Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,275,142 |
C→A |
90.8% |
intergenic (‑1/+199) |
yjcH ← / ← acs |
DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,275,142 | 0 | C | A | 90.8%
| 1037.4
/ 90.7
| 354 | intergenic (‑1/+199) | yjcH/acs | DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/14); new base A (173/147); total (192/162) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 364 total aligned reads displayed.
GCCGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTC > CP009273/4274995‑4275288
|
gccGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATaac > 2:4352680/1‑150 (MQ=255)
ccGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATaaca < 1:15403/150‑1 (MQ=255)
cGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAg > 1:2749397/1‑150 (MQ=255)
gggCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGa > 2:4404422/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGAt < 2:2973179/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAtt < 1:1635440/150‑1 (MQ=255)
cgcgAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtc > 2:1934555/1‑150 (MQ=255)
cgcgAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtc > 2:1524967/1‑150 (MQ=255)
cgcgAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtc > 2:454340/1‑150 (MQ=255)
gcgAAGGCGATCAGTACAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGAGGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtct < 1:3742299/150‑1 (MQ=255)
gcgAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtct > 2:1123586/1‑150 (MQ=255)
cgAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtctc > 2:1476133/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCTACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCa < 1:2330166/150‑1 (MQ=255)
aGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCag < 2:4014879/150‑1 (MQ=255)
ggCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCaga < 1:4970985/150‑1 (MQ=255)
ggCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCaga < 1:2181063/150‑1 (MQ=255)
ggCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCaga < 1:1733207/150‑1 (MQ=255)
ggCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCaga < 2:3728852/150‑1 (MQ=255)
cGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAgg > 1:618987/1‑150 (MQ=255)
cGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAgg > 2:3598934/1‑150 (MQ=255)
gATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGt < 2:2454721/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTa > 2:4112528/1‑150 (MQ=255)
tCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTaa > 2:5031169/1‑150 (MQ=255)
cAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAAt > 2:2590393/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAg > 2:4884745/1‑150 (MQ=255)
aaaTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAgg > 1:3891277/1‑150 (MQ=255)
aaaTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAgg > 2:3460046/1‑150 (MQ=255)
aTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGa < 1:987217/150‑1 (MQ=255)
aTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGa > 1:707388/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAt > 2:2205469/1‑150 (MQ=255)
aaGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTg < 2:867191/150‑1 (MQ=255)
aGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGt < 1:2034403/150‑1 (MQ=255)
cGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt < 2:3115255/150‑1 (MQ=255)
cGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt < 1:2392103/150‑1 (MQ=255)
taAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTc > 2:2831137/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTccc > 2:1648814/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTccc > 1:4287324/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg < 1:2503859/150‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTc < 1:1009330/150‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTc > 2:620516/1‑150 (MQ=255)
ccAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTcc < 1:3266005/150‑1 (MQ=255)
cAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTccc < 1:1509990/150‑1 (MQ=255)
cATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa < 2:4827345/150‑1 (MQ=255)
taataaTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATg > 2:3978874/1‑150 (MQ=255)
aataatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATgg < 2:227607/150‑1 (MQ=255)
taatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGga > 2:562188/1‑150 (MQ=255)
cGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAg > 2:1445831/1‑150 (MQ=255)
gACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAgg > 2:1074339/1‑150 (MQ=255)
aCAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGt > 1:2855949/1‑150 (MQ=255)
gATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAAc > 1:1436167/1‑150 (MQ=255)
aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACg < 1:9148/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACg > 1:1703614/1‑150 (MQ=255)
gCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCggg > 2:3270971/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGt > 1:2608635/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGt < 1:1207798/150‑1 (MQ=255)
aaCCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTaa < 2:1701295/150‑1 (MQ=255)
aaCCGTTGCCGTTGTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCAGTGTCTTCTAGCCGCTGATAAAGAGTGCCATTCATACCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTaa < 2:5092084/150‑1 (MQ=255)
ccGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAAGTCCCGCTCCCTTCTGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAAcc < 2:1985871/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTCATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt > 2:4624336/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt < 1:1123586/150‑1 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt > 1:4830687/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCtt > 1:4249041/1‑150 (MQ=255)
gCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGc < 2:425773/150‑1 (MQ=255)
tttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg > 1:3880538/1‑150 (MQ=255)
tCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa < 1:544728/150‑1 (MQ=255)
gACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAgg < 2:1264294/150‑1 (MQ=255)
aCTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGc > 2:684715/1‑150 (MQ=255)
aaCTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 1:3819220/1‑150 (MQ=255)
aaCTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 2:2129492/1‑150 (MQ=255)
aaCTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 2:4683176/1‑150 (MQ=255)
aCTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGa < 2:1180552/150‑1 (MQ=255)
cTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGAt > 2:3528706/1‑150 (MQ=255)
tCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATa < 1:2931687/150‑1 (MQ=255)
aaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 2:736522/150‑1 (MQ=255)
gcgcATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAc < 1:4305037/150‑1 (MQ=255)
cgcATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg < 1:4673052/150‑1 (MQ=255)
cgcAGTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATGACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg < 1:4655418/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc > 1:1824843/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 1:2689539/150‑1 (MQ=255)
tGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCa > 1:4443305/1‑150 (MQ=255)
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gTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAt > 1:3003427/1‑150 (MQ=255)
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TATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCA > SRR19973077.3621357/1‑150 (MQ=60)
ATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAA > SRR19973077.2252117/1‑150 (MQ=60)
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CTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAAT < SRR19973077.1692976/150‑1 (MQ=60)
ATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCC > SRR19973077.3727394/1‑150 (MQ=60)
TAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCT < SRR19973077.1477854/150‑1 (MQ=60)
TAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCT < SRR19973077.4043143/150‑1 (MQ=60)
AAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTG > SRR19973077.1097399/1‑150 (MQ=60)
AATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGA < SRR19973077.2167647/150‑1 (MQ=60)
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ATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCG > SRR19973077.950777/1‑150 (MQ=60)
ATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCG > SRR19973077.950873/1‑150 (MQ=60)
TAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGC > SRR19973077.3895446/1‑150 (MQ=60)
TAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGC > SRR19973077.4803173/1‑150 (MQ=60)
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CAGCCGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGC > CP009273/4274993‑4275290
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |