Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,275,142 |
C→A |
90.8% |
intergenic (‑1/+199) |
yjcH ← / ← acs |
DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,275,142 | 0 | C | A | 90.8%
| 1032.2
/ 83.8
| 348 | intergenic (‑1/+199) | yjcH/acs | DUF485 family inner membrane protein/acetyl‑CoA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/14); new base A (164/151); total (183/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
GCCGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTG > CP009273/4274995‑4275286
|
gccGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATaac < 1:316245/150‑1 (MQ=255)
gggCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTACCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGACATTCATcacaca > 1:2187330/1‑148 (MQ=255)
ggCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAt > 1:1581915/1‑150 (MQ=255)
gcgcGACGGCGATAAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAtt < 1:3678356/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAtt < 2:2294107/150‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATtc < 2:521250/150‑1 (MQ=255)
gAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTcc < 2:391359/150‑1 (MQ=255)
aaGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCa > 1:3338812/1‑150 (MQ=255)
cGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAgg > 2:2650886/1‑150 (MQ=255)
aTCAGTAAAATAAAGCCTATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTa < 1:119828/150‑1 (MQ=255)
tCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTaa > 1:2880672/1‑150 (MQ=255)
cattAAAATAAAGCCTATATAAACTGCCAGAATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAAt < 1:3657192/147‑1 (MQ=255)
aGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATg > 2:2470067/1‑150 (MQ=255)
gTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGt > 2:2712152/1‑150 (MQ=255)
aaaaTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAg < 2:3618474/150‑1 (MQ=255)
aaaTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAgg > 1:2638823/1‑150 (MQ=255)
aTAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGa > 1:914897/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAt < 2:4238888/150‑1 (MQ=255)
aaaGCCGATATAAACTGCCAGCATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAtt < 1:3239294/150‑1 (MQ=255)
aaaGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAtt < 1:1896830/150‑1 (MQ=255)
aaaGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTGTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGAtt > 1:1120588/1‑150 (MQ=255)
aGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGt < 1:4285817/150‑1 (MQ=255)
aGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGt > 2:3180469/1‑150 (MQ=255)
cGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt < 1:2697813/150‑1 (MQ=255)
cGAAATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATGGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGtttt < 2:3314247/150‑1 (MQ=255)
atatAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTaa > 2:1620928/1‑150 (MQ=255)
tataAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAAt < 2:285096/150‑1 (MQ=255)
taAACTGCCAGCATAATACTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTc < 1:4265290/150‑1 (MQ=255)
taAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTc > 1:1864025/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGACATGCGCAGTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTcc > 2:209878/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg > 1:4102437/1‑150 (MQ=255)
aCTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCg < 1:1691094/150‑1 (MQ=255)
gCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTc < 1:928577/150‑1 (MQ=255)
cAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTccc > 2:4163960/1‑150 (MQ=255)
cAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTccc < 1:3122132/150‑1 (MQ=255)
gCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCtt < 1:4202662/150‑1 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa > 1:2017617/1‑150 (MQ=255)
cATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTa < 1:1696472/150‑1 (MQ=255)
taataaTCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATg < 1:3493345/150‑1 (MQ=255)
taatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGga < 2:2962420/150‑1 (MQ=255)
aatCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTACCGCTCCCTTATGGgag > 1:4249748/1‑150 (MQ=255)
tCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGaa > 2:628619/1‑150 (MQ=255)
gACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGATGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAgg < 2:1327330/150‑1 (MQ=255)
cAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGtt > 2:1856141/1‑150 (MQ=255)
aGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTa > 2:3740885/1‑150 (MQ=255)
aGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTa > 2:3740731/1‑150 (MQ=255)
ggATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTaa < 1:1000879/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACg > 2:2405017/1‑150 (MQ=255)
aaCCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTAGGGGAGAAGGTTAACGCGCGGGTaa > 2:3343042/1‑150 (MQ=255)
ccGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATGGTCGTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAAcc < 1:687578/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGTTTTTCGCCTAACGCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCGCTCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAAccc < 1:1834748/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAAccc > 2:4099652/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCt < 1:2131978/150‑1 (MQ=255)
ccGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGcc > 1:3568922/1‑150 (MQ=255)
tttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATg > 1:3829922/1‑150 (MQ=255)
ttCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGt < 2:279615/150‑1 (MQ=255)
cGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAg > 2:4251393/1‑150 (MQ=255)
cTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGcc > 1:222047/1‑150 (MQ=255)
cTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGcc < 2:2015150/150‑1 (MQ=255)
aaCTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCgg > 1:2306304/1‑150 (MQ=255)
cTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCGATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGAt < 2:1919136/150‑1 (MQ=255)
tCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATa > 2:261535/1‑150 (MQ=255)
cccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATaa > 1:380748/1‑150 (MQ=255)
ccTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAg > 2:676608/1‑150 (MQ=255)
cTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAgg > 2:3142776/1‑150 (MQ=255)
cTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAgg > 2:1927130/1‑150 (MQ=255)
tGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGc < 1:1369080/150‑1 (MQ=255)
gAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCg > 1:4321056/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGt > 2:3525065/1‑150 (MQ=255)
aaTGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 1:2677551/150‑1 (MQ=255)
gcgcATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAc < 2:480919/150‑1 (MQ=255)
gcgcATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAc < 1:1519445/150‑1 (MQ=255)
gcgcATGGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAc < 2:908720/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 2:1736953/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc > 2:2535204/1‑150 (MQ=255)
cATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCAGTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 2:2579987/150‑1 (MQ=255)
cATGGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 1:4165882/150‑1 (MQ=255)
gTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAt > 1:4005080/1‑150 (MQ=255)
gTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAt > 1:2978324/1‑150 (MQ=255)
gTCTTCGATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCAt < 2:1208302/150‑1 (MQ=255)
tcttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATc < 1:1488580/150‑1 (MQ=255)
cttctATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATcc > 2:1591461/1‑150 (MQ=255)
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AATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTT < SRR19973079.2691430/150‑1 (MQ=60)
AATGCGCAGGGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGAGTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTT < SRR19973079.2691452/150‑1 (MQ=60)
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ATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCG < SRR19973079.2215848/150‑1 (MQ=60)
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TATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCA > SRR19973079.2511255/1‑150 (MQ=60)
CCGCTGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATC < SRR19973079.403504/150‑1 (MQ=60)
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TGATAAATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATG > SRR19973079.2784080/1‑150 (MQ=60)
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AATAGTGCCATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGA > SRR19973079.2544752/1‑150 (MQ=60)
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ATTCATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCT > SRR19973079.1873536/1‑150 (MQ=60)
ATAACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCG > SRR19973079.4101754/1‑150 (MQ=60)
|
CAGCCGGGCGCGAAGGCGATCAGTAAAATAAAGCCGATATAAACTGCCAGCATAATAATCGACAGGATGGTGGCAAACCGTTGCCGTTTTTCGACTAACTCCCTGAAATGCGCATTGTCTTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCG > CP009273/4274993‑4275289
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |