Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,986,052 |
G→T |
88.6% |
L200F (TTG→TTT) |
ygeH → |
putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,986,052 | 0 | G | T | 88.6%
| 568.3
/ 64.9
| 226 | L200F (TTG→TTT) | ygeH | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/11); new base T (106/94); total (121/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAA > CP009273/2985905‑2986196
|
tGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTg > 2:851691/1‑148 (MQ=255)
tctcTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATc > 2:1504249/1‑148 (MQ=255)
ctATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGAc > 2:325030/1‑148 (MQ=255)
taCCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCt > 1:914644/1‑148 (MQ=255)
cTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTaaa > 2:267007/1‑148 (MQ=255)
tATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTaaaa < 2:480863/148‑1 (MQ=255)
tATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTaaaa < 1:1702242/148‑1 (MQ=255)
aTCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTaaaaa > 1:737431/1‑148 (MQ=255)
ccGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAAcc > 1:3110133/1‑148 (MQ=255)
tGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCtttt > 2:211950/1‑148 (MQ=255)
ggCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTc < 2:2000780/148‑1 (MQ=255)
ggCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTc < 2:1605113/148‑1 (MQ=255)
gCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTcc < 1:2885437/148‑1 (MQ=255)
gCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCa > 1:2307224/1‑148 (MQ=255)
cGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCAt > 2:1257459/1‑148 (MQ=255)
cGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGAGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCAt > 2:3102603/1‑148 (MQ=255)
aaaTTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCTTGGcc < 1:1758104/148‑1 (MQ=255)
aaTTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCa < 2:752246/148‑1 (MQ=255)
aaTTTTTGTAATGATCACATATATCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCa > 1:944353/1‑148 (MQ=255)
ttGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAat > 1:1630473/1‑148 (MQ=255)
aaTGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAatcatc > 2:1763472/1‑148 (MQ=255)
aaTGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAatcatc > 2:90429/1‑148 (MQ=255)
gATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTcc > 1:2694112/1‑148 (MQ=255)
gATCACATATATCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTcc < 2:2061336/148‑1 (MQ=255)
aTCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTccc > 2:2612163/1‑148 (MQ=255)
tCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCt > 2:279777/1‑148 (MQ=255)
cacaTATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTg < 2:1102766/148‑1 (MQ=255)
acaTATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGt < 2:3014756/148‑1 (MQ=255)
acaTATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGt < 2:925926/148‑1 (MQ=255)
atatCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTtg < 2:2977373/148‑1 (MQ=255)
atatCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTtg > 1:2235481/1‑148 (MQ=255)
atCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTtgat > 1:1101820/1‑148 (MQ=255)
tatcAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTtgatg < 2:1823308/146‑1 (MQ=255)
ctcAATATTCATTATTTAGCAGATTAAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCTGTGAACACTTTATAAATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTtgatga < 1:2281378/148‑1 (MQ=255)
tcAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAATAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGaa < 1:2529527/148‑1 (MQ=255)
tcAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGaa < 1:173661/148‑1 (MQ=255)
tcAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGaa < 2:2071001/148‑1 (MQ=255)
cAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAAc > 2:2956748/1‑148 (MQ=255)
aaTTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTAc > 2:1152003/1‑148 (MQ=255)
attcattcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACa > 2:1350809/1‑148 (MQ=255)
attcattcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACa > 2:2155071/1‑148 (MQ=255)
ttcattcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTccc < 1:882402/132‑1 (MQ=255)
tctttcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACata < 2:286216/145‑1 (MQ=255)
tcattcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACata > 2:2762262/1‑148 (MQ=255)
ttcTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACATATTCATCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACataata > 1:2876843/1‑148 (MQ=255)
tGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACAATTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATc < 2:561472/148‑1 (MQ=255)
gAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATca > 1:1986251/1‑148 (MQ=255)
gAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATca > 1:1281327/1‑148 (MQ=255)
tcAGATTCAACCCATATTATATCTTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATcaca < 2:2828445/147‑1 (MQ=255)
cAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACaa > 2:1468410/1‑148 (MQ=255)
aGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACCTCACAAt < 2:3186033/148‑1 (MQ=255)
aGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAAt < 1:3307963/148‑1 (MQ=255)
gATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAAtt > 1:304833/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATtta > 2:3060919/1‑148 (MQ=255)
ttCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATtta > 1:2143092/1‑148 (MQ=255)
cAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATttatt > 2:811948/1‑148 (MQ=255)
aGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTtattat > 1:529690/1‑148 (MQ=255)
ccAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAg > 2:3273065/1‑148 (MQ=255)
cAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGa < 1:2188765/148‑1 (MQ=255)
aGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGat < 2:688708/148‑1 (MQ=255)
aGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGat < 2:2349411/148‑1 (MQ=255)
aGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTGTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGat > 2:1960645/1‑148 (MQ=255)
gATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGata < 1:2631255/148‑1 (MQ=255)
ttattTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGataat > 1:1329412/1‑148 (MQ=255)
tattTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGataata < 1:690359/148‑1 (MQ=255)
tttCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATc < 1:1551967/148‑1 (MQ=255)
ttACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCa > 2:2385014/1‑148 (MQ=255)
ttACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCa > 2:3142342/1‑148 (MQ=255)
aCAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCaaa > 2:447512/1‑148 (MQ=255)
taaTAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACa < 2:1039788/147‑1 (MQ=255)
aaTAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACAt > 1:2551458/1‑148 (MQ=255)
tAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATaa > 2:2583660/1‑148 (MQ=255)
aaCCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAAc > 2:1200888/1‑148 (MQ=255)
ccAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCa > 1:1170935/1‑148 (MQ=255)
aGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGa < 1:3089079/148‑1 (MQ=255)
aGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTAATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGa < 1:3021493/148‑1 (MQ=255)
gAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGaa > 2:247988/1‑148 (MQ=255)
gAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGaa > 1:1381256/1‑148 (MQ=255)
gAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGaa > 2:1013120/1‑148 (MQ=255)
gAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGaa > 2:1177396/1‑148 (MQ=255)
gAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGaa < 1:851691/148‑1 (MQ=255)
ataatGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACg > 1:1818304/1‑148 (MQ=255)
taatGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGa < 1:616952/148‑1 (MQ=255)
atGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATc < 1:1513682/148‑1 (MQ=255)
gCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTg > 1:386908/1‑148 (MQ=255)
gAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGa > 2:1667536/1‑148 (MQ=255)
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TATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATC < SRR19973070.695290/150‑1 (MQ=60)
TTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCT < SRR19973070.1562881/150‑1 (MQ=60)
TTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCT < SRR19973070.1562849/150‑1 (MQ=60)
CGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCA > SRR19973070.316045/1‑150 (MQ=60)
TACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAAC < SRR19973070.424023/150‑1 (MQ=60)
AGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACAT > SRR19973070.2568143/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTANTCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACC < SRR19973070.1688939/150‑1 (MQ=60)
AAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTANTCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACC < SRR19973070.1689390/150‑1 (MQ=60)
AACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCA > SRR19973070.1179132/1‑150 (MQ=60)
ACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAG < SRR19973070.23538/150‑1 (MQ=60)
CAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAA > SRR19973070.1390616/1‑150 (MQ=60)
CAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAA > SRR19973070.2621926/1‑150 (MQ=60)
AGAATAATGCAGTGAACACTTTATACTTTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTAATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAAC < SRR19973070.3040987/150‑1 (MQ=60)
AGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAAC < SRR19973070.1330001/150‑1 (MQ=60)
AGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAAC < SRR19973070.3108955/150‑1 (MQ=60)
AGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTAATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAAC < SRR19973070.3040747/150‑1 (MQ=60)
GAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACG < SRR19973070.857542/150‑1 (MQ=60)
GAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACG > SRR19973070.1830833/1‑150 (MQ=60)
TAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATC < SRR19973070.621385/150‑1 (MQ=60)
TAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATC < SRR19973070.621279/150‑1 (MQ=60)
AATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCT > SRR19973070.2148091/1‑150 (MQ=60)
AATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCT < SRR19973070.268835/150‑1 (MQ=60)
AATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCT < SRR19973070.817512/150‑1 (MQ=60)
AATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCT < SRR19973070.268773/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTTAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG < SRR19973070.88177/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG < SRR19973070.111243/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG < SRR19973070.1524064/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG < SRR19973070.1524272/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG < SRR19973070.1796658/150‑1 (MQ=60)
ATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTG > SRR19973070.389744/1‑150 (MQ=60)
GTGAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGA > SRR19973070.1874588/1‑150 (MQ=60)
GAACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATT < SRR19973070.2335198/150‑1 (MQ=60)
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ACACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAG > SRR19973070.708672/1‑150 (MQ=60)
CACTTTATACATTGAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGC < SRR19973070.2409010/150‑1 (MQ=60)
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GAGTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAAAACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATATGTAAGATTAGATAAGCAGGACCAA > SRR19973070.3283609/1‑150 (MQ=60)
GTTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAAGG < SRR19973070.2975774/150‑1 (MQ=60)
GTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAAGG < SRR19973070.453988/150‑1 (MQ=60)
TTTATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAAGGA < SRR19973070.1514777/150‑1 (MQ=60)
TATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAAGGATA > SRR19973070.1644435/1‑150 (MQ=60)
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GATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAACACTTTATACATTGAGTTGATCGACGCTAAAAACCTTTTCCTCATCGCCAGTAATCATCTCCCTGTTGATGAACTACATAATACATCACAATTTATTATAGATAATATCCTTCAAACGGTACATAAACCAGAACGATCTGTAAGATTAGCTAAGCAGGACCAAGGATA > CP009273/2985903‑2986201
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
