Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,245,848 |
G→T |
100% |
L62L (CTG→CTT) |
yhaH → |
DUF805 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,245,848 | 0 | G | T | 100.0%
| 996.6
/ ‑6.7
| 309 | L62L (CTG→CTT) | yhaH | DUF805 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (181/127); total (181/128) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
TTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAA > CP009273/3245701‑3245993
|
tttCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTgt < 1:2152615/150‑1 (MQ=255)
ggggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGtttt > 2:871345/1‑150 (MQ=255)
ggggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGtttt > 1:2504728/1‑150 (MQ=255)
ggggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACAACAATCTACGGTATTCTTGTGtttt > 2:126786/1‑150 (MQ=255)
gggTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGttttt < 1:4408441/150‑1 (MQ=255)
cgcgGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCgtggt < 2:5211926/150‑1 (MQ=255)
cgcgGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCgtggt < 1:967544/150‑1 (MQ=255)
gcggcgCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCgtggtg < 1:1807377/150‑1 (MQ=255)
gcggcgCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCgtggtg > 1:3676619/1‑150 (MQ=255)
cgcAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCg > 2:2247914/1‑150 (MQ=255)
aaaGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGtt > 2:3078314/1‑150 (MQ=255)
agTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGt < 2:4143543/150‑1 (MQ=255)
gttcTGGATTTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGTGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCATCGCGCTGGTGGCGAAGGCTTCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACAGTGGTGGGCGGTTCAGtt < 2:1688642/147‑1 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc > 2:3212188/1‑150 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc > 2:2533161/1‑150 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc > 1:1446757/1‑150 (MQ=255)
aCTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTAGTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTcc > 1:5226300/1‑150 (MQ=255)
cTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccg < 1:873313/150‑1 (MQ=255)
cTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccg < 2:957482/150‑1 (MQ=255)
cTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccg > 2:4235711/1‑150 (MQ=255)
ggATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTccgcc > 2:4956443/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCcgccgc > 2:4634961/1‑150 (MQ=255)
tGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCgccgcc > 2:1876666/1‑150 (MQ=255)
ttATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGc > 1:1881905/1‑150 (MQ=255)
tATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCa < 1:4446675/150‑1 (MQ=255)
aTTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCAc > 2:3822130/1‑150 (MQ=255)
cTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACACTCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGac < 2:4828028/150‑1 (MQ=255)
cTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGac < 1:2284445/150‑1 (MQ=255)
gTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACacc < 2:2980119/150‑1 (MQ=255)
tCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACaccg > 1:157825/1‑150 (MQ=255)
aaCATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACaccgac > 1:1033893/1‑150 (MQ=255)
aCATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACaccgacc < 2:2267800/150‑1 (MQ=255)
atcatcTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGc > 2:2473691/1‑150 (MQ=255)
atcTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTCCGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCg < 2:4027709/150‑1 (MQ=255)
tACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtg > 2:2024341/1‑150 (MQ=255)
gTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggtg > 2:4085886/1‑150 (MQ=255)
gTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggtg < 2:1514775/150‑1 (MQ=255)
gTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggtg > 1:1788022/1‑150 (MQ=255)
gTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGAAAATCTACGGTATTCTTGTTTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCgtggtg < 1:2422276/150‑1 (MQ=255)
gtccTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCa > 2:2056339/4‑150 (MQ=255)
ggggCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCt > 1:3709388/1‑150 (MQ=255)
gggCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTa < 2:2817169/150‑1 (MQ=255)
gctgctGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTAtt < 1:1665837/150‑1 (MQ=255)
gctgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCtt < 2:120007/150‑1 (MQ=255)
tgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTaa > 2:1078931/1‑150 (MQ=255)
tgGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTaa > 2:4838771/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt > 2:3530222/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt < 2:2904070/150‑1 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt > 1:813034/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAATGTTAGGCGGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAt < 1:3453336/150‑1 (MQ=255)
gATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATc < 2:3292412/150‑1 (MQ=255)
gATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATc > 2:2151906/1‑150 (MQ=255)
aTAAAATGTTAGGCTGGCACCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTCCGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCGGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATcc < 1:1373269/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCg > 2:4420176/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCg < 1:5276546/150‑1 (MQ=255)
tGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTa < 2:3733689/150‑1 (MQ=255)
tGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATACTGACTAAAATCTTCGGTATTCTTGTGTTTTTCCCGTGGTGGGCGTTTCAGTTCCGCCGCCTTAACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTa < 1:5065068/150‑1 (MQ=255)
gTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTAt > 2:3845948/1‑150 (MQ=255)
tAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCg < 2:2712060/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCggc > 2:1361576/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCggctg > 1:3633209/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCggctggc > 2:4544880/1‑150 (MQ=255)
cAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCtt > 1:2641893/1‑150 (MQ=255)
aaCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCtta > 2:537896/1‑150 (MQ=255)
aaCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCtta > 1:2127074/1‑150 (MQ=255)
aCGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:603555/150‑1 (MQ=255)
cgcgcgGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACACTCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttatt < 2:1954103/150‑1 (MQ=255)
cgcgCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttatt > 1:5053059/1‑150 (MQ=255)
cgcTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTtattat < 2:3396099/150‑1 (MQ=255)
gcTGGTGGCGAAGTCATCATTACGACAATCTACGGTATTCTTGTTTTTTTACGGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATAGGCTGGCTTATTatc < 1:3148587/150‑1 (MQ=255)
gcTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 2:3648332/1‑150 (MQ=255)
gtggCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCg > 2:4306428/1‑150 (MQ=255)
ggCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTATTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 2:1897920/150‑1 (MQ=255)
gCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCt < 1:4360768/150‑1 (MQ=255)
cGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCtt > 1:4941126/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt > 1:488076/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt > 1:288634/1‑150 (MQ=255)
gAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 2:1130453/150‑1 (MQ=255)
aaGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTa < 2:157375/150‑1 (MQ=255)
aaGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTa > 2:1044520/1‑150 (MQ=255)
cATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTg > 1:2962190/1‑150 (MQ=255)
aTCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGc > 2:3491491/1‑150 (MQ=255)
tGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAgg < 1:4177421/150‑1 (MQ=255)
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GGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTA > SRR19973062.2804033/1‑150 (MQ=60)
GCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATT < SRR19973062.845902/150‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATT < SRR19973062.1673865/150‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATT < SRR19973062.1674020/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTATAAAATTTTAGGCTGGAAACGCGCTGGTGGCGAAGTCATCATGACGACAATCTACGTTTTTCTTGTGTTTTTACCTTGGTGTGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCT < SRR19973062.592300/150‑1 (MQ=60)
TGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTCTTCT > SRR19973062.940190/1‑150 (MQ=60)
TGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCT > SRR19973062.765246/1‑150 (MQ=60)
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GGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAT > SRR19973062.816625/1‑150 (MQ=60)
GGATAAAATGTTAGGCGGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAAT < SRR19973062.3470950/150‑1 (MQ=60)
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ATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACTACAATCTACGGTATTCTTGTTTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCC < SRR19973062.307232/150‑1 (MQ=60)
AAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCG < SRR19973062.5304302/150‑1 (MQ=60)
AAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCG > SRR19973062.5300008/1‑150 (MQ=60)
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TTCTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAA < SRR19973062.3696229/150‑1 (MQ=60)
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CTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAAC > SRR19973062.861621/1‑150 (MQ=60)
CTTGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAAC < SRR19973062.3059357/150‑1 (MQ=60)
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GGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAAC > CP009273/3245699‑3245995
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |