MQ=60)
AGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTG > SRR4302533.6034773/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCT < SRR4302533.5852967/94‑1 (MQ=60)
TGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGA > SRR4302533.3167328/1‑94 (MQ=60)
GTCACAAAGAGTGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAT < SRR4302533.547240/94‑1 (MQ=60)
GTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAT < SRR4302533.5301270/94‑1 (MQ=60)
GTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGAT < SRR4302533.5343759/94‑1 (MQ=60)
TCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATT < SRR4302533.988417/94‑1 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTT > SRR4302533.3853674/1‑94 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTG < SRR4302533.37979/94‑1 (MQ=60)
CACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTG > SRR4302533.5315351/1‑94 (MQ=60)
CAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGGAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCC > SRR4302533.3381315/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT < SRR4302533.5056890/94‑1 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT > SRR4302533.5007590/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT > SRR4302533.4619021/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCT > SRR4302533.1889816/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTC < SRR4302533.524436/94‑1 (MQ=60)
AGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCG < SRR4302533.1141465/94‑1 (MQ=60)
GAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGCTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGC < SRR4302533.4475844/94‑1 (MQ=60)
GGTATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTG < SRR4302533.3594926/94‑1 (MQ=60)
GGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTG > SRR4302533.2159043/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTG > SRR4302533.4268483/1‑94 (MQ=60)
GGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGG > SRR4302533.2832420/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGG > SRR4302533.2671616/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGANACTGCTGATTGCCTCGCTGNGG > SRR4302533.5231073/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG < SRR4302533.6028229/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG < SRR4302533.638344/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTG > SRR4302533.857193/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGG < SRR4302533.2966724/94‑1 (MQ=60)
GGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGC < SRR4302533.1743427/94‑1 (MQ=60)
GGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGAGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCCATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGC > SRR4302533.2474843/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATT > SRR4302533.959035/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCCAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG > SRR4302533.5915299/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG > SRR4302533.1078764/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG < SRR4302533.2491397/94‑1 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG > SRR4302533.1800523/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTG < SRR4302533.1871736/94‑1 (MQ=60)
TACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCGCGCTGGGTGGCATTG < SRR4302533.686804/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGG > SRR4302533.899137/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGGTGCCAATGATACTGGTGATTGGCTCGCTGGGTGGCATTTGT > SRR4302533.5645355/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT > SRR4302533.5262416/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTT < SRR4302533.4382241/94‑1 (MQ=60)
TGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTAC < SRR4302533.3502396/94‑1 (MQ=60)
TTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCA > SRR4302533.6216597/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCAT < SRR4302533.1131764/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTTCATGGGGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG < SRR4302533.5048048/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG > SRR4302533.3172225/1‑94 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG < SRR4302533.5048047/94‑1 (MQ=60)
AAGCTACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCG > SRR4302533.6072242/1‑94 (MQ=60)
GCTACGGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTT < SRR4302533.188171/94‑1 (MQ=60)
TACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTC < SRR4302533.4029724/94‑1 (MQ=60)
TACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTC < SRR4302533.3936881/94‑1 (MQ=60)
TACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTC < SRR4302533.1585718/94‑1 (MQ=60)
ACTGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCA > SRR4302533.634953/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACA > SRR4302533.269351/1‑94 (MQ=60)
GGCCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAA < SRR4302533.2396222/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACT < SRR4302533.1407582/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT > SRR4302533.4360679/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT > SRR4302533.3423106/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTT > SRR4302533.4162914/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTT > SRR4302533.4395194/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT < SRR4302533.5789168/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT > SRR4302533.2157575/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT < SRR4302533.963248/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATCATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT < SRR4302533.3595622/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATGCTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCT < SRR4302533.4917059/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302533.278712/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG > SRR4302533.5129192/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302533.1534725/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG > SRR4302533.5510575/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAAGGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTG < SRR4302533.5853268/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGGTACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAA > SRR4302533.6179715/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAA < SRR4302533.854244/94‑1 (MQ=60)
GTGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACG < SRR4302533.124868/94‑1 (MQ=60)
TGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACGC > SRR4302533.617076/1‑94 (MQ=60)
|
GGGGTGCTGTGGTGTGTTTACTGGGGCGTCTGGTTAGTTTGTCACAAAGAGGGATTGGGCTACGGTGATTTCAAGCTACTGGCCGCTGCAGGCGCATGGTGTGGCTGGCAAACGTTGCCAATGATACTGCTGATTGCCTCGCTGGGTGGCATTGGTTACGCCATCGTTTCACAACTTCTGCAACGC > NC_000913/3463585‑3463770
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
