Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,198,343 |
C→A |
100% |
S90Y (TCT→TAT) |
yehL → |
putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,198,343 | 0 | C | A | 96.5%
| 685.4
/ 13.1
| 229 | S90Y (TCT→TAT) | yehL | putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/3); new base A (106/115); total (111/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGT > CP009273/2198198‑2198490
|
ggCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtctt < 1:2408188/148‑1 (MQ=255)
gCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCtcttc < 1:3185440/148‑1 (MQ=255)
ccGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATcttctt < 1:1050480/148‑1 (MQ=255)
ccGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATcttctt < 1:1982211/148‑1 (MQ=255)
ccGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCGTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATcttctt < 2:917421/148‑1 (MQ=255)
cGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttcttt > 2:3204638/1‑148 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc < 1:2987811/148‑1 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc < 2:2560344/148‑1 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTGTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc > 1:1244617/1‑148 (MQ=255)
gCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTg > 1:2177387/1‑148 (MQ=255)
cTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTATGa > 2:907983/1‑148 (MQ=255)
ttttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGaa < 1:2800661/148‑1 (MQ=255)
ttttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGaa < 1:824863/148‑1 (MQ=255)
tttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAt < 2:1341046/148‑1 (MQ=255)
tATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTa > 1:2753354/1‑148 (MQ=255)
tATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTa > 1:534740/1‑148 (MQ=255)
tCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACt > 2:3345882/1‑148 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCg < 1:2702482/148‑1 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCg < 1:2701702/148‑1 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCg < 1:3487099/148‑1 (MQ=255)
cgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGATACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGAAACCGCt > 1:2576412/1‑148 (MQ=255)
gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTa < 1:2055599/148‑1 (MQ=255)
aaGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAt < 1:2238494/148‑1 (MQ=255)
cAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcg < 2:2360049/148‑1 (MQ=255)
tCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGc < 1:864109/148‑1 (MQ=255)
aaaGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTaa < 2:2844395/148‑1 (MQ=255)
aaGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAAc > 2:1441133/1‑148 (MQ=255)
aGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAAcc > 1:3435687/1‑148 (MQ=255)
tggtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTCTTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCAt > 2:688061/1‑148 (MQ=255)
gtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTATCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATcc > 1:2550876/1‑148 (MQ=255)
gATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAg < 1:1457546/148‑1 (MQ=255)
gATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAg > 2:1153981/1‑148 (MQ=255)
ttAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAggg > 1:76899/1‑148 (MQ=255)
tAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc > 1:1911263/1‑148 (MQ=255)
tAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc < 2:1642018/148‑1 (MQ=255)
aGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCg < 2:2962237/148‑1 (MQ=255)
aGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCg < 2:2477079/148‑1 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg > 2:1312142/1‑148 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg < 1:2319387/148‑1 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg > 2:760619/1‑148 (MQ=255)
cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgggg < 1:2670861/148‑1 (MQ=255)
tCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAt < 2:3528060/148‑1 (MQ=255)
ccGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATc > 1:491772/1‑148 (MQ=255)
tGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacc > 2:2175307/1‑148 (MQ=255)
gTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacca < 2:3196033/148‑1 (MQ=255)
gTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacca < 2:405867/148‑1 (MQ=255)
gTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacca > 2:791392/1‑148 (MQ=255)
aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa > 2:730756/1‑148 (MQ=255)
aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa < 1:1319744/148‑1 (MQ=255)
cGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAg < 2:584739/148‑1 (MQ=255)
gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa < 2:1868202/148‑1 (MQ=255)
aTGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatc > 2:1095424/1‑148 (MQ=255)
aTGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatc > 1:3091810/1‑148 (MQ=255)
tGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGTCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatca < 2:1662351/148‑1 (MQ=255)
gTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaa > 1:236128/1‑148 (MQ=255)
cACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAg < 1:1485316/148‑1 (MQ=255)
ttGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATgg < 2:3412980/148‑1 (MQ=255)
ttGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATgg < 2:1232994/148‑1 (MQ=255)
tGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCCTCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGc > 2:318047/1‑148 (MQ=255)
cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAc < 2:2550738/148‑1 (MQ=255)
cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAc > 1:1939395/1‑148 (MQ=255)
ggCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACt < 2:3126721/148‑1 (MQ=255)
gCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTa < 2:3228993/148‑1 (MQ=255)
gCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTa < 2:1479745/148‑1 (MQ=255)
cgGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGcc > 1:1001510/1‑148 (MQ=255)
cgGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGATATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGcc < 2:1776030/148‑1 (MQ=255)
tttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTg > 1:2398035/1‑148 (MQ=255)
tttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTg > 2:867703/1‑148 (MQ=255)
tttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAGTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTg > 1:1170941/1‑148 (MQ=255)
ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGc < 2:464020/148‑1 (MQ=255)
ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGc > 1:2240814/1‑148 (MQ=255)
ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGc > 1:1799806/1‑148 (MQ=255)
tGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt < 1:644226/148‑1 (MQ=255)
tGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt < 1:3204638/148‑1 (MQ=255)
tGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt > 2:3009462/1‑148 (MQ=255)
aTGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa < 2:3077004/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa > 1:1370997/1‑148 (MQ=255)
aTGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa > 1:3054737/1‑148 (MQ=255)
tGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTat < 2:1826798/148‑1 (MQ=255)
gTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatc > 2:2313243/1‑148 (MQ=255)
ttGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatca < 2:38275/148‑1 (MQ=255)
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ttGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatca > 1:2314457/1‑148 (MQ=255)
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GTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATC > SRR19973067.758468/1‑150 (MQ=60)
GTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATC > SRR19973067.475377/1‑150 (MQ=60)
TATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCA > SRR19973067.597504/1‑150 (MQ=60)
ATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAA > SRR19973067.237799/1‑150 (MQ=60)
TGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAA > SRR19973067.341814/1‑150 (MQ=60)
GTCACTCTTGATACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCCCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAACTACCACCGAATAACAAATCAAC > SRR19973067.512458/1‑150 (MQ=60)
CACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTA < SRR19973067.1495159/150‑1 (MQ=60)
TGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTG > SRR19973067.2792349/1‑150 (MQ=60)
GCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGG < SRR19973067.22673/150‑1 (MQ=60)
ACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAC > SRR19973067.1952622/1‑150 (MQ=60)
ACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAC > SRR19973067.1952708/1‑150 (MQ=60)
ACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAC > SRR19973067.1951395/1‑150 (MQ=60)
GCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACG < SRR19973067.1192845/150‑1 (MQ=60)
CGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCC > SRR19973067.1008393/1‑150 (MQ=60)
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GTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGC > SRR19973067.2255714/1‑150 (MQ=60)
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GTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGC > SRR19973067.1812445/1‑150 (MQ=60)
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TGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTA > SRR19973067.3074198/1‑150 (MQ=60)
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TGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATG < SRR19973067.737351/150‑1 (MQ=60)
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GGAACCGGGCACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCC < SRR19973067.515878/150‑1 (MQ=60)
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ATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGT < SRR19973067.3043745/150‑1 (MQ=60)
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ATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTCC > SRR19973067.3280286/1‑150 (MQ=60)
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TGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTCC > CP009273/2198197‑2198492
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
