Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,806,223 |
A→G |
I19M (ATA→ATG) |
kdtA → |
3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,806,223 | 0 | A | G | 100.0%
| 760.9
/ NA
| 234 | I19M (ATA→ATG) | kdtA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (153/81); total (153/81) |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > NC_000913/3806135‑3806312
|
tCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGc > 1:4755188/1‑93 (MQ=255)
cccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctc > 1:1169246/1‑93 (MQ=255)
ccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctct > 1:2300065/1‑93 (MQ=255)
cAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTCCCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTg < 1:1051697/93‑1 (MQ=255)
cacaTCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGt > 2:870852/1‑93 (MQ=255)
aTCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcg > 1:2415509/1‑93 (MQ=255)
aTCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACAGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcg > 1:3391010/1‑93 (MQ=255)
tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgc < 2:421094/93‑1 (MQ=255)
tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGACGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgc > 2:4502309/1‑93 (MQ=255)
tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACATTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgc > 1:5480553/1‑93 (MQ=255)
ccATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGcgcg > 2:2047755/1‑93 (MQ=255)
cATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCgg > 1:2549385/1‑93 (MQ=255)
aTAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACCCCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGa < 1:3585071/93‑1 (MQ=255)
tAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGAc < 2:6291399/93‑1 (MQ=255)
aaGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACg < 2:4394014/93‑1 (MQ=255)
aGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGt < 2:5385528/93‑1 (MQ=255)
aGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGt < 1:4510369/93‑1 (MQ=255)
gTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTa > 2:1876704/1‑93 (MQ=255)
ttATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCt < 1:5846582/92‑1 (MQ=255)
tATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTc > 2:5796917/1‑93 (MQ=255)
tATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTc < 2:6055592/93‑1 (MQ=255)
aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc > 2:2183059/1‑93 (MQ=255)
aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc > 1:1218736/1‑93 (MQ=255)
tACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGc < 1:3691395/93‑1 (MQ=255)
aCTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGcc < 1:3912577/93‑1 (MQ=255)
tATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTa > 1:3249003/1‑93 (MQ=255)
tATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTa > 1:6242493/1‑93 (MQ=255)
gCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCg > 2:1610624/1‑93 (MQ=255)
gCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCg > 2:6187944/1‑93 (MQ=255)
cTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGa > 2:2505223/1‑93 (MQ=255)
cTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGa > 1:2992893/1‑93 (MQ=255)
cTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGa > 2:5786445/1‑93 (MQ=255)
tCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaa > 1:2625070/1‑93 (MQ=255)
tCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaa < 1:5172744/93‑1 (MQ=255)
cGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaca > 1:1812527/1‑91 (MQ=255)
gAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaaaa > 2:2896516/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAc > 1:1606200/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAc > 2:3713726/1‑93 (MQ=255)
aaTTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCCGCCTATCGAAAAc > 2:4314693/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGc > 2:5657209/1‑93 (MQ=255)
ttGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGc < 1:5997306/93‑1 (MQ=255)
tcTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTg < 1:4673/92‑1 (MQ=255)
gCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTg < 2:4101116/93‑1 (MQ=255)
gCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTg < 1:3281139/93‑1 (MQ=255)
gCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTg < 1:948299/93‑1 (MQ=255)
cTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTgg < 1:2936984/93‑1 (MQ=255)
tttACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTggg < 2:1013973/93‑1 (MQ=255)
tttACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTggg > 2:2804416/1‑93 (MQ=255)
tttACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTggg > 1:5440036/1‑93 (MQ=255)
ttACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTgggg < 2:2421467/93‑1 (MQ=255)
acCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGaa < 1:4841553/93‑1 (MQ=255)
ccGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAAc > 1:891476/1‑93 (MQ=255)
ccGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAAc > 1:1483340/1‑93 (MQ=255)
cGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACg > 1:6246378/1‑93 (MQ=255)
cGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACg < 2:4025432/93‑1 (MQ=255)
cccTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGtt > 2:5238772/1‑93 (MQ=255)
cccTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGtt > 2:78816/1‑93 (MQ=255)
ccTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTa > 2:1345631/1‑93 (MQ=255)
cTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTAc < 2:1739818/93‑1 (MQ=255)
cTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTAc > 2:3426277/1‑93 (MQ=255)
ttCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACg > 2:4250612/1‑93 (MQ=255)
tctcTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACgg > 1:664280/1‑93 (MQ=255)
tctcTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACgg < 1:5085117/93‑1 (MQ=255)
tctcTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACgg > 1:3738328/1‑93 (MQ=255)
ctctACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGt > 2:1432317/1‑93 (MQ=255)
ctctACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGt < 2:1936881/93‑1 (MQ=255)
tctACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGtt > 1:1959441/1‑93 (MQ=255)
tctACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGtt > 2:2291659/1‑93 (MQ=255)
tACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGtttt < 2:4858378/93‑1 (MQ=255)
aCCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGttttt < 2:5068616/93‑1 (MQ=255)
ccTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGtttttc > 1:4924780/1‑92 (MQ=255)
cTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAc > 2:1256315/1‑93 (MQ=255)
cTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAc > 1:3366440/1‑93 (MQ=255)
ttATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAcc > 1:3166627/1‑93 (MQ=255)
ttATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAcc > 1:6129877/1‑93 (MQ=255)
ttATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAcc < 1:4460426/93‑1 (MQ=255)
tATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCg < 1:265952/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGc > 2:5633750/1‑93 (MQ=255)
ttCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGAGTACGGTACGGTTTTTACCGcc > 1:4451523/1‑93 (MQ=255)
cAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAt > 2:494259/1‑93 (MQ=255)
cAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAt < 1:4878729/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAt > 1:5571238/1‑93 (MQ=255)
cAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAt > 1:3803667/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATc > 2:288079/1‑93 (MQ=255)
cGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGc > 2:5890171/1‑93 (MQ=255)
gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCt > 2:4655449/1‑93 (MQ=255)
gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGGGAACGTTACGGGTTTTACCGCCATCCGCt > 1:1407448/1‑93 (MQ=255)
gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGGAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGCGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCt > 2:3869902/1‑93 (MQ=255)
cTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTa > 2:5326084/1‑93 (MQ=255)
cTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTa > 1:3425701/1‑93 (MQ=255)
gATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaaa > 1:2041072/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaaaa < 2:255182/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaaaa > 2:3149160/1‑93 (MQ=255)
cTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAAcc > 1:5921977/1‑93 (MQ=255)
tGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAACCGCTGGGGTGACCGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCa < 1:3996734/93‑1 (MQ=255)
tGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCa > 1:3937788/1‑93 (MQ=255)
tGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCa < 2:3670985/93‑1 (MQ=255)
ggATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAg < 1:4143416/93‑1 (MQ=255)
ggATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAg < 1:580444/93‑1 (MQ=255)
gATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATACGCTAAAACCAgg > 1:5243695/1‑93 (MQ=255)
|
TCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > NC_000913/3806135‑3806312
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGGCGGC > NC_000913/3806131‑3806316
|
AGAATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGC > SRR4302533.1723476/1‑94 (MQ=60)
AGAATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGC > SRR4302533.4682381/1‑94 (MQ=60)
AGAATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGC > SRR4302533.5556398/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGC > SRR4302533.4784045/1‑94 (MQ=60)
TCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCT < SRR4302533.4501772/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTC > SRR4302533.1176263/1‑94 (MQ=60)
CCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTC > SRR4302533.6241058/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCT > SRR4302533.5283872/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCT > SRR4302533.2314321/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCT > SRR4302533.2039581/1‑94 (MQ=60)
CAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTCCCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGG < SRR4302533.1057889/94‑1 (MQ=60)
CAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGG < SRR4302533.6107743/94‑1 (MQ=60)
CAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGG > SRR4302533.324474/1‑94 (MQ=60)
ACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGC < SRR4302533.5823539/94‑1 (MQ=60)
CATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCG > SRR4302533.4966644/1‑94 (MQ=60)
CATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCG < SRR4302533.2218160/94‑1 (MQ=60)
CATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCG > SRR4302533.2430431/1‑94 (MQ=60)
CATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACAGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCG > SRR4302533.3411951/1‑94 (MQ=60)
ATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACATTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGC > SRR4302533.5513595/1‑94 (MQ=60)
CCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGG > SRR4302533.2565078/1‑94 (MQ=60)
CCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGG > SRR4302533.448146/1‑94 (MQ=60)
ATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACCCCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGAC < SRR4302533.3607151/94‑1 (MQ=60)
TAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACG < SRR4302533.787872/94‑1 (MQ=60)
TAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACG < SRR4302533.3439723/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTA > SRR4302533.3548269/1‑94 (MQ=60)
AGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTA < SRR4302533.4537684/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTA > SRR4302533.1185137/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAA > SRR4302533.3335028/1‑94 (MQ=60)
GTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGCGCGCGGACGTAA > SRR4302533.1061260/1‑94 (MQ=60)
TCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAG > SRR4302533.5916428/1‑94 (MQ=60)
TCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAG > SRR4302533.3841263/1‑94 (MQ=60)
TTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTC < SRR4302533.5881928/94‑1 (MQ=60)
TATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCC > SRR4302533.1226054/1‑94 (MQ=60)
ATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCG > SRR4302533.5176434/1‑94 (MQ=60)
TTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGG > SRR4302533.4244348/1‑94 (MQ=60)
TACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCC < SRR4302533.3714075/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCT < SRR4302533.3936473/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCT > SRR4302533.291776/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTA > SRR4302533.6279864/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTA > SRR4302533.3269035/1‑94 (MQ=60)
TATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTAT < SRR4302533.4877330/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATC < SRR4302533.2359677/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATC > SRR4302533.5859826/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCG > SRR4302533.2099594/1‑94 (MQ=60)
GCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGA > SRR4302533.4539589/1‑94 (MQ=60)
GCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGA > SRR4302533.3011190/1‑94 (MQ=60)
GCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGATGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGA > SRR4302533.3405915/1‑94 (MQ=60)
CTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAA > SRR4302533.2641176/1‑94 (MQ=60)
TCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGACA > SRR4302533.1823597/1‑94 (MQ=60)
TCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAA < SRR4302533.5203955/94‑1 (MQ=60)
CGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAA > SRR4302533.888561/1‑94 (MQ=60)
GAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAC > SRR4302533.3008477/1‑94 (MQ=60)
GAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAC > SRR4302533.1615923/1‑94 (MQ=60)
GAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAC > SRR4302533.3293001/1‑94 (MQ=60)
AATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACG < SRR4302533.3261600/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGC > SRR4302533.3980698/1‑94 (MQ=60)
TTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCT < SRR4302533.6033629/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTG < SRR4302533.3055683/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTG > SRR4302533.4897966/1‑94 (MQ=60)
TCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG < SRR4302533.4717/94‑1 (MQ=60)
TCTTTACACCGCCCTCCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG < SRR4302533.5932109/94‑1 (MQ=60)
GCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG < SRR4302533.953871/94‑1 (MQ=60)
GCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG > SRR4302533.380869/1‑94 (MQ=60)
GCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG < SRR4302533.1546198/94‑1 (MQ=60)
GCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG > SRR4302533.5061319/1‑94 (MQ=60)
GCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGG < SRR4302533.3301395/94‑1 (MQ=60)
CTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGG > SRR4302533.3535873/1‑94 (MQ=60)
CTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGG < SRR4302533.2954937/94‑1 (MQ=60)
CTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGG > SRR4302533.2656115/1‑94 (MQ=60)
CTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGG > SRR4302533.5472797/1‑94 (MQ=60)
TTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGT < SRR4302533.986837/94‑1 (MQ=60)
TACACCCCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTG < SRR4302533.4699817/94‑1 (MQ=60)
ACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAAC > SRR4302533.1492294/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAAC > SRR4302533.896714/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAAC < SRR4302533.4870897/94‑1 (MQ=60)
CCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACG > SRR4302533.6283762/1‑94 (MQ=60)
CGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGT > SRR4302533.3768813/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTT < SRR4302533.1949315/94‑1 (MQ=60)
CCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTA > SRR4302533.910450/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCTCCCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACG < SRR4302533.5737170/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACG > SRR4302533.6280770/1‑94 (MQ=60)
CTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACG < SRR4302533.5475705/94‑1 (MQ=60)
CTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACG < SRR4302533.3719650/94‑1 (MQ=60)
TTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGG > SRR4302533.3761255/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGG > SRR4302533.6331918/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGG > SRR4302533.668202/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGG > SRR4302533.1737265/1‑94 (MQ=60)
TCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGT < SRR4302533.5115847/94‑1 (MQ=60)
TCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGT > SRR4302533.4263831/1‑94 (MQ=60)
CTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTT > SRR4302533.1971399/1‑94 (MQ=60)
TCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTT < SRR4302533.5385979/94‑1 (MQ=60)
CTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTT < SRR4302533.3943446/94‑1 (MQ=60)
TACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTT > SRR4302533.2928241/1‑94 (MQ=60)
ACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTC > SRR4302533.4954611/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAC > SRR4302533.5543381/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAC > SRR4302533.3387234/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACC > SRR4302533.6166814/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACC > SRR4302533.1394276/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACC > SRR4302533.3186110/1‑94 (MQ=60)
TTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCG < SRR4302533.3341240/94‑1 (MQ=60)
TTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCG > SRR4302533.4745661/1‑94 (MQ=60)
TTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCG < SRR4302533.4487408/94‑1 (MQ=60)
TATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGC > SRR4302533.5224983/1‑94 (MQ=60)
TATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGC < SRR4302533.267571/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGAGTACGGTACGGTTTTTACCGCC > SRR4302533.4478436/1‑94 (MQ=60)
TTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCA > SRR4302533.1391161/1‑94 (MQ=60)
TTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCA < SRR4302533.2573094/94‑1 (MQ=60)
TCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAT > SRR4302533.5604911/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAT > SRR4302533.3826942/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCAT < SRR4302533.1454438/94‑1 (MQ=60)
CAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATC < SRR4302533.3983510/94‑1 (MQ=60)
CAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATC < SRR4302533.4908286/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCT < SRR4302533.6234417/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGGGAACGTTACGGGTTTTACCGCCATCCGCT > SRR4302533.1415958/1‑94 (MQ=60)
GCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTA > SRR4302533.3446861/1‑94 (MQ=60)
TGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAA > SRR4302533.2053650/1‑94 (MQ=60)
TGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAA > SRR4302533.4866355/1‑94 (MQ=60)
GATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAA > SRR4302533.5984955/1‑94 (MQ=60)
GATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAA > SRR4302533.494832/1‑94 (MQ=60)
TCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACC > SRR4302533.2497174/1‑94 (MQ=60)
TCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACC > SRR4302533.5957773/1‑94 (MQ=60)
CTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCA < SRR4302533.4042696/94‑1 (MQ=60)
CTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCA > SRR4302533.3961823/1‑94 (MQ=60)
TGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAACCGCTGGGGTGACCGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAG < SRR4302533.4021071/94‑1 (MQ=60)
TGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAG < SRR4302533.1670602/94‑1 (MQ=60)
GGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG < SRR4302533.4168534/94‑1 (MQ=60)
GGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > SRR4302533.3652876/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG < SRR4302533.583860/94‑1 (MQ=60)
GGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > SRR4302533.2498624/1‑94 (MQ=60)
GGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATACGCTAAAACCAGG > SRR4302533.5275213/1‑94 (MQ=60)
ATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGGCG < SRR4302533.2338468/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGGCGG < SRR4302533.3357321/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGGCGGC < SRR4302533.5660218/94‑1 (MQ=60)
|
AGAATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGGCGGC > NC_000913/3806131‑3806316
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
