Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,677 |
+G |
intergenic (+175/‑264) |
kup → / → rbsD |
low affinity potassium transport system/RbsD |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.6%
| 1964.8
/ ‑4.5
| 502 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base G (251/249); minor base T (2/0); total (253/249) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 569 total aligned reads displayed.
AACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > NC_000913/3930581‑3930766
|
aCGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑g < 1:11095883/96‑1 (MQ=255)
cGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑gg < 1:11593011/96‑2 (MQ=255)
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc < 1:10447776/96‑3 (MQ=255)
tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggca > 2:14152628/1‑93 (MQ=255)
agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGGCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACATCCTTCTTTATGTCGCATGATTCGTTGATCCTC‑ggcaa > 2:4028419/1‑92 (MQ=255)
aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc > 1:5926632/1‑96 (MQ=255)
aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc < 2:812806/96‑1 (MQ=255)
aagaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAc < 1:12457834/96‑1 (MQ=255)
agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACg < 1:5214414/96‑1 (MQ=255)
gaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGc > 2:5474347/1‑96 (MQ=255)
gaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGc > 2:2243921/1‑96 (MQ=255)
aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGcc < 1:1232027/96‑1 (MQ=255)
aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGcc < 1:1803853/96‑1 (MQ=255)
agTTTTCCCCCGCTGCGGTCTGGAATTATTAAGTTGCCGGATGATGGAATCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGccc < 1:1518596/96‑1 (MQ=255)
agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAAACGccc > 1:9856914/1‑96 (MQ=255)
gatttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCg > 1:10718985/3‑96 (MQ=255)
tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg > 2:8793525/1‑96 (MQ=255)
tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:13993776/96‑1 (MQ=255)
tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:13150358/96‑1 (MQ=255)
ttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTgg > 2:10244615/1‑96 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAt < 2:2404391/96‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAt < 2:5820905/96‑1 (MQ=255)
ccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAttt < 2:6203444/96‑1 (MQ=255)
cGCTGCGGTCTGGAAGGGTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:1395888/1‑96 (MQ=255)
cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:13364420/1‑96 (MQ=255)
gatGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCGTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGc > 1:3068264/3‑96 (MQ=255)
gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc > 1:2330002/1‑96 (MQ=255)
gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc < 1:5531979/96‑1 (MQ=255)
gCTACGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc > 2:12593108/1‑96 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAGCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc < 2:12324480/96‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc > 2:4497737/1‑96 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc > 1:5023644/1‑96 (MQ=255)
cgttCTGGAATGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:4192394/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt < 1:4534868/96‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc > 1:6257108/1‑96 (MQ=255)
tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 1:468052/1‑96 (MQ=255)
cTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc < 2:776975/96‑1 (MQ=255)
tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg < 1:8675020/96‑1 (MQ=255)
gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc < 1:1003156/96‑1 (MQ=255)
acggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 1:11668955/3‑96 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 2:910736/1‑96 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa > 1:255485/1‑96 (MQ=255)
aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa < 1:14122144/96‑1 (MQ=255)
aGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 2:3369254/96‑1 (MQ=255)
ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAg < 1:2001217/96‑1 (MQ=255)
gATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc > 2:600554/1‑96 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 1:13218917/1‑96 (MQ=255)
aTTAAGGTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 2:13691865/1‑96 (MQ=255)
tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 2:290561/1‑96 (MQ=255)
tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 2:4975543/96‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 1:13761004/96‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:1281292/96‑1 (MQ=255)
aGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:9759492/96‑1 (MQ=255)
ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 1:10244615/96‑1 (MQ=255)
tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtg > 2:8583267/1‑96 (MQ=255)
gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:12017945/1‑96 (MQ=255)
ccGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:6581522/96‑1 (MQ=255)
cGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg > 2:5321529/1‑96 (MQ=255)
ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 2:8336395/96‑1 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 2:6710747/1‑96 (MQ=255)
attatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg < 1:9267485/93‑1 (MQ=255)
atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg > 2:1905894/1‑96 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 2:5117770/96‑1 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:3152673/1‑96 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 1:5701301/96‑1 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 1:4407008/96‑1 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa < 2:7488619/96‑1 (MQ=255)
tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 1:12992219/1‑96 (MQ=255)
tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 2:9464150/1‑96 (MQ=255)
tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 2:10655056/1‑96 (MQ=255)
gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt > 1:13570359/1‑96 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCTG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 1:334746/1‑96 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa > 2:1583389/1‑96 (MQ=255)
atcctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 1:7774976/3‑96 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTTCTGCAACGTAAt > 1:3903698/1‑96 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:14295287/96‑1 (MQ=255)
aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGGCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 2:11889389/1‑96 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg < 2:3601946/96‑1 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 1:5298997/1‑96 (MQ=255)
ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:14338591/96‑1 (MQ=255)
cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc > 2:7180869/1‑96 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 1:3737096/96‑1 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTGATGCGCt > 1:7626618/1‑96 (MQ=255)
ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTg > 2:10796218/1‑96 (MQ=255)
tATGGCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc < 2:6905918/96‑1 (MQ=255)
tctCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAc > 1:6830899/3‑96 (MQ=255)
tCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa < 2:468052/96‑1 (MQ=255)
cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 1:8784130/96‑1 (MQ=255)
cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 1:9677242/1‑96 (MQ=255)
cGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 2:12228036/1‑96 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGac < 1:11271356/96‑2 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt > 1:492771/1‑96 (MQ=255)
aTGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATc < 2:5551683/96‑1 (MQ=255)
gTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAGtt > 1:8161637/1‑96 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt < 1:8504709/96‑1 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt < 2:11617273/96‑1 (MQ=255)
gTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 2:11764950/1‑96 (MQ=255)
gATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAAt > 1:7207342/1‑96 (MQ=255)
aTCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATc > 2:10986809/1‑96 (MQ=255)
tCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATcc < 2:13459025/96‑1 (MQ=255)
|
AACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > NC_000913/3930581‑3930766
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 355 total aligned reads displayed.
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGG > NC_000913/3930577‑3930777
|
NNNAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G < SRR4302518.9980565/101‑1 (MQ=60)
NNNAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G < SRR4302518.11614975/101‑1 (MQ=60)
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G < SRR4302518.1854820/101‑1 (MQ=60)
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G > SRR4302518.4069199/1‑101 (MQ=60)
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCNN‑N > SRR4302518.13859891/1‑101 (MQ=60)
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCNN‑N > SRR4302518.7554880/1‑101 (MQ=60)
nnnaaaGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑G < SRR4302518.13074508/95‑1 (MQ=60)
NNNACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggc < SRR4302518.10363651/101‑3 (MQ=60)
CAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTTGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑GA > SRR4302518.3326073/1‑101 (MQ=60)
CAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑N‑NN > SRR4302518.14226063/1‑101 (MQ=60)
NNNCGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggca < SRR4302518.11246986/101‑4 (MQ=60)
AAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggca < SRR4302518.1984094/101‑4 (MQ=60)
AAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggca > SRR4302518.3532316/1‑98 (MQ=60)
AACGTAGAGGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggnnn > SRR4302518.13557779/1‑97 (MQ=60)
AACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAA > SRR4302518.5481043/1‑101 (MQ=60)
NNNTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAA < SRR4302518.8183449/101‑1 (MQ=60)
ACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggcnnn > SRR4302518.14754854/1‑96 (MQ=60)
CGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAC < SRR4302518.3795221/101‑1 (MQ=60)
CGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAAC < SRR4302518.2053365/101‑1 (MQ=60)
CGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggcannn > SRR4302518.9067188/1‑95 (MQ=60)
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACG < SRR4302518.1706570/101‑1 (MQ=60)
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggcaannn > SRR4302518.13780845/1‑94 (MQ=60)
CTAGAAGAAGTTATACACCGCTGCGGACTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACG < SRR4302518.5588528/101‑1 (MQ=60)
TAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGC < SRR4302518.2827716/101‑1 (MQ=60)
TAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGC < SRR4302518.4966993/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGC < SRR4302518.13846840/101‑1 (MQ=60)
AGAAGAAGTTTTCCCCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCC < SRR4302518.1603105/101‑1 (MQ=60)
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCC < SRR4302518.6112867/101‑1 (MQ=60)
AGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggcaaacnnn > SRR4302518.14034405/1‑92 (MQ=60)
NNNGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCC < SRR4302518.8371000/101‑1 (MQ=60)
GAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGNNN > SRR4302518.13281566/1‑101 (MQ=60)
GAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCC > SRR4302518.5526554/1‑101 (MQ=60)
GAAGAAGTTTTCCACCGCCGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCC < SRR4302518.5352079/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG < SRR4302518.12921656/101‑1 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG > SRR4302518.7015186/1‑101 (MQ=60)
AACAAGTTTTCCCCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCG < SRR4302518.4227197/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGT < SRR4302518.13685051/101‑1 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGT > SRR4302518.2807128/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTG < SRR4302518.9113841/101‑1 (MQ=60)
GAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTG < SRR4302518.1164491/101‑1 (MQ=60)
NNNTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGT < SRR4302518.14129101/101‑1 (MQ=60)
AGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAAACGCCCGTNNN > SRR4302518.10328160/1‑101 (MQ=60)
NNNTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGCA < SRR4302518.11815028/101‑1 (MQ=60)
GTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGNNN > SRR4302518.9139560/1‑101 (MQ=60)
TGTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGACTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGNNN > SRR4302518.11155564/1‑101 (MQ=60)
TTTCCAACGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATT < SRR4302518.3969543/101‑1 (MQ=60)
TTCCCCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTT < SRR4302518.1063901/101‑1 (MQ=60)
TTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTT > SRR4302518.5279947/1‑101 (MQ=60)
NNNACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTG < SRR4302518.13909650/101‑1 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGC < SRR4302518.245405/101‑1 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGC < SRR4302518.5813096/101‑1 (MQ=60)
ttCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTNNN > SRR4302518.12335354/3‑101 (MQ=60)
NNNCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCG < SRR4302518.14606709/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTC < SRR4302518.8123255/101‑1 (MQ=60)
nnnaGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGCTGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302518.14841962/97‑1 (MQ=60)
NNNTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302518.8718812/101‑1 (MQ=60)
CGCTGCGTTCTGGAATGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302518.4396848/101‑1 (MQ=60)
CGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302518.4772792/101‑1 (MQ=60)
CGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302518.549628/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGTAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTG < SRR4302518.10101962/101‑1 (MQ=60)
GCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTG < SRR4302518.5992210/101‑1 (MQ=60)
GCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTG < SRR4302518.5209836/101‑1 (MQ=60)
GATGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCGTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGCGTCTG > SRR4302518.3212339/1‑101 (MQ=60)
NNNCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGC < SRR4302518.14808283/101‑1 (MQ=60)
TGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTNNN > SRR4302518.12164371/1‑101 (MQ=60)
TGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG < SRR4302518.2226778/101‑1 (MQ=60)
TGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCG > SRR4302518.141425/1‑101 (MQ=60)
CGGTGTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATTATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCG < SRR4302518.4191558/101‑1 (MQ=60)
CGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCNNN > SRR4302518.15002241/1‑101 (MQ=60)
CGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCNNN > SRR4302518.13683737/1‑101 (MQ=60)
GTTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGNNN > SRR4302518.14902750/1‑101 (MQ=60)
GGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGNNN > SRR4302518.14196155/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC < SRR4302518.15064885/101‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC < SRR4302518.7059964/101‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302518.630948/1‑101 (MQ=60)
TCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCA > SRR4302518.5833674/1‑101 (MQ=60)
TCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCA > SRR4302518.486514/1‑101 (MQ=60)
TCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCA < SRR4302518.3903137/101‑1 (MQ=60)
CTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGTCAA > SRR4302518.4782099/1‑101 (MQ=60)
CTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGCGTGTGCGCGGCAA > SRR4302518.6625798/1‑101 (MQ=60)
CAGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGNNN > SRR4302518.11322748/1‑101 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCNNN > SRR4302518.10958599/1‑101 (MQ=60)
TGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302518.2093261/101‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGC < SRR4302518.4901628/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTGTGCGCGGCAAGCT < SRR4302518.11918777/101‑1 (MQ=60)
GAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAtnnn > SRR4302518.8937601/1‑97 (MQ=60)
ACGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGNNN > SRR4302518.12218301/1‑101 (MQ=60)
AAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGNNN > SRR4302518.7591198/1‑101 (MQ=60)
AAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG < SRR4302518.4187962/101‑1 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGggcctccgcgccaagcgga > SRR4302518.4444911/1‑82 (MQ=60)
NNNTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGAA < SRR4302518.11650042/101‑1 (MQ=60)
NNNTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAC < SRR4302518.14390975/101‑1 (MQ=60)
GGTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGCATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGNNN > SRR4302518.11104778/1‑101 (MQ=60)
GATTAAGTTGCCTGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCTATCTGTAC > SRR4302518.724628/1‑101 (MQ=60)
NNNAAGTTGCCGGATGATGGACACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT < SRR4302518.10816286/101‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTttnnn > SRR4302518.13828624/1‑96 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT < SRR4302518.2664621/101‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT > SRR4302518.4554614/1‑101 (MQ=60)
TTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTG > SRR4302518.6319488/1‑101 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTG < SRR4302518.4949832/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTG < SRR4302518.13034151/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC < SRR4302518.15081999/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTAC < SRR4302518.7910564/101‑1 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGC > SRR4302518.6415748/1‑101 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT < SRR4302518.6919791/101‑1 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTNNN > SRR4302518.12731614/1‑101 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT < SRR4302518.6827457/101‑1 (MQ=60)
NNNGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTG < SRR4302518.8835176/101‑1 (MQ=60)
GTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCATTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCcgaggatcaacgactcatgcgacata < SRR4302518.5308750/101‑27 (MQ=60)
TTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGC > SRR4302518.3458364/1‑101 (MQ=60)
TGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT > SRR4302518.5415950/1‑101 (MQ=60)
NNNCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAaaccgccagcattgc < SRR4302518.9528999/101‑16 (MQ=60)
NNNCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCT < SRR4302518.12030822/101‑1 (MQ=60)
NNNGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATCAGTCGCTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTG < SRR4302518.13320401/101‑1 (MQ=60)
GCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGNNN > SRR4302518.12590484/1‑101 (MQ=60)
CCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGC < SRR4302518.2885878/101‑1 (MQ=60)
CCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGC > SRR4302518.5557360/1‑101 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA > SRR4302518.3483427/1‑101 (MQ=60)
CGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA < SRR4302518.4630747/101‑1 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302518.869116/1‑101 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCAGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGNNN > SRR4302518.10566651/1‑101 (MQ=60)
NNNGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302518.14635251/101‑1 (MQ=60)
GATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCGGCAAC > SRR4302518.4844979/1‑101 (MQ=60)
ATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG < SRR4302518.403529/101‑1 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACNNN > SRR4302518.12191146/1‑101 (MQ=60)
GATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTA > SRR4302518.2421027/1‑101 (MQ=60)
ATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGNNN > SRR4302518.10147107/1‑101 (MQ=60)
nnntaacgTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCTTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302518.12509984/93‑1 (MQ=60)
TGGCAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302518.1283387/101‑1 (MQ=60)
NNNAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302518.14539483/101‑1 (MQ=60)
NNNAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302518.11177486/101‑1 (MQ=60)
NNNAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302518.14955989/101‑1 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCActgtannn > SRR4302518.10923031/1‑93 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATG > SRR4302518.2401435/1‑101 (MQ=60)
nnncCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC < SRR4302518.11778235/97‑1 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAANNN > SRR4302518.9034503/1‑101 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC > SRR4302518.5845912/1‑101 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATNNN > SRR4302518.9464126/1‑101 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG > SRR4302518.2072149/1‑101 (MQ=60)
ATCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGNNN > SRR4302518.8168075/1‑101 (MQ=60)
NNNTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302518.8038276/101‑1 (MQ=60)
AGCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGGCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCNNN > SRR4302518.13618953/1‑101 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTTCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302518.4089523/1‑101 (MQ=60)
ACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302518.3591809/1‑101 (MQ=60)
NNNCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCCG < SRR4302518.7933567/101‑1 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTG > SRR4302518.5570981/1‑101 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGC < SRR4302518.6647412/101‑1 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGC > SRR4302518.741974/1‑101 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG > SRR4302518.5231618/1‑101 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG < SRR4302518.3359936/101‑1 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGGGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTGATGCGCTGCNNN > SRR4302518.8015590/1‑101 (MQ=60)
TTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGNNN > SRR4302518.10404254/1‑101 (MQ=60)
CTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAC > SRR4302518.3204296/1‑101 (MQ=60)
TTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACC < SRR4302518.6249338/101‑1 (MQ=60)
TATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACNNN > SRR4302518.10058177/1‑101 (MQ=60)
NNNGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG < SRR4302518.9210618/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGCGGTATTTGCGTCTGCGCGGGAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG < SRR4302518.14364107/101‑1 (MQ=60)
TCTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAT > SRR4302518.7191979/1‑101 (MQ=60)
NNNGCATGGGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC < SRR4302518.11560007/101‑1 (MQ=60)
GTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATC < SRR4302518.4731486/101‑1 (MQ=60)
TCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCA > SRR4302518.3265356/1‑101 (MQ=60)
CGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGAATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGCGCCCCAGATCAA > SRR4302518.5668716/1‑101 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT > SRR4302518.2682278/1‑101 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT > SRR4302518.512171/1‑101 (MQ=60)
NNNAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302518.8920030/101‑1 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCTCGG‑GAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGAGGTAAACTGGACTTGCTGCTGCtaggtaaggcgccgcggggaccagcacaattt > SRR4302518.1145025/1‑69 (MQ=34)
ATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAANNN > SRR4302518.10672510/1‑101 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAANNN > SRR4302518.10184982/1‑101 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302518.948227/101‑1 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302518.150195/101‑1 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATNNN > SRR4302518.10800399/1‑101 (MQ=60)
NNNGTCGTTGAGCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302518.9142322/101‑1 (MQ=60)
GAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGA < SRR4302518.4667228/101‑1 (MQ=60)
nnnattgatactcC‑G‑CAAACGCGCGTGGTATTTGCGTACGCGCGGCAAGCTGTAGTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA < SRR4302518.8656707/88‑1 (MQ=60)
AGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA < SRR4302518.325615/101‑1 (MQ=60)
GTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAGTTTGNNN > SRR4302518.8565872/1‑101 (MQ=60)
GTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGNNN > SRR4302518.9429287/1‑101 (MQ=60)
NNNGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC < SRR4302518.14575181/101‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302518.5944186/1‑101 (MQ=60)
GTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAANNN > SRR4302518.12620367/1‑101 (MQ=60)
TTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302518.6100983/1‑101 (MQ=60)
nnntcctcgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302518.12670172/92‑1 (MQ=60)
TGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCG < SRR4302518.2513863/101‑1 (MQ=60)
TGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGGATGTGCGGCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCGGCTGCAAGGTAATGCGGTGCGTGCGCCAGAcaattgtgaaatccac > SRR4302518.2943141/1‑85 (MQ=41)
GATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCNNN > SRR4302518.7585020/1‑101 (MQ=60)
nnnctcgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCA < SRR4302518.12249353/94‑1 (MQ=60)
atcctagG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > SRR4302518.3296750/8‑101 (MQ=60)
ATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCNNN > SRR4302518.13989754/1‑101 (MQ=60)
ATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC < SRR4302518.51007/101‑1 (MQ=60)
ATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC < SRR4302518.4032161/101‑1 (MQ=60)
nnngG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAA < SRR4302518.13175087/97‑1 (MQ=60)
NNN‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAATC < SRR4302518.7761665/101‑1 (MQ=60)
CTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCNNN > SRR4302518.8089980/1‑101 (MQ=60)
CTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGACTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAGCAATTAGAACTCCCGCCNNN > SRR4302518.9935646/1‑101 (MQ=60)
tcgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAAC > SRR4302518.2313414/4‑101 (MQ=60)
tcgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACCTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAAC < SRR4302518.1435657/98‑1 (MQ=60)
cgG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAANNN > SRR4302518.8223653/3‑101 (MQ=60)
G‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAG < SRR4302518.2598086/101‑1 (MQ=60)
G‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCGGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAANNN > SRR4302518.12101525/1‑101 (MQ=60)
G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGG > SRR4302518.6182405/1‑101 (MQ=60)
|
GCCAAACGTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGG > NC_000913/3930577‑3930777
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |