Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,778,820 |
G→A |
100% |
intergenic (‑450/+301) |
ypjC ← / ← ileY |
pseudogene/tRNA‑Ile |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,778,820 | 0 | G | A | 97.9%
| 929.8
/ 7.0
| 280 | intergenic (‑450/+301) | ypjC/ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/4); new base A (124/150); total (126/154) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGA > CP009273/2778674‑2778963
|
gcctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa > 1:522919/1‑149 (MQ=255)
gcctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 2:2567734/149‑1 (MQ=255)
gcctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa > 1:132960/1‑149 (MQ=255)
gcctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 2:2680304/149‑1 (MQ=255)
ctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGaataat > 2:1998812/1‑149 (MQ=255)
ctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGaataat < 1:2570717/149‑1 (MQ=255)
ctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGaataat < 1:2285890/149‑1 (MQ=255)
cggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACTTTGCTTGTGGTACTCACTGATCAGCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTaa < 1:4034770/149‑1 (MQ=255)
cggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTaa < 2:2907087/149‑1 (MQ=255)
cggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTaa < 1:1014646/149‑1 (MQ=255)
cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCt < 2:578098/149‑1 (MQ=255)
cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCt < 2:2739654/149‑1 (MQ=255)
cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCt < 2:578048/149‑1 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa < 2:725817/149‑1 (MQ=255)
gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAt > 2:786079/1‑149 (MQ=255)
ttCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaa < 2:3631265/149‑1 (MQ=255)
ttCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaa > 2:2344677/1‑149 (MQ=255)
tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaaa < 2:1821273/149‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 2:3041036/149‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAg > 2:2289613/1‑149 (MQ=255)
cAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgg < 1:3113551/149‑1 (MQ=255)
agtagtAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAggg > 2:2075309/1‑149 (MQ=255)
gtagtaGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgggg < 2:3278222/149‑1 (MQ=255)
tagtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGt > 1:1095066/1‑149 (MQ=255)
agtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGta < 2:690600/149‑1 (MQ=255)
tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtata > 2:3621035/1‑149 (MQ=255)
gATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat > 1:847061/1‑149 (MQ=255)
gATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat > 1:2104141/1‑149 (MQ=255)
tGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAtaataa > 2:3399915/1‑149 (MQ=255)
tGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAtaataa > 2:3936840/1‑149 (MQ=255)
gTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa > 2:927036/1‑149 (MQ=255)
gTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa < 1:3841081/149‑1 (MQ=255)
gTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa > 2:3829664/1‑149 (MQ=255)
aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat > 2:2546159/1‑149 (MQ=255)
aaGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat < 2:3160775/149‑1 (MQ=255)
ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataa > 2:200668/1‑149 (MQ=255)
cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataata < 2:2823815/149‑1 (MQ=255)
gTGACAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAc > 1:2972633/1‑149 (MQ=255)
cAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTg > 2:2612023/1‑149 (MQ=255)
agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCt < 2:3911782/149‑1 (MQ=255)
gaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCtt < 1:2040154/149‑1 (MQ=255)
aCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCttt < 1:34200/149‑1 (MQ=255)
tCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGt > 1:3712731/1‑149 (MQ=255)
tCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGt < 1:1528353/149‑1 (MQ=255)
aTCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTa < 1:3525501/149‑1 (MQ=255)
tCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 2:1866231/1‑149 (MQ=255)
tCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 1:574853/1‑149 (MQ=255)
ccTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAAt < 1:1432229/149‑1 (MQ=255)
cTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAAtt > 2:43274/1‑149 (MQ=255)
ttACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTa > 1:2752580/1‑149 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt < 2:3518148/149‑1 (MQ=255)
aCGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 1:3362902/149‑1 (MQ=255)
aCGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 1:3196587/149‑1 (MQ=255)
cGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 2:848441/149‑1 (MQ=255)
cGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 1:955867/149‑1 (MQ=255)
aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca < 2:3244749/149‑1 (MQ=255)
aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca > 1:2636811/1‑149 (MQ=255)
ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt < 1:4071315/149‑1 (MQ=255)
ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 2:3476776/1‑149 (MQ=255)
tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATg < 2:1501805/149‑1 (MQ=255)
tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTaa < 1:1150631/149‑1 (MQ=255)
tacatacaTTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGc > 1:3303880/1‑149 (MQ=255)
tacatacaGTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTACAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGTGTATAATAATTGATAATACTCTGTCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTACGc > 1:3673871/1‑149 (MQ=255)
catacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCaa > 1:3259126/1‑149 (MQ=255)
tacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAtt > 1:1465082/1‑149 (MQ=255)
catTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTg < 2:1366862/149‑1 (MQ=255)
ttGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTCAGCAATTTGcc > 2:2657804/1‑149 (MQ=255)
ttGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGcc < 1:1067481/149‑1 (MQ=255)
ttGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGcc < 2:1968556/149‑1 (MQ=255)
gTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc < 1:894354/149‑1 (MQ=255)
ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCt > 2:48559/1‑149 (MQ=255)
gtgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg < 1:3346623/149‑1 (MQ=255)
tgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTgg < 2:2253701/149‑1 (MQ=255)
tACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAt > 1:4004110/1‑149 (MQ=255)
tCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGc < 1:1188635/149‑1 (MQ=255)
tCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGc < 1:3581487/149‑1 (MQ=255)
cTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAgg > 1:261176/1‑149 (MQ=255)
ttATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGc > 1:1825474/1‑149 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt > 1:419276/1‑149 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt < 1:1913730/149‑1 (MQ=255)
tcatcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt < 1:2461844/149‑1 (MQ=255)
catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttt > 2:2201352/1‑149 (MQ=255)
atcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt > 1:1931636/1‑149 (MQ=255)
tcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAttttt < 1:3989026/149‑1 (MQ=255)
aGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTc < 1:824941/149‑1 (MQ=255)
tGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 2:3598635/149‑1 (MQ=255)
aGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAgg > 1:2435579/1‑149 (MQ=255)
aaCAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACt > 1:222287/1‑149 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACttt < 1:3460721/149‑1 (MQ=255)
cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACttt > 2:1680700/1‑149 (MQ=255)
gagaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCtt > 1:2724391/1‑117 (MQ=255)
gaATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGaa > 2:112576/1‑149 (MQ=255)
aaTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAt < 1:1729991/149‑1 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg < 1:3708573/149‑1 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg > 1:1208179/1‑149 (MQ=255)
aGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAg < 1:1649288/149‑1 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTa < 2:1265769/149‑1 (MQ=255)
tCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAc < 1:2891036/149‑1 (MQ=255)
aGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg < 1:1745152/149‑1 (MQ=255)
tGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAt < 1:3783693/149‑1 (MQ=255)
|
GCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGA > CP009273/2778674‑2778963
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778671‑2778969
|
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAA > SRR19973068.325017/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATA > SRR19973068.134533/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATA > SRR19973068.134173/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATA > SRR19973068.526532/1‑150 (MQ=60)
GCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAA < SRR19973068.831544/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATT < SRR19973068.2300700/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATT < SRR19973068.2586987/150‑1 (MQ=60)
GCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAA < SRR19973068.1747629/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACTTTGCTTGTGGTACTCACTGATCAGCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC < SRR19973068.4059099/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC < SRR19973068.1021313/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC < SRR19973068.2010840/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC < SRR19973068.3028018/150‑1 (MQ=60)
CGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAC < SRR19973068.1021241/150‑1 (MQ=60)
GCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCT < SRR19973068.4025824/150‑1 (MQ=60)
GCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCT < SRR19973068.4025755/150‑1 (MQ=60)
CGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTG < SRR19973068.563203/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973068.411920/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973068.2766948/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973068.2768150/150‑1 (MQ=60)
GTGTTGTGGTCTGTAGTAGATGTTTTAGGCTTGGCAGAGACTTTTCATACTTACTCTACGGCATTTTTCTACATACATTGGTTGTGGTTCTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATT < SRR19973068.1162113/150‑1 (MQ=60)
GTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATT < SRR19973068.2245394/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTA < SRR19973068.1131911/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTA < SRR19973068.1085941/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTA < SRR19973068.1131931/150‑1 (MQ=60)
CTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATG > SRR19973068.3341691/1‑150 (MQ=60)
CTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATG < SRR19973068.1754390/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAG > SRR19973068.3387924/1‑150 (MQ=60)
CAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGG < SRR19973068.3132569/150‑1 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT > SRR19973068.1102351/1‑150 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT < SRR19973068.1076010/150‑1 (MQ=60)
TAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTA < SRR19973068.1197638/150‑1 (MQ=60)
TAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTA < SRR19973068.325885/150‑1 (MQ=60)
GTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATA < SRR19973068.979128/150‑1 (MQ=60)
AGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAAT > SRR19973068.852823/1‑150 (MQ=60)
AGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAAT > SRR19973068.2117866/1‑150 (MQ=60)
AGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAAT < SRR19973068.2104381/150‑1 (MQ=60)
GATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATA > SRR19973068.1695280/1‑150 (MQ=60)
GTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAT < SRR19973068.3864245/150‑1 (MQ=60)
AAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATA > SRR19973068.3558678/1‑150 (MQ=60)
AGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAA < SRR19973068.352377/150‑1 (MQ=60)
GGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAAT < SRR19973068.167341/150‑1 (MQ=60)
GGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAAT < SRR19973068.3136532/150‑1 (MQ=60)
CGTGACAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAC > SRR19973068.2991042/1‑150 (MQ=60)
CAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGG > SRR19973068.2691055/1‑150 (MQ=60)
GACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTT < SRR19973068.2053481/150‑1 (MQ=60)
GACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTT > SRR19973068.1925998/1‑150 (MQ=60)
ACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTA < SRR19973068.34641/150‑1 (MQ=60)
ACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTA < SRR19973068.34647/150‑1 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973068.3336903/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATC > SRR19973068.3620498/1‑150 (MQ=60)
TTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGT > SRR19973068.3735050/1‑150 (MQ=60)
TCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTT < SRR19973068.1538406/150‑1 (MQ=60)
TCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTT > SRR19973068.2352057/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAA < SRR19973068.3546906/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAA > SRR19973068.578787/1‑150 (MQ=60)
ATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAA < SRR19973068.3546940/150‑1 (MQ=60)
CCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATT < SRR19973068.1441584/150‑1 (MQ=60)
CTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTA > SRR19973068.2769490/1‑150 (MQ=60)
CTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTA > SRR19973068.772303/1‑150 (MQ=60)
ACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR19973068.2067705/150‑1 (MQ=60)
TCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAA > SRR19973068.94213/1‑150 (MQ=60)
CTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAT < SRR19973068.1160935/150‑1 (MQ=60)
ACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTC < SRR19973068.3216255/150‑1 (MQ=60)
ACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTC < SRR19973068.3383348/150‑1 (MQ=60)
CGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCC < SRR19973068.962246/150‑1 (MQ=60)
GGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR19973068.1518623/1‑150 (MQ=60)
GGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR19973068.3577245/1‑150 (MQ=60)
GGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATAAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR19973068.25672/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA > SRR19973068.2653372/1‑150 (MQ=60)
TTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATG < SRR19973068.4094118/150‑1 (MQ=60)
TTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATG < SRR19973068.4095765/150‑1 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG < SRR19973068.1796003/150‑1 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG < SRR19973068.1158335/150‑1 (MQ=60)
CTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGC > SRR19973068.1647282/1‑150 (MQ=60)
CTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGC > SRR19973068.3324100/1‑150 (MQ=60)
CTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGC > SRR19973068.3702595/1‑150 (MQ=60)
CTACATACAGTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTACAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGTGTATAATAATTGATAATACTCTGTCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTACGC > SRR19973068.3696066/1‑150 (MQ=60)
ACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAA > SRR19973068.3279147/1‑150 (MQ=60)
ATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATT > SRR19973068.1286626/1‑150 (MQ=60)
ATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATT > SRR19973068.1474709/1‑150 (MQ=60)
TACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT > SRR19973068.856849/1‑150 (MQ=60)
TACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT > SRR19973068.2191433/1‑150 (MQ=60)
TACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTT > SRR19973068.856827/1‑150 (MQ=60)
TTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCC < SRR19973068.1074483/150‑1 (MQ=60)
TGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCG < SRR19973068.2600183/150‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCT < SRR19973068.900401/150‑1 (MQ=60)
GTTGTGGTACTCAATTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCT < SRR19973068.3852745/150‑1 (MQ=60)
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGG < SRR19973068.3367165/150‑1 (MQ=60)
GTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGG < SRR19973068.3367008/150‑1 (MQ=60)
GTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATTATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTACACATGTAAGAAATTTGCCCGCTTGTCAT > SRR19973068.1633066/1‑150 (MQ=60)
GTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR19973068.4028305/1‑150 (MQ=60)
CTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGC > SRR19973068.328168/1‑150 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA < SRR19973068.3603246/150‑1 (MQ=60)
TCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCA < SRR19973068.1196578/150‑1 (MQ=60)
CACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAG < SRR19973068.1308587/150‑1 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGG > SRR19973068.264507/1‑150 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGG > SRR19973068.263035/1‑150 (MQ=60)
CTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGC > SRR19973068.1837481/1‑150 (MQ=60)
CTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGC > SRR19973068.1837491/1‑150 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT > SRR19973068.2520190/1‑150 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT > SRR19973068.422234/1‑150 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT > SRR19973068.423602/1‑150 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973068.2477552/150‑1 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973068.1926450/150‑1 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973068.1926967/150‑1 (MQ=60)
TCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTT < SRR19973068.2477539/150‑1 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTT > SRR19973068.1944406/1‑150 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTT > SRR19973068.3994272/1‑150 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTT > SRR19973068.1944477/1‑150 (MQ=60)
ATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTT < SRR19973068.2401184/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTT > SRR19973068.573647/1‑150 (MQ=60)
TCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT < SRR19973068.1963736/150‑1 (MQ=60)
TCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT < SRR19973068.4013133/150‑1 (MQ=60)
TCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTT < SRR19973068.3298724/150‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAGCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC > SRR19973068.2613688/1‑150 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC < SRR19973068.831407/150‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC < SRR19973068.830546/150‑1 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC > SRR19973068.1449231/1‑150 (MQ=60)
AGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCC < SRR19973068.43819/150‑1 (MQ=60)
GTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCA > SRR19973068.3729907/1‑150 (MQ=60)
GAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGG > SRR19973068.2451071/1‑150 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC < SRR19973068.3735662/150‑1 (MQ=60)
CGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTAC < SRR19973068.3735672/150‑1 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR19973068.223904/1‑150 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR19973068.223945/1‑150 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT > SRR19973068.1457685/1‑150 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT < SRR19973068.4033936/150‑1 (MQ=60)
GAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACT < SRR19973068.4034508/150‑1 (MQ=60)
AACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTT < SRR19973068.3881910/150‑1 (MQ=60)
CAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTT < SRR19973068.3481657/150‑1 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAGTTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTG > SRR19973068.2709631/1‑150 (MQ=60)
AGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGagatcggaagagcacacgtctgaactccagt > SRR19973068.2741218/1‑119 (MQ=60)
GAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGA > SRR19973068.3217126/1‑150 (MQ=60)
AGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAA > SRR19973068.2945915/1‑150 (MQ=60)
AGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAA > SRR19973068.598295/1‑150 (MQ=60)
GAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAT > SRR19973068.3390967/1‑150 (MQ=60)
GAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAT < SRR19973068.2629205/150‑1 (MQ=60)
GAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAT < SRR19973068.3178092/150‑1 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR19973068.1216234/1‑150 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG < SRR19973068.1740962/150‑1 (MQ=60)
AATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATG > SRR19973068.1216086/1‑150 (MQ=60)
ATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGA < SRR19973068.3730879/150‑1 (MQ=60)
ATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGA < SRR19973068.3730899/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG < SRR19973068.1494004/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT < SRR19973068.2800932/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT < SRR19973068.2257513/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT < SRR19973068.1659989/150‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA < SRR19973068.2992052/150‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA > SRR19973068.3445257/1‑150 (MQ=60)
TCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACT < SRR19973068.2909029/150‑1 (MQ=60)
TCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACT < SRR19973068.2909026/150‑1 (MQ=60)
CAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTG < SRR19973068.3643008/150‑1 (MQ=60)
AGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGA < SRR19973068.1756276/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATG < SRR19973068.3806397/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATG < SRR19973068.3806279/150‑1 (MQ=60)
TGATGTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATG < SRR19973068.418656/150‑1 (MQ=60)
GAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAA > SRR19973068.3206530/1‑150 (MQ=60)
AATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAAT > SRR19973068.1762828/1‑150 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA < SRR19973068.791432/150‑1 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA < SRR19973068.2562319/150‑1 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > SRR19973068.438575/1‑150 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > SRR19973068.438453/1‑150 (MQ=60)
|
TCTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778671‑2778969
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |