Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,406,487 |
T→C |
L415P (CTT→CCT) |
b3258 → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,406,487 | 0 | T | C | 100.0%
| 856.0
/ NA
| 242 | L415P (CTT→CCT) | b3258 | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (120/122); total (120/122) |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTC > NC_000913/3406397‑3406576
|
ccTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCctt > 1:3626843/1‑93 (MQ=255)
ccTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCctt > 2:145866/1‑93 (MQ=255)
ccTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCGGGGTCctt < 1:6284259/93‑1 (MQ=255)
cTGGAAGCCGCCTGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTa > 2:1396861/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTa > 2:5241539/1‑93 (MQ=255)
tGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTAc < 1:1050058/93‑1 (MQ=255)
tGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTAc > 2:3154215/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTgg < 2:2160663/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTggg > 2:6148419/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTggg > 1:3129196/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTggg > 1:5270997/1‑93 (MQ=255)
gccgccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGa > 2:4640504/1‑93 (MQ=255)
cgccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAc > 2:2872193/1‑93 (MQ=255)
gccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAcg > 2:620809/1‑93 (MQ=255)
gccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAcg < 1:6073331/93‑1 (MQ=255)
gccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAcg > 2:4962512/1‑93 (MQ=255)
ccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAcgc < 2:1300099/93‑1 (MQ=255)
ccAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAcgc > 1:2577765/1‑93 (MQ=255)
aGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTCCTGGGAACgcgc > 2:4948657/1‑93 (MQ=255)
aGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACgcgc > 2:3584632/1‑93 (MQ=255)
gAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgcc < 2:1529820/93‑1 (MQ=255)
gAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgcc > 1:2770502/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgcca > 2:3955953/1‑93 (MQ=255)
aaTGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgccaa > 1:4750260/1‑93 (MQ=255)
tGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgccaacg > 1:1516671/1‑93 (MQ=255)
atcatcTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgccaacgcc > 1:4889127/1‑93 (MQ=255)
tcatcTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgccaacgcca > 1:855256/1‑93 (MQ=255)
tcatcTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGcgccaacgcca > 2:6386630/1‑93 (MQ=255)
atcTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCaaa > 1:4142700/1‑93 (MQ=255)
atcTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCaaa > 1:4543694/1‑93 (MQ=255)
cTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAgg < 2:4435154/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgc > 1:3330843/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgc < 1:3584896/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgc < 1:135646/93‑1 (MQ=255)
gCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgcgc > 2:557736/1‑93 (MQ=255)
gCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgcgc < 2:5687099/93‑1 (MQ=255)
gCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGgcgc < 1:726524/93‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTaa > 2:4367170/1‑93 (MQ=255)
aTTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTaa < 1:3266509/93‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGGCCTGCGGTGGTCTGGAAGCTGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTaa < 2:6067461/93‑1 (MQ=255)
tttGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAg > 1:5315343/1‑93 (MQ=255)
ttgttgGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGt < 2:4788993/93‑1 (MQ=255)
tgttgGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTAGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTg > 1:1487629/1‑93 (MQ=255)
tgGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCga < 2:4241576/93‑1 (MQ=255)
tgGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCga > 2:1110823/1‑93 (MQ=255)
gCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatg < 2:106465/93‑1 (MQ=255)
gCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatg > 2:2272975/1‑93 (MQ=255)
gCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatg < 2:2512266/93‑1 (MQ=255)
gCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatg < 1:4625293/93‑1 (MQ=255)
ccTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatga > 1:6364217/1‑93 (MQ=255)
ccTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatga > 1:762727/1‑93 (MQ=255)
cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatgat < 2:5546956/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatgat < 1:2680419/93‑1 (MQ=255)
cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCgatgat > 2:2933636/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGGCGCTGGAGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGCTGATc > 1:3902551/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCg > 2:2406893/1‑93 (MQ=255)
tCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCg < 2:871925/93‑1 (MQ=255)
ggTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGtt < 2:332086/93‑1 (MQ=255)
ggTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGtt > 1:225684/1‑93 (MQ=255)
gTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTg < 1:5308200/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTgg < 2:5979156/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGACGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCACCGCCAAAGGCGCGCTAAGCGCGATGATCGTTgg > 1:4041491/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTggcg < 1:1628327/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTggcgg < 1:5437504/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTggcgg > 2:2006842/1‑93 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTggcggc < 1:4909674/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGt > 1:4431366/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGt > 2:695032/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGt < 1:1990910/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTgg > 1:1912378/1‑92 (MQ=255)
aaGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGc < 1:3754278/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGTTTTCCTGCGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGCTGGCGGCGTGc > 1:2207307/1‑93 (MQ=255)
gTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTAt < 2:3082297/93‑1 (MQ=255)
ttttCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATg < 1:436629/93‑1 (MQ=255)
tCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCg > 1:2405066/1‑93 (MQ=255)
tCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCg < 2:3377923/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGt < 1:369986/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGCTGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTa > 2:5428044/1‑93 (MQ=255)
gtgGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACt < 2:4210666/93‑1 (MQ=255)
tgGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTc < 2:3477709/93‑1 (MQ=255)
tgGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTc < 1:2831236/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTcgcg > 1:1588656/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGa > 1:4468609/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGAc > 1:5416833/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGAc > 1:5666757/1‑93 (MQ=255)
tGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGc < 1:4797942/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCt > 2:5309144/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCt > 1:6105801/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGa < 1:3885749/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGaa < 1:5789386/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGaa < 2:140241/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAat < 2:2556580/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAat < 1:5355215/93‑1 (MQ=255)
tGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAata > 1:2093341/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAata > 1:133897/1‑93 (MQ=255)
gggTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAatat > 1:5113647/1‑93 (MQ=255)
gggTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAatat < 1:5184744/93‑1 (MQ=255)
ggTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAtt < 2:2649616/93‑1 (MQ=255)
gTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTc < 2:1625047/93‑1 (MQ=255)
gTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTc < 1:1199361/93‑1 (MQ=255)
|
CCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTC > NC_000913/3406397‑3406576
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCGCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTA > NC_000913/3406394‑3406580
|
CCGCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCC < SRR4302534.308295/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCT < SRR4302534.4743969/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCT > SRR4302534.3047268/1‑94 (MQ=60)
GCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTT < SRR4302534.2398277/94‑1 (MQ=60)
GCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTT > SRR4302534.3724330/1‑94 (MQ=60)
CCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTA < SRR4302534.5439366/94‑1 (MQ=60)
CCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCGGGGTCCTTA < SRR4302534.6454292/94‑1 (MQ=60)
CCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCCGGGTCCTTA < SRR4302534.6494808/94‑1 (MQ=60)
CTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTAC > SRR4302534.2588621/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACT < SRR4302534.1077249/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACT < SRR4302534.6481507/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGG > SRR4302534.3344159/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGG > SRR4302534.5227425/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGG > SRR4302534.4874587/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGG > SRR4302534.5413373/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGG > SRR4302534.3211459/1‑94 (MQ=60)
GCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTGGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAA < SRR4302534.4552289/94‑1 (MQ=60)
CCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAAC < SRR4302534.2843157/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACG < SRR4302534.2760309/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACG > SRR4302534.1455219/1‑94 (MQ=60)
GCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGC > SRR4302534.2646044/1‑94 (MQ=60)
GCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGC < SRR4302534.6238462/94‑1 (MQ=60)
CCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCG > SRR4302534.1617143/1‑94 (MQ=60)
CAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGC > SRR4302534.2255524/1‑94 (MQ=60)
AGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCC > SRR4302534.2843414/1‑94 (MQ=60)
AAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAA > SRR4302534.4879202/1‑94 (MQ=60)
AATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAAC > SRR4302534.5459710/1‑94 (MQ=60)
ATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACG < SRR4302534.1638049/94‑1 (MQ=60)
ATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACG > SRR4302534.4005918/1‑94 (MQ=60)
ATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACG > SRR4302534.1556520/1‑94 (MQ=60)
GATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCC > SRR4302534.5021702/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCA > SRR4302534.876835/1‑94 (MQ=60)
ATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCA < SRR4302534.4566762/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAA > SRR4302534.4666864/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAA > SRR4302534.6230066/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAA > SRR4302534.4254502/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTCGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAA > SRR4302534.3485656/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAG < SRR4302534.3330785/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAG < SRR4302534.2982391/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGC > SRR4302534.3419932/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCG < SRR4302534.3681325/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCG < SRR4302534.139199/94‑1 (MQ=60)
GCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCG < SRR4302534.744458/94‑1 (MQ=60)
GCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCG > SRR4302534.4821471/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCT > SRR4302534.402301/1‑94 (MQ=60)
TGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCT < SRR4302534.2847925/94‑1 (MQ=60)
GAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTA > SRR4302534.1547729/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAG > SRR4302534.5458736/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAG < SRR4302534.4031701/94‑1 (MQ=60)
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ATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAG < SRR4302534.3353505/94‑1 (MQ=60)
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GTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAGCGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCG < SRR4302534.4250821/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCG > SRR4302534.3796560/1‑94 (MQ=60)
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tgcgttcgttgtGCTGGAAGCTGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATG < SRR4302534.374189/82‑1 (MQ=60)
GGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATG > SRR4302534.1207706/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATG > SRR4302534.5582900/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGA > SRR4302534.781657/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGA < SRR4302534.4750794/94‑1 (MQ=60)
GCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGA > SRR4302534.743854/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGA < SRR4302534.4649969/94‑1 (MQ=60)
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CTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGGCGCTGGAGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGCTGATC > SRR4302534.4007217/1‑94 (MQ=60)
CTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATG < SRR4302534.3411182/94‑1 (MQ=60)
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CTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATC < SRR4302534.1820454/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATC < SRR4302534.3515603/94‑1 (MQ=60)
CTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATC < SRR4302534.2751269/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGGTCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGT < SRR4302534.1374521/94‑1 (MQ=60)
TCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGT < SRR4302534.6266552/94‑1 (MQ=60)
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CGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTT > SRR4302534.231575/1‑94 (MQ=60)
CGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTT > SRR4302534.5757595/1‑94 (MQ=60)
GGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTG < SRR4302534.4534956/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGG < SRR4302534.5451422/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGACGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCACCGCCAAAGGCGCGCTAAGCGCGATGATCGTTGG > SRR4302534.4149853/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGC < SRR4302534.1249302/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGG < SRR4302534.1670800/94‑1 (MQ=60)
GCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGC < SRR4302534.5583946/94‑1 (MQ=60)
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TGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGT > SRR4302534.5509802/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGT > SRR4302534.4551024/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTG < SRR4302534.2043043/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTG < SRR4302534.2014434/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGG > SRR4302534.1962300/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCGTTTTCCTGCGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGCTGGCGGCGTGC > SRR4302534.2265742/1‑94 (MQ=60)
AAGCTGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCT < SRR4302534.6128252/94‑1 (MQ=60)
AAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCT < SRR4302534.3855098/94‑1 (MQ=60)
AGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTG < SRR4302534.1007786/94‑1 (MQ=60)
GCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGT < SRR4302534.2129836/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTA > SRR4302534.5329010/1‑94 (MQ=60)
CGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTAT < SRR4302534.3839155/94‑1 (MQ=60)
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GTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATG < SRR4302534.956224/94‑1 (MQ=60)
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TTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCC < SRR4302534.228636/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCG > SRR4302534.2468988/1‑94 (MQ=60)
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TGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACT < SRR4302534.1293079/94‑1 (MQ=60)
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GTGGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTC > SRR4302534.2714835/1‑94 (MQ=60)
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GGCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGC < SRR4302534.4745078/94‑1 (MQ=60)
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GCCGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCG < SRR4302534.4901241/94‑1 (MQ=60)
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CGCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGAC > SRR4302534.5820161/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACG < SRR4302534.470024/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACG < SRR4302534.1933165/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACG < SRR4302534.5452361/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCT < SRR4302534.4928214/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCT < SRR4302534.5453495/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCT > SRR4302534.6271830/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTG > SRR4302534.5775238/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGA < SRR4302534.5512277/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGTCCTTCCTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAA < SRR4302534.2451804/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAA < SRR4302534.3990064/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAAT < SRR4302534.5946444/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATA > SRR4302534.2148241/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATA < SRR4302534.5499583/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATA > SRR4302534.137421/1‑94 (MQ=60)
TGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAT > SRR4302534.6364867/1‑94 (MQ=60)
TGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAT < SRR4302534.2637687/94‑1 (MQ=60)
TGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAT > SRR4302534.5251650/1‑94 (MQ=60)
TGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAT > SRR4302534.825661/1‑94 (MQ=60)
TGGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATAT < SRR4302534.4418626/94‑1 (MQ=60)
GGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATT < SRR4302534.5324499/94‑1 (MQ=60)
GGGTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATT < SRR4302534.3982486/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCA < SRR4302534.5016181/94‑1 (MQ=60)
GTCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCA < SRR4302534.1230922/94‑1 (MQ=60)
TCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAG > SRR4302534.5243929/1‑94 (MQ=60)
TCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAG < SRR4302534.404900/94‑1 (MQ=60)
TCCTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAG > SRR4302534.4530253/1‑94 (MQ=60)
CTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTA < SRR4302534.6059820/94‑1 (MQ=60)
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CCGCCTGGAAGCCGCCAGAAATGATCATCTGGCTGAATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTA > NC_000913/3406394‑3406580
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
