Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,275,142 |
C→A |
93.3% |
intergenic (‑1/+199) |
yjcH ← / ← acs |
DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,275,142 | 0 | C | A | 93.3%
| 856.5
/ 48.8
| 282 | intergenic (‑1/+199) | yjcH/acs | DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/11); new base A (145/118); total (153/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTC > CP009273/4274997‑4275288
|
cGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAg > 2:3774572/1‑150 (MQ=255)
gcgcGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAtt < 1:121397/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAtt < 1:2980041/150‑1 (MQ=255)
aGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCag > 2:1624454/1‑150 (MQ=255)
cGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAgg > 2:687693/1‑150 (MQ=255)
cGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAgg < 1:2368007/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTa < 2:3758956/150‑1 (MQ=255)
tCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTaa > 2:3285521/1‑150 (MQ=255)
tAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCGGGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTa > 1:2069473/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAt < 2:136168/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGACATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTg > 2:1215313/1‑150 (MQ=255)
aGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGt > 2:3242353/1‑150 (MQ=255)
aGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGt > 1:2477901/1‑150 (MQ=255)
cGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt > 1:897232/1‑150 (MQ=255)
cGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt < 2:4107132/150‑1 (MQ=255)
gATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTa < 2:846080/150‑1 (MQ=255)
tataAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAAt < 2:3986111/150‑1 (MQ=255)
taAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTc > 2:3257417/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTcc > 2:2793563/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTccc > 1:4402291/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTccc < 1:345793/150‑1 (MQ=255)
aaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTccc > 1:2035837/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg > 1:3258939/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg < 2:92764/150‑1 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg < 1:1975644/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGCATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCt < 2:424063/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCt < 2:6046/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCt > 1:1912497/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCt < 2:2314086/150‑1 (MQ=255)
cAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTccc < 2:697919/150‑1 (MQ=255)
cAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTccc > 1:3061237/1‑150 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa > 1:89725/1‑150 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa > 1:89745/1‑150 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa > 1:460852/1‑150 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa > 1:1008979/1‑150 (MQ=255)
aataatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATgg < 2:2607706/150‑1 (MQ=255)
aatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGgag < 1:679486/150‑1 (MQ=255)
gACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAgg > 2:4254834/1‑150 (MQ=255)
aCAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGt > 1:4202966/1‑150 (MQ=255)
gATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAAc < 2:2477901/150‑1 (MQ=255)
gATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATGGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAAc < 2:3450674/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACg < 1:3201507/150‑1 (MQ=255)
ggtggCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCt > 1:3463997/1‑150 (MQ=255)
ggtggCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCt > 1:3463923/1‑150 (MQ=255)
ggCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCgg < 2:1177590/150‑1 (MQ=255)
ggCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCgg > 1:1466373/1‑150 (MQ=255)
gCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCggg > 1:503976/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGt < 2:4537895/150‑1 (MQ=255)
aaaCCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTa < 2:1794011/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCATTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAAccc > 1:3674079/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt > 1:3207792/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCAATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt > 1:3700843/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCtt > 1:2843661/1‑150 (MQ=255)
ccGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGcc < 2:2848600/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCg < 1:2897162/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCg > 2:2202721/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGa < 2:3704410/150‑1 (MQ=255)
tttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg < 1:1943753/150‑1 (MQ=255)
ttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGt > 1:2409824/1‑150 (MQ=255)
tCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa < 1:2568595/150‑1 (MQ=255)
tCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa > 1:3098372/1‑150 (MQ=255)
tCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTa < 2:429954/150‑1 (MQ=255)
gACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAgg > 1:1572633/1‑150 (MQ=255)
gACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAgg > 1:67885/1‑150 (MQ=255)
aCTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTACTGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTGATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGc > 2:4367078/1‑150 (MQ=255)
aCTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCGATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGc < 1:1336969/150‑1 (MQ=255)
cTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGcc > 2:2083062/1‑150 (MQ=255)
cTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGAt > 2:172220/1‑150 (MQ=255)
cccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATaa < 1:2027990/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAg < 1:3437727/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAg > 1:380603/1‑150 (MQ=255)
tGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGc > 1:176819/1‑150 (MQ=255)
tGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGc < 2:207839/150‑1 (MQ=255)
gAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCg < 2:3129926/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt > 1:84186/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt < 1:2375490/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt > 2:2002377/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCGTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt > 2:3592963/1‑150 (MQ=255)
cgcATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcg > 2:1022573/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc > 2:24836/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc > 2:2329804/1‑150 (MQ=255)
aTTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTGGGGGGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccg > 2:363320/1‑150 (MQ=255)
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CGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTC > CP009273/4274997‑4275288
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |