Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,259,689 |
C→A |
9.4% |
intergenic (+188/‑35) |
yeiP → / → yeiQ |
elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,259,689 | 0 | C | A | 9.4%
| 870.2
/ 44.5
| 244 | intergenic (+188/‑35) | yeiP/yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (123/98); new base A (14/9); total (137/107) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCTC > CP009273/2259540‑2259838
|
ccTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTc > 2:1302303/1‑150 (MQ=255)
ccTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTc > 1:4400508/1‑150 (MQ=255)
ccTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTc < 1:1761004/150‑1 (MQ=255)
cTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCg < 1:3028940/150‑1 (MQ=255)
ttttttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCTCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgt > 1:3682043/1‑150 (MQ=255)
tttttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgtt < 1:3085797/150‑1 (MQ=255)
tttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgttgt > 1:305699/1‑150 (MQ=255)
tttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgttgt > 1:1431120/1‑150 (MQ=255)
aaTTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGttaa > 2:1307868/1‑150 (MQ=255)
tttATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGttaatt < 1:3375968/150‑1 (MQ=255)
ttattaTACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATCTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGttaatta > 1:3889248/1‑150 (MQ=255)
ttattaTACCAATCTTCTATTTTGCGCTTACTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGttaatta < 2:3367226/150‑1 (MQ=255)
tataCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCg > 2:2821842/1‑150 (MQ=255)
tataCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCg < 2:3703438/150‑1 (MQ=255)
tataCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCg > 1:4186166/1‑150 (MQ=255)
ataCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGt > 2:1302919/1‑150 (MQ=255)
aCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTa > 1:2760224/1‑150 (MQ=255)
aCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTa > 1:2760314/1‑150 (MQ=255)
aCCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTa > 2:1851366/1‑150 (MQ=255)
aaTCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTa > 2:1603850/1‑150 (MQ=255)
aaTCTTCTATTTTGAGCTTCCTGAACTCCTTACGCCCTCAAGTTTCACTCGTTGATTGATAGCCCTCACTCTTCATCTCATTAACAATCAAGTCCAATTTCAATTGCTTTCATATAACTTTACTATGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTa < 2:267445/150‑1 (MQ=255)
aTCTTCTATTTTGCGCTTACTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTATTTGTTAATTAAACGTTACTaa > 1:1813992/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCTATTTTGCGCTTACTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGATGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATAGTTACTaa > 2:3810152/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCTATTTTGCGCTTACTGAACACCTTACGCCCTAAATTTTCACTAGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCAAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTaa > 2:3810084/1‑150 (MQ=255)
tctATTTTGAGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACg > 1:3216978/1‑150 (MQ=255)
tctATTTTGAGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACg > 1:3217608/1‑150 (MQ=255)
ctATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGt > 2:3651310/1‑150 (MQ=255)
tATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTg < 1:1055970/150‑1 (MQ=255)
tATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTg < 2:4157318/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTc > 2:3016516/1‑150 (MQ=255)
gcgcTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCt > 1:3350529/1‑150 (MQ=255)
gcTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCGTTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTAt < 2:2018176/150‑1 (MQ=255)
ttCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGa < 2:3270/150‑1 (MQ=255)
ttCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGa < 2:3274/150‑1 (MQ=255)
ccTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAAt > 2:1369218/1‑150 (MQ=255)
cTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATa > 2:2384167/1‑150 (MQ=255)
ccTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGc > 1:4049548/1‑150 (MQ=255)
aCGCCCTCAATTATCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTcc < 2:45777/150‑1 (MQ=255)
gCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGt > 2:609331/1‑150 (MQ=255)
cTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTAc > 1:1979094/1‑150 (MQ=255)
cAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGc > 1:4149803/1‑150 (MQ=255)
aTTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTc < 1:1084098/150‑1 (MQ=255)
ttttCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTcc < 2:2267396/150‑1 (MQ=255)
tttCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTccc < 1:1603850/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCGTTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGcatcat < 1:769262/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGcatcat > 1:3198033/1‑150 (MQ=255)
cGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGcatcat > 1:3198133/1‑150 (MQ=255)
ttgattgaTCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGt > 2:3179397/1‑150 (MQ=255)
ttgattgaTCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGGGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGt > 2:3179762/1‑150 (MQ=255)
gattgatCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTac > 1:4096576/1‑150 (MQ=255)
gattgatCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATAAAATCGACTACGTTACGCTCCCGCATAATGTac > 2:570257/1‑150 (MQ=255)
gCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa > 1:796078/1‑150 (MQ=255)
gCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa > 1:3078290/1‑150 (MQ=255)
cacaCTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTa > 2:2754135/1‑150 (MQ=255)
acacTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTAt < 1:1949232/150‑1 (MQ=255)
cacTTCATCGCGTTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATg > 2:4468651/1‑150 (MQ=255)
ttCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATc < 2:3217522/150‑1 (MQ=255)
ttCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATc > 1:2564022/1‑150 (MQ=255)
cATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGc > 2:1240232/1‑150 (MQ=255)
aTCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACATTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGcc < 2:3453226/150‑1 (MQ=255)
tCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCca < 2:2338922/150‑1 (MQ=255)
cgcgTTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcag > 1:3142893/1‑150 (MQ=255)
cATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcagca > 2:905565/1‑150 (MQ=255)
cATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcagca < 2:4336247/150‑1 (MQ=255)
cATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcagca > 1:1410036/1‑150 (MQ=255)
aTTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcagcag < 2:3575703/150‑1 (MQ=255)
tAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGtt < 1:1547752/150‑1 (MQ=255)
cAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCa < 1:1103291/150‑1 (MQ=255)
cAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCAc < 1:4304800/150‑1 (MQ=255)
gACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGt > 2:340479/1‑150 (MQ=255)
gACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGt < 1:1302591/150‑1 (MQ=255)
aCCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTa > 2:139317/1‑150 (MQ=255)
ccAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTAt > 2:732365/1‑150 (MQ=255)
ccAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTAt > 1:699309/1‑150 (MQ=255)
cAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATc > 1:3651204/1‑150 (MQ=255)
cAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATc > 2:4042323/1‑150 (MQ=255)
aaTTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCAtt > 1:1876484/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCAtttt > 1:2701047/1‑150 (MQ=255)
ttGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAAACGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGGTCAtttt > 1:200535/1‑150 (MQ=255)
cTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTCTCGTTCAGGTTGGc > 1:1232322/1‑150 (MQ=255)
cTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGc > 2:3710382/1‑150 (MQ=255)
gTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCtt < 2:3485557/150‑1 (MQ=255)
tCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCttt < 1:2766819/150‑1 (MQ=255)
ataACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACACCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCAATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAg < 1:380954/150‑1 (MQ=255)
aCTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCt > 1:2740738/1‑150 (MQ=255)
aCTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCt < 2:3682043/150‑1 (MQ=255)
cTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCtt > 2:1510412/1‑150 (MQ=255)
tttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCttt > 1:3554038/1‑150 (MQ=255)
tttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCttt < 2:71700/150‑1 (MQ=255)
tACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCa > 1:574179/1‑150 (MQ=255)
acacTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAc < 2:2564022/150‑1 (MQ=255)
acacTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAc > 2:3310471/1‑150 (MQ=255)
cacTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAcc < 1:1307868/150‑1 (MQ=255)
cacTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAcc > 2:15970/1‑150 (MQ=255)
acTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcg < 2:3194751/150‑1 (MQ=255)
cTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgc < 2:1603679/150‑1 (MQ=255)
tGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgcg > 2:3948158/1‑150 (MQ=255)
tGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgcg > 1:4362947/1‑150 (MQ=255)
tGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgcg > 1:4356900/1‑150 (MQ=255)
gTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCgcgc > 2:3162120/1‑150 (MQ=255)
|
CCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCTC > CP009273/2259540‑2259838
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
