Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,896,324 |
+G |
coding (698/711 nt) |
b3718 ← |
putative isomerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,896,324 | 1 | . | G | 99.5%
| 701.2
/ ‑3.9
| 201 | coding (698/711 nt) | b3718 | putative isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (111/89); total (112/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACA > NC_000913/3896232‑3896410
|
ttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑Ca > 1:4895541/1‑93 (MQ=255)
tCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑Cag > 1:3745153/1‑92 (MQ=255)
tCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑Cag < 1:2451988/93‑2 (MQ=255)
cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑Cagc > 2:2224830/1‑91 (MQ=255)
ttATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCtt > 1:661731/1‑93 (MQ=255)
aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTa < 1:6161230/93‑1 (MQ=255)
tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTAt > 2:3291644/1‑93 (MQ=255)
tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTAt < 2:5059261/93‑1 (MQ=255)
ttAAATAATGAGAACAGGCCGTAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATc < 2:2584450/93‑1 (MQ=255)
ttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATc < 1:2184557/93‑1 (MQ=255)
ttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATc < 1:1480702/93‑1 (MQ=255)
aaaTAATGAGAACAGGCCGGTGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAg > 1:5251616/1‑93 (MQ=255)
aaaTAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAg > 1:2865640/1‑93 (MQ=255)
aaaTAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAg > 2:3210736/1‑93 (MQ=255)
aataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGc > 2:1828949/1‑93 (MQ=255)
aataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGc < 1:3086295/93‑1 (MQ=255)
ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCg > 1:4138574/1‑93 (MQ=255)
taatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGa < 2:3777478/93‑1 (MQ=255)
aatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGAt < 2:2690557/93‑1 (MQ=255)
atGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGAtt < 2:452896/93‑1 (MQ=255)
agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTAcc > 1:1946671/1‑93 (MQ=255)
gaACAGGCCGGAGCGTAATTCACGCATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAGCCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 2:6328772/93‑1 (MQ=255)
gaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa > 1:1454708/1‑93 (MQ=255)
gaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 1:5738585/93‑1 (MQ=255)
gaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa > 1:3036770/1‑93 (MQ=255)
aaCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAt > 1:3540820/1‑93 (MQ=255)
aaCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAt > 2:2833347/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATc > 1:3831996/1‑93 (MQ=255)
aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATc < 1:4558142/93‑1 (MQ=255)
cAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCa < 2:2097905/93‑1 (MQ=255)
aGGCCGGAGCGTAATTCCCACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAg < 1:3700437/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGc < 2:1512520/93‑1 (MQ=255)
gCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCg > 1:83253/1‑93 (MQ=255)
gCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCg < 2:5769386/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGaa > 2:657608/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGaa < 1:564604/93‑1 (MQ=255)
ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg > 1:2362057/1‑93 (MQ=255)
ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg < 2:3723402/93‑1 (MQ=255)
ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg < 1:5388123/93‑1 (MQ=255)
ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg > 2:1365852/1‑93 (MQ=255)
ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAg > 1:3273616/1‑93 (MQ=255)
aGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGa < 2:4073089/93‑1 (MQ=255)
gCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAt < 2:4391184/93‑1 (MQ=255)
gCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAt < 1:337116/93‑1 (MQ=255)
gTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGc > 2:4279295/1‑93 (MQ=255)
gTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGc < 1:4479522/93‑1 (MQ=255)
tAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCa < 2:817695/93‑1 (MQ=255)
aaTTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAg < 2:3558641/93‑1 (MQ=255)
aaTTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAg < 2:1650113/93‑1 (MQ=255)
aaTTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAg > 2:3865126/1‑93 (MQ=255)
cacacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGc > 2:5657956/1‑93 (MQ=255)
cacacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGc > 2:1463984/1‑93 (MQ=255)
cacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCaa < 1:2968760/93‑1 (MQ=255)
caTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAaca > 2:3111105/1‑93 (MQ=255)
caTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAaca < 1:25437/93‑1 (MQ=255)
tCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGTGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg > 1:1167295/1‑93 (MQ=255)
tCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg > 1:5897144/1‑93 (MQ=255)
cGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGa > 1:3500122/1‑93 (MQ=255)
gCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAg > 2:1198324/1‑93 (MQ=255)
cTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCt > 2:3131756/1‑93 (MQ=255)
ttATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTg > 1:5191078/1‑93 (MQ=255)
ttATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTg < 2:4996049/93‑1 (MQ=255)
tATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTgg > 2:3191665/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGa > 1:5047819/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGa > 2:4920510/1‑93 (MQ=255)
tttCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGaa < 2:5448851/93‑1 (MQ=255)
ttCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAc > 2:1979528/1‑93 (MQ=255)
tCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACa > 1:6362004/1‑93 (MQ=255)
tCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACa > 1:3569702/1‑93 (MQ=255)
cTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACAt < 1:5055970/93‑1 (MQ=255)
ttAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCCA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGTAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATc > 1:59606/1‑93 (MQ=255)
ttAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATc > 2:6408426/1‑93 (MQ=255)
ttAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATc > 2:4266768/1‑93 (MQ=255)
aGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTc > 1:2707149/1‑93 (MQ=255)
aGCTTAACCGAGTGCTAATCCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTCCCATGAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTc < 2:1416235/93‑1 (MQ=255)
gCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCg > 2:5197387/1‑93 (MQ=255)
gCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCg < 2:1101643/93‑1 (MQ=255)
gCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCg < 2:3713096/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCgg > 1:1281804/1‑93 (MQ=255)
ttAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGt > 1:4969050/1‑93 (MQ=255)
tAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTa > 1:1676591/1‑93 (MQ=255)
aCCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAc > 1:5121099/1‑93 (MQ=255)
aCCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAc > 2:2321906/1‑93 (MQ=255)
aCCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAc > 1:991857/1‑93 (MQ=255)
aCCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAc > 1:4294030/1‑93 (MQ=255)
ccGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAcc > 2:4903528/1‑93 (MQ=255)
ccGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAcc > 1:4167048/1‑93 (MQ=255)
gAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAcctg > 2:2382034/1‑91 (MQ=255)
gAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCgg > 2:4702412/1‑93 (MQ=255)
gAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCgg > 2:4317368/1‑93 (MQ=255)
aGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGa > 1:6172870/1‑93 (MQ=255)
gCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCt < 2:6447081/93‑1 (MQ=255)
cTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCtt < 1:4237376/93‑1 (MQ=255)
aaTTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc < 2:3450578/93‑1 (MQ=255)
aaTTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc > 2:1849323/1‑93 (MQ=255)
aaTTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc > 2:6209096/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCa > 1:5280549/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCa < 2:25193/93‑1 (MQ=255)
cTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGaa > 1:927853/1‑93 (MQ=255)
gCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACa > 2:5258686/1‑93 (MQ=255)
|
TTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACA > NC_000913/3896232‑3896410
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTT > NC_000913/3896231‑3896414
|
TTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA < SRR4302534.4987805/94‑1 (MQ=60)
TTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA > SRR4302534.5028266/1‑94 (MQ=60)
TTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA < SRR4302534.291326/94‑1 (MQ=60)
TTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑G > SRR4302534.3845764/1‑94 (MQ=60)
TTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGGAATTCACACATCCCGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCTAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑G > SRR4302534.1927916/1‑94 (MQ=60)
TCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAgc < SRR4302534.4391546/94‑3 (MQ=60)
TCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAgc < SRR4302534.2517137/94‑3 (MQ=60)
CGGAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAgcg > SRR4302534.6102789/1‑91 (MQ=60)
TAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGC < SRR4302534.1592970/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCT > SRR4302534.1410747/1‑94 (MQ=60)
AGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCT > SRR4302534.5053681/1‑94 (MQ=60)
GTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTT > SRR4302534.677823/1‑94 (MQ=60)
ATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTAT < SRR4302534.6328817/94‑1 (MQ=60)
ATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTAT > SRR4302534.2455321/1‑94 (MQ=60)
TTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATC > SRR4302534.2798734/1‑94 (MQ=60)
TTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCA < SRR4302534.1519637/94‑1 (MQ=60)
TTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCA < SRR4302534.2242312/94‑1 (MQ=60)
TAAATAATGAGAACAGGCCGGTGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAG > SRR4302534.5393516/1‑94 (MQ=60)
TAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAG < SRR4302534.5723070/94‑1 (MQ=60)
TAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAG > SRR4302534.2940908/1‑94 (MQ=60)
TAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAG < SRR4302534.5851108/94‑1 (MQ=60)
TAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCCAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCCG > SRR4302534.3505480/1‑94 (MQ=60)
AATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCG > SRR4302534.4250260/1‑94 (MQ=60)
AATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCG < SRR4302534.4635247/94‑1 (MQ=60)
AATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCG < SRR4302534.3167395/94‑1 (MQ=60)
AATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCCTTATCAGCG < SRR4302534.6535986/94‑1 (MQ=60)
ATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGA > SRR4302534.3177040/1‑94 (MQ=60)
AATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATT < SRR4302534.3655078/94‑1 (MQ=60)
GAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACC > SRR4302534.1997623/1‑94 (MQ=60)
GAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACC < SRR4302534.4574098/94‑1 (MQ=60)
AGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCT > SRR4302534.1312139/1‑94 (MQ=60)
AGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCA > SRR4302534.1492970/1‑94 (MQ=60)
AGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCA > SRR4302534.3116401/1‑94 (MQ=60)
GAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAT > SRR4302534.4634319/1‑94 (MQ=60)
GAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAT < SRR4302534.5894109/94‑1 (MQ=60)
GAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAT > SRR4302534.3636072/1‑94 (MQ=60)
AACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATC > SRR4302534.3934909/1‑94 (MQ=60)
ACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCA < SRR4302534.4681719/94‑1 (MQ=60)
CAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAG > SRR4302534.252954/1‑94 (MQ=60)
AGGCCGGAGCGTAATTCCCACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGC < SRR4302534.3799914/94‑1 (MQ=60)
AGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGC < SRR4302534.3151630/94‑1 (MQ=60)
AGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAAACGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTAGCATCAGC > SRR4302534.5016944/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCG > SRR4302534.85482/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCG < SRR4302534.5972585/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG > SRR4302534.3360855/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG < SRR4302534.626515/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG < SRR4302534.578486/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG > SRR4302534.2424759/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG < SRR4302534.273053/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAG > SRR4302534.4103082/1‑94 (MQ=60)
GGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGG < SRR4302534.5533243/94‑1 (MQ=60)
GGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGG < SRR4302534.531948/94‑1 (MQ=60)
GAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGT > SRR4302534.5300734/1‑94 (MQ=60)
GAGCGTAATTCACACATCCGGCCGTATTTCTTCAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTCATCAACGATTACCACCACCGAAGAA > SRR4302534.673787/1‑94 (MQ=60)
GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG < SRR4302534.345746/94‑1 (MQ=60)
GTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCA < SRR4302534.4600710/94‑1 (MQ=60)
ATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCT > SRR4302534.2006009/1‑94 (MQ=60)
TCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGC > SRR4302534.3001935/1‑94 (MQ=60)
TCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGC > SRR4302534.677995/1‑94 (MQ=60)
ACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAA > SRR4302534.236263/1‑94 (MQ=60)
ACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAA > SRR4302534.947477/1‑94 (MQ=60)
CACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAAC < SRR4302534.3046503/94‑1 (MQ=60)
ACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACA < SRR4302534.5875751/94‑1 (MQ=60)
CATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACAC < SRR4302534.26107/94‑1 (MQ=60)
CATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACAC > SRR4302534.3827689/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGTGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACG > SRR4302534.1197952/1‑94 (MQ=60)
ATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACG > SRR4302534.6057262/1‑94 (MQ=60)
CCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGA < SRR4302534.517994/94‑1 (MQ=60)
CCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGA > SRR4302534.3594244/1‑94 (MQ=60)
CCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGA > SRR4302534.4269321/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACCGAAG > SRR4302534.3494988/1‑94 (MQ=60)
GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGC > SRR4302534.5385865/1‑94 (MQ=60)
CCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCT < SRR4302534.5225582/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG < SRR4302534.3777225/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG < SRR4302534.5402108/94‑1 (MQ=60)
CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG > SRR4302534.5331023/1‑94 (MQ=60)
TATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGA > SRR4302534.5184117/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACA > SRR4302534.3665711/1‑94 (MQ=60)
TTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACA > SRR4302534.6533803/1‑94 (MQ=60)
CTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCCA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGTAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC > SRR4302534.61223/1‑94 (MQ=60)
CTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC < SRR4302534.5192532/94‑1 (MQ=60)
TTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCT > SRR4302534.955253/1‑94 (MQ=60)
TAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGGTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTT > SRR4302534.5458077/1‑94 (MQ=60)
TAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTT > SRR4302534.149558/1‑94 (MQ=60)
TAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTT < SRR4302534.305978/94‑1 (MQ=60)
AAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTC > SRR4302534.2778634/1‑94 (MQ=60)
GCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGG > SRR4302534.1315544/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGT > SRR4302534.5103587/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGT < SRR4302534.4315346/94‑1 (MQ=60)
TTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTA > SRR4302534.1720215/1‑94 (MQ=60)
AACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAC > SRR4302534.1017235/1‑94 (MQ=60)
AACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAC > SRR4302534.5259374/1‑94 (MQ=60)
AACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAC > SRR4302534.6338339/1‑94 (MQ=60)
AACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAC > SRR4302534.4410384/1‑94 (MQ=60)
ACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACC > SRR4302534.4279605/1‑94 (MQ=60)
CGAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGG > SRR4302534.5174752/1‑94 (MQ=60)
GAGTGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGA > SRR4302534.6340798/1‑94 (MQ=60)
TGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAAGCGGACCT > SRR4302534.3421556/1‑94 (MQ=60)
TGCTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCT < SRR4302534.2951410/94‑1 (MQ=60)
CTAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTG < SRR4302534.4351605/94‑1 (MQ=60)
TAATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGC > SRR4302534.2179808/1‑94 (MQ=60)
AATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCA < SRR4302534.389047/94‑1 (MQ=60)
AATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCA > SRR4302534.5423134/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAG < SRR4302534.6063072/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGCGG‑AAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAG > SRR4302534.6462553/1‑94 (MQ=60)
TCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAA < SRR4302534.423753/94‑1 (MQ=60)
TCTGCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAA > SRR4302534.951469/1‑94 (MQ=60)
GCGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACAT > SRR4302534.1519577/1‑94 (MQ=60)
CGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATT > SRR4302534.5079509/1‑94 (MQ=60)
CGG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATT < SRR4302534.4185991/94‑1 (MQ=60)
GG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTT > SRR4302534.654726/1‑94 (MQ=60)
GG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTT > SRR4302534.3824493/1‑94 (MQ=60)
GG‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTT > SRR4302534.1607687/1‑94 (MQ=60)
G‑CAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTT < SRR4302534.6276882/94‑1 (MQ=60)
|
TTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGG‑CA‑CGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTT > NC_000913/3896231‑3896414
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
