Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F86 I0 R1
|
593 |
297.4 |
9515568 |
94.4% |
8982696 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
581,203 |
A→T |
94.2% |
intergenic (‑114/‑310) |
ompT ← / → pauD |
DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/tRNA‑OTHER |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 581,203 | 0 | A | T | 94.2%
| 421.7
/ 10.8
| 117 | intergenic (‑114/‑310) | ompT/pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/tRNA‑OTHER |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/2); new base T (51/59); total (56/61) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTT > CP009273/581057‑581352
|
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tGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATca > 2:3664949/1‑150 (MQ=255)
tCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTcaca < 2:1493746/150‑1 (MQ=255)
tCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTcaca < 2:1493754/150‑1 (MQ=255)
tCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTcaca < 2:2935375/150‑1 (MQ=255)
cAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACaa > 2:1320658/1‑150 (MQ=255)
cAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACaa > 2:3713810/1‑150 (MQ=255)
ggACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATg < 1:3078120/150‑1 (MQ=255)
gACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATgc < 2:1238437/150‑1 (MQ=255)
gACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATgc < 2:1238538/150‑1 (MQ=255)
aCTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATgcg < 1:2402770/150‑1 (MQ=255)
cTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATgcgc < 1:1048212/150‑1 (MQ=255)
cAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGt < 1:3473904/150‑1 (MQ=255)
aGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGtt > 1:3104612/1‑150 (MQ=255)
aGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGtt < 1:1555767/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGttt < 1:464003/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGttt < 1:102421/150‑1 (MQ=255)
aGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGttttt < 2:1896600/150‑1 (MQ=255)
cccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTaa < 1:2525520/150‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAt < 1:2335957/150‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAt < 1:2335985/150‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAt < 1:2336282/150‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAt < 1:1388412/150‑1 (MQ=255)
gTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTAt < 2:577952/150‑1 (MQ=255)
tctcCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTg < 1:3198976/150‑1 (MQ=255)
tcCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGtt < 1:2594551/150‑1 (MQ=255)
tcCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGtt < 1:2594558/150‑1 (MQ=255)
tcCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGtt < 2:4390594/150‑1 (MQ=255)
tcCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGtt < 2:4390448/150‑1 (MQ=255)
aTTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCa < 1:4110072/150‑1 (MQ=255)
aTTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCa > 1:1261883/1‑150 (MQ=255)
cAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCatat < 1:4291781/150‑1 (MQ=255)
tCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTc < 1:2072375/150‑1 (MQ=255)
tCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTc < 1:4456974/150‑1 (MQ=255)
gTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCgg > 2:1341144/1‑150 (MQ=255)
ttttAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGt > 1:3578041/1‑150 (MQ=255)
ttAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGttt < 1:2134670/150‑1 (MQ=255)
aTGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAc < 1:2608473/150‑1 (MQ=255)
aTGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAc > 2:4608036/1‑150 (MQ=255)
aTGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAc < 2:2550461/150‑1 (MQ=255)
tGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACt < 1:3993006/150‑1 (MQ=255)
tGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACt < 1:2926007/150‑1 (MQ=255)
gATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtg > 2:874388/1‑150 (MQ=255)
aTTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgt > 1:2304842/1‑150 (MQ=255)
gAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg > 2:3123232/1‑150 (MQ=255)
gAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg > 1:1374412/1‑150 (MQ=255)
gAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg > 1:3768105/1‑150 (MQ=255)
tatGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGtt > 1:622864/1‑150 (MQ=255)
atGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGttt > 2:3793278/1‑150 (MQ=255)
ttttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTa < 2:2660719/150‑1 (MQ=255)
tttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTAt < 1:4390854/150‑1 (MQ=255)
tttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTAt < 1:248242/150‑1 (MQ=255)
ttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATg < 2:3398967/150‑1 (MQ=255)
tttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGc > 2:58475/1‑150 (MQ=255)
atatCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCttt < 2:3254422/150‑1 (MQ=255)
tatCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCAATGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATTATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTTGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCtttt < 1:1642052/150‑1 (MQ=255)
aaCTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTgtggt < 1:1269488/150‑1 (MQ=255)
cTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGc > 1:930293/1‑150 (MQ=255)
tAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCtt < 1:1749339/150‑1 (MQ=255)
aTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCtttt > 2:274565/1‑150 (MQ=255)
aTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCtttt > 2:274414/1‑150 (MQ=255)
tGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATTCTTTTGTGGTGCTTTTa > 1:883100/1‑150 (MQ=255)
tGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTa < 2:4042654/150‑1 (MQ=255)
tGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTa < 2:4618794/150‑1 (MQ=255)
cAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTAt > 1:2482985/1‑150 (MQ=255)
aaTTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTTTGGTGCTTTTATCTAtt > 1:1431619/1‑150 (MQ=255)
aCATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAg < 2:2494814/150‑1 (MQ=255)
aCATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAg > 1:1266515/1‑150 (MQ=255)
cATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGt < 1:3969420/150‑1 (MQ=255)
cATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGt > 2:1347659/1‑150 (MQ=255)
aatatTGCTAAACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTTAATGATTTTCACAATGCGATATCAGATTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGTTTTTACTTTGTGGTTTATTTATGATTATGTGGTTCTTTTATCTATTTaatt > 2:3321787/2‑148 (MQ=255)
gCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATg < 2:3104612/150‑1 (MQ=255)
ccACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCt > 2:342045/1‑150 (MQ=255)
ccACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCt > 2:2713796/1‑150 (MQ=255)
aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCttt < 2:3334197/150‑1 (MQ=255)
aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCttt < 2:3336611/150‑1 (MQ=255)
gTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTaga > 1:1832322/1‑150 (MQ=255)
gTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTaga < 1:2463833/150‑1 (MQ=255)
tttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 1:1417031/150‑1 (MQ=255)
ttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAgg > 2:4167593/1‑150 (MQ=255)
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ATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATG > SRR19973082.4654236/1‑150 (MQ=60)
ATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATG > SRR19973082.4654735/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGG < SRR19973082.3736781/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGG < SRR19973082.1329783/150‑1 (MQ=60)
TTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGT > SRR19973082.1662670/1‑150 (MQ=60)
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GGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGT > CP009273/581062‑581350
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
