Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,494,555 |
T→C |
intergenic (+41/‑85) |
nirD → / → nirC |
nitrite reductase (NAD(P)H) subunit/Nitrite transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,494,555 | 0 | T | C | 100.0%
| 1102.2
/ NA
| 317 | intergenic (+41/‑85) | nirD/nirC | nitrite reductase (NAD(P)H) subunit/Nitrite transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (58/259); total (58/259) |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
AAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTT > NC_000913/3494464‑3494644
|
aaCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGccc < 1:3793132/93‑1 (MQ=255)
aaCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGccc < 2:4230460/93‑1 (MQ=255)
aCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCt < 1:3829975/93‑1 (MQ=255)
aCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCt > 1:3222697/1‑93 (MQ=255)
aCATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCt < 2:1126772/93‑1 (MQ=255)
cATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTg < 1:1490026/93‑1 (MQ=255)
cATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTg < 1:7249078/93‑1 (MQ=255)
cATGACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTg < 2:5378436/93‑1 (MQ=255)
aCGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaat > 2:8133429/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGCGGCTGAAAGACGGCGTGATGCAGCTGCGCGTTTAATGTTTTACCGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGtaataa < 2:3180183/93‑1 (MQ=255)
aaGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTaataat < 1:6778138/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCt < 2:2966643/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCt < 2:4844385/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:1577704/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 2:1456931/93‑1 (MQ=255)
gcgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTc < 1:6714486/93‑1 (MQ=255)
cgAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCg > 1:8439189/1‑93 (MQ=255)
aGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGt < 1:4674125/93‑1 (MQ=255)
gTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGta < 2:701651/93‑1 (MQ=255)
tGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtat < 1:8814076/93‑1 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 2:8778658/93‑1 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 1:5732553/93‑1 (MQ=255)
gAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGtata < 1:4743339/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt > 2:1500475/1‑93 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:4902163/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:5194843/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 2:6773522/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 2:6662984/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:560517/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:2000892/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:1654155/93‑1 (MQ=255)
aaGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAtt < 1:1751199/93‑1 (MQ=255)
gACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGc < 1:2430733/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAg < 2:1478015/93‑1 (MQ=255)
cGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAg < 2:5244262/93‑1 (MQ=255)
gtcGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAgg < 1:4404428/91‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAgg < 1:8544591/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACa > 2:2934917/1‑93 (MQ=255)
tggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAt < 2:5821481/93‑1 (MQ=255)
tggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAt < 1:2918771/93‑1 (MQ=255)
gggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAt < 1:3079627/92‑1 (MQ=255)
ggtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAtt < 2:8486385/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAttt < 2:5479626/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAttt < 1:1018180/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAttt < 1:8236098/93‑1 (MQ=255)
gtgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAttt > 1:5495287/1‑93 (MQ=255)
tgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAtttt < 1:4503995/93‑1 (MQ=255)
tgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAtttt > 1:6522356/1‑93 (MQ=255)
tgCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAtttt < 2:8285/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTa > 2:210082/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTa < 2:1720020/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTa > 2:6141570/1‑93 (MQ=255)
cTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCGTGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTaaa < 2:5743683/93‑1 (MQ=255)
tGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAAc < 2:3930086/93‑1 (MQ=255)
gcgcGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACt < 1:3600615/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGGCATTTTTTAAACtt < 1:5994788/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACtt < 1:7616621/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 2:5654875/93‑1 (MQ=255)
gcgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 2:6003071/93‑1 (MQ=255)
ccagTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttt < 2:8630300/90‑1 (MQ=255)
ggtttAATGTTTTAACGGGAGGCGAAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACtttt < 2:3118967/90‑1 (MQ=255)
cgGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACtttt > 2:2873405/1‑93 (MQ=255)
ggTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACttttt > 2:3747899/1‑93 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg > 1:5865618/1‑93 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCCCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg > 1:545778/1‑93 (MQ=255)
gTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCCCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTg < 2:6045764/93‑1 (MQ=255)
ttAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGt < 1:1772314/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGttt < 1:7506719/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTTAACGGGAGGCTCAATGCCTCACCGTTTTGCATGGCCCGGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtttt < 1:8637965/93‑1 (MQ=255)
aTGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGtttt < 2:489853/93‑1 (MQ=255)
tGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTT‑CATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAt < 2:1963534/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAt < 2:2661996/93‑1 (MQ=255)
tAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAttttt < 2:3667710/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTAtttttt < 1:1179530/93‑1 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt < 2:4664511/93‑1 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt < 2:4699606/93‑1 (MQ=255)
gggAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtt < 1:6808322/93‑1 (MQ=255)
gAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtttt < 1:7923403/93‑1 (MQ=255)
gAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtttt < 1:3354793/93‑1 (MQ=255)
gAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGtttt > 1:1422413/1‑93 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 2:6553353/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGttttt < 1:2864685/93‑1 (MQ=255)
gcgcAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGGCATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAt < 1:3495474/93‑1 (MQ=255)
gcgcAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAt < 1:4239487/93‑1 (MQ=255)
gcgcAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAt < 1:3949308/93‑1 (MQ=255)
gcAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAttt > 2:3349175/1‑93 (MQ=255)
cAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTAtttt < 1:6381487/93‑1 (MQ=255)
cTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAg > 2:7988091/1‑93 (MQ=255)
cTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAg < 1:7017386/93‑1 (MQ=255)
tCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGGCATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAgg < 2:7544481/93‑1 (MQ=255)
tCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAgg < 2:5044235/93‑1 (MQ=255)
tCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAgg < 2:4432552/93‑1 (MQ=255)
ccccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGa < 2:7222541/93‑1 (MQ=255)
ccccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTAGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGa < 1:6074391/93‑1 (MQ=255)
cccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGAt > 1:2627074/1‑93 (MQ=255)
cccTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGAt < 2:2190398/93‑1 (MQ=255)
ttttGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATc < 1:4315681/93‑1 (MQ=255)
tttGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCa < 2:5583077/93‑1 (MQ=255)
gCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAAt < 1:8167134/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGtt > 2:7307138/1‑93 (MQ=255)
|
AAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTT > NC_000913/3494464‑3494644
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTAC > NC_000913/3494463‑3494647
|
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCC > SRR4302541.586142/1‑94 (MQ=60)
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCC < SRR4302541.6962637/94‑1 (MQ=60)
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCC > SRR4302541.888988/1‑94 (MQ=60)
CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCC > SRR4302541.3711535/1‑94 (MQ=60)
AAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCC > SRR4302541.454712/1‑94 (MQ=60)
AACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCT > SRR4302541.3255251/1‑94 (MQ=60)
AACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCT < SRR4302541.3831283/94‑1 (MQ=60)
ACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTG < SRR4302541.3868557/94‑1 (MQ=60)
ACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTG > SRR4302541.3863344/1‑94 (MQ=60)
ACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTG > SRR4302541.3183535/1‑94 (MQ=60)
CATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGT < SRR4302541.1504711/94‑1 (MQ=60)
CATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGT < SRR4302541.7326397/94‑1 (MQ=60)
CATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGT < SRR4302541.5964740/94‑1 (MQ=60)
ATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTA < SRR4302541.6821682/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATA < SRR4302541.8123057/94‑1 (MQ=60)
ACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATA < SRR4302541.6683004/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAA > SRR4302541.1849450/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAAT < SRR4302541.5466733/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAAT < SRR4302541.3868230/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAAT < SRR4302541.6063497/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATC < SRR4302541.4624519/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATC > SRR4302541.3338149/1‑94 (MQ=60)
AAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATC < SRR4302541.6850628/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCT < SRR4302541.1384364/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTT < SRR4302541.4445018/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTT < SRR4302541.6125966/94‑1 (MQ=60)
CGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTC < SRR4302541.5131267/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302541.6786116/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG > SRR4302541.8530344/1‑94 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302541.5405544/94‑1 (MQ=60)
GCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCG < SRR4302541.2222906/94‑1 (MQ=60)
CGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGG < SRR4302541.7567556/94‑1 (MQ=60)
CGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTGAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGG < SRR4302541.8567808/94‑1 (MQ=60)
GAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGT > SRR4302541.363959/1‑94 (MQ=60)
GAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCCCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGT < SRR4302541.5693455/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCTGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTA < SRR4302541.2927128/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTA < SRR4302541.4721725/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTA < SRR4302541.1857286/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATA < SRR4302541.1646631/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATA < SRR4302541.3907611/94‑1 (MQ=60)
TGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATA < SRR4302541.8908181/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTTGGTATAT < SRR4302541.1498988/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302541.4791779/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302541.5790980/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302541.3815693/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302541.6808410/94‑1 (MQ=60)
GAAAGACGGCGTGGGGCAGCTGCGCGGTTAATGTGTTAACGGGAGGCGTAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATAT < SRR4302541.7679365/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.1670488/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.5248304/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.1742119/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.1768280/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.4952177/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.565789/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.2020273/94‑1 (MQ=60)
AAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCCCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTG < SRR4302541.1451023/94‑1 (MQ=60)
AGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGC < SRR4302541.1962397/94‑1 (MQ=60)
GACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCA < SRR4302541.8007780/94‑1 (MQ=60)
GACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCA < SRR4302541.2454781/94‑1 (MQ=60)
GACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCA < SRR4302541.4170394/94‑1 (MQ=60)
ACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAG < SRR4302541.8893169/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGG < SRR4302541.6738934/94‑1 (MQ=60)
CGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGG < SRR4302541.8603618/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGA < SRR4302541.4448491/94‑1 (MQ=60)
GGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGA < SRR4302541.8636442/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT < SRR4302541.8652157/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACAT > SRR4302541.8879776/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTACAGGACAT < SRR4302541.8652158/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.2598230/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.445071/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.6868409/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.2948123/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.5845887/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATT < SRR4302541.3110882/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.4790134/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.7230506/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT > SRR4302541.465130/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.8280077/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.5976998/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.1653754/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT < SRR4302541.8280078/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTT > SRR4302541.5551596/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACTGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTT < SRR4302541.677426/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTT < SRR4302541.8325870/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTT < SRR4302541.1027590/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTT > SRR4302541.6588910/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302541.4549428/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302541.4281826/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT < SRR4302541.838269/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTT > SRR4302541.8368627/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACT < SRR4302541.4764864/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTT < SRR4302541.3637122/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTT < SRR4302541.5688349/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTT < SRR4302541.8134333/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGGCATTTTTTAAACTTT < SRR4302541.6056203/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTT < SRR4302541.7697978/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTT > SRR4302541.3386308/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGACCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTT > SRR4302541.5646693/1‑94 (MQ=60)
GCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTT < SRR4302541.55247/94‑1 (MQ=60)
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CGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTT > SRR4302541.3898252/1‑94 (MQ=60)
GGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTG < SRR4302541.3621488/94‑1 (MQ=60)
GGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTG > SRR4302541.5925293/1‑94 (MQ=60)
GGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCCCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTG > SRR4302541.550925/1‑94 (MQ=60)
GTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGT < SRR4302541.4820438/94‑1 (MQ=60)
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GTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGT > SRR4302541.1033372/1‑94 (MQ=60)
TTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTT < SRR4302541.7086554/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTT < SRR4302541.1789539/94‑1 (MQ=60)
TTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTT > SRR4302541.5610162/1‑94 (MQ=60)
TTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTT < SRR4302541.5567289/94‑1 (MQ=60)
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TAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCTCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCTGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTT < SRR4302541.928604/94‑1 (MQ=60)
TAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTT < SRR4302541.5019373/94‑1 (MQ=60)
AATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTT < SRR4302541.7586954/94‑1 (MQ=60)
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ATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTA < SRR4302541.6378045/94‑1 (MQ=60)
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TTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTT < SRR4302541.6571728/94‑1 (MQ=60)
TAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTT < SRR4302541.6467244/94‑1 (MQ=60)
AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG < SRR4302541.1190929/94‑1 (MQ=60)
AACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTG < SRR4302541.1190928/94‑1 (MQ=60)
CGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTT > SRR4302541.4511718/1‑94 (MQ=60)
GGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTT < SRR4302541.6881138/94‑1 (MQ=60)
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GGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTT > SRR4302541.7988154/1‑94 (MQ=60)
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AGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTA > SRR4302541.8769925/1‑94 (MQ=60)
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CGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTT < SRR4302541.1720348/94‑1 (MQ=60)
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CAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTT < SRR4302541.6446669/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATCATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTACAG > SRR4302541.1771663/1‑94 (MQ=60)
CCTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAG > SRR4302541.1771662/1‑94 (MQ=60)
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CTCCCCTTTTTGCATGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGG < SRR4302541.7092007/94‑1 (MQ=60)
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TGGCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTT > SRR4302541.6062723/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTAC > SRR4302541.7812818/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTAC > SRR4302541.7812817/1‑94 (MQ=60)
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CAAACATTACGAAGCGCGAGTGAAAGACGGCGTGGTGCAGCTGCGCGGTTAATGTTTTAACGGGAGGCGCAATGCCTCCCCTTTTTGCATGGTCCTGTAATAATCTTCGGTATATTGCAGGACATTTTTTAAACTTTTTGTTTTATTTTTTGTTTTTATTTTTTAAAGGATAATCAAATGTTTAC > NC_000913/3494463‑3494647
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
