Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
647 |
270.1 |
21258240 |
98.4% |
20918108 |
94.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,950,557 |
2 bp→GC |
coding (451‑452/930 nt) |
ilvE → |
branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,950,557 | 0 | C | G | 99.8%
| 1806.4
/ NA
| 515 | R151A (CGA→GCA) | ilvE | branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (241/273); minor base T (0/1); total (241/274) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | NC_000913 | 3,950,558 | 0 | G | C | 99.8%
| 1773.8
/ ‑5.0
| 515 | R151A (CGA→GCA) | ilvE | branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (241/273); minor base T (0/1); total (241/274) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.61e-01 |
Only 100 of 531 total aligned reads displayed.
TATCGCTGCTTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCACGACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTA > NC_000913/3950469‑3950645
||
tgcGCTGCTTTCCCGTGGGGTTTTTACCTTGGCGCAGAAGCGCTGGAGCTGGGTATCGATTCGTTGTGTTCCTCCTGGAACTGCGCAGCACCaa > 1:8050249/3‑94 (MQ=255)
aTCGCTGCTTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCaa > 2:8520055/1‑94 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCCGTGGGGCGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCaaaa > 1:8834873/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCTTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAac < 2:450657/94‑1 (MQ=255)
ctgctTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAacac > 2:1425423/1‑94 (MQ=255)
ctgctTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAacac > 1:4134602/1‑94 (MQ=255)
ttctTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGTAGCACCacacacg > 1:2117877/3‑93 (MQ=255)
tgctTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACAcc > 2:10476634/1‑94 (MQ=255)
ctTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCAt > 1:5792599/1‑94 (MQ=255)
tttCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATc < 2:7395456/94‑1 (MQ=255)
tCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATccc < 1:4989490/94‑1 (MQ=255)
tCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCACCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATccc < 1:3406230/94‑1 (MQ=255)
cccGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCg < 1:6629781/94‑1 (MQ=255)
ccGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGa > 2:9860514/1‑94 (MQ=255)
ccGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGa < 1:1448269/94‑1 (MQ=255)
cGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAc < 1:6786276/94‑1 (MQ=255)
gTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcg < 2:2163832/94‑1 (MQ=255)
gTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcg < 1:197418/94‑1 (MQ=255)
gTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcg > 2:3142171/1‑94 (MQ=255)
tGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGGAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcgg < 2:3837373/94‑1 (MQ=255)
tGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcgg < 1:10459898/94‑1 (MQ=255)
ggggAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcggc > 1:1892247/1‑94 (MQ=255)
gggAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGAcggcg < 1:3156040/94‑1 (MQ=255)
gAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACggcggc < 1:6963855/94‑1 (MQ=255)
gAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACggcggc < 1:10369503/94‑1 (MQ=255)
cGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCaaa < 2:5426270/94‑1 (MQ=255)
cGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCaaa > 2:5767048/1‑94 (MQ=255)
gTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCaaaa < 1:9826059/94‑1 (MQ=255)
gTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCaaaa > 1:4022409/1‑94 (MQ=255)
gTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCaaaa < 2:4640915/94‑1 (MQ=255)
tATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAg < 1:2541367/94‑1 (MQ=255)
tATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAg < 1:7077476/94‑1 (MQ=255)
aTCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGc < 1:5113377/94‑1 (MQ=255)
aTCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGc > 2:1215271/1‑94 (MQ=255)
tCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGcc < 1:7923348/94‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCg > 1:5297185/1‑94 (MQ=255)
cTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCg < 2:5974743/94‑1 (MQ=255)
tGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCgg < 1:5414991/94‑1 (MQ=255)
ggCGCCGATGCGCTGGCGCGGCGGATCGGTGCGATGCTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCCCCAAACACCAGCCCGACGGCGGCAAAAGCCggtg < 2:9074699/94‑1 (MQ=255)
cgcAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCggtggt < 2:3993944/94‑1 (MQ=255)
cgcAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCggtggt < 2:4284055/94‑1 (MQ=255)
gcAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTa < 2:2261263/94‑1 (MQ=255)
aGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAAAACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAAc > 1:2698858/1‑94 (MQ=255)
aaGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCTCGCAGCACCAAACACCATCCCGGCGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTa < 1:9206532/94‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTAcc < 1:7410862/94‑1 (MQ=255)
cgcTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACct < 1:10125915/94‑1 (MQ=255)
gcTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctc > 2:7325737/1‑94 (MQ=255)
cTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctct > 2:4760968/1‑94 (MQ=255)
cTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctct < 1:4086361/94‑1 (MQ=255)
cTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctct > 1:5738743/1‑94 (MQ=255)
tGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctctc < 2:5197196/94‑1 (MQ=255)
tGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctctc > 1:6206976/1‑94 (MQ=255)
ggAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctctct < 2:9361339/94‑1 (MQ=255)
ggAGCAGGGGATCGATGCCATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACctctct < 2:1683174/94‑1 (MQ=255)
aGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTc > 2:6137360/1‑94 (MQ=255)
cAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTccc < 1:832412/94‑1 (MQ=255)
cAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTccc < 1:2823752/94‑1 (MQ=255)
aGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCCCCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGGGGAAACTACCTCTCTTCCct > 2:2796740/1‑94 (MQ=255)
aGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCct < 2:2671932/94‑1 (MQ=255)
ggggATCGATGCGATGGTTTCCTGCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctg < 1:7589855/94‑1 (MQ=255)
gggATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgc > 2:2948317/1‑94 (MQ=255)
ggATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgct < 1:10030094/94‑1 (MQ=255)
ggATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgct < 1:7747648/94‑1 (MQ=255)
ggATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgct < 2:10028237/94‑1 (MQ=255)
ggATCGATGCGATGGTGTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgct < 2:7588571/94‑1 (MQ=255)
gATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCctgctg > 1:7524346/1‑94 (MQ=255)
gatgcgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCtggtgg < 2:8341579/94‑1 (MQ=255)
atgcgatgGTTTCCTCCTGTAACCGTGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTggg > 1:3754785/1‑94 (MQ=255)
tgcgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGt < 1:2221066/94‑1 (MQ=255)
gctatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCATCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTa < 1:3050757/91‑1 (MQ=255)
gcgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTa > 1:3544158/1‑94 (MQ=255)
gcgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTa > 2:967542/1‑94 (MQ=255)
gcgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTa > 1:1282409/1‑94 (MQ=255)
cgatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAg > 2:2370127/1‑94 (MQ=255)
gatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGc > 1:903720/1‑94 (MQ=255)
gatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGc > 2:6439661/1‑94 (MQ=255)
gatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGc > 2:792300/1‑94 (MQ=255)
gatgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGc < 2:8829710/94‑1 (MQ=255)
atgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCg < 2:6244739/94‑1 (MQ=255)
atgGTTGCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCg < 2:3304744/94‑1 (MQ=255)
tgGTTTCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGa < 1:9630693/94‑1 (MQ=255)
tttCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgc > 2:4835519/1‑94 (MQ=255)
ttCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgcg < 2:773746/94‑1 (MQ=255)
ttCCTCCTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgcg < 1:9499238/94‑1 (MQ=255)
tcctccTGGAACCGCGCAGCACCAACCACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgcgc < 1:1087621/94‑1 (MQ=255)
tcctccTGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgcgc > 1:4469846/1‑94 (MQ=255)
ctcctGGATCCGCGCAGCAACAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAgcgcgc < 1:5634450/94‑1 (MQ=255)
tcctGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGcgcc < 2:7200223/94‑1 (MQ=255)
cctGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGGAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGcgccg > 2:10103719/1‑94 (MQ=255)
tGGAACCGCGCAGCACCAAACGCCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCgccgcc < 1:5171513/94‑1 (MQ=255)
tGGAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCgccgcc > 2:3688306/1‑94 (MQ=255)
ggAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCa < 2:8628619/94‑1 (MQ=255)
ggAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCa > 1:6375928/1‑94 (MQ=255)
ggAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCa > 1:3901663/1‑94 (MQ=255)
gAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCAc > 2:6680948/1‑94 (MQ=255)
gAACCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCAc < 1:4751380/94‑1 (MQ=255)
aaCCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACg > 2:3512368/1‑94 (MQ=255)
aCCGCGCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACgg > 2:159314/1‑94 (MQ=255)
cgcgCAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGtt < 2:1929765/94‑1 (MQ=255)
gcgcAGCACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTa < 2:8991338/94‑1 (MQ=255)
||
TATCGCTGCTTTCCCGTGGGGAGCGTATCTGGGCGCAGAAGCGCTGGAGCAGGGGATCGATGCGATGGTTTCCTCCTGGAACCGCGCACGACCAAACACCATCCCGACGGCGGCAAAAGCCGGTGGTAACTACCTCTCTTCCCTGCTGGTGGGTAGCGAAGCGCGCCGCCACGGTTA > NC_000913/3950469‑3950645
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 219 total aligned reads displayed.
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑G‑‑C‑‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGT > NC_000913/3951074‑3951250
|
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGGGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑C < SRR4302545.7689047/94‑1 (MQ=60)
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑C < SRR4302545.5203059/94‑1 (MQ=60)
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑C < SRR4302545.1078838/94‑1 (MQ=60)
AGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcg < SRR4302545.8566752/94‑3 (MQ=60)
AGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcg < SRR4302545.9067874/94‑3 (MQ=60)
ACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcg < SRR4302545.2210318/94‑5 (MQ=60)
CAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgc < SRR4302545.4546507/94‑6 (MQ=60)
AGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcc < SRR4302545.3766683/94‑7 (MQ=60)
AGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcc < SRR4302545.10759013/94‑7 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcca < SRR4302545.5080509/94‑8 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcca < SRR4302545.7676041/94‑8 (MQ=60)
GACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccc > SRR4302545.6658717/1‑88 (MQ=60)
ACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcggccc > SRR4302545.5657704/1‑87 (MQ=60)
CACTGGGATTAAATAAAGTATGCCTAAATACCTTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATACGGCGGGTGCTCGTTCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacc < SRR4302545.10511198/94‑10 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTGCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacc < SRR4302545.4228622/94‑10 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacc < SRR4302545.7288103/94‑10 (MQ=60)
CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacc < SRR4302545.5263802/94‑10 (MQ=60)
ACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccaccg < SRR4302545.1475107/94‑11 (MQ=60)
ACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccaccg > SRR4302545.1131238/1‑85 (MQ=60)
AGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGA < SRR4302545.713496/94‑1 (MQ=60)
GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGAC < SRR4302545.10588339/94‑1 (MQ=60)
TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACC < SRR4302545.5932190/94‑1 (MQ=60)
TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACC < SRR4302545.3227433/94‑1 (MQ=60)
TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcccccgggatgacc > SRR4302545.8458544/1‑76 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgggcccccgggatgaccg > SRR4302545.6660627/1‑75 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggatgaccc > SRR4302545.10524387/1‑76 (MQ=60)
AATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CCGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgcccccgggatgaccca > SRR4302545.1109694/1‑75 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGAC < SRR4302545.7001334/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGAC < SRR4302545.10724970/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGAC < SRR4302545.6924785/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACG < SRR4302545.7424979/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACG < SRR4302545.598940/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACG < SRR4302545.5030582/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACG < SRR4302545.1453437/94‑1 (MQ=60)
AAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGC < SRR4302545.8179694/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302545.9542178/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302545.1476299/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCC < SRR4302545.7575471/94‑1 (MQ=60)
AGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCG < SRR4302545.6773983/94‑1 (MQ=60)
GTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacccggatgacccacccccg > SRR4302545.3879357/1‑68 (MQ=60)
GTATGCCGAAATCCCGGTCCGCCACCGCCACGCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccgccggaaggagcggcgccga < SRR4302545.9475075/94‑27 (MQ=35)
TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAT < SRR4302545.8198427/94‑1 (MQ=60)
TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAT < SRR4302545.6859900/94‑1 (MQ=60)
TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacccggatgaccgacgcccct > SRR4302545.6326026/1‑67 (MQ=60)
GATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGAATGACCGACGCCGAT < SRR4302545.7520604/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302545.9783357/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302545.8359839/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302545.967284/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302545.3325785/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCGCGTGCG‑GTGTG‑‑‑‑Gcgcgccgccgggatggacaacccccaat > SRR4302545.478947/1‑66 (MQ=60)
TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTT < SRR4302545.9427933/94‑1 (MQ=60)
TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGGG‑‑‑‑G‑‑‑GGCG‑‑‑C‑‑CACCGGCATGAACGACGCCGATTT > SRR4302545.9039208/1‑94 (MQ=60)
