Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,176,733 |
G→T |
100% |
intergenic (+51/+439) |
zupT → / ← ribB |
zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,176,733 | 0 | G | T | 98.9%
| 605.1
/ ‑1.9
| 189 | intergenic (+51/+439) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (117/68); total (120/69) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGA > CP009273/3176588‑3176875
|
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAACCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa < 1:1600576/148‑1 (MQ=255)
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa < 1:3020229/148‑1 (MQ=255)
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa > 1:2505628/1‑148 (MQ=255)
ttGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaa > 1:187204/1‑148 (MQ=255)
tGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTaaa < 1:2223540/148‑1 (MQ=255)
gACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATAGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAg < 1:1541245/148‑1 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc > 1:1084195/1‑148 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc < 1:949372/148‑1 (MQ=255)
cccTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGcc > 2:3474403/1‑148 (MQ=255)
taataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTc > 2:153532/1‑148 (MQ=255)
aatacCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCt < 2:1784266/148‑1 (MQ=255)
aataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCt > 2:2259099/1‑148 (MQ=255)
ataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTa > 2:1749796/1‑148 (MQ=255)
ataaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTa > 1:2630779/1‑148 (MQ=255)
taaCCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTAc > 2:2447941/1‑148 (MQ=255)
cccAGCTATGGCGTACTATGTGTAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCttt < 1:1248375/148‑1 (MQ=255)
ccAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCtttt < 2:396917/148‑1 (MQ=255)
cAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 1:2435251/1‑148 (MQ=255)
cAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 1:530355/1‑148 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg > 2:2857147/1‑148 (MQ=255)
gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg > 1:295835/1‑148 (MQ=255)
cTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc > 1:1961613/1‑148 (MQ=255)
cGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc < 1:1202637/148‑1 (MQ=255)
cGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc > 2:794324/1‑148 (MQ=255)
tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt < 2:2349378/148‑1 (MQ=255)
aCTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc > 1:470615/1‑148 (MQ=255)
tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttctc > 2:3476859/1‑148 (MQ=255)
gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTGTTCGGCTGTCTCTTCTCTCg > 1:338624/1‑148 (MQ=255)
tgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGt > 1:1637336/1‑148 (MQ=255)
tGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTATTCTCTCGTACTGt > 1:862125/1‑148 (MQ=255)
tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt > 1:2406699/1‑148 (MQ=255)
aTGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt < 2:1680538/148‑1 (MQ=255)
aTGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt > 2:3257640/1‑148 (MQ=255)
aTGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGACTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt > 2:1896091/1‑148 (MQ=255)
gggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAttt < 1:2285746/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 2:476674/148‑1 (MQ=255)
ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAAGTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 2:912922/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc < 2:2688985/148‑1 (MQ=255)
ttCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc < 1:591989/148‑1 (MQ=255)
cAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:1847955/1‑148 (MQ=255)
gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgcg > 2:740551/1‑148 (MQ=255)
aGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTc > 2:1113381/1‑148 (MQ=255)
gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAg < 1:815234/148‑1 (MQ=255)
ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc < 1:3056944/148‑1 (MQ=255)
gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAg > 1:3413397/1‑148 (MQ=255)
gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAg < 1:2113479/148‑1 (MQ=255)
tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTg > 1:152315/1‑148 (MQ=255)
aaaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGt > 2:2043443/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 1:3333889/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 2:245478/1‑148 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct < 2:1639860/148‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCGTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtct > 1:1274944/1‑148 (MQ=255)
cggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtctc < 2:2216048/148‑1 (MQ=255)
cggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGtctc < 2:1854790/148‑1 (MQ=255)
cggGAATTGGTT‑AAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTc < 1:2653903/148‑1 (MQ=255)
gggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGGCAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTc < 1:1167100/148‑1 (MQ=255)
gggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTc < 1:224376/148‑1 (MQ=255)
gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCt < 2:1174738/148‑1 (MQ=255)
aaTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCtt > 1:105821/1‑147 (MQ=255)
aaTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACAAAAGCCTAATTCTACCATTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCtt > 1:2677539/1‑147 (MQ=255)
aTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCttg < 1:992420/148‑3 (MQ=255)
gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGaa < 2:1057298/148‑1 (MQ=255)
tAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAAc > 1:276798/1‑148 (MQ=255)
tAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAAc > 2:340892/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACg < 2:2562900/148‑1 (MQ=255)
aaaCAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGcc > 2:724999/1‑148 (MQ=255)
aacaacATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGccc > 2:3045227/1‑148 (MQ=255)
aacaacATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCACTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGccc > 1:3455344/1‑148 (MQ=255)
acaacaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCg > 1:2645151/1‑148 (MQ=255)
caacaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGa > 2:2398666/1‑148 (MQ=255)
caacaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGa > 2:2019004/1‑148 (MQ=255)
caacaTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAGTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAGTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGa > 1:528578/1‑148 (MQ=255)
caTCAGAAGTTGTCCCGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACaa < 1:218010/148‑1 (MQ=255)
aTCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAAt > 2:1254159/1‑148 (MQ=255)
tCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATa > 2:1078341/1‑148 (MQ=255)
tCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATa < 2:70354/148‑1 (MQ=255)
cAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATaa < 2:2062960/148‑1 (MQ=255)
gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACg > 2:3183045/1‑148 (MQ=255)
gAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACg > 2:684422/1‑148 (MQ=255)
aGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGtt < 2:2746718/148‑1 (MQ=255)
aGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGtt > 1:3145468/1‑148 (MQ=255)
aGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGtt > 2:279639/1‑148 (MQ=255)
tGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCa > 1:3494487/1‑148 (MQ=255)
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GGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCT < SRR19973065.226033/150‑1 (MQ=60)
GGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTT > SRR19973065.106792/1‑150 (MQ=60)
GGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACAAAAGCCTAATTCTACCATTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTT > SRR19973065.2694140/1‑150 (MQ=60)
AATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGC > SRR19973065.2186302/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCG < SRR19973065.999014/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAA > SRR19973065.1120192/1‑150 (MQ=60)
GTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAAC > SRR19973065.278648/1‑150 (MQ=60)
AAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCC > SRR19973065.2647744/1‑150 (MQ=60)
AAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCACTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCC > SRR19973065.3476404/1‑150 (MQ=60)
AAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCG > SRR19973065.2661462/1‑150 (MQ=60)
AAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCG < SRR19973065.99682/150‑1 (MQ=60)
AACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGA > SRR19973065.2720421/1‑150 (MQ=60)
AACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGA > SRR19973065.599356/1‑150 (MQ=60)
AACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTAGTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAGTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGA > SRR19973065.532043/1‑150 (MQ=60)
ACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAAT > SRR19973065.3070964/1‑150 (MQ=60)
CATCAGAAGTTGTCCCGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATA < SRR19973065.219639/150‑1 (MQ=60)
CATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATA < SRR19973065.1499436/150‑1 (MQ=60)
GAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTT > SRR19973065.3164573/1‑150 (MQ=60)
GTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCA > SRR19973065.3515727/1‑150 (MQ=60)
TCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATG < SRR19973065.2415194/150‑1 (MQ=60)
TCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATG < SRR19973065.2415212/150‑1 (MQ=60)
CAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCA > SRR19973065.1860387/1‑150 (MQ=60)
GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAATCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGG > SRR19973065.3477438/1‑150 (MQ=60)
CATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAA > SRR19973065.1965996/1‑150 (MQ=60)
TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATA > SRR19973065.689563/1‑150 (MQ=60)
TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATA > SRR19973065.684512/1‑150 (MQ=60)
GACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAC < SRR19973065.2914855/150‑1 (MQ=60)
GACAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAAC < SRR19973065.2914793/150‑1 (MQ=60)
CAACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCC > SRR19973065.610819/1‑150 (MQ=60)
ACTTCTGCCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCAC > SRR19973065.3045724/1‑150 (MQ=60)
CCAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGGTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACC < SRR19973065.2170607/150‑1 (MQ=60)
CAGCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTACGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGAAGGAAATAACCCACCACAACCA > SRR19973065.1116253/1‑150 (MQ=60)
GCTTCACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGA > SRR19973065.1617944/1‑150 (MQ=60)
CACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACGATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAA > SRR19973065.2895056/1‑150 (MQ=60)
CACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAA > SRR19973065.92202/1‑150 (MQ=60)
ACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAAT > SRR19973065.3108293/1‑150 (MQ=60)
ACTAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTTGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAAT < SRR19973065.3498015/150‑1 (MQ=60)
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GAGATTGACCCTAATAATAACCCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCAGCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGCAGTGCGTCTCTGTCCTGGCGAAACGCCCGACAATAACGTTTCAAATGCAGGAAATAACCCACCACAACCAGAGCAAT > CP009273/3176584‑3176880
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
