Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,362,298 |
T→C |
Q108R (CAG→CGG) |
dsbD ← |
thiol:disulfide interchange protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,362,298 | 0 | T | C | 99.7%
| 978.0
/ NA
| 285 | Q108R (CAG→CGG) | dsbD | thiol:disulfide interchange protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (143/141); minor base G (0/1); total (143/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362208‑4362387
|
aacggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCgg > 2:263119/1‑93 (MQ=255)
acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTTCCGCACTCGCCCGGt > 1:4463712/1‑93 (MQ=255)
acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGt > 1:844528/1‑93 (MQ=255)
acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGt < 2:5831623/93‑1 (MQ=255)
cggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGtt > 1:4225445/1‑93 (MQ=255)
gaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGa > 2:3872923/1‑93 (MQ=255)
aacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGAt < 2:5057051/93‑1 (MQ=255)
aacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGAt > 2:2007535/1‑93 (MQ=255)
acggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATg > 2:717115/1‑93 (MQ=255)
acggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATg > 2:5741954/1‑93 (MQ=255)
cggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATgg < 2:6258751/93‑1 (MQ=255)
cggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATgg < 1:2254362/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTg < 2:6411677/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTg < 1:817881/93‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTg > 1:5837019/1‑93 (MQ=255)
ttttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGa > 1:216182/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACgg > 1:5367008/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACgg > 2:2835554/1‑93 (MQ=255)
ggTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACggg > 2:4344180/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGa > 1:5347440/1‑93 (MQ=255)
tttCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGaa < 2:1489358/93‑1 (MQ=255)
tttCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATAGTGACGGGaa < 1:951434/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGc > 1:6152876/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGt > 2:5433948/1‑93 (MQ=255)
ggATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc < 2:2389993/93‑1 (MQ=255)
ggATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc > 1:5503889/1‑93 (MQ=255)
gATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGcc > 2:6368539/1‑93 (MQ=255)
gATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGcc > 1:2327821/1‑93 (MQ=255)
gATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGcc > 2:1020494/1‑93 (MQ=255)
aTAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCg < 2:5686662/93‑1 (MQ=255)
aaCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGAt < 1:5619196/93‑1 (MQ=255)
aCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATc < 1:3098810/93‑1 (MQ=255)
aCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATc > 1:6374631/1‑93 (MQ=255)
aGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgc < 2:2540763/93‑1 (MQ=255)
aaaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCgg > 1:3907808/1‑93 (MQ=255)
aaaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCgg > 1:4651815/1‑93 (MQ=255)
aaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGt < 1:4137797/93‑1 (MQ=255)
aaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGt > 2:12658/1‑93 (MQ=255)
aCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTa > 2:3593773/1‑93 (MQ=255)
ccGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTaa < 1:1342013/93‑1 (MQ=255)
gCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtc < 1:5299253/93‑1 (MQ=255)
cATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCCCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtct < 2:2505260/93‑1 (MQ=255)
cATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtct < 2:2435396/93‑1 (MQ=255)
cATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtct < 2:4564261/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtctc < 1:1478428/93‑1 (MQ=255)
cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt < 2:1630153/93‑1 (MQ=255)
cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt < 2:2800509/93‑1 (MQ=255)
cacaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCttt < 2:5985109/93‑1 (MQ=255)
acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCCCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 2:3195154/93‑1 (MQ=255)
acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 1:4053811/93‑1 (MQ=255)
acaGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtttt < 2:3009006/93‑1 (MQ=255)
gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTgtc > 1:5987450/1‑91 (MQ=255)
gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGcc > 1:623518/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGcc > 1:2012510/1‑93 (MQ=255)
gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGACGANCGCGGTAAATCTCGCNTTTNcc > 2:1376037/1‑93 (MQ=255)
gCCCTAGTAGGTGACAGTAAACAACGCACCCGCACTCACCAGGTTGTTGATGACGGGAAGCGTCAGCCGATCACGGTAAATCTCGCTTTTGcc < 1:6470742/93‑1 (MQ=255)
cccTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCg < 2:2349185/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGt > 1:5032402/1‑93 (MQ=255)
ccTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCCCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGt < 1:548068/93‑1 (MQ=255)
cTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTa > 1:5535503/1‑93 (MQ=255)
cTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTa > 1:2867457/1‑93 (MQ=255)
ggTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCGCTCGCCGGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaa < 2:2683060/93‑1 (MQ=255)
gTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaaa > 2:4692254/1‑93 (MQ=255)
tAGGTGCCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc < 1:4742401/93‑1 (MQ=255)
tAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc > 1:3408215/1‑93 (MQ=255)
tAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc < 2:1866335/93‑1 (MQ=255)
ggTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTc < 1:79037/93‑1 (MQ=255)
tGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCAt > 1:1540701/1‑93 (MQ=255)
gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc < 1:2569505/93‑1 (MQ=255)
gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc > 1:1310480/1‑93 (MQ=255)
gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc < 1:1232108/93‑1 (MQ=255)
aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt < 1:2703030/93‑1 (MQ=255)
cAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCtt > 2:6239740/1‑93 (MQ=255)
aGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTc > 1:2757327/1‑93 (MQ=255)
aGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTc < 1:3671160/93‑1 (MQ=255)
gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCa > 1:163475/1‑93 (MQ=255)
aCGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGcc < 1:5418564/93‑1 (MQ=255)
aCGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGcc < 1:5136393/93‑1 (MQ=255)
cGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCa < 2:3770389/93‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCGCGCTCGCCCGGTTTATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCTGGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAg < 1:4855642/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGa < 2:211794/93‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGa < 1:3006010/93‑1 (MQ=255)
cGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGAc > 2:3481072/1‑93 (MQ=255)
cGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGAc > 2:1217273/1‑93 (MQ=255)
tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc < 1:1030256/93‑1 (MQ=255)
tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc < 2:5086528/93‑1 (MQ=255)
cccGCACTCGCCCGGTTGCTGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCt > 1:3187840/1‑93 (MQ=255)
cccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCt < 2:494470/93‑1 (MQ=255)
ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt < 2:3534241/93‑1 (MQ=255)
ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt > 1:3506343/1‑93 (MQ=255)
ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt < 2:173068/93‑1 (MQ=255)
ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt > 1:2386817/1‑93 (MQ=255)
cGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTg < 2:1825702/93‑1 (MQ=255)
cGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTg > 1:3740629/1‑93 (MQ=255)
gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 1:1106225/93‑1 (MQ=255)
gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGGAAATCTAGCTTTTGCCGTAAAAGTCATCCTCATGCCAGACGCCttac > 1:5785275/1‑91 (MQ=255)
aCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCgg > 1:4331680/1‑93 (MQ=255)
cTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGc > 2:4124511/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCa > 2:926347/1‑93 (MQ=255)
gCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 1:1967962/93‑1 (MQ=255)
|
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362208‑4362387
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCA > NC_000913/4362205‑4362391
|
CTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCC > SRR4302534.4269526/1‑94 (MQ=60)
TTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCG < SRR4302534.3698712/94‑1 (MQ=60)
TAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGG > SRR4302534.2255509/1‑94 (MQ=60)
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTTCCGCACTCGCCCGGT > SRR4302534.4584408/1‑94 (MQ=60)
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGT > SRR4302534.865811/1‑94 (MQ=60)
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGT > SRR4302534.3690774/1‑94 (MQ=60)
ACGGATCGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTT < SRR4302534.4980985/94‑1 (MQ=60)
ACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTT > SRR4302534.5524712/1‑94 (MQ=60)
ACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTT > SRR4302534.4339337/1‑94 (MQ=60)
CGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTG < SRR4302534.849280/94‑1 (MQ=60)
CGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTG > SRR4302534.2331588/1‑94 (MQ=60)
CGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTG > SRR4302534.836808/1‑94 (MQ=60)
CGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTG > SRR4302534.4256336/1‑94 (MQ=60)
CGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTG > SRR4302534.6579915/1‑94 (MQ=60)
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AACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATG > SRR4302534.5725055/1‑94 (MQ=60)
AACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATG > SRR4302534.6346753/1‑94 (MQ=60)
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CGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGT < SRR4302534.2314124/94‑1 (MQ=60)
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ATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGA > SRR4302534.5567820/1‑94 (MQ=60)
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GGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATC < SRR4302534.5768334/94‑1 (MQ=60)
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AGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCC > SRR4302534.2065163/1‑94 (MQ=60)
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GGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAA > SRR4302534.5506291/1‑94 (MQ=60)
GTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAC > SRR4302534.3499755/1‑94 (MQ=60)
TAGGTGCCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACT < SRR4302534.4871142/94‑1 (MQ=60)
TAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACT > SRR4302534.964629/1‑94 (MQ=60)
TAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACT > SRR4302534.5581897/1‑94 (MQ=60)
TAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACT < SRR4302534.149159/94‑1 (MQ=60)
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AGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTC < SRR4302534.648299/94‑1 (MQ=60)
AGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTC > SRR4302534.3067285/1‑94 (MQ=60)
GGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCA < SRR4302534.2393911/94‑1 (MQ=60)
GGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCA < SRR4302534.81164/94‑1 (MQ=60)
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TGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATC > SRR4302534.1345036/1‑94 (MQ=60)
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GACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCT < SRR4302534.2637589/94‑1 (MQ=60)
GACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCT > SRR4302534.5981334/1‑94 (MQ=60)
GACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCT > SRR4302534.3526910/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAACACTCATCTT > SRR4302534.5471020/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTT < SRR4302534.2774423/94‑1 (MQ=60)
CAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTC > SRR4302534.2829957/1‑94 (MQ=60)
AGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCA > SRR4302534.167758/1‑94 (MQ=60)
AGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCA < SRR4302534.3769856/94‑1 (MQ=60)
AGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCA > SRR4302534.6631938/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCAT > SRR4302534.2776064/1‑94 (MQ=60)
TTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATG > SRR4302534.6056761/1‑94 (MQ=60)
TAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTCTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGC > SRR4302534.2775394/1‑94 (MQ=60)
ACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCA < SRR4302534.5564355/94‑1 (MQ=60)
ACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCA < SRR4302534.5275032/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAG > SRR4302534.771884/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTCCCGCGCTCGCCCGGTTTATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCTGGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGA < SRR4302534.4987375/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGAC > SRR4302534.5808985/1‑94 (MQ=60)
TCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGAC < SRR4302534.3084650/94‑1 (MQ=60)
CGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACG > SRR4302534.832341/1‑94 (MQ=60)
CGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACG < SRR4302534.2766204/94‑1 (MQ=60)
CGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACG < SRR4302534.2347971/94‑1 (MQ=60)
CGCTCCCGCACTCCCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACG < SRR4302534.1167934/94‑1 (MQ=60)
GCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGC < SRR4302534.3499147/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCACTCGCCCGGTTGCTGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCT > SRR4302534.3272210/1‑94 (MQ=60)
TCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCT < SRR4302534.1056798/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCT < SRR4302534.2033105/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCT > SRR4302534.4547393/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTT > SRR4302534.3600664/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTT < SRR4302534.6005603/94‑1 (MQ=60)
CCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTT > SRR4302534.2450241/1‑94 (MQ=60)
CCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTT > SRR4302534.563179/1‑94 (MQ=60)
CCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTG > SRR4302534.3841132/1‑94 (MQ=60)
CGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGGAAATCTAGCTTTTGCCGTAAAAGTCATCCTCATGCCAGACGCCTTAC > SRR4302534.5942197/1‑94 (MQ=60)
GCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCG < SRR4302534.1135064/94‑1 (MQ=60)
GCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCG > SRR4302534.839225/1‑94 (MQ=60)
GCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCG < SRR4302534.2031030/94‑1 (MQ=60)
CACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGG > SRR4302534.4448817/1‑94 (MQ=60)
CACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGG > SRR4302534.4228065/1‑94 (MQ=60)
CACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGG < SRR4302534.1230068/94‑1 (MQ=60)
ACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGC < SRR4302534.6234798/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCA > SRR4302534.5386236/1‑94 (MQ=60)
CTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCA > SRR4302534.1306145/1‑94 (MQ=60)
CTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACGCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCA < SRR4302534.4278216/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAG < SRR4302534.2555617/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > SRR4302534.3771823/1‑94 (MQ=60)
CGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > SRR4302534.4407413/1‑94 (MQ=60)
GCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCT < SRR4302534.2019478/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCT < SRR4302534.1590739/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCT > SRR4302534.6119628/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTG < SRR4302534.5300610/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTG < SRR4302534.2930638/94‑1 (MQ=60)
CCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTCTTGCCGTAAAACTCATCTTAATGCCAGACGCCATGCGGCAGCTG > SRR4302534.3098517/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGC > SRR4302534.1221363/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGC > SRR4302534.3638017/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGC < SRR4302534.3567054/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCA > SRR4302534.3310205/1‑94 (MQ=60)
|
CTTAACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGCTGCA > NC_000913/4362205‑4362391
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
