Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,778,820 |
G→A |
100% |
intergenic (‑450/+301) |
ypjC ← / ← ileY |
pseudogene/tRNA‑Ile |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,778,820 | 0 | G | A | 95.6%
| 879.1
/ 21.6
| 273 | intergenic (‑450/+301) | ypjC/ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/2); new base A (105/156); total (115/158) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT > CP009273/2778675‑2778964
|
cctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 2:416921/148‑1 (MQ=255)
ctgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATaa > 1:2157569/1‑148 (MQ=255)
cggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTa < 2:699087/148‑1 (MQ=255)
ggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTaa < 1:989186/148‑1 (MQ=255)
ggcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTaa < 1:2384401/148‑1 (MQ=255)
cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAcc < 2:96684/148‑1 (MQ=255)
cggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAAcc < 2:1573695/148‑1 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTg < 2:3003130/148‑1 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTg < 2:1829081/148‑1 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTg > 2:1772200/1‑148 (MQ=255)
ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACATg > 2:2056542/1‑148 (MQ=255)
gtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAtt < 1:705170/148‑1 (MQ=255)
tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaa < 2:2623610/148‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaaa < 1:1019028/148‑1 (MQ=255)
ggTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATg > 2:1167795/1‑148 (MQ=255)
gTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGa < 1:49674/148‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa < 1:1690498/148‑1 (MQ=255)
tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGaa < 2:1814120/148‑1 (MQ=255)
cAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAg < 1:2247227/148‑1 (MQ=255)
gtagtaGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAggg < 1:732200/148‑1 (MQ=255)
tagtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAgggg < 1:3230408/148‑1 (MQ=255)
tagtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAgggg < 1:1458907/148‑1 (MQ=255)
tagtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgggg < 2:2981563/148‑1 (MQ=255)
tagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 1:547923/1‑148 (MQ=255)
agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtata < 2:912505/148‑1 (MQ=255)
aTGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat > 2:3091712/1‑148 (MQ=255)
gTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAtaataa < 2:34924/148‑1 (MQ=255)
tttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATaaa < 1:1601604/148‑1 (MQ=255)
ttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAt > 1:363842/1‑148 (MQ=255)
ttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAt > 1:2025084/1‑148 (MQ=255)
tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg > 1:2642074/1‑148 (MQ=255)
tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:2561068/148‑1 (MQ=255)
aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat < 2:3188249/148‑1 (MQ=255)
ggCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGata > 2:3371336/1‑148 (MQ=255)
cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataat < 1:1833182/148‑1 (MQ=255)
cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataat > 2:2187700/1‑148 (MQ=255)
gTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataata < 1:970675/148‑1 (MQ=255)
ggCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAct > 1:245848/1‑148 (MQ=255)
gCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATActc < 2:563832/148‑1 (MQ=255)
gagaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTgg < 2:429585/148‑1 (MQ=255)
aCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCtt > 2:3338374/1‑148 (MQ=255)
aTTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTa < 2:2158371/148‑1 (MQ=255)
aTTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTa < 2:621429/148‑1 (MQ=255)
tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt > 1:526584/1‑148 (MQ=255)
tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt > 1:2760587/1‑148 (MQ=255)
tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt > 1:2687031/1‑148 (MQ=255)
tttCATACTTAATCTACTGTATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTAACTTATAATCAGTTAGCTAACAGAGAATACTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGTTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAt < 2:2475386/148‑1 (MQ=255)
aTCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGtt > 1:2899439/1‑148 (MQ=255)
ccTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 2:2321957/1‑148 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt < 1:3072622/148‑1 (MQ=255)
ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt > 1:2073073/1‑148 (MQ=255)
tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt < 1:1611426/148‑1 (MQ=255)
tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt < 1:1611430/148‑1 (MQ=255)
ctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTa > 1:1000216/1‑148 (MQ=255)
aCGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAt < 1:3300509/148‑1 (MQ=255)
cATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca > 1:3564976/1‑148 (MQ=255)
ttGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCcaca < 2:2783776/148‑1 (MQ=255)
tGTTCTACATACTTTTGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGTATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt < 1:1842613/148‑1 (MQ=255)
tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 2:491879/1‑148 (MQ=255)
tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 1:2509498/1‑148 (MQ=255)
gTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATg < 1:2615402/148‑1 (MQ=255)
ttCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGt < 1:2725188/148‑1 (MQ=255)
tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 1:600414/148‑1 (MQ=255)
tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 1:717075/148‑1 (MQ=255)
acatacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGc > 2:1023986/1‑148 (MQ=255)
acatacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGc < 2:3224531/148‑1 (MQ=255)
catacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCa > 1:2351380/1‑148 (MQ=255)
gTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCg > 1:3153645/1‑148 (MQ=255)
ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc < 1:1891150/148‑1 (MQ=255)
ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGc < 2:1267478/148‑1 (MQ=255)
gtgGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCtt < 2:2683188/148‑1 (MQ=255)
ggTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTgg < 2:1708815/148‑1 (MQ=255)
tCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAg < 2:1497430/148‑1 (MQ=255)
ttATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAgg > 1:1305960/1‑148 (MQ=255)
catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt > 2:3414828/1‑148 (MQ=255)
tcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt < 2:245848/148‑1 (MQ=255)
gTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTc > 1:2273335/1‑148 (MQ=255)
gAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa < 2:3137474/148‑1 (MQ=255)
gAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCa > 1:1336065/1‑148 (MQ=255)
aGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAg < 2:2609729/148‑1 (MQ=255)
cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg > 1:837204/1‑124 (MQ=255)
cGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTg < 2:837204/124‑1 (MQ=255)
aaTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGaa > 2:787144/1‑148 (MQ=255)
aTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAt < 2:2025084/148‑1 (MQ=255)
aTAGTACAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAAt < 2:3167036/148‑1 (MQ=255)
tAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAACTGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg < 1:2996954/148‑1 (MQ=255)
tAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg > 2:1860444/1‑148 (MQ=255)
tAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg < 1:3371336/148‑1 (MQ=255)
aGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa < 1:2187700/148‑1 (MQ=255)
gTTCAGTTATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAg < 2:2690597/148‑1 (MQ=255)
gTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAg > 1:942703/1‑148 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGt < 1:460445/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGt > 2:1086979/1‑148 (MQ=255)
tCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTa > 1:20104/1‑148 (MQ=255)
cAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAc > 1:787961/1‑148 (MQ=255)
gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg < 1:1774618/148‑1 (MQ=255)
gATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAt > 2:2849057/1‑148 (MQ=255)
aTTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATg > 2:3473545/1‑148 (MQ=255)
ttGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa > 1:1102411/1‑148 (MQ=255)
tGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAt > 1:3461226/1‑148 (MQ=255)
|
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT > CP009273/2778675‑2778964
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778672‑2778969
|
CTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAAT > SRR19973066.2441024/1‑150 (MQ=60)
CTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGGTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAAT > SRR19973066.2440928/1‑150 (MQ=60)
GCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAA > SRR19973066.2172600/1‑150 (MQ=60)
GCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAA > SRR19973066.2172552/1‑150 (MQ=60)
CCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAAT < SRR19973066.2421689/150‑1 (MQ=60)
GCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAA < SRR19973066.3297080/150‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACC < SRR19973066.2400475/150‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACC < SRR19973066.996485/150‑1 (MQ=60)
GGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACC < SRR19973066.797331/150‑1 (MQ=60)
CGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTG > SRR19973066.2627373/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973066.249453/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973066.359376/150‑1 (MQ=60)
GGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAT < SRR19973066.249463/150‑1 (MQ=60)
GTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATT < SRR19973066.1328927/150‑1 (MQ=60)
GTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAA < SRR19973066.710381/150‑1 (MQ=60)
TCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAT < SRR19973066.987841/150‑1 (MQ=60)
CTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATG < SRR19973066.1026526/150‑1 (MQ=60)
TGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGA < SRR19973066.1097269/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAG < SRR19973066.50314/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAG < SRR19973066.51235/150‑1 (MQ=60)
TCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGG < SRR19973066.1229016/150‑1 (MQ=60)
TCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGG < SRR19973066.1702799/150‑1 (MQ=60)
CAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGG < SRR19973066.2262685/150‑1 (MQ=60)
CAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGG < SRR19973066.2262718/150‑1 (MQ=60)
CAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGG < SRR19973066.186797/150‑1 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT < SRR19973066.737411/150‑1 (MQ=60)
GTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGT < SRR19973066.737632/150‑1 (MQ=60)
TAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTA < SRR19973066.3251749/150‑1 (MQ=60)
TAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTA < SRR19973066.1469237/150‑1 (MQ=60)
AGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAT > SRR19973066.551866/1‑150 (MQ=60)
AGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAT < SRR19973066.2966772/150‑1 (MQ=60)
AGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTAT > SRR19973066.2356378/1‑150 (MQ=60)
TAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAA < SRR19973066.1658580/150‑1 (MQ=60)
GTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAT > SRR19973066.2175330/1‑150 (MQ=60)
GTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAT > SRR19973066.366698/1‑150 (MQ=60)
GTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAAT > SRR19973066.2039239/1‑150 (MQ=60)
TTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATG > SRR19973066.2659860/1‑150 (MQ=60)
TTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATG > SRR19973066.2659841/1‑150 (MQ=60)
TTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATG < SRR19973066.1613868/150‑1 (MQ=60)
TTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATG < SRR19973066.1613312/150‑1 (MQ=60)
TTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATG < SRR19973066.1613228/150‑1 (MQ=60)
AAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATA > SRR19973066.3375614/1‑150 (MQ=60)
AAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATA < SRR19973066.428847/150‑1 (MQ=60)
CGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAC < SRR19973066.1846273/150‑1 (MQ=60)
GTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACT < SRR19973066.744596/150‑1 (MQ=60)
GTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACT > SRR19973066.247755/1‑150 (MQ=60)
GTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACT < SRR19973066.744658/150‑1 (MQ=60)
GTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACT < SRR19973066.977816/150‑1 (MQ=60)
GTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACT < SRR19973066.1795862/150‑1 (MQ=60)
TGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTC > SRR19973066.572261/1‑150 (MQ=60)
AGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGC > SRR19973066.734388/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973066.2704955/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973066.530443/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973066.531427/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973066.2708559/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTAT > SRR19973066.2779174/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATC < SRR19973066.1366957/150‑1 (MQ=60)
TTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGT < SRR19973066.1611645/150‑1 (MQ=60)
TCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTT > SRR19973066.2918817/1‑150 (MQ=60)
CCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATT > SRR19973066.303250/1‑150 (MQ=60)
TACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACT > SRR19973066.2087412/1‑150 (MQ=60)
TACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACT > SRR19973066.2087432/1‑150 (MQ=60)
ACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTT < SRR19973066.479735/150‑1 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA > SRR19973066.1007586/1‑150 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR19973066.3092945/150‑1 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR19973066.2114402/150‑1 (MQ=60)
CTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTA < SRR19973066.3093158/150‑1 (MQ=60)
TCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTTA < SRR19973066.1623117/150‑1 (MQ=60)
TCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAA < SRR19973066.1623114/150‑1 (MQ=60)
TCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAA < SRR19973066.1623118/150‑1 (MQ=60)
ACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTC < SRR19973066.3322329/150‑1 (MQ=60)
CGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCC < SRR19973066.1063499/150‑1 (MQ=60)
CGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCC < SRR19973066.2708113/150‑1 (MQ=60)
GGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR19973066.3588612/1‑150 (MQ=60)
GGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCA > SRR19973066.3588639/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACA < SRR19973066.521803/150‑1 (MQ=60)
ATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT > SRR19973066.2696650/1‑150 (MQ=60)
ATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAT > SRR19973066.2526579/1‑150 (MQ=60)
TGTTCTACATACTTTTGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGTATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR19973066.1855783/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR19973066.1855787/150‑1 (MQ=60)
TGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGT < SRR19973066.1855767/150‑1 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR19973066.3373718/1‑150 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR19973066.1594890/1‑150 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR19973066.3199117/1‑150 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA > SRR19973066.1805977/1‑150 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA < SRR19973066.2633745/150‑1 (MQ=60)
GTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTA < SRR19973066.2633074/150‑1 (MQ=60)
TTCTACATACATTTGTTGTGGGACTCTCTTATCATGAGTGAGCGAAAAGAGTATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGTTTAAATGAAGGGGTATAATTAATGATTATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAA < SRR19973066.1010834/150‑1 (MQ=60)
TTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAA > SRR19973066.2757120/1‑150 (MQ=60)
TTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAA < SRR19973066.2743519/150‑1 (MQ=60)
TTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAA < SRR19973066.953362/150‑1 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG < SRR19973066.604546/150‑1 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG > SRR19973066.2745566/1‑150 (MQ=60)
TCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAG < SRR19973066.722380/150‑1 (MQ=60)
CTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGC > SRR19973066.1770704/1‑150 (MQ=60)
TACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCA > SRR19973066.2367352/1‑150 (MQ=60)
CATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAGTAATGTTTATAATAACTTATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAT < SRR19973066.3520833/150‑1 (MQ=60)
ACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTG > SRR19973066.717648/1‑150 (MQ=60)
ACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTG > SRR19973066.717719/1‑150 (MQ=60)
TTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCC < SRR19973066.1784886/150‑1 (MQ=60)
TGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCG > SRR19973066.3174673/1‑150 (MQ=60)
TTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTT < SRR19973066.1904665/150‑1 (MQ=60)
TTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTT < SRR19973066.1904632/150‑1 (MQ=60)
TTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTT < SRR19973066.1200295/150‑1 (MQ=60)
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG > SRR19973066.2303089/1‑150 (MQ=60)
TGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTG < SRR19973066.2594967/150‑1 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC > SRR19973066.530493/1‑150 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC > SRR19973066.2063217/1‑150 (MQ=60)
TGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGC > SRR19973066.2063161/1‑150 (MQ=60)
GTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAT > SRR19973066.1977245/1‑150 (MQ=60)
ACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAG < SRR19973066.3171742/150‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAG > SRR19973066.3420586/1‑150 (MQ=60)
ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGG > SRR19973066.1315431/1‑150 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT > SRR19973066.3315188/1‑150 (MQ=60)
ATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATT > SRR19973066.2370765/1‑150 (MQ=60)
CATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTT < SRR19973066.874237/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTT > SRR19973066.2277502/1‑150 (MQ=60)
CAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTC > SRR19973066.2288549/1‑150 (MQ=60)
CAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTC > SRR19973066.2288960/1‑150 (MQ=60)
GTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCA > SRR19973066.1345759/1‑150 (MQ=60)
GTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCA > SRR19973066.1345760/1‑150 (MQ=60)
GTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCCATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCA > SRR19973066.1696245/1‑150 (MQ=60)
AGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCAgatcggaagagcacacgtctg > SRR19973066.843305/1‑129 (MQ=60)
AACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTT < SRR19973066.2025866/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAACTGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG < SRR19973066.3016840/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG < SRR19973066.3393833/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG < SRR19973066.3393829/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG > SRR19973066.949577/1‑150 (MQ=60)
TAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAG < SRR19973066.3016658/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT < SRR19973066.2202879/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT < SRR19973066.395710/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGT > SRR19973066.958020/1‑150 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA > SRR19973066.20405/1‑150 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA < SRR19973066.567098/150‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA < SRR19973066.2369251/150‑1 (MQ=60)
GTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTA < SRR19973066.3160524/150‑1 (MQ=60)
TTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAC < SRR19973066.670025/150‑1 (MQ=60)
TTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAC > SRR19973066.793767/1‑150 (MQ=60)
TTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAC < SRR19973066.463968/150‑1 (MQ=60)
AGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGA > SRR19973066.873945/1‑150 (MQ=60)
GTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAT < SRR19973066.1787313/150‑1 (MQ=60)
GTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAT > SRR19973066.2820000/1‑150 (MQ=60)
GTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAT < SRR19973066.997354/150‑1 (MQ=60)
ATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGA > SRR19973066.1110411/1‑150 (MQ=60)
TTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGAT > SRR19973066.3484367/1‑150 (MQ=60)
GAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAA > SRR19973066.2401838/1‑150 (MQ=60)
ATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > SRR19973066.1069886/1‑150 (MQ=60)
|
CTGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAAATA > CP009273/2778672‑2778969
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |