Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,908,031 |
T→C |
intergenic (‑5/+82) |
pstC ← / ← pstS |
PstC/PstS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,908,031 | 0 | T | C | 100.0%
| 883.0
/ NA
| 250 | intergenic (‑5/+82) | pstC/pstS | PstC/PstS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (131/119); total (131/119) |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
ATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTTACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACA > NC_000913/3907941‑3908120
|
aTCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCAc > 1:1299455/1‑93 (MQ=255)
aGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCActct > 2:5427126/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCtt > 2:4222908/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCtt > 2:6371298/1‑93 (MQ=255)
gccgccAGTTTTACCAGCACGATGAACATTATGTCACCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCa > 2:162502/1‑93 (MQ=255)
ccgctAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAg < 1:3373592/93‑1 (MQ=255)
ccgccAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAg < 2:3231883/93‑1 (MQ=255)
cgccAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGt < 1:3583076/93‑1 (MQ=255)
gccAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGtt > 2:1400401/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTaa > 2:3315395/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTaa < 1:2957508/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTaa < 1:4384722/93‑1 (MQ=255)
gTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAAc < 1:4600959/93‑1 (MQ=255)
gTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAAc > 2:669004/1‑93 (MQ=255)
cAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTa < 1:6178768/93‑1 (MQ=255)
aGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTAc < 1:3835485/93‑1 (MQ=255)
cACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACaa < 2:5043115/93‑1 (MQ=255)
cGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAg > 2:792128/1‑93 (MQ=255)
cGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAg < 1:4965964/93‑1 (MQ=255)
gCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGt > 2:3857351/1‑93 (MQ=255)
gCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGt < 1:2600312/93‑1 (MQ=255)
cTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCGCTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTc < 2:2890462/93‑1 (MQ=255)
cTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTc > 1:2316311/1‑93 (MQ=255)
gAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAt < 2:2392872/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAtt < 1:2485116/93‑1 (MQ=255)
aaaTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAttt > 1:5864683/1‑93 (MQ=255)
aaTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAtttt > 2:348189/1‑93 (MQ=255)
aaTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAtttt > 2:3740355/1‑93 (MQ=255)
aaTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAtttt > 1:1801358/1‑93 (MQ=255)
aTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTg > 2:2592793/1‑93 (MQ=255)
aTTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTg < 2:6461162/93‑1 (MQ=255)
ttATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGt > 1:4523870/1‑93 (MQ=255)
ttATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGt > 1:655127/1‑93 (MQ=255)
tATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTa > 2:1109331/1‑93 (MQ=255)
tATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTa < 2:416704/93‑1 (MQ=255)
tATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTa < 1:1965283/93‑1 (MQ=255)
tATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTa > 1:2217601/1‑93 (MQ=255)
tATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTAGTa > 1:4824104/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAAt < 1:2440192/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATg < 1:3692560/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATg < 2:2580362/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCCTAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGc > 2:1804096/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGc < 1:6073049/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGc < 2:4856266/93‑1 (MQ=255)
cGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGcc > 2:2046734/1‑93 (MQ=255)
cGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGcc < 2:912191/93‑1 (MQ=255)
cGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGcc > 1:198588/1‑93 (MQ=255)
gCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCg > 1:3995812/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCgg > 2:2739207/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCgg > 1:621436/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCgg > 2:874500/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCgg > 1:1197685/1‑93 (MQ=255)
cTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGAt < 2:5174108/93‑1 (MQ=255)
tttttACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATg > 1:835008/1‑93 (MQ=255)
tttttACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATg > 2:6322622/1‑93 (MQ=255)
ttttACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATgc > 2:2080300/1‑93 (MQ=255)
ttttACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATgc < 2:4463238/93‑1 (MQ=255)
tttACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATgcg > 1:515426/1‑93 (MQ=255)
ggTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTaaa < 1:1628569/93‑1 (MQ=255)
gTGGGTTAAAAGCAGGTTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGGCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTaaaa < 2:1003094/93‑1 (MQ=255)
tGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAac > 2:1482693/1‑93 (MQ=255)
ggTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAacac < 2:246406/93‑1 (MQ=255)
ttAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCg < 2:1279706/93‑1 (MQ=255)
ttAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCg < 2:4593855/93‑1 (MQ=255)
tAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGt > 1:5287296/1‑93 (MQ=255)
tAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGt > 2:4921588/1‑93 (MQ=255)
tAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGt > 1:4082900/1‑93 (MQ=255)
tAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGt > 2:3377191/1‑93 (MQ=255)
aaaaGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTa < 1:3305408/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTAcc < 1:1009510/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTAcc > 1:4950523/1‑93 (MQ=255)
cAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCgg < 2:5372207/93‑1 (MQ=255)
aGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGc > 1:5403435/1‑93 (MQ=255)
ggCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGcc < 1:3669669/93‑1 (MQ=255)
gttGGTTGCATCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAGCGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTg < 1:2805902/92‑1 (MQ=255)
cTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTg > 2:6210963/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTg < 2:6158298/93‑1 (MQ=255)
cTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTg < 1:1610695/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTgg > 1:3522039/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTgg < 2:5886021/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAg < 2:3035722/93‑1 (MQ=255)
gTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAGACACCGTACCCGGCCTGGAGt > 2:570888/1‑93 (MQ=255)
ttGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGtt > 2:1884098/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGtttt > 1:4336718/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGtttt > 2:6108604/1‑93 (MQ=255)
cAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTtta < 1:3082100/93‑1 (MQ=255)
gCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTttatt > 1:1361735/1‑93 (MQ=255)
gCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTttatt > 2:4689175/1‑93 (MQ=255)
gCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTttatt < 1:2948005/93‑1 (MQ=255)
ccATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTttatta < 2:650871/93‑1 (MQ=255)
ccATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTttatta < 1:5986960/93‑1 (MQ=255)
cATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAg > 1:5790335/1‑93 (MQ=255)
cATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAg > 2:1141174/1‑93 (MQ=255)
cATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAg < 2:4073046/93‑1 (MQ=255)
aTAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGt > 1:2181323/1‑93 (MQ=255)
tAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTa < 2:6229893/93‑1 (MQ=255)
tAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTa > 2:2190721/1‑93 (MQ=255)
tAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTa > 2:1696921/1‑93 (MQ=255)
aGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACa < 2:5580781/93‑1 (MQ=255)
aGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACa < 2:3493722/93‑1 (MQ=255)
|
ATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTTACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACA > NC_000913/3907941‑3908120
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACAATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTTACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACAGCG > NC_000913/3907938‑3908123
|
ACAATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTC > SRR4302537.1551397/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCA < SRR4302537.6166062/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCAC > SRR4302537.1308488/1‑94 (MQ=60)
AATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCAC < SRR4302537.2061995/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCACTTTTTAGCAGGCGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCAC > SRR4302537.2247968/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACT > SRR4302537.6200699/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGATTGGTTGCAGCCATAAGTCACT < SRR4302537.6463180/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTT > SRR4302537.5682579/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTT > SRR4302537.647101/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCA > SRR4302537.3667436/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCA < SRR4302537.3388819/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCA > SRR4302537.2247508/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTACGTCGCCCTTTTTGCCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCA < SRR4302537.3703513/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGACATAAGGCACTCTTCAG > SRR4302537.993222/1‑94 (MQ=60)
CCGCTAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGT < SRR4302537.3397500/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGT < SRR4302537.1656958/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGT > SRR4302537.5055915/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTT < SRR4302537.3608332/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTT < SRR4302537.2775941/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTA > SRR4302537.2502749/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAA < SRR4302537.2978258/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAA < SRR4302537.2849146/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAA < SRR4302537.4414980/94‑1 (MQ=60)
AGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAAC > SRR4302537.1416950/1‑94 (MQ=60)
AGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAAC < SRR4302537.4892903/94‑1 (MQ=60)
GTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACG < SRR4302537.4632805/94‑1 (MQ=60)
GTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACG < SRR4302537.5076679/94‑1 (MQ=60)
TTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGC < SRR4302537.1261221/94‑1 (MQ=60)
TTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGC > SRR4302537.4138498/1‑94 (MQ=60)
TTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGT < SRR4302537.2977132/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTT < SRR4302537.4451463/94‑1 (MQ=60)
CCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTA < SRR4302537.1929310/94‑1 (MQ=60)
CAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTAC < SRR4302537.6221325/94‑1 (MQ=60)
CAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTAC < SRR4302537.6221324/94‑1 (MQ=60)
AGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACA < SRR4302537.3862363/94‑1 (MQ=60)
GCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAA < SRR4302537.624389/94‑1 (MQ=60)
GCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGATTGGGTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAA > SRR4302537.3065026/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAG < SRR4302537.2485929/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAG < SRR4302537.4388329/94‑1 (MQ=60)
CGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGT < SRR4302537.5000191/94‑1 (MQ=60)
CGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGT < SRR4302537.1287114/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTC < SRR4302537.2618496/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTC > SRR4302537.2350347/1‑94 (MQ=60)
GCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTC > SRR4302537.2332663/1‑94 (MQ=60)
GCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTC < SRR4302537.4293440/94‑1 (MQ=60)
CTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTACACGCGTTTACAAAGTCA > SRR4302537.475669/1‑94 (MQ=60)
CTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCA > SRR4302537.1629460/1‑94 (MQ=60)
TGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAT < SRR4302537.3998407/94‑1 (MQ=60)
TGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCAT < SRR4302537.600941/94‑1 (MQ=60)
GAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATT < SRR4302537.4585259/94‑1 (MQ=60)
GAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATT < SRR4302537.5808535/94‑1 (MQ=60)
AAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTT > SRR4302537.5904906/1‑94 (MQ=60)
AAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTT < SRR4302537.2502610/94‑1 (MQ=60)
AAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTT > SRR4302537.1813926/1‑94 (MQ=60)
AAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTT < SRR4302537.3870836/94‑1 (MQ=60)
AATTATGTCGCCCTTTTTGCCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTG < SRR4302537.4024890/94‑1 (MQ=60)
AATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTG < SRR4302537.3663867/94‑1 (MQ=60)
ATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGT > SRR4302537.4555167/1‑94 (MQ=60)
ATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGT > SRR4302537.659591/1‑94 (MQ=60)
TTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTA > SRR4302537.2233235/1‑94 (MQ=60)
TTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTAGTA > SRR4302537.4857425/1‑94 (MQ=60)
TATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAA < SRR4302537.1978949/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATG > SRR4302537.1828308/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATG < SRR4302537.2457375/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGC < SRR4302537.3718547/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCC > SRR4302537.200004/1‑94 (MQ=60)
TCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCC < SRR4302537.6114780/94‑1 (MQ=60)
TCGCACTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCC > SRR4302537.2465877/1‑94 (MQ=60)
CGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCG > SRR4302537.4023781/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGG > SRR4302537.625669/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGG > SRR4302537.4999242/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGG > SRR4302537.1206008/1‑94 (MQ=60)
GCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGG < SRR4302537.5283532/94‑1 (MQ=60)
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CCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGAT < SRR4302537.2090624/94‑1 (MQ=60)
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TTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCG > SRR4302537.518972/1‑94 (MQ=60)
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CCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAA > SRR4302537.4916747/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAA > SRR4302537.5900636/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAA < SRR4302537.1639959/94‑1 (MQ=60)
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GTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCG < SRR4302537.3534892/94‑1 (MQ=60)
TTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGT > SRR4302537.4111403/1‑94 (MQ=60)
TTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGT > SRR4302537.5323647/1‑94 (MQ=60)
AAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTAC < SRR4302537.291421/94‑1 (MQ=60)
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AAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACC > SRR4302537.3007223/1‑94 (MQ=60)
AAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCC < SRR4302537.1016472/94‑1 (MQ=60)
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TGGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAG > SRR4302537.1357710/1‑94 (MQ=60)
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GGTTGCAGCCATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGT > SRR4302537.3776560/1‑94 (MQ=60)
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CATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGT > SRR4302537.256454/1‑94 (MQ=60)
CATAAGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGT > SRR4302537.3578105/1‑94 (MQ=60)
AGTCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACAG < SRR4302537.5982059/94‑1 (MQ=60)
TCACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACAGCG > SRR4302537.5032073/1‑94 (MQ=60)
|
ACAATCAGCGCCGCCAGTTTTACCAGCACGCTGAAAATTATGTCGCCCTTTTTACCCGGTGGGTTAAAAGCAGGCTTGGTTGCAGCCATAAGTTACTCTTCAGTTAAACGCGTTTACAAAGTCATTTTGTAATGCCGGATGCGGCGTAAAACACCGTACCCGGCCTGGAGTTTTATTAGTACAGCG > NC_000913/3907938‑3908123
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
