Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
581,203 |
A→T |
100% |
intergenic (‑114/‑310) |
ompT ← / → pauD |
DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/tRNA‑OTHER |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 581,203 | 0 | A | T | 100.0%
| 783.3
/ NA
| 234 | intergenic (‑114/‑310) | ompT/pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/tRNA‑OTHER |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (104/130); total (104/130) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATG > CP009273/581057‑581346
|
gTCAGGACTATTCCCAGAATTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTATTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTca < 2:2465554/149‑1 (MQ=255)
tCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTcac < 2:1681703/149‑1 (MQ=255)
aGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACaa < 2:1180992/149‑1 (MQ=255)
aCTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATgc < 2:2706850/149‑1 (MQ=255)
aTTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCt > 1:2842374/1‑149 (MQ=255)
cAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTg < 1:4063417/149‑1 (MQ=255)
aGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGt < 2:1751734/149‑1 (MQ=255)
aGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGt < 1:3791209/149‑1 (MQ=255)
gAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACaa > 2:2809637/1‑136 (MQ=255)
gAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACaa < 1:2809637/136‑1 (MQ=255)
gAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGtt < 1:3409515/149‑1 (MQ=255)
tCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGt < 2:3961956/149‑1 (MQ=255)
tCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGt < 2:736406/149‑1 (MQ=255)
tCGCCCGCAGCAAAGGTCTCCATGCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGt < 2:3962475/149‑1 (MQ=255)
cGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGtt < 2:690356/149‑1 (MQ=255)
cGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGtt < 1:3608926/149‑1 (MQ=255)
gCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGttt < 1:743234/149‑1 (MQ=255)
cccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTa > 1:3423868/1‑149 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATGTGTTTTTGGtttca > 1:832041/1‑147 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTaa < 1:2911923/149‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTaa < 2:1773758/149‑1 (MQ=255)
ccGCATAAAAGTTCTACATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAAATTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTaa < 2:3485586/149‑1 (MQ=255)
gCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAtt < 1:1029089/149‑1 (MQ=255)
gCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAtt < 1:3076309/149‑1 (MQ=255)
gCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAtt > 2:1068501/1‑149 (MQ=255)
gCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAtt < 1:1727433/149‑1 (MQ=255)
cATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTa > 1:1708177/1‑149 (MQ=255)
aaaaGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCt < 2:1824368/149‑1 (MQ=255)
aaaaGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATATTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCAATGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCTCTCTCTTTTTTAGGTTTAATTATCt > 2:471601/1‑149 (MQ=255)
aaaGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTg < 1:1444754/149‑1 (MQ=255)
aGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGtt < 1:3691430/149‑1 (MQ=255)
gTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTa > 1:3649935/1‑149 (MQ=255)
gTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTa < 2:3854376/149‑1 (MQ=255)
gTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTa < 2:3855409/149‑1 (MQ=255)
ccATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGtt < 1:1210788/149‑1 (MQ=255)
cATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGttt > 1:2734309/1‑149 (MQ=255)
cATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGttt < 1:414426/149‑1 (MQ=255)
ttCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCa < 1:3335129/149‑1 (MQ=255)
tCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCat > 2:255299/1‑149 (MQ=255)
tCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCat < 1:436827/149‑1 (MQ=255)
tCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCat < 2:2774797/149‑1 (MQ=255)
aaTCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCatat < 2:375027/149‑1 (MQ=255)
aaTCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCatat < 2:1318883/149‑1 (MQ=255)
aTCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAGTTATCTGTTATTGTTTCATAtt > 1:2493336/1‑149 (MQ=255)
aTCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATAtt < 1:3662237/149‑1 (MQ=255)
aTCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATAtt < 1:481270/149‑1 (MQ=255)
cGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTc > 2:1544481/1‑149 (MQ=255)
ttttAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTGATTGTTTCATATTTCgg > 2:1917706/1‑149 (MQ=255)
tttAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGt > 2:437464/1‑149 (MQ=255)
aaTGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGtttt > 1:634196/1‑149 (MQ=255)
aaTGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGtttt > 1:2698048/1‑149 (MQ=255)
tGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAc > 1:2733317/1‑149 (MQ=255)
gAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTAGGTTTTAAtgtgt > 2:3560384/1‑149 (MQ=255)
aaTATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg > 2:648204/1‑149 (MQ=255)
aaTATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg < 1:3737138/149‑1 (MQ=255)
aaTATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACtgtgtg > 1:2165246/1‑149 (MQ=255)
tatGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAGTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAATGTGTGGt > 2:2492099/1‑149 (MQ=255)
tGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGttt > 1:3129081/1‑149 (MQ=255)
tATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGttttt > 2:408889/1‑149 (MQ=255)
tATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTGAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAGTGTGTGGttttt > 2:1792961/1‑149 (MQ=255)
tATTTTTTATATATAACTTAATTAGTCAATTAAATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGttttt < 1:3963304/149‑1 (MQ=255)
tttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTa < 2:2233758/149‑1 (MQ=255)
ttttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTAt < 2:2219405/149‑1 (MQ=255)
ttATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGc < 2:841063/149‑1 (MQ=255)
tatCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCttt > 2:1109570/1‑149 (MQ=255)
aCTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGTTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTgtggt < 2:3336912/149‑1 (MQ=255)
aCTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTgtggt < 2:2408241/149‑1 (MQ=255)
aCTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGATTTTgtggt > 2:2929178/1‑149 (MQ=255)
ttAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGc < 1:896235/149‑1 (MQ=255)
ttAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGc < 1:1917593/149‑1 (MQ=255)
aTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGTTTCttt > 2:1868866/1‑149 (MQ=255)
aTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCttt < 2:2843695/149‑1 (MQ=255)
aTGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCttt < 2:3348730/149‑1 (MQ=255)
gAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGGTTTTa > 1:3895467/1‑149 (MQ=255)
aGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTAt < 1:401230/149‑1 (MQ=255)
gTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATc < 2:3129081/149‑1 (MQ=255)
aaTTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTAt < 2:2733329/149‑1 (MQ=255)
aaTTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTAt < 2:2734309/149‑1 (MQ=255)
aTTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTAtt < 1:408889/149‑1 (MQ=255)
ttACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTAttt > 1:2588972/1‑149 (MQ=255)
ttGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATATATTTAAGTGcc > 1:1579648/1‑149 (MQ=255)
tGCTCCACTTTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCa < 1:2217501/149‑1 (MQ=255)
tCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGc > 2:3258604/1‑149 (MQ=255)
aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCtt < 1:503404/149‑1 (MQ=255)
aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCtt < 1:2371855/149‑1 (MQ=255)
cTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCAttt > 2:3761974/1‑149 (MQ=255)
tttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTaga < 1:3525758/149‑1 (MQ=255)
ttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 1:2469846/149‑1 (MQ=255)
tataTTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAgg < 2:4023691/149‑1 (MQ=255)
gTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAg < 2:902039/149‑1 (MQ=255)
gTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAg < 2:1475013/149‑1 (MQ=255)
tttAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGc > 1:113532/1‑149 (MQ=255)
aGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaa < 2:2673358/149‑1 (MQ=255)
gTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaa < 2:2698048/149‑1 (MQ=255)
tATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCGTTAGAGGCATATAAGCGaaaa > 1:3947504/1‑149 (MQ=255)
ttGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATATGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTGTTGTGGTGGTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaaaaa > 2:3620811/1‑147 (MQ=255)
tGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAg < 1:1313370/149‑1 (MQ=255)
aaTGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAATCGAAAATAGCa > 2:2334397/1‑149 (MQ=255)
aaTGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTGTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCa > 1:811873/1‑149 (MQ=255)
aTGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCAt > 2:1713648/1‑149 (MQ=255)
|
TGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATG > CP009273/581057‑581346
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTTGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGG > CP009273/581054‑581349
|
GGTTGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTT > SRR19973068.3899350/1‑150 (MQ=60)
TTGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTC < SRR19973068.1421655/150‑1 (MQ=60)
GTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCAC < SRR19973068.240678/150‑1 (MQ=60)
ctcttccgatctAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAAT < SRR19973068.2827102/138‑1 (MQ=60)
TATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCT > SRR19973068.2860086/1‑150 (MQ=60)
TATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCG > SRR19973068.2859859/1‑150 (MQ=60)
ATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTA < SRR19973068.3661421/150‑1 (MQ=60)
CCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTG < SRR19973068.2159087/150‑1 (MQ=60)
CAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGT > SRR19973068.930767/1‑150 (MQ=60)
CAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGT < SRR19973068.4087841/150‑1 (MQ=60)
AGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTT < SRR19973068.3813898/150‑1 (MQ=60)
GAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTT > SRR19973068.4101931/1‑150 (MQ=60)
GAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTT < SRR19973068.3430115/150‑1 (MQ=60)
GAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTT < SRR19973068.3429269/150‑1 (MQ=60)
GAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTT > SRR19973068.1495520/1‑150 (MQ=60)
GAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTT < SRR19973068.994476/150‑1 (MQ=60)
AGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTT < SRR19973068.1833932/150‑1 (MQ=60)
GTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTG < SRR19973068.2866493/150‑1 (MQ=60)
TCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTT < SRR19973068.3609070/150‑1 (MQ=60)
CGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTT < SRR19973068.3630836/150‑1 (MQ=60)
GCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAGTGCGCGATCTGTTTTTGGTTTA > SRR19973068.2758798/1‑150 (MQ=60)
GCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTA > SRR19973068.3444516/1‑150 (MQ=60)
GCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTA > SRR19973068.3443450/1‑150 (MQ=60)
GCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTA < SRR19973068.748192/150‑1 (MQ=60)
GCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTA < SRR19973068.383675/150‑1 (MQ=60)
CCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATGTGTTTTTGGTTTCA > SRR19973068.837692/1‑150 (MQ=60)
CCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAA < SRR19973068.3973724/150‑1 (MQ=60)
CCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAAT < SRR19973068.2930032/150‑1 (MQ=60)
CGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATT < SRR19973068.3799720/150‑1 (MQ=60)
GCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTA < SRR19973068.1738394/150‑1 (MQ=60)
GCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTA < SRR19973068.3095077/150‑1 (MQ=60)
GCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTA < SRR19973068.3115643/150‑1 (MQ=60)
GCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTA < SRR19973068.1035729/150‑1 (MQ=60)
GCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTA > SRR19973068.1719082/1‑150 (MQ=60)
CATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTAT < SRR19973068.1625711/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGT < SRR19973068.1454226/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGGTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACACTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGT > SRR19973068.3701866/1‑150 (MQ=60)
AGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTA > SRR19973068.3672036/1‑150 (MQ=60)
AGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTA < SRR19973068.3713677/150‑1 (MQ=60)
CTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGT < SRR19973068.860448/150‑1 (MQ=60)
CCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACACTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTT > SRR19973068.2750184/1‑150 (MQ=60)
CCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTT > SRR19973068.2751167/1‑150 (MQ=60)
CCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTT < SRR19973068.1218860/150‑1 (MQ=60)
CCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTT < SRR19973068.4011075/150‑1 (MQ=60)
CCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTT < SRR19973068.3281686/150‑1 (MQ=60)
CATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTC > SRR19973068.471287/1‑150 (MQ=60)
CATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTC < SRR19973068.417336/150‑1 (MQ=60)
ATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCA > SRR19973068.363261/1‑150 (MQ=60)
ATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCA < SRR19973068.644014/150‑1 (MQ=60)
ATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCA > SRR19973068.3449735/1‑150 (MQ=60)
TTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCAT < SRR19973068.3355475/150‑1 (MQ=60)
TCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATA < SRR19973068.439926/150‑1 (MQ=60)
TCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATA < SRR19973068.2521545/150‑1 (MQ=60)
CAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACACTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATAT > SRR19973068.4034217/1‑150 (MQ=60)
AATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAGTTATCTGTTATTGTTTCATATT > SRR19973068.2509229/1‑150 (MQ=60)
AATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATT > SRR19973068.427281/1‑150 (MQ=60)
ATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTT < SRR19973068.484661/150‑1 (MQ=60)
ATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTT < SRR19973068.3684385/150‑1 (MQ=60)
CGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATCTTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGAGCTATCTGTTTTTGGTTTATTTATCTGTTATTGTTTCATATTTCG > SRR19973068.752846/1‑150 (MQ=60)
CGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCG > SRR19973068.3026253/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTT > SRR19973068.116901/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTT > SRR19973068.638377/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTT > SRR19973068.2714800/1‑150 (MQ=60)
TAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTT > SRR19973068.2714783/1‑150 (MQ=60)
ATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAC > SRR19973068.2750172/1‑150 (MQ=60)
ATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTAC > SRR19973068.582408/1‑150 (MQ=60)
GAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTG > SRR19973068.1378502/1‑150 (MQ=60)
GAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTG > SRR19973068.2179426/1‑150 (MQ=60)
AATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGG < SRR19973068.3959644/150‑1 (MQ=60)
AATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGG < SRR19973068.3759537/150‑1 (MQ=60)
TATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTT < SRR19973068.126199/150‑1 (MQ=60)
ATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTT > SRR19973068.3148263/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTTATATATAACTTAATTAGTCAATTAAATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTT < SRR19973068.3987276/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTAT > SRR19973068.494743/1‑150 (MQ=60)
TTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTAT < SRR19973068.3396118/150‑1 (MQ=60)
TATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTT < SRR19973068.4038584/150‑1 (MQ=60)
TATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTT > SRR19973068.204860/1‑150 (MQ=60)
TTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCT < SRR19973068.902287/150‑1 (MQ=60)
TTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCT < SRR19973068.1930336/150‑1 (MQ=60)
TGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGGTTTTA > SRR19973068.3919028/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATC < SRR19973068.404042/150‑1 (MQ=60)
AATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTAGCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGTTTTTTTTATGCTTTTGTGGTTCTTTTATCTATT > SRR19973068.270083/1‑150 (MQ=60)
ATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTT > SRR19973068.832355/1‑150 (MQ=60)
ATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTT < SRR19973068.411760/150‑1 (MQ=60)
ATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTT > SRR19973068.2605323/1‑150 (MQ=60)
TACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAA > SRR19973068.3684402/1‑150 (MQ=60)
TACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAA > SRR19973068.3683859/1‑150 (MQ=60)
CATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTGTCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGT > SRR19973068.2434657/1‑150 (MQ=60)
CATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGT < SRR19973068.1075514/150‑1 (MQ=60)
ATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATATATTTAAGTGCC > SRR19973068.1590023/1‑150 (MQ=60)
TGCTCCACTTTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCAT < SRR19973068.2231995/150‑1 (MQ=60)
TGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCAT < SRR19973068.495964/150‑1 (MQ=60)
TGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCAT < SRR19973068.278581/150‑1 (MQ=60)
TGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCAAT < SRR19973068.417006/150‑1 (MQ=60)
CTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGC > SRR19973068.1630297/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTT < SRR19973068.2387010/150‑1 (MQ=60)
ACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTT < SRR19973068.2386969/150‑1 (MQ=60)
ACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTT < SRR19973068.506911/150‑1 (MQ=60)
TGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAG < SRR19973068.12386/150‑1 (MQ=60)
TGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAG < SRR19973068.3821618/150‑1 (MQ=60)
TTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAG < SRR19973068.3547199/150‑1 (MQ=60)
TTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAG < SRR19973068.2184645/150‑1 (MQ=60)
TTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGG < SRR19973068.2485609/150‑1 (MQ=60)
TTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGG < SRR19973068.2485824/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATAT < SRR19973068.2718664/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATAT < SRR19973068.801134/150‑1 (MQ=60)
TTGTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAA > SRR19973068.4116029/1‑150 (MQ=60)
GTTTAGTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGC > SRR19973068.114626/1‑150 (MQ=60)
TAGTATTGAATGATTTTCACCATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAA > SRR19973068.1735420/1‑150 (MQ=60)
GTATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCGTTAGAGGCATATAAGCGAAAA > SRR19973068.3971402/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATA > SRR19973068.3752166/1‑150 (MQ=60)
TGAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGC < SRR19973068.1321955/150‑1 (MQ=60)
GAATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTGTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCA > SRR19973068.817400/1‑150 (MQ=60)
AATGATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAATCGAAAATAGCAT > SRR19973068.3085079/1‑150 (MQ=60)
GATTTTCACACTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATTCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAATCGAAAAAAGAATGAG > SRR19973068.1200553/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATATCATGAGG > SRR19973068.2963611/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGG > SRR19973068.2963616/1‑150 (MQ=60)
|
GGTTGTCAGGACTATTCCCAGAAGTTTCGCCCGCATAAAAGTTCTCCATTCAATCGTTTTAATGATTGAATATGTATTTTTTATATCTAACTTAATGAGTCAATTACATATTGCTCCACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGG > CP009273/581054‑581349
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
