Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,887,809 |
A→G |
intergenic (+35/‑56) |
b3708 → / → tnaB |
tryptophanase/low affinity tryptophan permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,887,809 | 0 | A | G | 100.0%
| 717.2
/ NA
| 205 | intergenic (+35/‑56) | b3708/tnaB | tryptophanase/low affinity tryptophan permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (111/94); total (111/94) |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCA > NC_000913/3887719‑3887897
|
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ttACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGct < 2:5671426/93‑1 (MQ=255)
tacgtacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGctc > 1:5281453/1‑93 (MQ=255)
acgtacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGctct > 1:5719948/1‑93 (MQ=255)
acgtacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGctct > 1:2121011/1‑93 (MQ=255)
gtacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGctctct > 2:5031305/1‑93 (MQ=255)
tacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCtt > 2:1670695/1‑93 (MQ=255)
tacgAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCtt < 1:2465600/93‑1 (MQ=255)
gAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAcc < 1:1528537/93‑1 (MQ=255)
gAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAcc < 2:4576011/93‑1 (MQ=255)
aaCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAccc < 2:1114566/93‑1 (MQ=255)
aaCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAccc > 1:4775093/1‑93 (MQ=255)
aaCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAccc > 1:4666021/1‑93 (MQ=255)
aaCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTAccc > 1:3239070/1‑93 (MQ=255)
aCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCt < 2:4095470/93‑1 (MQ=255)
aCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCt > 2:4855347/1‑93 (MQ=255)
cGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTAc > 1:4824117/1‑93 (MQ=255)
gAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTGAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACa > 1:5150228/1‑93 (MQ=255)
gAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACa < 1:3204119/93‑1 (MQ=255)
aaaGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACAt > 2:1473664/1‑93 (MQ=255)
aaaGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACAt > 2:5689033/1‑93 (MQ=255)
aaGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATc < 2:3538911/93‑1 (MQ=255)
aGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACGCTACATcc > 1:306514/1‑93 (MQ=255)
aGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATcc < 2:1275962/93‑1 (MQ=255)
tATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCta > 2:3224644/1‑92 (MQ=255)
tATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTc < 1:3748392/93‑1 (MQ=255)
ttGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCaa < 1:4025148/93‑1 (MQ=255)
cGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATaa > 1:3143/1‑93 (MQ=255)
gTCACTTCACNGCAAAACTTAAAGNAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAc < 1:2883970/93‑1 (MQ=255)
gTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAc > 2:309674/1‑93 (MQ=255)
gTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAc > 1:1939549/1‑93 (MQ=255)
gTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAc > 1:4857531/1‑93 (MQ=255)
cTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACaaaa > 1:6062756/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACaaaaa < 2:2080817/93‑1 (MQ=255)
tCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAAt < 1:923811/93‑1 (MQ=255)
cGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATGCTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc < 1:5798938/93‑1 (MQ=255)
cGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc < 2:3517883/93‑1 (MQ=255)
cGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTACCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGcc < 1:557177/93‑1 (MQ=255)
gCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCt > 1:5446598/1‑93 (MQ=255)
cAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCtt > 1:1837073/1‑93 (MQ=255)
cAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAAAAAAATAGCCtt < 1:1485977/93‑1 (MQ=255)
aaaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTc < 1:1040755/93‑1 (MQ=255)
aaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTcc < 2:4203862/93‑1 (MQ=255)
aaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTcc > 2:618306/1‑93 (MQ=255)
aaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTcc < 1:1358820/93‑1 (MQ=255)
aaaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTcc > 1:6387412/1‑93 (MQ=255)
aaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCct < 1:824028/93‑1 (MQ=255)
aaCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCct > 1:4298563/1‑93 (MQ=255)
aCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctc < 2:4972846/93‑1 (MQ=255)
aCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctc > 1:277883/1‑93 (MQ=255)
aCTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctc < 2:6357642/93‑1 (MQ=255)
cTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCctct < 2:5249429/93‑1 (MQ=255)
ttAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTa < 2:3431204/93‑1 (MQ=255)
tAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTaa > 1:1110824/1‑93 (MQ=255)
tAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTaa > 1:1877917/1‑93 (MQ=255)
aagaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAg < 2:1870293/93‑1 (MQ=255)
aagaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAg > 1:4438534/1‑93 (MQ=255)
gaagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGt > 2:2542546/1‑93 (MQ=255)
aagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTg < 2:4476888/93‑1 (MQ=255)
aagTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTg > 1:2322439/1‑93 (MQ=255)
agTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTgg > 2:5080542/1‑93 (MQ=255)
agTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTgg > 2:5515634/1‑93 (MQ=255)
gTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGc < 2:3898453/93‑1 (MQ=255)
gTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGc < 1:2301149/93‑1 (MQ=255)
tttAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGca > 1:5029870/1‑93 (MQ=255)
taattaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGcatc < 1:3468080/93‑1 (MQ=255)
attaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGcatcat > 2:2937014/1‑93 (MQ=255)
ttaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATg > 2:5730681/1‑93 (MQ=255)
ttaatACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATg > 1:3156963/1‑93 (MQ=255)
atACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACt > 1:3572629/1‑93 (MQ=255)
atACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGCGGCATCATGACt > 2:6000615/1‑93 (MQ=255)
tactacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTg > 2:4932115/1‑93 (MQ=255)
ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt < 1:2371905/93‑1 (MQ=255)
ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt < 2:4666815/93‑1 (MQ=255)
ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt > 2:3925382/1‑93 (MQ=255)
ctacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGAt < 1:5005252/93‑1 (MQ=255)
tacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATc < 1:42969/93‑1 (MQ=255)
tacAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATc > 2:1313885/1‑93 (MQ=255)
agagTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAg > 1:152460/1‑93 (MQ=255)
agagTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAg > 1:6303414/1‑93 (MQ=255)
gagTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGc < 1:5335169/93‑1 (MQ=255)
agTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCt < 1:3388035/93‑1 (MQ=255)
gCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaa > 2:5588604/1‑93 (MQ=255)
gCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaa > 1:1132202/1‑93 (MQ=255)
cTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaa < 1:227894/93‑1 (MQ=255)
tataAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaa > 2:5834958/1‑93 (MQ=255)
ataAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaaa > 1:3950970/1‑93 (MQ=255)
ataAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaaa > 2:1205763/1‑93 (MQ=255)
ataAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACACTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaaa > 2:4316224/1‑93 (MQ=255)
taAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaaaa > 2:3579821/1‑93 (MQ=255)
taAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGaaaaaaa < 2:5889908/93‑1 (MQ=255)
aaGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAg > 2:364019/1‑93 (MQ=255)
aaGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAg < 2:180183/93‑1 (MQ=255)
aaGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAg > 2:4689318/1‑93 (MQ=255)
aGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGc > 1:3640104/1‑93 (MQ=255)
aGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGc > 2:2644742/1‑93 (MQ=255)
gATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCAc > 2:730777/1‑93 (MQ=255)
tGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCActc > 1:3045346/1‑93 (MQ=255)
gTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCActct > 2:5367253/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCa > 2:783758/1‑93 (MQ=255)
|
TTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCA > NC_000913/3887719‑3887897
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTG > NC_000913/3887716‑3887902
|
CCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCG < SRR4302534.3280267/94‑1 (MQ=60)
CCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCG < SRR4302534.3804692/94‑1 (MQ=60)
CTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGC > SRR4302534.6034445/1‑94 (MQ=60)
CTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGC > SRR4302534.5115594/1‑94 (MQ=60)
TTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCT > SRR4302534.4395390/1‑94 (MQ=60)
TTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTC > SRR4302534.5424059/1‑94 (MQ=60)
TACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCT > SRR4302534.2176847/1‑94 (MQ=60)
TACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCT > SRR4302534.5874913/1‑94 (MQ=60)
CGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCT > SRR4302534.936413/1‑94 (MQ=60)
CGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCT < SRR4302534.2851982/94‑1 (MQ=60)
TACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTA < SRR4302534.2531111/94‑1 (MQ=60)
TACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTA < SRR4302534.114632/94‑1 (MQ=60)
GAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCC > SRR4302534.4904765/1‑94 (MQ=60)
GAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCC < SRR4302534.1568652/94‑1 (MQ=60)
GAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCC > SRR4302534.3325246/1‑94 (MQ=60)
GAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCC > SRR4302534.4792699/1‑94 (MQ=60)
AACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCT < SRR4302534.3881173/94‑1 (MQ=60)
ACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTA > SRR4302534.5178897/1‑94 (MQ=60)
CCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTAC > SRR4302534.4955036/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTGAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACA > SRR4302534.5289167/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACA < SRR4302534.5399143/94‑1 (MQ=60)
CGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACA > SRR4302534.1556666/1‑94 (MQ=60)
GAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACAT < SRR4302534.3289082/94‑1 (MQ=60)
AAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATC < SRR4302534.1201341/94‑1 (MQ=60)
AAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACGCTACATCC > SRR4302534.314417/1‑94 (MQ=60)
AAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCC < SRR4302534.6610606/94‑1 (MQ=60)
AGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCT < SRR4302534.5669717/94‑1 (MQ=60)
TATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCA < SRR4302534.3849079/94‑1 (MQ=60)
TATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACACTACATCCTCA > SRR4302534.965328/1‑94 (MQ=60)
TTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAAT < SRR4302534.4133079/94‑1 (MQ=60)
GCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAA > SRR4302534.3237/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAC > SRR4302534.1990265/1‑94 (MQ=60)
CGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAC > SRR4302534.4989325/1‑94 (MQ=60)
GTCACTTCACNGCAAAACTTAAAGNAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACA < SRR4302534.2959666/94‑1 (MQ=60)
CACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAA > SRR4302534.2273516/1‑94 (MQ=60)
ACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAA > SRR4302534.6227608/1‑94 (MQ=60)
TCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATA < SRR4302534.947336/94‑1 (MQ=60)
TCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAAGACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATA < SRR4302534.3078853/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < SRR4302534.4870778/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC > SRR4302534.5030532/1‑94 (MQ=60)
ACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < SRR4302534.4934078/94‑1 (MQ=60)
CCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCC < SRR4302534.1918921/94‑1 (MQ=60)
CCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAACAACAAAAATAGCC > SRR4302534.5859654/1‑94 (MQ=60)
CGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATGCTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCT < SRR4302534.5956298/94‑1 (MQ=60)
CGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCT > SRR4302534.5593344/1‑94 (MQ=60)
CGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTACCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCT < SRR4302534.570912/94‑1 (MQ=60)
GCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGTCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCGACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTT < SRR4302534.2422858/94‑1 (MQ=60)
GCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTT > SRR4302534.1884833/1‑94 (MQ=60)
GCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTT < SRR4302534.4066814/94‑1 (MQ=60)
CAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC > SRR4302534.1567866/1‑94 (MQ=60)
CAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAAAAAAATAGCCTTC < SRR4302534.1525069/94‑1 (MQ=60)
AAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCC < SRR4302534.1067629/94‑1 (MQ=60)
AAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCC > SRR4302534.6559948/1‑94 (MQ=60)
AAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT > SRR4302534.4415041/1‑94 (MQ=60)
AAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT < SRR4302534.2437264/94‑1 (MQ=60)
AAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT < SRR4302534.1394625/94‑1 (MQ=60)
AAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT < SRR4302534.4410007/94‑1 (MQ=60)
AACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTC < SRR4302534.4970797/94‑1 (MQ=60)
AACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTC > SRR4302534.285072/1‑94 (MQ=60)
AACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTC < SRR4302534.844761/94‑1 (MQ=60)
ACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT > SRR4302534.3134794/1‑94 (MQ=60)
ACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT < SRR4302534.3821009/94‑1 (MQ=60)
CTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTA > SRR4302534.44117/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAA > SRR4302534.1139802/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAA > SRR4302534.1926820/1‑94 (MQ=60)
AAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAG > SRR4302534.4558427/1‑94 (MQ=60)
AGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGT < SRR4302534.5157091/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTG > SRR4302534.2384079/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTG > SRR4302534.5454720/1‑94 (MQ=60)
AAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGG < SRR4302534.1952559/94‑1 (MQ=60)
AAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGG < SRR4302534.3312043/94‑1 (MQ=60)
AGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGC > SRR4302534.2382302/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCA < SRR4302534.1125931/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCA > SRR4302534.5165732/1‑94 (MQ=60)
GTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCA < SRR4302534.2362228/94‑1 (MQ=60)
GTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCA > SRR4302534.4624598/1‑94 (MQ=60)
TAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCA < SRR4302534.3240112/94‑1 (MQ=60)
TAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCA < SRR4302534.3561290/94‑1 (MQ=60)
ATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATG > SRR4302534.3240111/1‑94 (MQ=60)
TAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGAC < SRR4302534.5939122/94‑1 (MQ=60)
AATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACT > SRR4302534.3668721/1‑94 (MQ=60)
AATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACT < SRR4302534.317904/94‑1 (MQ=60)
AATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACT > SRR4302534.6538378/1‑94 (MQ=60)
ATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTG > SRR4302534.6053832/1‑94 (MQ=60)
CTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATC < SRR4302534.5140552/94‑1 (MQ=60)
CTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATC < SRR4302534.2434886/94‑1 (MQ=60)
CTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATC > SRR4302534.415279/1‑94 (MQ=60)
TACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCA < SRR4302534.44116/94‑1 (MQ=60)
ACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAA < SRR4302534.1839566/94‑1 (MQ=60)
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CAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAG > SRR4302534.6473873/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAG > SRR4302534.2036211/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAG > SRR4302534.3597752/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAG > SRR4302534.156429/1‑94 (MQ=60)
CAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAG > SRR4302534.4459215/1‑94 (MQ=60)
GAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCT < SRR4302534.5479031/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTG < SRR4302534.3233250/94‑1 (MQ=60)
AGTGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTG < SRR4302534.3478901/94‑1 (MQ=60)
TGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAA > SRR4302534.3500392/1‑94 (MQ=60)
TGGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAA > SRR4302534.1514288/1‑94 (MQ=60)
GGCTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAA > SRR4302534.1161800/1‑94 (MQ=60)
CTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAA < SRR4302534.233853/94‑1 (MQ=60)
CTATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAA < SRR4302534.233852/94‑1 (MQ=60)
TATAAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAA > SRR4302534.4056743/1‑94 (MQ=60)
AAGGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGC > SRR4302534.3737934/1‑94 (MQ=60)
GGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCAC < SRR4302534.5558492/94‑1 (MQ=60)
GGATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCAC > SRR4302534.3697809/1‑94 (MQ=60)
GATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACT < SRR4302534.3462152/94‑1 (MQ=60)
ATGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTC > SRR4302534.3125223/1‑94 (MQ=60)
TGTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCT < SRR4302534.6312059/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTG < SRR4302534.4517942/94‑1 (MQ=60)
TAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCA < SRR4302534.6489197/94‑1 (MQ=60)
TAGCCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCA > SRR4302534.2583035/1‑94 (MQ=60)
CCGCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTT < SRR4302534.1537229/94‑1 (MQ=60)
GCTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTG < SRR4302534.489376/94‑1 (MQ=60)
|
CCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTAAAGGTGGCATCATGACTGATCAAGCTGAAAAAAAGCACTCTGCATTTTG > NC_000913/3887716‑3887902
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
