Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,245,848 |
G→T |
90.2% |
L62L (CTG→CTT) |
yhaH → |
DUF805 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,245,848 | 0 | G | T | 90.2%
| 788.5
/ 75.0
| 273 | L62L (CTG→CTT) | yhaH | DUF805 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (14/13); new base T (141/105); total (155/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAA > CP009273/3245703‑3245994
|
ggggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGtttt > 2:2961072/1‑150 (MQ=255)
ggggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGtttt > 1:2007804/1‑150 (MQ=255)
gggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGttttt < 1:4004743/150‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTa < 1:3716493/150‑1 (MQ=255)
ggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTa < 1:359091/150‑1 (MQ=255)
gTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTAc < 2:2775641/150‑1 (MQ=255)
gTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTAc < 2:2242223/150‑1 (MQ=255)
tCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTAcc < 2:1263119/150‑1 (MQ=255)
cgcgGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCgtggt > 2:1152376/1‑150 (MQ=255)
cgcAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCg < 1:3302538/150‑1 (MQ=255)
aaaGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGtt > 1:272201/1‑150 (MQ=255)
aaGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTc > 2:986713/1‑150 (MQ=255)
aaGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTc > 2:3038773/1‑150 (MQ=255)
agTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGt > 2:4182358/1‑150 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc < 1:4129413/150‑1 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc > 1:2306924/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTGTTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccg < 2:2193323/150‑1 (MQ=255)
cTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccg < 2:4452585/150‑1 (MQ=255)
aTGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCcgccgc > 2:1031522/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCcgccgc > 1:4093353/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCcgccgc > 2:3978945/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCcgccgc > 2:1908026/1‑150 (MQ=255)
gTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCt > 1:4186337/1‑150 (MQ=255)
tttATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTg > 2:1484358/1‑150 (MQ=255)
ttATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGc > 1:234133/1‑150 (MQ=255)
tATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCa < 1:2762118/150‑1 (MQ=255)
aTTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCAc > 1:3664948/1‑150 (MQ=255)
aTTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCAc > 1:2429611/1‑150 (MQ=255)
ttCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACg < 1:1264457/150‑1 (MQ=255)
tCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGa > 1:825483/1‑150 (MQ=255)
tCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGa > 1:824127/1‑150 (MQ=255)
cTGGTCAACATAATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGac > 2:1140579/1‑150 (MQ=255)
gTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACacc < 2:1967891/150‑1 (MQ=255)
gTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCAGCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACacc < 1:2200290/150‑1 (MQ=255)
cAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACaccga > 2:3741789/1‑150 (MQ=255)
atcTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCg > 1:516903/1‑150 (MQ=255)
atcTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCg < 1:4425503/150‑1 (MQ=255)
tcTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCgg > 2:1697732/1‑150 (MQ=255)
cTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGc > 1:2618533/1‑150 (MQ=255)
ttACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgt > 2:4519019/1‑150 (MQ=255)
tACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtg < 2:3074914/150‑1 (MQ=255)
aCGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAATTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtgg < 1:4318174/150‑1 (MQ=255)
aCGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGCCACCGACCGCTCGGCgtgg < 1:4318315/150‑1 (MQ=255)
cGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggt < 2:2151270/150‑1 (MQ=255)
gTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggtg > 1:2966499/1‑150 (MQ=255)
ttCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGtggtgg < 2:246056/150‑1 (MQ=255)
ttCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGtggtgg < 2:682973/150‑1 (MQ=255)
tCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTggg > 2:338140/1‑150 (MQ=255)
gTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCa > 1:1635640/1‑150 (MQ=255)
gTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCa < 2:3815361/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACt < 2:2614604/150‑1 (MQ=255)
ggggCTGCTGGATAAAATGTTCGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCt < 1:4281411/150‑1 (MQ=255)
gggCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCACCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTa < 2:3427982/150‑1 (MQ=255)
gggCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTa > 2:2492298/1‑150 (MQ=255)
ggCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTAt < 1:2162920/150‑1 (MQ=255)
gctgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCtt > 2:2898289/1‑150 (MQ=255)
tgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTaa > 1:686206/1‑150 (MQ=255)
tgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTaa > 2:2228704/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt > 1:1372255/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt > 2:1994982/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt < 2:2391242/150‑1 (MQ=255)
tAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCACCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATccc < 1:3369791/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCg < 2:3527220/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGt > 2:2635239/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGtt < 2:644236/150‑1 (MQ=255)
aTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 2:3574726/1‑150 (MQ=255)
tGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTa > 2:836317/1‑150 (MQ=255)
gTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTAt < 1:3463176/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCggctg < 2:178837/150‑1 (MQ=255)
tGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCggctgg > 1:505203/1‑150 (MQ=255)
cAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCtt > 1:1082348/1‑150 (MQ=255)
cAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCtt > 1:3850766/1‑150 (MQ=255)
aCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat > 1:959981/1‑150 (MQ=255)
aCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:2136265/150‑1 (MQ=255)
aCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTGTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTCTTCTTAATCCCGTGTCTCGGCTGGCttat > 2:4352455/1‑150 (MQ=255)
cgcgCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttatt > 1:3692345/1‑150 (MQ=255)
gCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCt < 1:180147/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGTTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCtt < 1:3096026/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCtt > 2:3466016/1‑150 (MQ=255)
cGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCtt > 2:1946355/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt > 2:1596652/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:3177918/150‑1 (MQ=255)
aaGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTa < 2:3354967/150‑1 (MQ=255)
aGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTaa < 1:713283/150‑1 (MQ=255)
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ACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGCCACCGACCGCTCGGCGTGG < SRR19973080.4341907/150‑1 (MQ=60)
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ATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAA > SRR19973080.3439753/1‑150 (MQ=60)
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ATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAA > SRR19973080.1143867/1‑150 (MQ=60)
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GGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAA > CP009273/3245699‑3245992
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |