Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,198,343 |
C→A |
100% |
S90Y (TCT→TAT) |
yehL → |
putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,198,343 | 0 | C | A | 99.6%
| 797.7
/ ‑4.4
| 244 | S90Y (TCT→TAT) | yehL | putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (100/142); total (100/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCT > CP009273/2198198‑2198487
|
gCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAAtatc < 1:3138530/148‑1 (MQ=255)
gCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAAtatc > 1:3152100/1‑148 (MQ=255)
cGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATatct < 1:1747771/148‑1 (MQ=255)
gCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtcttc < 2:3073156/148‑1 (MQ=255)
gCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtcttc < 2:1601961/148‑1 (MQ=255)
cccGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATAtcttct > 2:2395056/1‑148 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc < 2:3241312/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTg > 1:3511597/1‑148 (MQ=255)
tttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAt < 2:2780998/148‑1 (MQ=255)
tttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAt < 2:193028/148‑1 (MQ=255)
ccTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCCAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg > 1:1379465/1‑148 (MQ=255)
ccTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg > 2:2205274/1‑148 (MQ=255)
ccTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg < 1:3467347/148‑1 (MQ=255)
cTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTgg < 2:2758780/148‑1 (MQ=255)
cTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTgg > 2:489825/1‑148 (MQ=255)
acgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc < 1:777956/148‑1 (MQ=255)
cgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCt > 2:3015607/1‑148 (MQ=255)
gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTTATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTa > 1:998573/1‑148 (MQ=255)
gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTa < 2:766911/148‑1 (MQ=255)
aGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAtt > 1:963821/1‑148 (MQ=255)
aGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAtt < 1:1068538/148‑1 (MQ=255)
gcgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTa > 2:559814/1‑148 (MQ=255)
cgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAg < 2:1473086/148‑1 (MQ=255)
cgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAg < 1:547358/148‑1 (MQ=255)
aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcggcg < 1:745484/148‑1 (MQ=255)
aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcggcg < 2:2626272/148‑1 (MQ=255)
aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcggcg < 1:1598929/148‑1 (MQ=255)
atatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa > 1:2380370/1‑148 (MQ=255)
atatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa < 1:1774474/148‑1 (MQ=255)
atCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATg < 2:2571004/148‑1 (MQ=255)
cAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGcc > 1:1307963/1‑148 (MQ=255)
gCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTCTTAGCGGCGATGCCgg > 2:3421771/1‑148 (MQ=255)
ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCggg < 1:631850/148‑1 (MQ=255)
tAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTATGAATTACTGGCAACCGCGATTAGCGGCGATGCCGGGTTa > 1:1194280/1‑148 (MQ=255)
aGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAAcc < 2:770539/148‑1 (MQ=255)
tggtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCAt < 1:901856/148‑1 (MQ=255)
tgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCa < 1:868793/148‑1 (MQ=255)
aTTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAgg > 1:483670/1‑148 (MQ=255)
ttAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAggg > 1:3117693/1‑148 (MQ=255)
tAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc > 1:1445036/1‑148 (MQ=255)
tAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc > 2:1026293/1‑148 (MQ=255)
aGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCg < 1:269862/148‑1 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGAgg < 1:2941340/148‑1 (MQ=255)
ccccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTCCCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCggg > 1:2760406/1‑148 (MQ=255)
cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgggg < 2:835156/148‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCa > 1:2223245/1‑148 (MQ=255)
tCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGGCGCGGTTTGATGTTGGTGGTGGAACCGGGTACCGCAAAATATATTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGACGGGTTAACCATCCAGGGCGTGGctt < 2:3104989/148‑3 (MQ=255)
tCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAt < 1:650199/148‑1 (MQ=255)
ccGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATc < 2:2003692/148‑1 (MQ=255)
cGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCt < 1:1681260/148‑1 (MQ=255)
gCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCGACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTa > 2:3165973/1‑148 (MQ=255)
cTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTac < 1:1033620/148‑1 (MQ=255)
cTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTac < 1:1543643/148‑1 (MQ=255)
cTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTac > 2:2700416/1‑148 (MQ=255)
tGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacc > 2:3062100/1‑148 (MQ=255)
gTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacca < 2:1665023/148‑1 (MQ=255)
aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa < 2:2661578/148‑1 (MQ=255)
cGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAg < 1:2171474/148‑1 (MQ=255)
gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa < 1:1083650/148‑1 (MQ=255)
gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa > 2:586235/1‑148 (MQ=255)
gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGa < 1:2595788/148‑1 (MQ=255)
tATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGat > 1:2397403/1‑148 (MQ=255)
gTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaa > 1:2299051/1‑148 (MQ=255)
gTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaa < 2:3174878/148‑1 (MQ=255)
tAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaat < 1:2075810/148‑1 (MQ=255)
tCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaatcaa < 2:412952/148‑1 (MQ=255)
ctctTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTa < 1:2826655/148‑1 (MQ=255)
tctTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAt < 2:841815/148‑1 (MQ=255)
tctTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAt > 2:2158848/1‑148 (MQ=255)
gCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCt < 2:1158972/148‑1 (MQ=255)
cgaCCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTg < 2:297327/146‑1 (MQ=255)
tACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTgg < 2:2380125/148‑1 (MQ=255)
tACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTgg < 2:2893909/148‑1 (MQ=255)
ccGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATGACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGaa < 2:2414642/148‑1 (MQ=255)
cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAAc < 1:2881549/148‑1 (MQ=255)
cgGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGcc < 2:1579918/148‑1 (MQ=255)
ggTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGccc < 2:2365629/148‑1 (MQ=255)
gTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCt > 1:1431874/1‑148 (MQ=255)
tttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTg > 1:1496464/1‑148 (MQ=255)
tGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt < 1:2099491/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa > 1:2403585/1‑148 (MQ=255)
tGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTat < 1:2846383/148‑1 (MQ=255)
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AGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGG > SRR19973065.2777494/1‑150 (MQ=60)
AGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGG > SRR19973065.2427224/1‑150 (MQ=60)
GCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGAGGGG < SRR19973065.2959196/150‑1 (MQ=60)
CCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCTGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCA > SRR19973065.1105951/1‑150 (MQ=60)
CCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCA > SRR19973065.2237426/1‑150 (MQ=60)
CCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAT > SRR19973065.2261918/1‑150 (MQ=60)
CTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATC < SRR19973065.2857951/150‑1 (MQ=60)
CTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATC < SRR19973065.1703263/150‑1 (MQ=60)
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TCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCT < SRR19973065.654479/150‑1 (MQ=60)
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CGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGAT < SRR19973065.2100681/150‑1 (MQ=60)
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CTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGC < SRR19973065.2959694/150‑1 (MQ=60)
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ATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTCC < SRR19973065.3289207/150‑1 (MQ=60)
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GCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTCC > CP009273/2198194‑2198492
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
