Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,471,916 |
C→T |
G92S (GGT→AGT) |
rpsL ← |
30S ribosomal subunit protein S12 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,471,916 | 0 | C | T | 100.0%
| 995.5
/ NA
| 252 | G92S (GGT→AGT) | rpsL | 30S ribosomal subunit protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (133/119); total (133/119) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTT > NC_000913/3471826‑3472005
|
aCGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCgg < 2:3227623/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCgg > 1:2523366/1‑93 (MQ=255)
cTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAg < 2:1917714/93‑1 (MQ=255)
ttCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAgg < 2:6347083/93‑1 (MQ=255)
tCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGCACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGt > 2:4530137/1‑93 (MQ=255)
cACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTc < 2:5401892/93‑1 (MQ=255)
aCGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCt > 2:1980889/1‑93 (MQ=255)
aCGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCt > 2:4104333/1‑93 (MQ=255)
gCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCttt < 2:3480492/93‑1 (MQ=255)
ccATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTa > 1:661464/1‑93 (MQ=255)
ccATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTa > 2:4315083/1‑93 (MQ=255)
cATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTaa > 2:3899000/1‑93 (MQ=255)
aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac > 1:968571/1‑93 (MQ=255)
tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca > 2:800254/1‑93 (MQ=255)
aCTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAacac < 1:4669533/93‑1 (MQ=255)
cTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACg < 2:5166257/93‑1 (MQ=255)
ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGACTTTAACACGa > 2:2023228/1‑93 (MQ=255)
tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 1:59815/93‑1 (MQ=255)
ggAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAcc > 2:2665390/1‑93 (MQ=255)
aaCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGc > 1:1622996/1‑93 (MQ=255)
aaCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGc > 1:1001151/1‑93 (MQ=255)
aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc < 1:2780735/93‑1 (MQ=255)
gAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTGTTTAACACGACCGCCag > 1:2035624/1‑92 (MQ=255)
aGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACg > 2:2280724/1‑93 (MQ=255)
aGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACg > 1:4602704/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgg > 1:5844278/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgg > 1:530452/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggat < 1:3452478/93‑1 (MQ=255)
cTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggat > 2:2991553/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggat < 2:4667438/93‑1 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc > 2:1031783/1‑93 (MQ=255)
tGCTTACGGTCTTTAACGCCAGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc < 2:5728376/93‑1 (MQ=255)
cTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcag > 1:2919994/1‑93 (MQ=255)
ttACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagg < 2:2614561/93‑1 (MQ=255)
ttACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagg < 2:4924056/93‑1 (MQ=255)
ttACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagg < 2:5087607/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggat > 1:2162196/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggat < 1:2729751/93‑1 (MQ=255)
gTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCAc > 2:3710218/1‑93 (MQ=255)
tttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGa < 2:3974055/93‑1 (MQ=255)
tttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGa < 2:2851631/93‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAg < 2:5045307/93‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 2:5784547/93‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 2:5918926/93‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt > 2:6136747/1‑93 (MQ=255)
tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 1:6342082/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAgcgc > 2:3352137/1‑93 (MQ=255)
cGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCt > 1:4056910/1‑93 (MQ=255)
gCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTc < 1:4441140/93‑1 (MQ=255)
ccGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTcc < 1:306132/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt < 1:5429011/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt < 2:560496/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGGGCTCCt > 1:3782731/1‑93 (MQ=255)
ggAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTg > 2:1284164/1‑93 (MQ=255)
gCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAg > 2:2069804/1‑93 (MQ=255)
gCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAg < 1:3756244/93‑1 (MQ=255)
cAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAgg < 1:2636766/93‑1 (MQ=255)
aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt < 1:4267946/93‑1 (MQ=255)
aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt > 2:1661450/1‑93 (MQ=255)
aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt < 1:5691449/93‑1 (MQ=255)
aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt > 1:647786/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGCGCCCCACGTACGGTGTGGTAACGAACCCTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGtt < 2:5308935/93‑1 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACGCTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGtt < 1:3982081/93‑1 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGtt > 1:4846879/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGtt > 1:3275654/1‑93 (MQ=255)
gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGtt > 2:5995770/1‑93 (MQ=255)
tCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTtg < 1:4796329/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTtgt > 1:2407439/1‑93 (MQ=255)
cgcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGAcc < 1:882156/93‑1 (MQ=255)
gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt > 2:5278076/1‑93 (MQ=255)
gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt > 1:1054833/1‑93 (MQ=255)
gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt > 2:2765663/1‑93 (MQ=255)
caccacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCtt > 1:147648/1‑93 (MQ=255)
accacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTc > 1:486997/1‑93 (MQ=255)
accacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTc > 2:1557930/1‑93 (MQ=255)
accacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTc > 2:1469335/1‑93 (MQ=255)
accacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTc > 1:1392002/1‑93 (MQ=255)
acGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGAACTTcacc > 2:6112349/1‑93 (MQ=255)
cGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTcacca > 1:5185668/1‑93 (MQ=255)
gTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTcaccac > 1:1546497/1‑93 (MQ=255)
gTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTcaccac < 1:3532615/93‑1 (MQ=255)
gTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTcaccac < 2:3620914/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCg > 1:1268337/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCg > 1:2067998/1‑93 (MQ=255)
cGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGa < 2:4783668/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGa < 1:6213831/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGTACCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATg > 1:6270783/1‑93 (MQ=255)
tgtgGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGt > 2:1146429/1‑93 (MQ=255)
gtgGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTa < 1:6165713/93‑1 (MQ=255)
ggTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAgg > 2:6281573/1‑93 (MQ=255)
gTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGa < 2:620626/93‑1 (MQ=255)
tAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGaa < 1:2982218/93‑1 (MQ=255)
tAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGaa > 2:3767426/1‑93 (MQ=255)
aaCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAg < 2:2381367/93‑1 (MQ=255)
aCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGt > 1:6021427/1‑93 (MQ=255)
aaCACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACNTTCACCACCGATGNANGAAGTCAc > 1:1428113/1‑93 (MQ=255)
aaCACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAc > 2:5660184/1‑93 (MQ=255)
aaCACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAc < 1:5030575/93‑1 (MQ=255)
acacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACt > 1:4974588/1‑93 (MQ=255)
cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt > 2:6406879/1‑93 (MQ=255)
|
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTT > NC_000913/3471826‑3472005
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGAA > NC_000913/3471823‑3472009
|
TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACT < SRR4302534.5578686/94‑1 (MQ=60)
AGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTC > SRR4302534.3848067/1‑94 (MQ=60)
AGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTC > SRR4302534.1143089/1‑94 (MQ=60)
AGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTC > SRR4302534.4985698/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCG < SRR4302534.3249677/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG < SRR4302534.4112410/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG > SRR4302534.2590333/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGG < SRR4302534.1094885/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTC < SRR4302534.1516987/94‑1 (MQ=60)
TCACGCCATACTGGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTC < SRR4302534.3417507/94‑1 (MQ=60)
CACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCT < SRR4302534.212655/94‑1 (MQ=60)
ACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTT < SRR4302534.3034217/94‑1 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA < SRR4302534.5206484/94‑1 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA > SRR4302534.4839376/1‑94 (MQ=60)
GCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTA > SRR4302534.677551/1‑94 (MQ=60)
CCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAA < SRR4302534.3307318/94‑1 (MQ=60)
CATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCGAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAAC > SRR4302534.812291/1‑94 (MQ=60)
CATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAAC > SRR4302534.993250/1‑94 (MQ=60)
CATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAAC > SRR4302534.635056/1‑94 (MQ=60)
ATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACA < SRR4302534.6045487/94‑1 (MQ=60)
TACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACAC > SRR4302534.6562720/1‑94 (MQ=60)
ACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACG < SRR4302534.2666340/94‑1 (MQ=60)
ACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACA < SRR4302534.4796296/94‑1 (MQ=60)
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TTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAC > SRR4302534.2213513/1‑94 (MQ=60)
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TGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACC < SRR4302534.61433/94‑1 (MQ=60)
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GAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGC > SRR4302534.1665334/1‑94 (MQ=60)
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AACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCA > SRR4302534.2813870/1‑94 (MQ=60)
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CGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCAC < SRR4302534.1442742/94‑1 (MQ=60)
