Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,778,820 |
G→A |
91.8% |
intergenic (‑450/+301) |
ypjC ← / ← ileY |
pseudogene/tRNA‑Ile |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,778,820 | 0 | G | A | 91.8%
| 726.8
/ 44.9
| 232 | intergenic (‑450/+301) | ypjC/ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/14); new base A (89/124); total (94/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGA > CP009273/2778675‑2778963
|
cctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTa < 1:858153/148‑1 (MQ=255)
cctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 1:522647/148‑1 (MQ=255)
cctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 1:800342/148‑1 (MQ=255)
ctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATaa < 1:1129183/148‑1 (MQ=255)
ggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTaa < 1:3287789/148‑1 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTg > 1:1169107/1‑148 (MQ=255)
gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGATAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa < 2:2671341/148‑1 (MQ=255)
gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa > 1:3032895/1‑148 (MQ=255)
gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa > 2:2168889/1‑148 (MQ=255)
gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa < 1:211516/148‑1 (MQ=255)
gTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGa > 2:3217747/1‑148 (MQ=255)
tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa > 1:794717/1‑148 (MQ=255)
cAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAg < 2:2354371/148‑1 (MQ=255)
agtagtAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgg < 2:1123393/148‑1 (MQ=255)
gtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTGCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGta < 1:1736710/148‑1 (MQ=255)
gtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGta > 2:3138757/1‑148 (MQ=255)
gtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGta > 2:617208/1‑148 (MQ=255)
tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 1:224066/1‑148 (MQ=255)
gATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataa < 2:141197/148‑1 (MQ=255)
aTGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATGTCAACCTGACTCTACGGCATTGTTCTACATACAGTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat < 2:1720254/148‑1 (MQ=255)
tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:1094966/148‑1 (MQ=255)
tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:1692007/148‑1 (MQ=255)
tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 1:2569440/148‑1 (MQ=255)
aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGa < 2:1572577/148‑1 (MQ=255)
aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGa < 2:1881473/148‑1 (MQ=255)
aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGa < 2:2449480/148‑1 (MQ=255)
ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGata > 2:1924294/1‑148 (MQ=255)
cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataat < 2:794717/148‑1 (MQ=255)
ggCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAct < 1:1203513/148‑1 (MQ=255)
cAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTTGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATActct < 2:1981390/148‑1 (MQ=255)
agagACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTg < 1:281174/148‑1 (MQ=255)
gagaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATGATAAATGATAATACTCTgg < 1:3122333/148‑1 (MQ=255)
gagaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTgg < 1:244764/148‑1 (MQ=255)
agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGc < 2:262480/148‑1 (MQ=255)
agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGc > 2:1038977/1‑148 (MQ=255)
gaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCt > 1:532033/1‑148 (MQ=255)
aCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCtt < 1:1438668/148‑1 (MQ=255)
aTTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTa < 2:2395437/148‑1 (MQ=255)
aTTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTa < 2:1493774/148‑1 (MQ=255)
tCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTa < 1:1691295/148‑1 (MQ=255)
ccTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 2:1073599/1‑148 (MQ=255)
ttACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAAtt < 2:1910703/148‑1 (MQ=255)
aCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTAc < 2:577876/148‑1 (MQ=255)
aCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTAc < 2:52613/148‑1 (MQ=255)
aCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTAc < 2:2858912/148‑1 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt > 2:2988599/1‑148 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt < 1:95129/148‑1 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCGTTATCGTTAATTACt > 2:3154837/1‑148 (MQ=255)
tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt > 1:2261216/1‑148 (MQ=255)
tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt > 1:2701885/1‑148 (MQ=255)
ctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTa < 2:164243/148‑1 (MQ=255)
cGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 1:1778484/148‑1 (MQ=255)
gCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTcc < 1:2865870/148‑1 (MQ=255)
aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcac < 1:384562/148‑1 (MQ=255)
ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 1:2020381/1‑148 (MQ=255)
tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 1:2344144/1‑148 (MQ=255)
tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt < 1:1671675/148‑1 (MQ=255)
tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 2:2443592/148‑1 (MQ=255)
tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 1:897495/148‑1 (MQ=255)
tacatacaTTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAg < 2:1172098/148‑1 (MQ=255)
catacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCa > 1:1595841/1‑148 (MQ=255)
ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc > 1:3046451/1‑148 (MQ=255)
tgtgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCt < 2:1831604/148‑1 (MQ=255)
gTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGc < 2:1029816/148‑1 (MQ=255)
aCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAt > 1:2476233/1‑148 (MQ=255)
cTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGAGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATa > 1:3003168/1‑148 (MQ=255)
cACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGc > 1:273421/1‑148 (MQ=255)
aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCa > 2:1366618/1‑148 (MQ=255)
aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCa > 1:1641018/1‑148 (MQ=255)
tATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGc < 2:1474094/148‑1 (MQ=255)
tATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGc > 1:2249408/1‑148 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt < 1:1085836/148‑1 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt < 2:2089405/148‑1 (MQ=255)
tcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt < 2:419336/148‑1 (MQ=255)
tcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt > 2:796660/1‑148 (MQ=255)
tGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTcc > 2:235523/1‑148 (MQ=255)
tGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTcc < 1:2912313/148‑1 (MQ=255)
aaCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAc > 2:1762172/1‑148 (MQ=255)
aCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt < 2:2767656/148‑1 (MQ=255)
aCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt < 2:247544/148‑1 (MQ=255)
aCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt > 1:1916930/1‑148 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtt > 1:1361621/1‑148 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtt < 1:356126/148‑1 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtt < 1:977761/148‑1 (MQ=255)
gagaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtttt < 2:2283123/148‑1 (MQ=255)
agaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTg > 1:2763268/1‑148 (MQ=255)
aGTTCAGTGATTTGAATAAATAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa < 2:1698665/148‑1 (MQ=255)
aGTTCAGTGAATTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa < 2:382597/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGt > 2:212586/1‑148 (MQ=255)
tCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTa > 1:2856200/1‑148 (MQ=255)
gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg > 2:1233485/1‑148 (MQ=255)
tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGTCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGa > 1:1280128/1‑148 (MQ=255)
tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGa < 1:428162/148‑1 (MQ=255)
gATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAt < 1:1822173/148‑1 (MQ=255)
aTTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATg < 2:2601521/148‑1 (MQ=255)
tttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATgg < 1:1037465/148‑1 (MQ=255)
tttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATgg < 1:3217747/148‑1 (MQ=255)
tttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATgg < 1:493241/148‑1 (MQ=255)
ttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa < 2:3108310/148‑1 (MQ=255)
ttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa > 2:937133/1‑148 (MQ=255)
|
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGA > CP009273/2778675‑2778963
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778671‑2778969
|
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAG < SRR19973070.147412/150‑1 (MQ=60)
CTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAAT < SRR19973070.965373/150‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAAT < SRR19973070.864095/150‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAAT < SRR19973070.2319660/150‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAAT < SRR19973070.806029/150‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAAT < SRR19973070.805861/150‑1 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAAT < SRR19973070.526198/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATT < SRR19973070.1083071/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATT < SRR19973070.1136970/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC > SRR19973070.960406/1‑150 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC > SRR19973070.1405251/1‑150 (MQ=60)
GGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACC < SRR19973070.3308891/150‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACC < SRR19973070.3267070/150‑1 (MQ=60)
CGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTG > SRR19973070.1177293/1‑150 (MQ=60)
CGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTG > SRR19973070.1815624/1‑150 (MQ=60)
GGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGA > SRR19973070.3052191/1‑150 (MQ=60)
GGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGGTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGA < SRR19973070.404769/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973070.2226842/150‑1 (MQ=60)
GTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATT < SRR19973070.213076/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTA < SRR19973070.1390221/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTA < SRR19973070.2568972/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGACAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACAATGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTA > SRR19973070.3028133/1‑150 (MQ=60)
GTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAA > SRR19973070.2693789/1‑150 (MQ=60)
GTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAA > SRR19973070.2693941/1‑150 (MQ=60)
CTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATG < SRR19973070.3200631/150‑1 (MQ=60)
GGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAA > SRR19973070.801338/1‑150 (MQ=60)
GGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAA > SRR19973070.800208/1‑150 (MQ=60)
GTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAG > SRR19973070.358633/1‑150 (MQ=60)
CAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGG < SRR19973070.1156476/150‑1 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT > SRR19973070.279163/1‑150 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT < SRR19973070.3059242/150‑1 (MQ=60)
AGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAT > SRR19973070.225687/1‑150 (MQ=60)
AGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAT > SRR19973070.225675/1‑150 (MQ=60)
GTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTGCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATA < SRR19973070.1748744/150‑1 (MQ=60)
AGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAAT < SRR19973070.2396186/150‑1 (MQ=60)
GATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATA < SRR19973070.2746451/150‑1 (MQ=60)
TGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAA < SRR19973070.127345/150‑1 (MQ=60)
TAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGAT < SRR19973070.2586230/150‑1 (MQ=60)
GCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATA < SRR19973070.1126935/150‑1 (MQ=60)
GGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCT < SRR19973070.1211591/150‑1 (MQ=60)
GGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCT < SRR19973070.1211965/150‑1 (MQ=60)
CAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGG > SRR19973070.1211564/1‑150 (MQ=60)
AGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGC < SRR19973070.283012/150‑1 (MQ=60)
GAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATGATAAATGATAATACTCTGGCT < SRR19973070.3142489/150‑1 (MQ=60)
GAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCT > SRR19973070.535617/1‑150 (MQ=60)
GAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCT < SRR19973070.246448/150‑1 (MQ=60)
GAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCT > SRR19973070.535613/1‑150 (MQ=60)
AGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTT > SRR19973070.2964655/1‑150 (MQ=60)
GACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATATTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTT > SRR19973070.2479213/1‑150 (MQ=60)
ACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTA < SRR19973070.1483293/150‑1 (MQ=60)
ACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTA < SRR19973070.1448638/150‑1 (MQ=60)
TCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTT < SRR19973070.444164/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTGTATCGTTAA > SRR19973070.1776708/1‑150 (MQ=60)
TCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAAT < SRR19973070.1702918/150‑1 (MQ=60)
TCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCAATTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAAT < SRR19973070.1663174/150‑1 (MQ=60)
TACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACT < SRR19973070.525832/150‑1 (MQ=60)
ACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT > SRR19973070.2276220/1‑150 (MQ=60)
ACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT > SRR19973070.2719361/1‑150 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR19973070.3121054/150‑1 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR19973070.96063/150‑1 (MQ=60)
CTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT < SRR19973070.2875089/150‑1 (MQ=60)
TACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATT > SRR19973070.539501/1‑150 (MQ=60)
TACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATT > SRR19973070.1775125/1‑150 (MQ=60)
ACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTC < SRR19973070.3082149/150‑1 (MQ=60)
CGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCC < SRR19973070.1790791/150‑1 (MQ=60)
GCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCAC < SRR19973070.871848/150‑1 (MQ=60)
GCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCAC < SRR19973070.2884466/150‑1 (MQ=60)
GCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCAC < SRR19973070.2884436/150‑1 (MQ=60)
CATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR19973070.1664979/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR19973070.2033467/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR19973070.2034043/1‑150 (MQ=60)
ATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT < SRR19973070.387382/150‑1 (MQ=60)
ATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT < SRR19973070.386728/150‑1 (MQ=60)
ATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT > SRR19973070.2359692/1‑150 (MQ=60)
TGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR19973070.1683138/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR19973070.1683143/150‑1 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG < SRR19973070.903851/150‑1 (MQ=60)
TACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCA < SRR19973070.2044083/150‑1 (MQ=60)
TACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCA > SRR19973070.1606993/1‑150 (MQ=60)
CATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTCAGCAAT > SRR19973070.2839577/1‑150 (MQ=60)
CATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAT > SRR19973070.2839944/1‑150 (MQ=60)
GGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGC > SRR19973070.3065825/1‑150 (MQ=60)
GGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCA < SRR19973070.888166/150‑1 (MQ=60)
GGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCA < SRR19973070.35490/150‑1 (MQ=60)
GTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR19973070.2492362/1‑150 (MQ=60)
TACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGAGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATA > SRR19973070.3022369/1‑150 (MQ=60)
CTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGC > SRR19973070.275205/1‑150 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA > SRR19973070.462270/1‑150 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA > SRR19973070.1652337/1‑150 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA > SRR19973070.1652371/1‑150 (MQ=60)
CTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGC > SRR19973070.2264289/1‑150 (MQ=60)
CTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGC > SRR19973070.2263674/1‑150 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973070.1093367/150‑1 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGGTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973070.1354730/150‑1 (MQ=60)
TGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAG < SRR19973070.2931137/150‑1 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR19973070.1929863/1‑150 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT < SRR19973070.1936114/150‑1 (MQ=60)
AACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTT > SRR19973070.1370907/1‑150 (MQ=60)
ACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTT > SRR19973070.582448/1‑150 (MQ=60)
CAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT > SRR19973070.927939/1‑150 (MQ=60)
CAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT < SRR19973070.984740/150‑1 (MQ=60)
CAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT < SRR19973070.358719/150‑1 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTG < SRR19973070.237879/150‑1 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTG > SRR19973070.2780974/1‑150 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTG > SRR19973070.2996709/1‑150 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA > SRR19973070.2874700/1‑150 (MQ=60)
AGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGTCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGA > SRR19973070.1289073/1‑150 (MQ=60)
AGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGA > SRR19973070.2275700/1‑150 (MQ=60)
GTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAT > SRR19973070.174739/1‑150 (MQ=60)
TGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATG < SRR19973070.431280/150‑1 (MQ=60)
GATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGG < SRR19973070.1834715/150‑1 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT < SRR19973070.3238549/150‑1 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT < SRR19973070.2762430/150‑1 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT < SRR19973070.1044796/150‑1 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT < SRR19973070.1911315/150‑1 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT < SRR19973070.496689/150‑1 (MQ=60)
GAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAA > SRR19973070.1247994/1‑150 (MQ=60)
AATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAAT < SRR19973070.2860659/150‑1 (MQ=60)
AATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAAT > SRR19973070.35589/1‑150 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > SRR19973070.1895411/1‑150 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > SRR19973070.1894899/1‑150 (MQ=60)
|
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778671‑2778969
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
