Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,176,733 |
G→T |
84.8% |
intergenic (+51/+439) |
zupT → / ← ribB |
zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,176,733 | 0 | G | T | 84.8%
| 388.8
/ 75.5
| 176 | intergenic (+51/+439) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/15); new base T (80/69); total (92/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAG > CP009273/3176588‑3176874
|
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa < 1:434360/148‑1 (MQ=255)
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTAGGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa < 2:1527431/148‑1 (MQ=255)
tGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaaa > 1:1105801/1‑148 (MQ=255)
taataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTa > 1:872991/1‑148 (MQ=255)
taataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTa > 1:540546/1‑148 (MQ=255)
taataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTa < 2:1446504/148‑1 (MQ=255)
ataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTa < 1:1501304/148‑1 (MQ=255)
ccccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtt > 2:2153727/1‑148 (MQ=255)
ccccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtt < 2:1383764/148‑1 (MQ=255)
ccccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtt > 1:644122/1‑148 (MQ=255)
cAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 2:253870/1‑148 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg > 2:2856412/1‑148 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTGTTCgg > 2:1535605/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 2:30255/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 2:2336845/1‑148 (MQ=255)
ggCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCTGCTGtc > 2:2689476/1‑148 (MQ=255)
cGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc > 1:1451646/1‑148 (MQ=255)
tACTATGTGTAATGTCAGTGATGGTATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt < 1:1990773/148‑1 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt > 2:1315229/1‑148 (MQ=255)
aCTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc > 2:1356536/1‑148 (MQ=255)
cTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttct > 2:1063699/1‑148 (MQ=255)
gAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTAc > 2:2580411/1‑148 (MQ=255)
aTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg < 2:1504624/148‑1 (MQ=255)
tGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt < 1:1764914/148‑1 (MQ=255)
gTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTCCCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGtt > 1:1163181/1‑148 (MQ=255)
tCAGTGATGGTATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGttt < 1:2516968/148‑1 (MQ=255)
tCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGttt < 2:689349/148‑1 (MQ=255)
cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTa > 2:1876247/1‑148 (MQ=255)
cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTa < 1:273454/148‑1 (MQ=255)
tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt < 1:2925255/148‑1 (MQ=255)
aTGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt > 2:2738863/1‑148 (MQ=255)
tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 2:336737/148‑1 (MQ=255)
gggATTCATTTTTGTGCTGCTAAATACGGCGTTAATTGTTTAAAAACAACATCAGAAGTGGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAttt < 1:971261/148‑1 (MQ=255)
gggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAttt < 1:3097865/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 1:2672840/1‑148 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 2:2579063/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 2:2405658/1‑148 (MQ=255)
aTTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt < 2:2803535/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc < 2:1635524/148‑1 (MQ=255)
tttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAACGCCTTATTCTACATTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTGTAAGTATTTGTTCCgcgc > 2:2263591/1‑148 (MQ=255)
tttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCgcgc > 2:157323/1‑148 (MQ=255)
ttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt > 1:87038/1‑148 (MQ=255)
tgctgcTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCaa > 2:515730/1‑148 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc < 1:3252720/148‑1 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc > 1:3138478/1‑148 (MQ=255)
gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAATTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAg > 1:2515576/1‑148 (MQ=255)
cAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCg > 1:820430/1‑148 (MQ=255)
ccggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct < 2:173919/147‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 1:700696/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct < 2:644122/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 1:2321881/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 1:2322191/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct < 2:733286/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGGTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct < 1:2102618/148‑1 (MQ=255)
gcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTg < 2:1422727/148‑1 (MQ=255)
ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTcc < 2:523359/148‑1 (MQ=255)
ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTcc > 1:1485665/1‑148 (MQ=255)
gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCt > 2:84340/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGc > 1:204912/1‑148 (MQ=255)
tGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCg > 1:2317722/1‑148 (MQ=255)
gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaa < 1:1950719/148‑1 (MQ=255)
ttAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaaa > 1:646694/1‑148 (MQ=255)
ttAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGGTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaaa < 2:2996979/148‑1 (MQ=255)
tAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAAc > 1:2188322/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg < 1:55909/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg < 2:268027/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg > 1:2421146/1‑148 (MQ=255)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGc < 2:268962/148‑1 (MQ=255)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGc < 2:120952/148‑1 (MQ=255)
aacaacATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGccc > 2:3141009/1‑148 (MQ=255)
caTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACaa < 2:1254895/148‑1 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAAt > 2:3099826/1‑148 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAAt > 2:277015/1‑148 (MQ=255)
tCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATa < 1:1466682/148‑1 (MQ=255)
cAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATaa > 2:2062044/1‑148 (MQ=255)
aGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAAc > 1:2590490/1‑148 (MQ=255)
aGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAAc > 1:1016394/1‑148 (MQ=255)
gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACACTAACg > 2:2065558/1‑148 (MQ=255)
gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACg > 1:2992056/1‑148 (MQ=255)
gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACg < 1:2251923/148‑1 (MQ=255)
aaGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACACTAACGt > 1:206045/1‑148 (MQ=255)
ttGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTc > 2:2729250/1‑148 (MQ=255)
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tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCa > 2:55857/1‑148 (MQ=255)
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TCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAAC > SRR19973070.2607417/1‑150 (MQ=60)
CAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACG > SRR19973070.3011221/1‑150 (MQ=60)
AGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACACTAACGT > SRR19973070.207586/1‑150 (MQ=60)
GAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTT < SRR19973070.2266838/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAAT < SRR19973070.251332/150‑1 (MQ=60)
AGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAG < SRR19973070.519262/150‑1 (MQ=60)
AGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAG < SRR19973070.2067196/150‑1 (MQ=60)
GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGG < SRR19973070.266301/150‑1 (MQ=60)
GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTACAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGG < SRR19973070.266348/150‑1 (MQ=60)
CGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGA < SRR19973070.1800447/150‑1 (MQ=60)
TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATA < SRR19973070.2171898/150‑1 (MQ=60)
ACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACC < SRR19973070.1889028/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCC < SRR19973070.239938/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCC > SRR19973070.2369484/1‑150 (MQ=60)
ACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCAC > SRR19973070.2627927/1‑150 (MQ=60)
ACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCAC < SRR19973070.2015815/150‑1 (MQ=60)
ACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCAC < SRR19973070.2015796/150‑1 (MQ=60)
TTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCA < SRR19973070.369635/150‑1 (MQ=60)
CCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACC < SRR19973070.2969229/150‑1 (MQ=60)
CAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCA < SRR19973070.840302/150‑1 (MQ=60)
AGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAG < SRR19973070.1990521/150‑1 (MQ=60)
TAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA < SRR19973070.2168059/150‑1 (MQ=60)
TAAAGCCTTATTCTACCATTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTCTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAACCAGTGCGTCTCTGTCCTAGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA < SRR19973070.2167739/150‑1 (MQ=60)
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GAGATTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA > CP009273/3176584‑3176882
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
