Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F2 I207 R1
|
218 |
45.0 |
2482936 |
97.1% |
2410930 |
86.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
4,034,572 |
T→G |
Q74H (CAA→CAC) |
mobB ← |
molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 4,034,572 | 0 | T | G | 100.0%
| 215.3
/ NA
| 62 | Q74H (CAA→CAC) | mobB | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (27/35); total (27/35) |
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATG > NZ_CP009273/4034486‑4034658
|
tCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgc < 2:910794/90‑1 (MQ=255)
aGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctgg > 2:1046851/1‑90 (MQ=255)
tGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCtggctggc < 1:663432/90‑1 (MQ=255)
gAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCa < 2:1011061/90‑1 (MQ=255)
tATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGGTGGCAACGa < 2:336798/90‑1 (MQ=255)
tATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGa < 1:1133631/90‑1 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 1:1171594/1‑90 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 1:29416/1‑90 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 1:62197/1‑90 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 2:356639/1‑90 (MQ=255)
aTTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGtt < 1:1231855/90‑1 (MQ=255)
ttCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGttt > 1:1112563/1‑90 (MQ=255)
gACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAGGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTtgtg > 1:110324/1‑90 (MQ=255)
cTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc < 2:166389/90‑1 (MQ=255)
cTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc < 2:429684/90‑1 (MQ=255)
cTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc > 2:787486/1‑90 (MQ=255)
tGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc < 1:584147/88‑1 (MQ=255)
tGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc > 2:584147/1‑88 (MQ=255)
tGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgg > 2:227941/1‑89 (MQ=255)
gCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgcg > 1:866651/1‑90 (MQ=255)
gagaAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGcc < 1:430109/90‑1 (MQ=255)
gagaAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGcc > 2:620778/1‑90 (MQ=255)
aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 1:379825/90‑1 (MQ=255)
aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 2:219179/90‑1 (MQ=255)
aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 2:483323/90‑1 (MQ=255)
ccAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCt < 2:348020/90‑1 (MQ=255)
ccAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCt < 1:620778/90‑1 (MQ=255)
cAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTc > 1:1119599/1‑90 (MQ=255)
cAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTc > 2:387723/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAg > 1:229248/1‑86 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAg < 2:229248/86‑1 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:320101/1‑90 (MQ=255)
ctctTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATa > 2:306992/1‑90 (MQ=255)
cttcttCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGc < 1:1081739/90‑1 (MQ=255)
cttcttCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGc < 1:496003/90‑1 (MQ=255)
tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCt < 2:1199738/73‑1 (MQ=255)
tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCt > 1:1199738/1‑73 (MQ=255)
tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTa > 1:429017/1‑90 (MQ=255)
tcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCt > 2:1064809/1‑90 (MQ=255)
gTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCttt > 2:146041/1‑90 (MQ=255)
gTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCttt > 1:295154/1‑90 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc < 2:616216/90‑1 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc > 2:467383/1‑90 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc > 2:1056265/1‑90 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc < 1:210114/90‑1 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc < 2:1145089/90‑1 (MQ=255)
tGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGcc > 2:862387/1‑90 (MQ=255)
tttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCt < 1:693141/90‑1 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 2:1213756/90‑1 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 2:492430/90‑1 (MQ=255)
tcatcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCaa < 1:332133/90‑1 (MQ=255)
tcatcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCaa < 2:292675/90‑1 (MQ=255)
catcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAc < 2:47903/90‑1 (MQ=255)
tcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGC‑ATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:245910/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:1119599/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:175168/90‑1 (MQ=255)
aGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCa < 2:866651/90‑1 (MQ=255)
ggCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCat < 1:1064809/90‑1 (MQ=255)
cccATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCatat < 1:306992/90‑1 (MQ=255)
cATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCa > 2:878512/1‑90 (MQ=255)
aTCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCAt > 2:632609/1‑90 (MQ=255)
tCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATg < 1:809740/90‑1 (MQ=255)
|
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATG > NZ_CP009273/4034486‑4034658
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > NZ_CP009273/4034473‑4034671
|
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGG < SRR3722089.510678/100‑1 (MQ=60)
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGG < SRR3722089.927362/100‑1 (MQ=60)
CAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGC < SRR3722089.482398/100‑1 (MQ=60)
ATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGC < SRR3722089.988547/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722089.792933/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722089.370771/100‑1 (MQ=60)
GCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAT > SRR3722089.1189425/1‑100 (MQ=60)
GCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAT > SRR3722089.29772/1‑100 (MQ=60)
GCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAT > SRR3722089.62955/1‑100 (MQ=60)
TGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTT < SRR3722089.671986/100‑1 (MQ=60)
GAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTT > SRR3722089.1129416/1‑100 (MQ=60)
GTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAGGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTG > SRR3722089.111676/1‑100 (MQ=60)
TATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGC < SRR3722089.1150873/100‑1 (MQ=60)
CATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCG > SRR3722089.879070/1‑100 (MQ=60)
ATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGC < SRR3722089.1250585/100‑1 (MQ=60)
CTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCT < SRR3722089.591164/100‑1 (MQ=60)
GAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGC < SRR3722089.435286/100‑1 (MQ=60)
ACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTC > SRR3722089.1136580/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTctgtctcttatacacatctgacgctgccgacgaccatctt > SRR3722089.743590/1‑60 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722089.324144/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722089.232159/1‑100 (MQ=60)
AGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGC < SRR3722089.384462/100‑1 (MQ=60)
ATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCctgtctc > SRR3722089.1217979/1‑93 (MQ=60)
ATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTA > SRR3722089.434186/1‑100 (MQ=60)
CCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATC < SRR3722089.628590/100‑1 (MQ=60)
GCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTT > SRR3722089.298924/1‑100 (MQ=60)
CTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCC < SRR3722089.501881/100‑1 (MQ=60)
CTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCC < SRR3722089.1098027/100‑1 (MQ=60)
TGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCA < SRR3722089.212760/100‑1 (MQ=60)
TTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATC < SRR3722089.702179/100‑1 (MQ=60)
TCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATC < SRR3722089.336287/100‑1 (MQ=60)
GGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGC < SRR3722089.1080796/100‑1 (MQ=60)
CCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGT < SRR3722089.310886/100‑1 (MQ=60)
TCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGC < SRR3722089.821036/100‑1 (MQ=60)
GTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > SRR3722089.651842/1‑100 (MQ=60)
GTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > SRR3722089.114206/1‑100 (MQ=60)
|
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > NZ_CP009273/4034473‑4034671
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