TGCCTAAGTACCGTCCCCCCACCACCTCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTT < SRR4302545.3872031/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < SRR4302545.5461728/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CCGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccacccgaatgaacgaggccggtgtc > SRR4302545.7142954/1‑65 (MQ=60)
GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGATGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTC > SRR4302545.10873710/1‑94 (MQ=60)
CCTAAGTCCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTCATGTGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302545.9692913/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGCATGACCGACCCCGCTTTCG > SRR4302545.9426990/1‑94 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGAATGACCGACGCCGCTTTCG > SRR4302545.5522655/1‑94 (MQ=60)
CTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGG < SRR4302545.6214005/94‑1 (MQ=60)
CTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGG < SRR4302545.208817/94‑1 (MQ=60)
CTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CCGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggaagaacggacccgcgtttcg > SRR4302545.8586511/1‑63 (MQ=60)
TAAGTACCTTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTCCTCGTGCG‑CTG‑G‑‑‑‑G‑‑‑G‑‑CGCGC‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < SRR4302545.7245803/94‑1 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < SRR4302545.2068840/94‑1 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcggcccccggatgaacgcaccccatttcggt > SRR4302545.10780187/1‑62 (MQ=60)
TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGAACGCCGCCGCTTTCGGT > SRR4302545.5305823/1‑94 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgcccccgggatgaccgccccccatttctgta > SRR4302545.9051861/1‑61 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCCTGGG‑‑‑‑G‑‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCCGAAGGACCGACGCCGATTTTGGTA > SRR4302545.6072653/1‑94 (MQ=60)
AAGTACCGTTCAGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcggcaccggcatgaccgaccccgctttctgta > SRR4302545.1214863/1‑60 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302545.1057460/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302545.9556991/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302545.882002/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302545.10144672/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302545.4782024/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302545.3595911/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302545.4245330/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302545.1307208/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCGCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gagggccccccggaagaacgacccccgtttcgtgcag > SRR4302545.4066932/1‑58 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302545.8011287/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302545.3062427/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302545.7731463/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302545.8904056/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302545.2582170/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccccccgaaagaaacacccccatttcttgaaag > SRR4302545.2328263/1‑57 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGGGCG‑CTGTGGCGCG‑‑‑G‑‑C‑‑‑C‑‑‑‑CCGGGATGAACGACGCCGCTTTCGGTCAGCC > SRR4302545.10647693/1‑94 (MQ=36)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGGATGACCGACGCCGATTTTCGTAAGCCG > SRR4302545.9557186/1‑94 (MQ=60)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCG < SRR4302545.9812213/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccaccgggatgaccgccccccattttcggaaggcg > SRR4302545.2359507/1‑56 (MQ=60)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcggggcaccggaatgaacgacgccccattcggtgaggcg > SRR4302545.6002388/1‑55 (MQ=60)
CCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcggcccccggatgaccgacgcccatttctggaagccg > SRR4302545.2908377/1‑56 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACTGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAT < SRR4302545.9948348/94‑1 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAT < SRR4302545.6301304/94‑1 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccacccggatgaacgcccccgatttcggtaagccgct > SRR4302545.1411763/1‑54 (MQ=60)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑GGCG‑‑‑C‑‑CACCGGAAAGACCGGCACCCATTTCGGGAAGCCGAT > SRR4302545.4947352/1‑94 (MQ=42)
GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CCGTG‑‑‑‑GGGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCCGAATGAACCACGCCCATTTTGGTAAGCCGAT > SRR4302545.2174519/1‑94 (MQ=42)
TCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTGGCGCG‑‑‑G‑‑C‑‑‑C‑‑‑‑CCGGAATGACCGAAGCCGCTTTCGGTGAGCCGATTT > SRR4302545.6669365/1‑94 (MQ=60)
TCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < SRR4302545.7725069/94‑1 (MQ=60)
TCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < SRR4302545.959364/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < SRR4302545.3161054/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGGATGACCGACGCCGcttttcgtaagccgcatat > SRR4302545.6271461/1‑75 (MQ=57)
CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < SRR4302545.4262800/94‑1 (MQ=60)
CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < SRR4302545.5427447/94‑1 (MQ=60)
CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GGGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGAATGACCGACGCCGATTTTGGGAAGCCGACTATC > SRR4302545.3626361/1‑94 (MQ=60)
GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCG < SRR4302545.9280176/94‑1 (MQ=60)
GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCCGGATGACCGACGCCGATTTttgtaaagcgaatatcc > SRR4302545.7491857/1‑77 (MQ=55)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < SRR4302545.2661387/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < SRR4302545.8585301/94‑1 (MQ=60)
CCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGGGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑GGCG‑‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGCCGCCCGGTTCCGTAAGCCGAGTATCGC > SRR4302545.4135924/1‑94 (MQ=46)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG < SRR4302545.8472653/94‑1 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgcccccgggatgaccgccgcccagttttgtgagccggttttctcg > SRR4302545.6102506/1‑46 (MQ=60)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGG < SRR4302545.8151867/94‑1 (MQ=60)
ACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GGGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGAATGACCCACCCCGATTTCGGTAAGCCCATTATCGCGG > SRR4302545.9416810/1‑94 (MQ=55)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.2146967/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.8592372/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.1419301/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.8912784/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.3737502/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTACG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑C‑‑G‑‑‑CGACACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302545.7513708/94‑1 (MQ=60)
CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < SRR4302545.3847017/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < SRR4302545.2806493/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < SRR4302545.1305965/94‑1 (MQ=60)
ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCCCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GGGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCGGGAAGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGA > SRR4302545.10087931/1‑94 (MQ=60)
ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccacccggatgaaccacccccatttttgtaagccgattattgcgggtgtgg > SRR4302545.6844045/1‑40 (MQ=54)
ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCCGAAAGACCGACGCCGAATTTGGTAAGCCGAATATCGCGCGTGTGA > SRR4302545.9444935/1‑94 (MQ=21)
CTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < SRR4302545.6994618/94‑1 (MQ=60)
CTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑Gcgcgccacccggaagaccgcggcccagttctgtgagccgattatctcgggtgtgaa > SRR4302545.6754153/1‑38 (MQ=60)
TCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CGCCGGGATGAACGACGCCGATTTTGGGAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAAA > SRR4302545.6096206/1‑94 (MQ=38)
CATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGGGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcggcaccgggatgaccgccccccagttctggtaggcgattatcgggggtgtggaat > SRR4302545.5905946/1‑37 (MQ=60)
ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < SRR4302545.3442509/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑Ggcgccccccggatgaccgcccccggcttcggtaagaccattttttcgggttgggaatc > SRR4302545.6325767/1‑36 (MQ=60)
TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCG < SRR4302545.3947254/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑CCCCGG‑ATGACCGACGCCGATTTCGGTGAGCCGATTATCGCGGGTGTGAACTCGT > SRR4302545.4154362/1‑94 (MQ=60)
GTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTT < SRR4302545.9891679/94‑1 (MQ=60)
TCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTC < SRR4302545.962494/94‑1 (MQ=60)
TCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTC < SRR4302545.1402498/94‑1 (MQ=60)
TCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTC < SRR4302545.10315485/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGGG‑CTGTG‑‑‑‑GCGCG‑‑C‑‑‑C‑‑C‑CCCGAAAGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGCTTATCTCGGGTGTGAAattcttca > SRR4302545.586769/1‑86 (MQ=30)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302545.158556/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302545.110954/94‑1 (MQ=60)
GTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAC < SRR4302545.199949/94‑1 (MQ=60)
CTAATATGGCGGGTCCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CA‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAC < SRR4302545.4216977/94‑1 (MQ=60)
AATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCC < SRR4302545.7283202/94‑1 (MQ=60)
AATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCC < SRR4302545.3981266/94‑1 (MQ=60)
ATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCA > SRR4302545.9960186/1‑94 (MQ=60)
ATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCA < SRR4302545.52707/94‑1 (MQ=60)
ATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCA < SRR4302545.6741944/94‑1 (MQ=60)
ATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCA < SRR4302545.407624/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAT < SRR4302545.5096837/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAT < SRR4302545.10501879/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAT > SRR4302545.614093/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT < SRR4302545.9810387/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT > SRR4302545.9008667/1‑94 (MQ=60)
GGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTT < SRR4302545.9358530/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTT < SRR4302545.325508/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTT < SRR4302545.2784240/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTT < SRR4302545.9908551/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTG > SRR4302545.8158833/1‑94 (MQ=60)
GCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTG < SRR4302545.2503967/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTG < SRR4302545.8407537/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGCTCACCCAATTTG < SRR4302545.4162377/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGCTCGTGCG‑CTGTGAC‑‑G‑‑‑C‑‑G‑‑‑C‑‑CACCGGCGTGACCGACGCCGATTTCGGTCTGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCATTCACCCAATTTGT < SRR4302545.9635602/94‑1 (MQ=53)
CGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTTACCCAATTTGT > SRR4302545.10077874/1‑94 (MQ=60)
CGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCTAATTTGT > SRR4302545.10077873/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTC > SRR4302545.2762447/1‑94 (MQ=60)
GGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTA < SRR4302545.4340334/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTA > SRR4302545.1673459/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAC > SRR4302545.4171229/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAC < SRR4302545.5529272/94‑1 (MQ=60)
GTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC > SRR4302545.2435580/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302545.6587208/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCTCACAATTTGTTCCG < SRR4302545.4849489/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302545.1012195/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG > SRR4302545.2225342/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG < SRR4302545.6276713/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCG > SRR4302545.8784239/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGG > SRR4302545.5588864/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGG > SRR4302545.9907621/1‑94 (MQ=60)
GCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑C‑‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTGCCGGG < SRR4302545.7556166/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302545.298215/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302545.2467608/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG > SRR4302545.4242736/1‑94 (MQ=60)
TCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGT < SRR4302545.7351854/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGT > SRR4302545.6035636/1‑94 (MQ=60)
TCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGT < SRR4302545.5603900/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCTATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302545.1761149/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302545.1863468/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302545.1863469/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302545.831928/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302545.2901282/94‑1 (MQ=60)
CGTGCG‑CTG‑G‑‑‑‑G‑‑‑G‑‑CGCGC‑‑CACCGGAATGACCGACGGCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGAGAACTCGTTCACCAAATTTGgacaggggc > SRR4302545.5620443/1‑85 (MQ=60)
GTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CGCCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAACGGGTCA > SRR4302545.5765117/1‑94 (MQ=60)
GTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA > SRR4302545.8443986/1‑94 (MQ=60)
GTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA < SRR4302545.8393158/94‑1 (MQ=60)
GTGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA < SRR4302545.1215350/94‑1 (MQ=60)
TGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC < SRR4302545.10879575/94‑1 (MQ=60)
TGCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCCGTAAGCCGATTATTGCGGTTGTGAGCTCGTTCTCTCAATGTGTACCGGGACAC > SRR4302545.171092/1‑94 (MQ=46)
GCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG < SRR4302545.10761574/94‑1 (MQ=60)
GCG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACG < SRR4302545.1724701/94‑1 (MQ=60)
CG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGT > SRR4302545.7179637/1‑94 (MQ=60)
CG‑CTGTG‑‑‑‑GC‑‑G‑‑CG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGC > SRR4302545.8184594/1‑94 (MQ=60)
|
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑CTGTG‑‑‑‑G‑‑‑G‑‑C‑‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGT > NC_000913/3951074‑3951250
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
