Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,144,474 |
C→A |
100% |
intergenic (‑8/‑192) |
yegI ← / → yegJ |
protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,144,474 | 0 | C | A | 100.0%
| 840.7
/ NA
| 249 | intergenic (‑8/‑192) | yegI/yegJ | protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (128/121); total (128/121) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTT > CP009273/2144332‑2144618
|
cgTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCggg > 1:2931862/1‑148 (MQ=255)
cgTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCggg < 2:1041611/148‑1 (MQ=255)
gtgtGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGt < 2:666558/148‑1 (MQ=255)
tgtgATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTa > 1:2065546/1‑148 (MQ=255)
gtgATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAg < 1:2788512/148‑1 (MQ=255)
tgATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGt < 1:256728/148‑1 (MQ=255)
aaaTCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttata > 1:2224221/1‑148 (MQ=255)
tGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTATGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGTTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTAATATTTGTTTACATAATATTTAGCGGGTAGTtatataatat > 1:1371846/1‑148 (MQ=255)
gCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATAttt < 2:1598741/148‑1 (MQ=255)
cGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTc > 2:837869/1‑148 (MQ=255)
cTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTGTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGa < 1:17296/148‑1 (MQ=255)
cTATAGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGa < 1:2141677/148‑1 (MQ=255)
aTCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaat < 1:2312810/148‑1 (MQ=255)
aTCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaat > 2:667296/1‑148 (MQ=255)
tCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaata < 2:2421619/148‑1 (MQ=255)
tCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCGTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaata < 2:2791125/148‑1 (MQ=255)
cGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaataa < 1:902409/148‑1 (MQ=255)
cGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaataa < 2:101839/148‑1 (MQ=255)
cGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTAAATGaataa > 1:155947/1‑148 (MQ=255)
cAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAAtaataa < 2:2897375/148‑1 (MQ=255)
aaaCTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaac < 2:3095121/148‑1 (MQ=255)
aaaCTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaac > 1:2435684/1‑148 (MQ=255)
ctcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaacatc < 1:315200/148‑3 (MQ=255)
ctcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaacaac < 1:392270/148‑1 (MQ=255)
ctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTaa < 2:382815/148‑1 (MQ=255)
ctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTaa < 2:2401420/148‑1 (MQ=255)
ctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTaa < 2:742295/148‑1 (MQ=255)
ctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTAAATGAATAATAAAAAATaa > 2:1995435/1‑148 (MQ=255)
tcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAAc > 2:2883567/1‑148 (MQ=255)
tcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAAc < 2:1966185/148‑1 (MQ=255)
cGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAAcc > 1:2854118/1‑148 (MQ=255)
atatCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAt < 1:1916075/148‑1 (MQ=255)
tatCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAtt > 1:303975/1‑148 (MQ=255)
tCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaa > 1:1917228/1‑148 (MQ=255)
cATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaaa < 2:2533055/148‑1 (MQ=255)
aTAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaaaa < 2:896080/148‑1 (MQ=255)
aTAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaaaa < 2:2473598/148‑1 (MQ=255)
aTAAACCGCGCATTCACAATCTTTGCCCATTTCACTGCCTAGAGTGGTAAATTCAACTGTCGATTTAAATAATTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGAGGGTAGTTATATTATATTTCAATGATTAATTACAACTAACCTTTaaaa < 2:895433/148‑1 (MQ=255)
aaCCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAatta > 2:1346442/1‑148 (MQ=255)
aCCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAattat < 1:1869510/148‑1 (MQ=255)
cgcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCt < 1:577430/148‑1 (MQ=255)
cgcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCt < 1:1000465/148‑1 (MQ=255)
ccTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtat > 1:3055857/1‑148 (MQ=255)
ccTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtat > 2:118621/1‑148 (MQ=255)
ccTTCAACACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtat < 2:1690581/148‑1 (MQ=255)
tCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATg < 1:943796/148‑1 (MQ=255)
ccaccTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATgggg < 2:1121352/148‑1 (MQ=255)
ccaccTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATgggg > 1:1572643/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGaaaa < 2:2444728/148‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGaaaa > 1:467111/1‑148 (MQ=255)
gCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCa < 1:63787/148‑1 (MQ=255)
cAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTc < 1:2751534/148‑1 (MQ=255)
aGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCa < 2:2152641/148‑1 (MQ=255)
aGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCa < 1:1450100/148‑1 (MQ=255)
aGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCa > 2:29382/1‑148 (MQ=255)
tCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGa < 1:2179927/148‑1 (MQ=255)
tCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGa < 2:2081547/148‑1 (MQ=255)
cGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATa < 2:3226737/148‑1 (MQ=255)
cAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATaaaaa > 2:2665995/1‑148 (MQ=255)
cAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATaaaaa < 1:1586395/148‑1 (MQ=255)
agagTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATg > 1:1234095/1‑148 (MQ=255)
tGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATaa < 2:3029237/148‑1 (MQ=255)
tCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGTGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGc > 2:2376427/1‑148 (MQ=255)
cAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCa > 2:2410434/1‑148 (MQ=255)
ttCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTAATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAAACCACTCAAGAATAAAAATGATAATTCAAtt > 2:1150775/1‑148 (MQ=255)
tCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAttt > 2:1077817/1‑148 (MQ=255)
cACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAtttt > 2:2517741/1‑148 (MQ=255)
aCCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTa > 2:1233558/1‑148 (MQ=255)
ccTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTAt < 1:881530/148‑1 (MQ=255)
cTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATc > 2:773067/1‑148 (MQ=255)
gTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAg > 1:3060477/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATa > 2:3183946/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATa > 2:35239/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATa > 1:1033596/1‑148 (MQ=255)
gTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAca < 2:467111/148‑1 (MQ=255)
aaaTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaat > 2:1960672/1‑148 (MQ=255)
aaTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaatt > 2:193049/1‑148 (MQ=255)
aTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattc > 2:1434765/1‑148 (MQ=255)
ttttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattcaatt > 1:1673724/1‑148 (MQ=255)
ttttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattcaatt < 2:2713278/148‑1 (MQ=255)
tttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAAttt > 2:756160/1‑148 (MQ=255)
tataTTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCg > 1:57371/1‑148 (MQ=255)
atatTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCgg > 1:692390/1‑148 (MQ=255)
tatTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGc > 2:2690937/1‑148 (MQ=255)
tatTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGc < 2:2625331/148‑1 (MQ=255)
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TGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCAC < SRR19973070.897668/150‑1 (MQ=60)
GCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACT < SRR19973070.64498/150‑1 (MQ=60)
CCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAATAAAATTATTTATATATGGGGAAAACCCACTC > SRR19973070.284774/1‑150 (MQ=60)
CAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAA < SRR19973070.2769209/150‑1 (MQ=60)
AGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAG < SRR19973070.1460185/150‑1 (MQ=60)
TCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAAT < SRR19973070.2194455/150‑1 (MQ=60)
TCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAAT < SRR19973070.2194355/150‑1 (MQ=60)
CAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATG > SRR19973070.1242734/1‑150 (MQ=60)
CAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATG < SRR19973070.1597499/150‑1 (MQ=60)
AAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGA > SRR19973070.2172406/1‑150 (MQ=60)
CAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAT < SRR19973070.2115185/150‑1 (MQ=60)
AATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATT > SRR19973070.1675959/1‑150 (MQ=60)
TCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTA > SRR19973070.2521468/1‑150 (MQ=60)
CCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCA < SRR19973070.887746/150‑1 (MQ=60)
CTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAG > SRR19973070.3080062/1‑150 (MQ=60)
GTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGA > SRR19973070.330841/1‑150 (MQ=60)
CGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATA > SRR19973070.1040906/1‑150 (MQ=60)
ATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACA > SRR19973070.479291/1‑150 (MQ=60)
TAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATT < SRR19973070.877658/150‑1 (MQ=60)
AAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTGGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACACTTC > SRR19973070.259744/1‑150 (MQ=60)
AATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCA < SRR19973070.1647449/150‑1 (MQ=60)
AATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCA < SRR19973070.918945/150‑1 (MQ=60)
ATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAA > SRR19973070.2640295/1‑150 (MQ=60)
ACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATT > SRR19973070.2041597/1‑150 (MQ=60)
ACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATT > SRR19973070.1685190/1‑150 (MQ=60)
TTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCG > SRR19973070.58047/1‑150 (MQ=60)
TTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCG > SRR19973070.58036/1‑150 (MQ=60)
TTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCG > SRR19973070.58035/1‑150 (MQ=60)
TTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGG < SRR19973070.1847203/150‑1 (MQ=60)
TTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGG > SRR19973070.697334/1‑150 (MQ=60)
ATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCC > SRR19973070.2929149/1‑150 (MQ=60)
TTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAT > SRR19973070.128917/1‑150 (MQ=60)
TGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATA > SRR19973070.2427142/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAA > SRR19973070.3154613/1‑150 (MQ=60)
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TAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAA > SRR19973070.1478456/1‑150 (MQ=60)
TAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAA > SRR19973070.1478452/1‑150 (MQ=60)
AATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAC < SRR19973070.841218/150‑1 (MQ=60)
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TTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCC < SRR19973070.10207/150‑1 (MQ=60)
TTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCA < SRR19973070.2708369/150‑1 (MQ=60)
TTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCA < SRR19973070.2707465/150‑1 (MQ=60)
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GGCGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCA > CP009273/2144330‑2144621
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |