Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,883,067 |
T→C |
D121D (GAT→GAC) |
yidC → |
60 KD inner‑membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,883,067 | 0 | T | C | 100.0%
| 787.6
/ NA
| 248 | D121D (GAT→GAC) | yidC | 60 KD inner‑membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (127/121); total (127/121) |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > NC_000913/3882977‑3883156
|
aCTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAcc > 2:898010/1‑93 (MQ=255)
aCTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAcc > 2:3837005/1‑93 (MQ=255)
ctctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAccc > 1:1250036/1‑93 (MQ=255)
ctctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAccc < 1:3188668/93‑1 (MQ=255)
tctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCg > 2:5831002/1‑93 (MQ=255)
tACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGc > 1:3777616/1‑93 (MQ=255)
tACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGc > 1:6266572/1‑93 (MQ=255)
cccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTa < 2:3106736/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTaa < 2:3364483/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTaa < 1:4373228/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAc > 1:3440828/1‑93 (MQ=255)
aGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACg > 2:5087757/1‑93 (MQ=255)
ccGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGc < 1:2813754/93‑1 (MQ=255)
cGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGcc > 1:3528506/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 1:4580031/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 2:138925/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 2:728145/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg < 1:6109973/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 1:672156/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTc > 1:4293627/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTc < 2:122128/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTcc < 2:1819785/93‑1 (MQ=255)
gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt > 2:2370686/1‑93 (MQ=255)
gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt > 2:5002345/1‑93 (MQ=255)
ttGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTg < 2:2948949/93‑1 (MQ=255)
tcggAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTg < 2:5301394/91‑1 (MQ=255)
tGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGt < 2:3524431/93‑1 (MQ=255)
tGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGt < 2:1294365/93‑1 (MQ=255)
gAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGtat < 1:526159/93‑1 (MQ=255)
aCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAc < 2:4880809/93‑1 (MQ=255)
aCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAc < 2:4310261/93‑1 (MQ=255)
cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg > 2:151528/1‑93 (MQ=255)
cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg > 1:1146790/1‑93 (MQ=255)
cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg > 2:3483377/1‑93 (MQ=255)
cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg < 1:3603074/93‑1 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGCCAACTCGGCTAACGGGGCACGTCCGCTGTCTAACGt > 2:4415468/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGt > 1:1953415/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGt > 1:916538/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGt > 2:458854/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGt > 1:4079913/1‑93 (MQ=255)
tCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGtt > 1:586067/1‑93 (MQ=255)
cACCGCAGTTTATTTAACAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTg > 1:3969902/1‑93 (MQ=255)
ccGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaa > 2:4852120/1‑93 (MQ=255)
ccGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaa > 2:5782617/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa > 2:2985161/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa < 2:5695705/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaaa > 1:5301016/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaaa < 1:1540419/93‑1 (MQ=255)
aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg > 1:2958944/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa < 2:1367220/93‑1 (MQ=255)
tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGGCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc > 2:6215491/1‑93 (MQ=255)
ttatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACg > 1:899091/1‑93 (MQ=255)
ttatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACg < 2:4614901/93‑1 (MQ=255)
tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCTGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 1:601536/93‑1 (MQ=255)
tttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCtt < 1:2325303/93‑1 (MQ=255)
tttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCtt < 2:3133276/93‑1 (MQ=255)
tatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAt < 1:2213929/93‑1 (MQ=255)
atCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtg < 2:2144386/93‑1 (MQ=255)
tCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtgt < 2:2220163/93‑1 (MQ=255)
aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgc > 2:107937/1‑93 (MQ=255)
aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgc > 1:5058358/1‑93 (MQ=255)
aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGGgc < 2:2525502/93‑1 (MQ=255)
ggCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgct > 1:4745036/1‑93 (MQ=255)
ggCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgct < 1:2725973/93‑1 (MQ=255)
acaGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggc > 2:1940500/1‑93 (MQ=255)
caGCGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggct < 1:2396959/93‑1 (MQ=255)
agagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggctg < 1:5014258/93‑1 (MQ=255)
gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa < 1:1277239/93‑1 (MQ=255)
gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa > 2:5524226/1‑93 (MQ=255)
gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa > 1:1029578/1‑93 (MQ=255)
agCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGaa > 1:2164788/1‑93 (MQ=255)
gCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAg > 2:2422792/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGt < 2:2249915/93‑1 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGGAGGTc > 2:2713855/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc > 2:5912950/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc < 2:5440817/93‑1 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc < 2:1966727/93‑1 (MQ=255)
cTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaa > 2:505237/1‑93 (MQ=255)
tGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaaa > 1:5558153/1‑93 (MQ=255)
gACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaaaa > 1:5374607/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAAc < 2:3860112/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAAc > 1:4114574/1‑93 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCCAAACGAACt > 2:5357841/1‑93 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACt < 1:5118502/93‑1 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACt < 1:1406269/93‑1 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACt < 1:1912011/93‑1 (MQ=255)
gTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGc < 1:5234337/93‑1 (MQ=255)
gTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGc < 1:1791742/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCa > 2:3225065/1‑93 (MQ=255)
tGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCa < 2:1831448/93‑1 (MQ=255)
tGATCGCCGGCAGAACCCTGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATACCGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGACTGACGGTCAAAACGCACTGCa < 2:3634409/93‑1 (MQ=255)
gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg > 1:4832772/1‑93 (MQ=255)
gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg > 1:5494487/1‑93 (MQ=255)
gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg < 1:3878972/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAggg > 1:1340408/1‑92 (MQ=255)
ggCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTg < 2:4119612/93‑1 (MQ=255)
cGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGa < 1:4686636/93‑1 (MQ=255)
cGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGa > 2:3393716/1‑93 (MQ=255)
ggACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAt > 2:5191065/1‑93 (MQ=255)
ggACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAt > 1:1719601/1‑93 (MQ=255)
|
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > NC_000913/3882977‑3883156
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG > NC_000913/3882974‑3883160
|
GCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGAC < SRR4302533.4278381/94‑1 (MQ=60)
CTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACA > SRR4302533.3363339/1‑94 (MQ=60)
ACTCTCCCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCC < SRR4302533.5074683/94‑1 (MQ=60)
ACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCC > SRR4302533.1257502/1‑94 (MQ=60)
ACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCC < SRR4302533.3362142/94‑1 (MQ=60)
CTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGTGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCG > SRR4302533.4480680/1‑94 (MQ=60)
CTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCG < SRR4302533.3208284/94‑1 (MQ=60)
CTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACACCCCGGC > SRR4302533.1934781/1‑94 (MQ=60)
CTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGC > SRR4302533.6304016/1‑94 (MQ=60)
CTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGC > SRR4302533.3800763/1‑94 (MQ=60)
TACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCGCAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCT > SRR4302533.1831167/1‑94 (MQ=60)
TACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCT < SRR4302533.235557/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTA < SRR4302533.1383278/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTA > SRR4302533.5395432/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAA < SRR4302533.696264/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAA < SRR4302533.5666807/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAC > SRR4302533.3462075/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAC < SRR4302533.4399627/94‑1 (MQ=60)
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CAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACG > SRR4302533.2226925/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACG < SRR4302533.2751855/94‑1 (MQ=60)
AGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGG > SRR4302533.2176618/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCC > SRR4302533.3550254/1‑94 (MQ=60)
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CGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCC > SRR4302533.4607785/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCG > SRR4302533.676124/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGC > SRR4302533.6096056/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGC < SRR4302533.6146856/94‑1 (MQ=60)
TCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCG < SRR4302533.3141048/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTC > SRR4302533.4319451/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCG > SRR4302533.905153/1‑94 (MQ=60)
GTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGGGTCCGATG > SRR4302533.4129859/1‑94 (MQ=60)
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TGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTA > SRR4302533.5327961/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTA > SRR4302533.6237654/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTA > SRR4302533.120428/1‑94 (MQ=60)
GAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATA < SRR4302533.529277/94‑1 (MQ=60)
GAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATA < SRR4302533.1233014/94‑1 (MQ=60)
AACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAC < SRR4302533.4100666/94‑1 (MQ=60)
AACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAC < SRR4302533.1748606/94‑1 (MQ=60)
AACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAC < SRR4302533.3509652/94‑1 (MQ=60)
ACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACG > SRR4302533.1153635/1‑94 (MQ=60)
ACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACG < SRR4302533.1337554/94‑1 (MQ=60)
CTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGT < SRR4302533.3625249/94‑1 (MQ=60)
CTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGT > SRR4302533.1888795/1‑94 (MQ=60)
CTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGT > SRR4302533.1965320/1‑94 (MQ=60)
CTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGT > SRR4302533.4104749/1‑94 (MQ=60)
CTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGT > SRR4302533.921923/1‑94 (MQ=60)
TTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTT < SRR4302533.4697858/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTT > SRR4302533.589524/1‑94 (MQ=60)
TCACCGCAGTTTATTTAACAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTG > SRR4302533.3994079/1‑94 (MQ=60)
ACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAA > SRR4302533.138444/1‑94 (MQ=60)
ACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAA > SRR4302533.4251836/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAA > SRR4302533.4321264/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAA > SRR4302533.2950023/1‑94 (MQ=60)
GCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAA > SRR4302533.5332774/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG > SRR4302533.2552735/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG < SRR4302533.5307305/94‑1 (MQ=60)
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GTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAC < SRR4302533.3593031/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAC > SRR4302533.5203236/1‑94 (MQ=60)
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TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT > SRR4302533.4345000/1‑94 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302533.5047805/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302533.4798586/94‑1 (MQ=60)
TATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATG < SRR4302533.2227588/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGT < SRR4302533.2517061/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTG < SRR4302533.668529/94‑1 (MQ=60)
CAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGC > SRR4302533.5088925/1‑94 (MQ=60)
AGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCT > SRR4302533.4773805/1‑94 (MQ=60)
GGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTG < SRR4302533.2742693/94‑1 (MQ=60)
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CAGCGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTG < SRR4302533.2411755/94‑1 (MQ=60)
CAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTG > SRR4302533.294594/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA < SRR4302533.5044638/94‑1 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA > SRR4302533.1039317/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA > SRR4302533.1035629/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAA < SRR4302533.1284915/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAA > SRR4302533.2178105/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGGAG > SRR4302533.4744405/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAG > SRR4302533.4763433/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAG < SRR4302533.5264572/94‑1 (MQ=60)
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GGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTC > SRR4302533.1276239/1‑94 (MQ=60)
CTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAA > SRR4302533.5591743/1‑94 (MQ=60)
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GACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAAG > SRR4302533.1931739/1‑94 (MQ=60)
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TGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAG > SRR4302533.4862062/1‑94 (MQ=60)
GATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGG < SRR4302533.3902642/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGT < SRR4302533.2294516/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGG > SRR4302533.1348476/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTGATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGT < SRR4302533.3707876/94‑1 (MQ=60)
TGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTG > SRR4302533.1642065/1‑94 (MQ=60)
GGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGC < SRR4302533.5148067/94‑1 (MQ=60)
GGCACGGACAACCCGGCTAACGTCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGCTCAAAACGAACTGCAGGTGC < SRR4302533.5857607/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCC > SRR4302533.815691/1‑94 (MQ=60)
CCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGA > SRR4302533.1588/1‑94 (MQ=60)
CGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > SRR4302533.1730026/1‑94 (MQ=60)
CGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT < SRR4302533.4715030/94‑1 (MQ=60)
GGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATG > SRR4302533.4734948/1‑94 (MQ=60)
GGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATG > SRR4302533.5930949/1‑94 (MQ=60)
GGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATG > SRR4302533.2548297/1‑94 (MQ=60)
GACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA > SRR4302533.1659703/1‑94 (MQ=60)
GACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA < SRR4302533.1528337/94‑1 (MQ=60)
GACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA < SRR4302533.5556873/94‑1 (MQ=60)
GACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA < SRR4302533.3308772/94‑1 (MQ=60)
ACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGAC > SRR4302533.1795756/1‑94 (MQ=60)
ACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGAC < SRR4302533.5476221/94‑1 (MQ=60)
CAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG < SRR4302533.4725390/94‑1 (MQ=60)
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GCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG > NC_000913/3882974‑3883160
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