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GAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACG > SRR4302534.1806242/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGG > SRR4302534.6002945/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGG > SRR4302534.543630/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATC < SRR4302534.3545291/94‑1 (MQ=60)
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GCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAG > SRR4302534.2996620/1‑94 (MQ=60)
CTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGG < SRR4302534.5514718/94‑1 (MQ=60)
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TACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGAT > SRR4302534.1063019/1‑94 (MQ=60)
ACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATC < SRR4302534.2801732/94‑1 (MQ=60)
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GGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCAC > SRR4302534.6644805/1‑94 (MQ=60)
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CCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGGGCTCCT > SRR4302534.3884292/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGTTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTG < SRR4302534.5319415/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTG < SRR4302534.5575150/94‑1 (MQ=60)
GGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGC > SRR4302534.2098295/1‑94 (MQ=60)
AGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAG > SRR4302534.5018925/1‑94 (MQ=60)
AGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAG > SRR4302534.6081752/1‑94 (MQ=60)
GCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGG < SRR4302534.3857098/94‑1 (MQ=60)
CAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGT > SRR4302534.663494/1‑94 (MQ=60)
CAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGT < SRR4302534.4085036/94‑1 (MQ=60)
CAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGT < SRR4302534.2706523/94‑1 (MQ=60)
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TCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGT > SRR4302534.2471420/1‑94 (MQ=60)
TCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGT < SRR4302534.4926560/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGT < SRR4302534.3016409/94‑1 (MQ=60)
TCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGG > SRR4302534.1547953/1‑94 (MQ=60)
CAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTG < SRR4302534.3958477/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGA < SRR4302534.5978523/94‑1 (MQ=60)
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AGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGAC > SRR4302534.5804171/1‑94 (MQ=60)
CGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCT > SRR4302534.1082138/1‑94 (MQ=60)
CGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCT < SRR4302534.5962341/94‑1 (MQ=60)
CGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCT < SRR4302534.904467/94‑1 (MQ=60)
GCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTT > SRR4302534.151494/1‑94 (MQ=60)
GCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTT < SRR4302534.649423/94‑1 (MQ=60)
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CACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTC < SRR4302534.771841/94‑1 (MQ=60)
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ACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCA > SRR4302534.4649375/1‑94 (MQ=60)
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TACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCG > SRR4302534.1301736/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGA > SRR4302534.666625/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGAT < SRR4302534.919946/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGAT < SRR4302534.6382675/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGGTACCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATG > SRR4302534.6440565/1‑94 (MQ=60)
GGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATG < SRR4302534.5450675/94‑1 (MQ=60)
GTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGT < SRR4302534.4913492/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTA < SRR4302534.6393622/94‑1 (MQ=60)
GTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAG < SRR4302534.6333417/94‑1 (MQ=60)
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AACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGT < SRR4302534.2680863/94‑1 (MQ=60)
AACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGT > SRR4302534.162613/1‑94 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTACCACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA < SRR4302534.2311179/94‑1 (MQ=60)
CGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCA < SRR4302534.1463517/94‑1 (MQ=60)
GAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACNTTCACCACCGATGNANGAAGTCAC > SRR4302534.1465696/1‑94 (MQ=60)
GAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAC > SRR4302534.131938/1‑94 (MQ=60)
GAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCAC < SRR4302534.3624068/94‑1 (MQ=60)
AACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACT < SRR4302534.5166457/94‑1 (MQ=60)
AACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACT > SRR4302534.5109255/1‑94 (MQ=60)
AACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACT < SRR4302534.3807420/94‑1 (MQ=60)
ACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTT > SRR4302534.6203789/1‑94 (MQ=60)
CACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTTGGAAGTCACTTC < SRR4302534.4708077/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCG < SRR4302534.4046400/94‑1 (MQ=60)
ACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCG > SRR4302534.1689118/1‑94 (MQ=60)
CTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGA > SRR4302534.565646/1‑94 (MQ=60)
TCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGAA < SRR4302534.1127866/94‑1 (MQ=60)
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TAGGACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGAA > NC_000913/3471823‑3472009
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
