Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,176,733 |
G→T |
94.6% |
intergenic (+51/+439) |
zupT → / ← ribB |
zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,176,733 | 0 | G | T | 94.6%
| 531.6
/ 21.1
| 184 | intergenic (+51/+439) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/8); new base T (89/85); total (91/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAG > CP009273/3176589‑3176874
|
tGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaaa < 2:634580/148‑1 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc < 2:1021472/148‑1 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc > 2:3390005/1‑148 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc > 2:3449525/1‑148 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc > 2:1623925/1‑148 (MQ=255)
cTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCtt < 1:709733/148‑1 (MQ=255)
aataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAt < 1:2758987/148‑1 (MQ=255)
aataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAt > 1:1344592/1‑148 (MQ=255)
aataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAt < 2:215653/148‑1 (MQ=255)
ataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAtt < 1:204833/148‑1 (MQ=255)
ataataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTAtt > 1:792790/1‑148 (MQ=255)
taataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTc < 2:39998/148‑1 (MQ=255)
aataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCt < 1:541312/148‑1 (MQ=255)
taaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTAc > 2:3021419/1‑148 (MQ=255)
ccccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtt < 2:2635887/148‑1 (MQ=255)
ccccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtt > 1:2419846/1‑148 (MQ=255)
ccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtttt > 1:1555420/1‑148 (MQ=255)
cAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 2:3216886/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 1:1070150/1‑148 (MQ=255)
ggCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtc > 2:1910219/1‑148 (MQ=255)
cGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc < 2:2563006/148‑1 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGTGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACATCTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt < 2:1416730/148‑1 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt > 2:1036225/1‑148 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt > 2:1821764/1‑148 (MQ=255)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttctc < 1:1437726/148‑1 (MQ=255)
aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCt < 2:3472759/137‑1 (MQ=255)
aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCt > 1:3472759/1‑137 (MQ=255)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGt > 1:833240/1‑148 (MQ=255)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGt < 2:52487/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGTGATGTGATTCATTTTAGTGCTGCTACAAACTGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg < 2:3229366/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg > 2:1768419/1‑148 (MQ=255)
tGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt < 2:1035574/148‑1 (MQ=255)
gTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGtt < 2:779647/148‑1 (MQ=255)
tCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGttt < 2:1000658/148‑1 (MQ=255)
aGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa < 1:523648/148‑1 (MQ=255)
tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt > 2:520224/1‑148 (MQ=255)
gATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTa < 2:2749317/148‑1 (MQ=255)
tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 1:3211940/148‑1 (MQ=255)
tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 2:2469114/148‑1 (MQ=255)
tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 1:2830414/148‑1 (MQ=255)
tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 1:1913392/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 1:2825373/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 1:2898645/1‑148 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 1:1045185/148‑1 (MQ=255)
gATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 2:2808857/1‑148 (MQ=255)
gATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt < 1:2270060/148‑1 (MQ=255)
aTTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt < 1:3014657/148‑1 (MQ=255)
aTTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt > 1:721698/1‑148 (MQ=255)
tCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTcc > 1:900429/1‑148 (MQ=255)
gTTTAGTGCTGCTACAACCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg < 2:2945943/148‑1 (MQ=255)
gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg < 2:122306/148‑1 (MQ=255)
gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg < 2:2801262/148‑1 (MQ=255)
ttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt > 2:428514/1‑148 (MQ=255)
ttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt > 2:430035/1‑148 (MQ=255)
gTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCCGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCa < 2:2661845/148‑1 (MQ=255)
tgctgcTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCaa > 2:863258/1‑148 (MQ=255)
aCAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGc > 1:1688745/1‑148 (MQ=255)
aaaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGt > 1:1499441/1‑148 (MQ=255)
aaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtc > 2:2087596/1‑148 (MQ=255)
ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTcc > 2:1276084/1‑148 (MQ=255)
gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCt < 2:1862624/148‑1 (MQ=255)
ttAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaaa < 1:2461459/148‑1 (MQ=255)
ttAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaaa < 1:672503/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg > 1:3489058/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg > 1:16915/1‑148 (MQ=255)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGc < 1:1421586/148‑1 (MQ=255)
aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCGTCACTACAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGc < 2:211417/148‑1 (MQ=255)
acaacaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCg > 1:436904/1‑148 (MQ=255)
acaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACa > 2:2424988/1‑148 (MQ=255)
caTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACaa < 1:3449525/148‑1 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAAt > 1:1157235/1‑148 (MQ=255)
tCAGACGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATa < 2:3110803/148‑1 (MQ=255)
cAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATaa > 2:1348944/1‑148 (MQ=255)
aGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAAc < 2:2322425/148‑1 (MQ=255)
aaGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACgc < 1:1048688/148‑2 (MQ=255)
gTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGttt < 2:1314522/148‑1 (MQ=255)
tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCa > 2:2477375/1‑148 (MQ=255)
tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCa > 2:2477016/1‑148 (MQ=255)
gTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaa < 1:1466539/148‑1 (MQ=255)
gTCCAGCGCATGGACAACTTCGGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCaa < 2:2422316/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAAt > 2:2239347/1‑148 (MQ=255)
tGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGaaa > 1:3509011/1‑148 (MQ=255)
tGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGaaa > 1:1849424/1‑148 (MQ=255)
ggACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAAt > 1:2216407/1‑148 (MQ=255)
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CAACATCATAAGTTGTCCAGGGCATGGACAAATTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACA < SRR19973066.2125990/150‑1 (MQ=60)
AACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAA > SRR19973066.712475/1‑150 (MQ=60)
ACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAAT > SRR19973066.1165460/1‑150 (MQ=60)
CATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATA < SRR19973066.3472588/150‑1 (MQ=60)
CAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACG > SRR19973066.2091748/1‑150 (MQ=60)
GAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTT > SRR19973066.1411062/1‑150 (MQ=60)
AAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGCTT < SRR19973066.1056395/150‑1 (MQ=60)
AGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTC < SRR19973066.230843/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAAT < SRR19973066.1476891/150‑1 (MQ=60)
GTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAAT < SRR19973066.2827756/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCA > SRR19973066.1504671/1‑150 (MQ=60)
GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGG < SRR19973066.2440814/150‑1 (MQ=60)
CATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAA > SRR19973066.1862662/1‑150 (MQ=60)
CATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAA > SRR19973066.3532392/1‑150 (MQ=60)
CATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAA > SRR19973066.1656505/1‑150 (MQ=60)
ATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAAT > SRR19973066.3574900/1‑150 (MQ=60)
ATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAAT > SRR19973066.2231751/1‑150 (MQ=60)
TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCTGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTACGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATA > SRR19973066.2476871/1‑150 (MQ=60)
TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATA > SRR19973066.2476681/1‑150 (MQ=60)
GACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAC > SRR19973066.2137021/1‑150 (MQ=60)
ACAAATTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACCATAACGTTTCAAATGCAGGACATAACC > SRR19973066.2666059/1‑150 (MQ=60)
ACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCAC < SRR19973066.1781092/150‑1 (MQ=60)
TTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCA < SRR19973066.1635697/150‑1 (MQ=60)
TTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCA < SRR19973066.3412631/150‑1 (MQ=60)
TTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCA < SRR19973066.3412657/150‑1 (MQ=60)
CAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCA > SRR19973066.2095532/1‑150 (MQ=60)
CAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCA > SRR19973066.2095537/1‑150 (MQ=60)
AGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAG < SRR19973066.1288941/150‑1 (MQ=60)
CTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAG < SRR19973066.1834752/150‑1 (MQ=60)
ACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAAT < SRR19973066.1450314/150‑1 (MQ=60)
TAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA > SRR19973066.184967/1‑150 (MQ=60)
TAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA > SRR19973066.3140405/1‑150 (MQ=60)
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AGATTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAATCA > CP009273/3176585‑3176882
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |