Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F2 I199 R1
|
220 |
57.5 |
3163680 |
97.0% |
3068769 |
86.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
4,034,572 |
T→G |
Q74H (CAA→CAC) |
mobB ← |
molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 4,034,572 | 0 | T | G | 100.0%
| 251.7
/ NA
| 76 | Q74H (CAA→CAC) | mobB | molybdopterin‑guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (27/49); total (27/49) |
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATG > NZ_CP009273/4034486‑4034658
|
tCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgc < 1:774486/90‑1 (MQ=255)
tCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgc < 1:127512/90‑1 (MQ=255)
tCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgc < 2:1542944/90‑1 (MQ=255)
cAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctg > 2:1441529/1‑90 (MQ=255)
cAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctg > 2:54164/1‑90 (MQ=255)
cAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctg > 2:1139160/1‑90 (MQ=255)
gCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTgctggc > 1:1149714/1‑90 (MQ=255)
tGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCtggctggc < 2:507687/90‑1 (MQ=255)
gAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCa < 1:1139160/90‑1 (MQ=255)
tATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGa < 1:915289/90‑1 (MQ=255)
tATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGa < 2:439996/90‑1 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 1:1242411/1‑90 (MQ=255)
aTCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAt > 2:1250762/1‑90 (MQ=255)
tGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgc > 1:235017/1‑90 (MQ=255)
gCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCcgcg > 2:1325001/1‑90 (MQ=255)
gagaAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGcc < 1:123561/90‑1 (MQ=255)
gagaAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGcc < 1:1366802/90‑1 (MQ=255)
aaCTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGcc > 2:747901/1‑90 (MQ=255)
gTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgc > 1:1314287/1‑90 (MQ=255)
aGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 2:1486809/90‑1 (MQ=255)
aGATCCAGCTCTTCTTCGCCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 1:1261091/90‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAg < 1:880298/90‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAg < 1:1063259/90‑1 (MQ=255)
tCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGc > 1:676541/1‑90 (MQ=255)
cAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTc < 2:1123963/90‑1 (MQ=255)
cAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTc > 1:864702/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc > 2:626820/1‑69 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGcc < 1:626820/69‑1 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:997361/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 2:141306/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:383676/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:1214372/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:1570977/1‑90 (MQ=255)
aGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCa > 1:858864/1‑90 (MQ=255)
cttcttCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGc < 2:1314287/90‑1 (MQ=255)
tcttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCCCGCCAGCCTTGCGCCGCTCATAGCTa > 1:1264952/1‑90 (MQ=255)
ttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATc < 2:1040457/90‑1 (MQ=255)
ttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATc < 1:1476814/90‑1 (MQ=255)
ttcGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATc < 1:983768/90‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCttt > 1:951486/1‑90 (MQ=255)
ggTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCt < 2:1357916/90‑1 (MQ=255)
ggTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCt < 1:10918/90‑1 (MQ=255)
gtgtTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTg < 1:1250762/90‑1 (MQ=255)
gtgtTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTg > 2:809835/1‑90 (MQ=255)
tttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCt < 1:1497299/90‑1 (MQ=255)
tttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCt < 2:1513128/90‑1 (MQ=255)
tttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCt < 2:1494581/90‑1 (MQ=255)
ttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCtt < 2:463039/90‑1 (MQ=255)
ttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCtt > 2:1130719/1‑90 (MQ=255)
ttCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCtt > 1:274090/1‑90 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 2:1149714/90‑1 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 1:1325001/90‑1 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 1:1245226/90‑1 (MQ=255)
gTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCa < 2:798715/90‑1 (MQ=255)
tcatcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCaa < 2:1264952/90‑1 (MQ=255)
tcatcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCaa < 2:676541/90‑1 (MQ=255)
catcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAc < 1:860937/90‑1 (MQ=255)
catcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAc > 1:566867/1‑90 (MQ=255)
atcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACa < 2:1554956/90‑1 (MQ=255)
atcaAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACa < 2:34986/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:714367/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:540856/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:951486/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:494355/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:360542/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:1570977/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 2:1240968/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 1:1183283/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 1:1130719/90‑1 (MQ=255)
caAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATc < 1:1086833/90‑1 (MQ=255)
gCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCata < 1:1493542/90‑1 (MQ=255)
ccATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATc < 2:612453/90‑1 (MQ=255)
cATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCa > 2:363435/1‑90 (MQ=255)
aTCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc > 1:916427/1‑47 (MQ=255)
aTCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTgcgc < 2:916427/47‑1 (MQ=255)
tCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATg < 1:721094/90‑1 (MQ=255)
|
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATG > NZ_CP009273/4034486‑4034658
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > NZ_CP009273/4034473‑4034671
|
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGG < SRR3722078.630160/100‑1 (MQ=60)
ATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGC > SRR3722078.1167439/1‑100 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722078.617972/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722078.694001/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722078.769596/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722078.650793/100‑1 (MQ=60)
TCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCT < SRR3722078.88604/100‑1 (MQ=60)
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAA < SRR3722078.128984/100‑1 (MQ=60)
TCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAA < SRR3722078.784502/100‑1 (MQ=60)
GCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGAT > SRR3722078.1262040/1‑100 (MQ=60)
GAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTT < SRR3722078.1156658/100‑1 (MQ=60)
TATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGC < SRR3722078.927713/100‑1 (MQ=60)
CCATTCGTCTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGC > SRR3722078.237878/1‑100 (MQ=60)
ataagagacagCTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCT < SRR3722078.634033/89‑1 (MQ=60)
GCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGC > SRR3722078.1335286/1‑100 (MQ=60)
GAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGC < SRR3722078.125000/100‑1 (MQ=60)
GAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGC < SRR3722078.1388796/100‑1 (MQ=60)
AAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGC > SRR3722078.684345/1‑100 (MQ=60)
ACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTC > SRR3722078.876277/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722078.1596542/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722078.388354/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722078.1011890/1‑100 (MQ=60)
CTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722078.870350/1‑100 (MQ=60)
CTGAAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCA > SRR3722078.1233459/1‑100 (MQ=60)
AGATCCAGCTCTTCTTCGCCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGC < SRR3722078.1281081/100‑1 (MQ=60)
ATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTTTGCCCCGCCAGCCTTGCGCCGCTCATAGCTA > SRR3722078.1285024/1‑100 (MQ=60)
ATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTA < SRR3722078.892136/100‑1 (MQ=60)
ATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTA < SRR3722078.1079269/100‑1 (MQ=60)
GCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTT > SRR3722078.964854/1‑100 (MQ=60)
TTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGC < SRR3722078.997991/100‑1 (MQ=60)
TTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGC < SRR3722078.1500907/100‑1 (MQ=60)
CGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTT > SRR3722078.277428/1‑100 (MQ=60)
GGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAA < SRR3722078.11041/100‑1 (MQ=60)
GTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAC < SRR3722078.1270566/100‑1 (MQ=60)
GTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAAC > SRR3722078.573508/1‑100 (MQ=60)
TTTCCGTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATC < SRR3722078.1521703/100‑1 (MQ=60)
GTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATAT < SRR3722078.1346182/100‑1 (MQ=60)
GTCATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATAT < SRR3722078.1264919/100‑1 (MQ=60)
CATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCA < SRR3722078.872455/100‑1 (MQ=60)
ATCAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCctgtctcttatacacatctgacgctgccgacga > SRR3722078.928875/1‑67 (MQ=60)
CAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGG < SRR3722078.1201781/100‑1 (MQ=60)
CAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGG < SRR3722078.1148030/100‑1 (MQ=60)
CAAGGCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGG < SRR3722078.1103306/100‑1 (MQ=60)
GCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCG > SRR3722078.142895/1‑100 (MQ=60)
GCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCG < SRR3722078.1517890/100‑1 (MQ=60)
GCCCATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTCGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCG > SRR3722078.1037009/1‑100 (MQ=60)
CATCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCtgtctcttatacacat > SRR3722078.1512969/1‑84 (MQ=60)
TCGGTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGC < SRR3722078.730028/100‑1 (MQ=60)
GTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCActgtctcttatacacatctgacgctgc > SRR3722078.695268/1‑73 (MQ=60)
GTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > SRR3722078.884130/1‑100 (MQ=60)
|
GACCAGAATCAAATCCAGCTTTGAGGTATCCATTCGACTTGCGAGAAACTGTAGATCCAGCTCTTCTTCGTCTGGTGTTTCCGTCATCAAGGCCCATCGTTGCTGGCTGGCAACGATGGTTTGTGCCGCGCCAGCCTTGCGCAGCTCATAGCTATCTTTGCCTGGCTTATCAACATCCATATCATGGTGCGTATGCTTA > NZ_CP009273/4034473‑4034671
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
