Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
882 |
254.4 |
12957588 |
98.0% |
12698436 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,951,168 |
+G |
coding (37/1818 nt) |
ilvD → |
dihydroxyacid dehydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,951,168 | 1 | . | G | 100.0%
| 371.1
/ NA
| 107 | P13A (CCC→GCC) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (10/97); total (10/97) |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GG‑G‑C‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC > NC_000913/3951087‑3951246
|
ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGaa < 2:2172046/93‑1 (MQ=255)
gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAAt < 1:4854749/93‑1 (MQ=255)
aGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATg < 2:2243965/93‑1 (MQ=255)
taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGAc < 1:5651888/93‑1 (MQ=255)
taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGAc < 2:2712307/93‑1 (MQ=255)
aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGAcc < 2:6417010/93‑1 (MQ=255)
aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGAcc < 1:4416763/93‑1 (MQ=255)
aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGAcc < 2:6003133/93‑1 (MQ=255)
aataaaTTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCg < 1:5420777/93‑1 (MQ=255)
aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCg < 1:5736997/93‑1 (MQ=255)
ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGa < 2:2794342/93‑1 (MQ=255)
ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGa < 1:807082/93‑1 (MQ=255)
tataGTATGCCTGCGTCCCGTTCTGCCACCAGCCCTCATGGCCGTAATATGGTGG‑‑CTGCGCGTGCGCT‑GT‑GGCGAG‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGAc < 2:4169876/90‑1 (MQ=255)
taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGAc < 2:5375093/93‑1 (MQ=255)
taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGAc < 1:44573/93‑1 (MQ=255)
gTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCg < 2:4579001/93‑1 (MQ=255)
tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGa < 2:2849119/93‑1 (MQ=255)
tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGa < 1:2284267/93‑1 (MQ=255)
tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGa < 2:2617787/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 1:4939958/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 1:5088741/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:6342059/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:3332780/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:4541423/93‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:3135773/93‑1 (MQ=255)
tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTAATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:2495530/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAttt < 2:4545517/93‑1 (MQ=255)
gCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGAttt < 1:47885/93‑1 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCGCCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 2:1083172/93‑1 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:2068943/93‑1 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGGTCCTGGGCTGGT‑GG‑G‑CG‑C‑‑CGCCCGCATGACCCCCGCCGActtt > 2:4946097/1‑92 (MQ=255)
ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGCTCGTGCGCT‑GTGGG‑G‑CG‑C‑‑CACCCGGAAGACCGACCCCGActtt > 1:207568/1‑92 (MQ=255)
cTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCg < 2:292847/93‑1 (MQ=255)
tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGGTCGTGCGCT‑GTGGG‑G‑CG‑C‑‑CCCCCGAATGAACGACGCCGGttttcg > 2:2527337/1‑90 (MQ=255)
gaaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGCTCGTGCGCC‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CCCCCGAAAGACACACGCCCATTTCgg > 2:6206041/2‑93 (MQ=255)
aaGTACCGTTCCGCCGCCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGt < 1:2569906/93‑1 (MQ=255)
aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:4808689/93‑1 (MQ=255)
aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:2694574/93‑1 (MQ=255)
gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 1:347913/93‑1 (MQ=255)
gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:756642/93‑1 (MQ=255)
gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 1:794974/93‑1 (MQ=255)
tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:5871290/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:4885335/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 2:4643983/93‑1 (MQ=255)
aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGGTCGTGCGCT‑GT‑GG‑G‑G‑‑CGGCACCCGGATGAACGACCCCCATTTCGGTaaac > 2:88393/1‑91 (MQ=255)
ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAgac < 2:6374001/93‑3 (MQ=255)
cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 1:1124368/93‑1 (MQ=255)
cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 1:1722847/93‑1 (MQ=255)
gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGGTCGTGCGCC‑GT‑GGCG‑CG‑G‑‑CACCGCGATGAACCACGCCGAGTTTTGTAAGACgc > 2:1400976/1‑92 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:3564642/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 1:2061884/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGGTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑G‑‑CACCCGGATGAACCCCGCCGATTTCTGTAAGCCGAt > 2:2851028/1‑93 (MQ=255)
tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCC‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CCCCGGGAAGGCCGACGCCCGTTTTGGTAAGCCGagt > 2:2377629/1‑91 (MQ=255)
ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTa < 1:4454860/93‑1 (MQ=255)
gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:1094406/93‑1 (MQ=255)
caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑AACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 2:4718501/93‑1 (MQ=255)
ccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCgg < 2:896630/93‑1 (MQ=255)
caccacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 1:1252568/93‑1 (MQ=255)
caccacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:3940802/93‑1 (MQ=255)
accacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGtt < 1:5552281/93‑1 (MQ=255)
accacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGtt < 2:4028366/93‑1 (MQ=255)
ccacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTCCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtg < 1:4380577/93‑1 (MQ=255)
cacTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGCTCGTGCGGT‑GTGGG‑G‑CGGC‑‑CACCGGAA‑GACCGACGCCGACTTTGGTTAGGCGATTATTGCGGtttt > 2:3733039/1‑91 (MQ=255)
cTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGa < 1:3596832/93‑1 (MQ=255)
tCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 2:658197/93‑1 (MQ=255)
tCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 1:3011455/93‑1 (MQ=255)
cATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAc < 2:5959059/93‑1 (MQ=255)
cATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GGGCTCGTGCGCT‑GTGGG‑G‑CG‑C‑‑CCCCCGGATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGCCGATTATTGCGGGTGTGaaa > 2:5203896/1‑92 (MQ=255)
aTGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:1494742/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTAATATGGCGGGCGTGCGGGCCCGCT‑GG‑TG‑G‑G‑‑C‑‑CACCGGCATGAACGACACCGCTTTCGGTCAGCCGAGTATCGAGGTTGTGAAGTCg > 2:2132592/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 1:3619228/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 1:3112062/93‑1 (MQ=255)
cGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:164881/93‑1 (MQ=255)
cGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:1746055/93‑1 (MQ=255)
cGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 2:5546547/93‑1 (MQ=255)
gTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCa < 2:6466373/93‑1 (MQ=255)
gTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCa < 2:1004392/93‑1 (MQ=255)
tAATATGTCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAc < 1:2924129/93‑1 (MQ=255)
tatGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGGACTCGTTCACCCa > 2:1402393/1‑93 (MQ=255)
tatGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCa > 2:1464874/1‑93 (MQ=255)
tatGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCa < 1:2920385/93‑1 (MQ=255)
tatGGCGG‑‑GGGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CCCCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGGACTCGTTCACCCa > 2:5569751/1‑93 (MQ=255)
atGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 2:1586878/93‑1 (MQ=255)
atGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 1:5433046/93‑1 (MQ=255)
tGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAt > 2:2344769/1‑93 (MQ=255)
gCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 1:859373/93‑1 (MQ=255)
g‑‑gTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa > 1:3625033/1‑93 (MQ=255)
gTGCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:1189868/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 1:2202523/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:424572/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:2379239/93‑1 (MQ=255)
cTCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 1:4250035/93‑1 (MQ=255)
tCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg > 1:284318/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg > 1:4230498/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGACGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg > 2:3479611/1‑93 (MQ=255)
cGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt > 2:5353920/1‑93 (MQ=255)
cGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt > 2:6111774/1‑93 (MQ=255)
cGTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 1:2657831/93‑1 (MQ=255)
gTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 1:5852954/93‑1 (MQ=255)
gTGCGCT‑GT‑GGCG‑CG‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 1:5521113/93‑1 (MQ=255)
|
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGG‑‑GTGCTCGTGCGCT‑GT‑GG‑G‑C‑‑C‑‑CACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC > NC_000913/3951087‑3951246
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑G‑‑C‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCCATCTGCGCG > NC_000913/3951088‑3951261
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GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATG < SRR4302537.4888244/94‑1 (MQ=60)
TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACC < SRR4302537.5690570/94‑1 (MQ=60)
AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCG < SRR4302537.4447253/94‑1 (MQ=60)
AATAAATTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGA < SRR4302537.5457715/94‑1 (MQ=60)
AATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGA < SRR4302537.5776275/94‑1 (MQ=60)
ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGAC < SRR4302537.812621/94‑1 (MQ=60)
TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACG < SRR4302537.44906/94‑1 (MQ=60)
TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGAT < SRR4302537.2300382/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302537.5123773/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATT < SRR4302537.4974027/94‑1 (MQ=60)
GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < SRR4302537.48240/94‑1 (MQ=60)
CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < SRR4302537.2083479/94‑1 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCGCCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTA < SRR4302537.2587909/94‑1 (MQ=60)
AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGTGGGGCG‑‑C‑CCCCCGGAA‑GACCGACGCCGATTTttgga > SRR4302537.5828154/1‑89 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302537.4841879/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302537.2713403/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302537.6516619/94‑1 (MQ=60)
AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < SRR4302537.5625990/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302537.800429/94‑1 (MQ=60)
GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < SRR4302537.350328/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < SRR4302537.5911563/94‑1 (MQ=60)
ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCC < SRR4302537.4919072/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < SRR4302537.1734887/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < SRR4302537.1132166/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATT < SRR4302537.2080131/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATT < SRR4302537.2076365/94‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < SRR4302537.4485625/94‑1 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCCGAATGACCGACGCCCATTTCGGTAAGCCGATTATCGCG > SRR4302537.3385347/1‑94 (MQ=60)
CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCCTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCCGGATGAACGACGCCCATTTTTGTAAGCCGATTATCTCG > SRR4302537.5596171/1‑94 (MQ=18)
CCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGT < SRR4302537.2902907/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302537.1261284/94‑1 (MQ=60)
CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < SRR4302537.4464011/94‑1 (MQ=60)
ACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTG < SRR4302537.5590194/94‑1 (MQ=60)
CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTCCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < SRR4302537.4410812/94‑1 (MQ=60)
CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < SRR4302537.5242286/94‑1 (MQ=60)
ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑GGCG‑CCACCGGCATGACCGACGCCCATTTTGGTTAGCCGAGTATCGCGGGTGTGA > SRR4302537.3105189/1‑94 (MQ=42)
CTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < SRR4302537.3622187/94‑1 (MQ=60)
TCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAC < SRR4302537.3032455/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < SRR4302537.1505159/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGT < SRR4302537.3133801/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGT < SRR4302537.3644736/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCG‑‑C‑CC‑CCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTTTTGCGGGTGTGGACTCGT > SRR4302537.5030172/1‑94 (MQ=57)
TCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACCCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAATCGTTC > SRR4302537.3466678/1‑94 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302537.4848362/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302537.1758235/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCA < SRR4302537.166052/94‑1 (MQ=60)
CGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑‑C‑CC‑CCGGAATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAaccgtttc > SRR4302537.3287855/1‑86 (MQ=60)
TAATATGTCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACC < SRR4302537.2944669/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAA < SRR4302537.2940910/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAT < SRR4302537.5470101/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATT < SRR4302537.4078892/94‑1 (MQ=60)
GCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTG < SRR4302537.865272/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTA > SRR4302537.3650580/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACC < SRR4302537.1198133/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGG < SRR4302537.2218058/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302537.4279571/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG > SRR4302537.4259949/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG > SRR4302537.286300/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGG < SRR4302537.1602671/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTC < SRR4302537.2676405/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCA < SRR4302537.5558805/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGT > SRR4302537.3820935/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTGGC‑‑G‑‑CGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGT > SRR4302537.641241/1‑94 (MQ=60)
G‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCCATCTGCGCG > SRR4302537.1370719/1‑94 (MQ=60)
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GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑G‑‑C‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCCATCTGCGCG > NC_000913/3951088‑3951261
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
