Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,775,779 |
A→G |
I252V (ATT→GTT) |
lldP → |
L‑lactate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,775,779 | 0 | A | G | 100.0%
| 676.1
/ NA
| 209 | I252V (ATT→GTT) | lldP | L‑lactate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (79/130); total (79/130) |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775690‑3775868
|
agaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTa < 1:2900900/93‑1 (MQ=255)
gaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAt > 2:3912528/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtc > 1:437750/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtc > 1:2288913/1‑93 (MQ=255)
cGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtct < 2:2381245/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtctc < 2:847627/93‑1 (MQ=255)
gTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtctc < 1:2217659/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCtt > 2:5095841/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCtt < 1:6201132/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt < 1:4479896/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt > 1:2107432/1‑93 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt > 1:3501973/1‑93 (MQ=255)
gCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGGGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTg < 2:1670288/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTg < 1:1690725/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTg < 2:5307240/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTg < 2:3078393/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGt < 2:2902944/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTa > 1:4334948/1‑93 (MQ=255)
cGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATc > 2:1760838/1‑93 (MQ=255)
gTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCa < 2:6161155/93‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc > 2:3635832/1‑93 (MQ=255)
ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACt > 1:2377566/1‑93 (MQ=255)
gTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTg < 2:2589054/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTg > 1:4389227/1‑93 (MQ=255)
ttGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGc < 2:2785166/93‑1 (MQ=255)
ttGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGc < 1:3947828/93‑1 (MQ=255)
ttGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGc < 2:4332475/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 2:4130570/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 2:4863329/93‑1 (MQ=255)
ggcggcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGc > 1:3698236/1‑93 (MQ=255)
cggcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCt < 2:456070/93‑1 (MQ=255)
ggcTCGTTTTCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTTGGTCCGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTTGTATCACTGCTCTGCCTg > 2:4523539/1‑93 (MQ=255)
tCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACg > 1:2527793/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGc > 2:5446811/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCt < 2:4501237/93‑1 (MQ=255)
gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCt < 1:1597844/93‑1 (MQ=255)
tGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGtt > 2:5823975/1‑93 (MQ=255)
gCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTc > 2:1126009/1‑93 (MQ=255)
gCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTc < 1:853191/93‑1 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc < 2:6274242/93‑1 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc < 1:5466884/93‑1 (MQ=255)
cATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCt < 2:794528/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCa > 2:4400488/1‑93 (MQ=255)
tCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACg < 1:114022/93‑1 (MQ=255)
cAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGc > 2:4785760/1‑93 (MQ=255)
aGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCt < 2:2179127/93‑1 (MQ=255)
aGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCt < 1:3584786/93‑1 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg < 1:3875874/93‑1 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg > 1:3444876/1‑93 (MQ=255)
ccTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCa < 1:5771822/93‑1 (MQ=255)
cTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAg < 1:3812812/93‑1 (MQ=255)
cTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAg > 1:4559041/1‑93 (MQ=255)
ttAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGc > 1:4058903/1‑93 (MQ=255)
ttAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGc > 1:4525096/1‑93 (MQ=255)
tAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGcc < 2:1091313/93‑1 (MQ=255)
cgCTCTATCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTACCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCa < 2:1434234/92‑1 (MQ=255)
aGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCa < 2:3134098/93‑1 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg < 1:1745271/93‑1 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg > 2:668649/1‑93 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc < 2:5052801/93‑1 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc < 1:510214/93‑1 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc > 2:2217979/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 1:2757603/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:2247476/1‑93 (MQ=255)
aaCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgg > 2:1883459/1‑92 (MQ=255)
aCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtg < 1:2303308/93‑1 (MQ=255)
aCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtg > 1:1001270/1‑93 (MQ=255)
cTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtgt < 1:3099449/93‑1 (MQ=255)
ttCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTa < 1:5026162/93‑1 (MQ=255)
aTTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTc < 2:4973512/93‑1 (MQ=255)
aTTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTc < 2:4729052/93‑1 (MQ=255)
aTTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTc > 2:1546593/1‑93 (MQ=255)
ttGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTcc < 1:4776640/93‑1 (MQ=255)
gggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGt > 1:603336/1‑93 (MQ=255)
gggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGt < 2:1301832/93‑1 (MQ=255)
gggcGGAGCTGCCGAACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 1:1259314/90‑1 (MQ=255)
ggCCGTAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 1:2043185/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 2:3470863/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 2:5601698/93‑1 (MQ=255)
gCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGttt > 1:1852006/1‑93 (MQ=255)
ccGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtttt < 2:2001363/93‑1 (MQ=255)
ccGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtttt < 2:4508385/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt > 2:2103350/1‑93 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt > 1:2609069/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTg > 1:5499600/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGCTTTGGTg > 2:5744142/1‑93 (MQ=255)
gCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa < 1:937421/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa < 2:3298523/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAtt < 1:3246111/93‑1 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt > 1:2432480/1‑93 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt < 1:4829985/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg < 1:2941409/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg < 1:3005751/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg < 2:6018319/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg > 1:148973/1‑93 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg > 1:4047682/1‑93 (MQ=255)
ggACGTTTTCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAGACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTGCGTTTTGGTGATTTggg > 2:5130044/1‑93 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg < 2:516511/93‑1 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg < 1:5583906/93‑1 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg < 1:4175393/93‑1 (MQ=255)
|
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775690‑3775868
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > NC_000913/3775687‑3775871
|
AAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGT < SRR4302533.4867386/94‑1 (MQ=60)
AAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGT < SRR4302533.1601812/94‑1 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT > SRR4302533.2994314/1‑94 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT < SRR4302533.2918722/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATC > SRR4302533.2303086/1‑94 (MQ=60)
GACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATC > SRR4302533.440358/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCT < SRR4302533.1677107/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCT > SRR4302533.4583875/1‑94 (MQ=60)
GTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCT < SRR4302533.2231349/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTC < SRR4302533.6238325/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCT > SRR4302533.2120433/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCT > SRR4302533.3523567/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCT < SRR4302533.1605640/94‑1 (MQ=60)
TGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTG < SRR4302533.4506997/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGG < SRR4302533.3498577/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGG < SRR4302533.1700968/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGG < SRR4302533.2936454/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGT < SRR4302533.3751620/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTA > SRR4302533.4361068/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTAATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTAT < SRR4302533.4604330/94‑1 (MQ=60)
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CGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCA < SRR4302533.2232357/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCA > SRR4302533.1973145/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTCCCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAC < SRR4302533.6177541/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAC < SRR4302533.5508905/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAC < SRR4302533.5091519/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT > SRR4302533.2392275/1‑94 (MQ=60)
GGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTG > SRR4302533.4415727/1‑94 (MQ=60)
TTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCT < SRR4302533.3971903/94‑1 (MQ=60)
TTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCT < SRR4302533.3971904/94‑1 (MQ=60)
tggggccgctcggttggccTCGCTCAGTTCCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCT < SRR4302533.639588/75‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCT < SRR4302533.4817272/94‑1 (MQ=60)
GGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGC > SRR4302533.3720950/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGAC > SRR4302533.1430984/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACG > SRR4302533.2543354/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTG < SRR4302533.6214153/94‑1 (MQ=60)
GTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTG < SRR4302533.1607518/94‑1 (MQ=60)
TTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTT < SRR4302533.5891794/94‑1 (MQ=60)
GCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCC < SRR4302533.858186/94‑1 (MQ=60)
CCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCT < SRR4302533.5499835/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTC < SRR4302533.5771572/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTC < SRR4302533.3081543/94‑1 (MQ=60)
CATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTC > SRR4302533.2874683/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACG < SRR4302533.1788817/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACG < SRR4302533.3483544/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAATGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACG < SRR4302533.4389226/94‑1 (MQ=60)
TCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGC < SRR4302533.114746/94‑1 (MQ=60)
AGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTG < SRR4302533.3606863/94‑1 (MQ=60)
GTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGG > SRR4302533.3466148/1‑94 (MQ=60)
TACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGC < SRR4302533.3899534/94‑1 (MQ=60)
TACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGC > SRR4302533.4189746/1‑94 (MQ=60)
TACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGC < SRR4302533.4892720/94‑1 (MQ=60)
TACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGC < SRR4302533.3329915/94‑1 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG < SRR4302533.5806674/94‑1 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG > SRR4302533.4586692/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG < SRR4302533.1063791/94‑1 (MQ=60)
CCTTAGCTCAAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG < SRR4302533.4523247/94‑1 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302533.2450990/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302533.3682674/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302533.4552492/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302533.4083610/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC < SRR4302533.3836129/94‑1 (MQ=60)
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TTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCC < SRR4302533.4414473/94‑1 (MQ=60)
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CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302533.2436737/1‑94 (MQ=60)
TCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGC < SRR4302533.1755888/94‑1 (MQ=60)
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CTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCG < SRR4302533.513245/94‑1 (MQ=60)
TAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGTTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGT > SRR4302533.4467422/1‑94 (MQ=60)
TAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGT < SRR4302533.3936422/94‑1 (MQ=60)
AACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTG > SRR4302533.1007116/1‑94 (MQ=60)
ACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGT > SRR4302533.5539140/1‑94 (MQ=60)
ACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGT < SRR4302533.2317577/94‑1 (MQ=60)
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CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC > SRR4302533.2652108/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCC > SRR4302533.4771118/1‑94 (MQ=60)
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TTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCG < SRR4302533.2132731/94‑1 (MQ=60)
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TGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGT > SRR4302533.606881/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGAGCTGCCGAACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTT < SRR4302533.1266845/94‑1 (MQ=60)
GGCCGTAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTT < SRR4302533.2055782/94‑1 (MQ=60)
GGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTT > SRR4302533.1863298/1‑94 (MQ=60)
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GGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGT > SRR4302533.2625089/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGT > SRR4302533.4256941/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG > SRR4302533.5532773/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG < SRR4302533.208710/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAT < SRR4302533.942928/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATT < SRR4302533.4072757/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTT < SRR4302533.3266125/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTT > SRR4302533.2447510/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTT < SRR4302533.2143096/94‑1 (MQ=60)
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CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG > SRR4302533.4072328/1‑94 (MQ=60)
CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG < SRR4302533.3186012/94‑1 (MQ=60)
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CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG > SRR4302533.149925/1‑94 (MQ=60)
CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG < SRR4302533.1746251/94‑1 (MQ=60)
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CGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGG < SRR4302533.516392/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > SRR4302533.2525069/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG < SRR4302533.5617646/94‑1 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG < SRR4302533.4200694/94‑1 (MQ=60)
ACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGC < SRR4302533.4925401/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > SRR4302533.2766863/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG < SRR4302533.2021243/94‑1 (MQ=60)
|
AAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > NC_000913/3775687‑3775871
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
