Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,804,224 |
A→G |
T157T (ACT→ACC) |
rfaG ← |
glucosyltransferase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,804,224 | 0 | A | G | 100.0%
| 583.0
/ NA
| 183 | T157T (ACT→ACC) | rfaG | glucosyltransferase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (98/85); total (98/85) |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > NC_000913/3804134‑3804313
|
gCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGt > 1:4285483/1‑93 (MQ=255)
gCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGt < 2:2728401/93‑1 (MQ=255)
cGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGtt > 2:596302/1‑93 (MQ=255)
gATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGttt > 2:4452373/1‑93 (MQ=255)
gATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGttt > 2:4387215/1‑93 (MQ=255)
gATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGttt > 2:1105342/1‑93 (MQ=255)
aTAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTg > 1:5766242/1‑93 (MQ=255)
tAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGa > 1:55979/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGAt < 2:3246399/93‑1 (MQ=255)
aaaTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGAt < 1:2462159/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATa < 1:3285468/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATa > 2:2108979/1‑93 (MQ=255)
tttCGCGGCTGTTGAGGATTTGCTCACTGTATTTACTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAt < 1:469064/93‑1 (MQ=255)
tttCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAt < 2:2894909/93‑1 (MQ=255)
tttCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAt > 1:3712850/1‑93 (MQ=255)
ttCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATg < 1:3245071/93‑1 (MQ=255)
tCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGc < 1:2699829/93‑1 (MQ=255)
cACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCt < 2:4181177/93‑1 (MQ=255)
aCGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCtt > 1:1443873/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCt > 2:5281931/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCt > 2:1945473/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTg > 1:3180520/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTg > 2:2768369/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGa > 2:4199166/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGa > 1:1012182/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGa > 2:2469967/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGaa < 2:1276014/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATc < 2:1397781/93‑1 (MQ=255)
gggATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCg > 1:2851572/1‑93 (MQ=255)
gggATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCg < 2:6048140/93‑1 (MQ=255)
gATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGc > 1:1548620/1‑93 (MQ=255)
aTTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCg > 1:3095318/1‑93 (MQ=255)
tGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGAtt < 1:4306263/93‑1 (MQ=255)
tGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGAtt < 2:1800910/93‑1 (MQ=255)
gCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGAttt > 2:2174000/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGc < 1:220257/93‑1 (MQ=255)
tCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGc > 2:6254887/1‑93 (MQ=255)
cTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTa > 1:2773480/1‑93 (MQ=255)
gTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATc < 2:5685536/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATc < 1:4800825/93‑1 (MQ=255)
tATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCg > 1:4429960/1‑93 (MQ=255)
aTTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCgg < 2:5852320/93‑1 (MQ=255)
aTTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCgg > 1:1867043/1‑93 (MQ=255)
aTTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCgg > 1:5520783/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGt > 2:3185398/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGt > 2:3386502/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGt > 1:4329356/1‑93 (MQ=255)
tttCTGGCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTc < 1:1510609/93‑1 (MQ=255)
ttCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGGTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATTCGTCa > 2:5399779/1‑93 (MQ=255)
ttCTGTCCGGATAAATACCGGGAAGAAGAATTTGAAAGCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCa < 1:5337442/93‑1 (MQ=255)
tgcTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCa < 2:3962651/91‑1 (MQ=255)
tGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGca > 2:2864226/1‑93 (MQ=255)
gTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcat < 1:6092574/93‑1 (MQ=255)
ccGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatca < 1:423959/93‑1 (MQ=255)
cGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatcat < 1:2274956/93‑1 (MQ=255)
gATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATaa < 1:4717871/93‑1 (MQ=255)
gATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATaa > 2:1407824/1‑93 (MQ=255)
aTAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAg > 1:3385439/1‑93 (MQ=255)
tAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGt < 1:5981822/93‑1 (MQ=255)
tAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGt < 1:1218547/93‑1 (MQ=255)
aaaTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGtt < 2:651839/93‑1 (MQ=255)
aaaTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGtt < 1:6079130/93‑1 (MQ=255)
aaTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGttt > 1:2520191/1‑93 (MQ=255)
aaTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGttt < 2:4858875/93‑1 (MQ=255)
aTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtc > 2:1463971/1‑93 (MQ=255)
aCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgt < 2:159139/93‑1 (MQ=255)
aCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgt < 1:393178/93‑1 (MQ=255)
ccGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgtc < 2:5039157/93‑1 (MQ=255)
cGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgtcg < 1:3793794/93‑1 (MQ=255)
gggAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGa > 1:724717/1‑93 (MQ=255)
gggAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGa < 1:4127083/93‑1 (MQ=255)
gggAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGa < 2:3095395/93‑1 (MQ=255)
gggAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGCTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGa > 1:1085008/1‑93 (MQ=255)
ggaggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAt < 2:631198/93‑1 (MQ=255)
gaggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAtt < 2:2312440/93‑1 (MQ=255)
gaggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAtt < 1:2596608/93‑1 (MQ=255)
ggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTa > 1:4473488/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 2:5775945/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 1:3566780/1‑93 (MQ=255)
aagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAcc > 2:1889998/1‑93 (MQ=255)
aagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAcc < 2:4051416/93‑1 (MQ=255)
gaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCt > 2:561914/1‑93 (MQ=255)
gaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACACt > 1:5423872/1‑93 (MQ=255)
aaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTg < 2:3513364/93‑1 (MQ=255)
tttGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCt > 1:4969967/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTc > 1:2679702/1‑93 (MQ=255)
ttGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTc > 1:461430/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAg < 2:4641211/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGt < 1:2323811/93‑1 (MQ=255)
cGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtc > 1:5789585/1‑93 (MQ=255)
gttcaggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcg > 1:6173901/1‑93 (MQ=255)
gttcaggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcg > 1:2919824/1‑93 (MQ=255)
cttcaggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcg < 2:816950/92‑1 (MQ=255)
caggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctc < 1:207523/93‑1 (MQ=255)
ggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctcgc < 1:3677135/93‑1 (MQ=255)
gttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTcgctcgct < 2:5174327/93‑1 (MQ=255)
gttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTcgctcgct > 2:1136677/1‑93 (MQ=255)
ttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCgctcgctc < 2:344437/93‑1 (MQ=255)
ttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCgctcgctc > 2:1490174/1‑93 (MQ=255)
ttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCgctcgctc > 2:753105/1‑93 (MQ=255)
|
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > NC_000913/3804134‑3804313
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > NC_000913/3804131‑3804317
|
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGTTAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCG > SRR4302533.1981940/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCG > SRR4302533.5609472/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCG > SRR4302533.5468091/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGG > SRR4302533.4877736/1‑94 (MQ=60)
GGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGT > SRR4302533.4311232/1‑94 (MQ=60)
GATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTG > SRR4302533.2273608/1‑94 (MQ=60)
GATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTG > SRR4302533.5801055/1‑94 (MQ=60)
ATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGA > SRR4302533.56353/1‑94 (MQ=60)
AAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATA < SRR4302533.2477349/94‑1 (MQ=60)
AAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATA < SRR4302533.2477768/94‑1 (MQ=60)
AATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAA < SRR4302533.3305749/94‑1 (MQ=60)
AATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAA > SRR4302533.6145917/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAT > SRR4302533.3735650/1‑94 (MQ=60)
TTTCGCGGCTGTTGAGGATTTGCTCACTGTATTTACTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATG < SRR4302533.471866/94‑1 (MQ=60)
TTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATG > SRR4302533.4425149/1‑94 (MQ=60)
TTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGC < SRR4302533.3265075/94‑1 (MQ=60)
TCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCT < SRR4302533.2716394/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTT > SRR4302533.1452584/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTC > SRR4302533.277822/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTC > SRR4302533.583083/1‑94 (MQ=60)
ACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTC > SRR4302533.4908863/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG > SRR4302533.4112749/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG < SRR4302533.4419743/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG > SRR4302533.3200085/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302533.1018105/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTACTGACCGGATAAATACCGGGAGTAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA < SRR4302533.5578441/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAA > SRR4302533.4496954/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAA < SRR4302533.5477627/94‑1 (MQ=60)
TTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAAT > SRR4302533.420067/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCG > SRR4302533.2869115/1‑94 (MQ=60)
GGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGC > SRR4302533.1557952/1‑94 (MQ=60)
GATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCG < SRR4302533.3633944/94‑1 (MQ=60)
GATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCG > SRR4302533.3114347/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGATGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATT > SRR4302533.6083127/1‑94 (MQ=60)
TGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTT > SRR4302533.3303903/1‑94 (MQ=60)
TGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTT < SRR4302533.4332173/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTT < SRR4302533.1971251/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGGTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTT > SRR4302533.5793414/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGC > SRR4302533.4581821/1‑94 (MQ=60)
CTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGC > SRR4302533.237368/1‑94 (MQ=60)
TCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCT < SRR4302533.221633/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCT > SRR4302533.1549045/1‑94 (MQ=60)
ACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTA > SRR4302533.2790507/1‑94 (MQ=60)
CTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAT > SRR4302533.6313522/1‑94 (MQ=60)
CTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAT > SRR4302533.2550390/1‑94 (MQ=60)
TGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCTGCGATTTGCTTATC > SRR4302533.2901207/1‑94 (MQ=60)
GTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCG > SRR4302533.4456739/1‑94 (MQ=60)
GTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCG < SRR4302533.4829905/94‑1 (MQ=60)
GTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCG > SRR4302533.2706386/1‑94 (MQ=60)
TATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGG > SRR4302533.1878427/1‑94 (MQ=60)
TATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGG > SRR4302533.5554114/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGT > SRR4302533.4355440/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCA > SRR4302533.4315227/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCA > SRR4302533.2294889/1‑94 (MQ=60)
TTTCTGGCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCA < SRR4302533.1519713/94‑1 (MQ=60)
TTCTGTCCGGATAAATACCGGGAAGAAGAATTTGAAAGCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAG < SRR4302533.5369439/94‑1 (MQ=60)
TCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGC > SRR4302533.4283722/1‑94 (MQ=60)
GTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATC < SRR4302533.6129390/94‑1 (MQ=60)
TCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCA > SRR4302533.3945646/1‑94 (MQ=60)
TCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGGTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGACTTGCTTATCGGTCAGCATCA > SRR4302533.5409629/1‑94 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCAT < SRR4302533.426494/94‑1 (MQ=60)
CGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATA < SRR4302533.2289043/94‑1 (MQ=60)
GATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAG > SRR4302533.3406340/1‑94 (MQ=60)
GATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAG < SRR4302533.4746478/94‑1 (MQ=60)
TAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTT < SRR4302533.1225864/94‑1 (MQ=60)
TAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTT < SRR4302533.6018051/94‑1 (MQ=60)
AAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTT < SRR4302533.6115897/94‑1 (MQ=60)
AAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTT > SRR4302533.2535720/1‑94 (MQ=60)
AATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTC > SRR4302533.1088325/1‑94 (MQ=60)
TACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCAGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGT < SRR4302533.3392205/94‑1 (MQ=60)
ACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTC < SRR4302533.395562/94‑1 (MQ=60)
CCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCG < SRR4302533.4354256/94‑1 (MQ=60)
CCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCG < SRR4302533.6127299/94‑1 (MQ=60)
CGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGA > SRR4302533.729004/1‑94 (MQ=60)
CGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGA < SRR4302533.3817013/94‑1 (MQ=60)
CGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGCTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGA > SRR4302533.1091406/1‑94 (MQ=60)
GGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAT < SRR4302533.4152138/94‑1 (MQ=60)
GGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAT < SRR4302533.3513192/94‑1 (MQ=60)
GGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATT > SRR4302533.2956773/1‑94 (MQ=60)
GAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTT < SRR4302533.2612564/94‑1 (MQ=60)
GAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTT > SRR4302533.2856774/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTA > SRR4302533.4706331/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTA > SRR4302533.4500545/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC > SRR4302533.3588760/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC > SRR4302533.11920/1‑94 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCT > SRR4302533.5821444/1‑94 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCT < SRR4302533.3711057/94‑1 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACACT > SRR4302533.5456538/1‑94 (MQ=60)
AATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGC > SRR4302533.6210463/1‑94 (MQ=60)
ATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCT > SRR4302533.5000100/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAAACGTTGAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTC < SRR4302533.3255654/94‑1 (MQ=60)
TTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTC > SRR4302533.2696126/1‑94 (MQ=60)
TTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTC > SRR4302533.464181/1‑94 (MQ=60)
TGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGA < SRR4302533.313078/94‑1 (MQ=60)
TGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGA > SRR4302533.2113884/1‑94 (MQ=60)
GAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAA > SRR4302533.4738934/1‑94 (MQ=60)
AACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGT < SRR4302533.282312/94‑1 (MQ=60)
AACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGT > SRR4302533.1795360/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTC > SRR4302533.5824566/1‑94 (MQ=60)
ACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTC < SRR4302533.2338198/94‑1 (MQ=60)
CGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCG > SRR4302533.2937714/1‑94 (MQ=60)
CGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCG > SRR4302533.6211004/1‑94 (MQ=60)
GTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGC < SRR4302533.3741593/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCT < SRR4302533.137023/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCG < SRR4302533.208838/94‑1 (MQ=60)
AGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGC > SRR4302533.4773467/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCT < SRR4302533.3699734/94‑1 (MQ=60)
GGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCT > SRR4302533.1513262/1‑94 (MQ=60)
GGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGCCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCT < SRR4302533.5047686/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > SRR4302533.2645744/1‑94 (MQ=60)
TCTGTTTGATAATGCTTCTGCAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAA < SRR4302533.2784903/94‑1 (MQ=60)
CGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAA < SRR4302533.2570270/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT < SRR4302533.6285/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > SRR4302533.2062980/1‑94 (MQ=60)
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CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > NC_000913/3804131‑3804317
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
