Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,198,343 |
C→A |
100% |
S90Y (TCT→TAT) |
yehL → |
putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,198,343 | 0 | C | A | 98.2%
| 880.6
/ 4.0
| 274 | S90Y (TCT→TAT) | yehL | putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base A (126/142); total (128/146) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCT > CP009273/2198197‑2198487
|
cGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttc > 2:3126512/1‑149 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttct > 1:3761836/1‑149 (MQ=255)
gTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGAAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCttctttct > 2:1192941/1‑149 (MQ=255)
tGCTTTTATCCTTGGCGACGACGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTg > 2:1028347/1‑149 (MQ=255)
cTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGaa < 2:2927770/149‑1 (MQ=255)
ttttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGGGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAt > 1:482812/1‑149 (MQ=255)
tttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAAtt < 2:1577448/149‑1 (MQ=255)
tATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTAc < 1:661487/149‑1 (MQ=255)
aTCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACt > 2:957556/1‑149 (MQ=255)
aTCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACt > 2:954544/1‑149 (MQ=255)
aTCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACt > 2:852040/1‑149 (MQ=255)
tCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTg > 1:3853173/1‑149 (MQ=255)
tGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGAGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTGGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAACTATCTTCTTTCTGAATTACTGGCaa > 2:330410/1‑149 (MQ=255)
ggCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAAc > 2:856933/1‑149 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc < 1:1242828/149‑1 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc < 1:1462667/149‑1 (MQ=255)
gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc < 1:3337720/149‑1 (MQ=255)
acgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCt > 1:3961413/1‑149 (MQ=255)
gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAt > 2:510661/1‑149 (MQ=255)
aaGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTAtt < 1:636935/149‑1 (MQ=255)
gcgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAg > 1:1792383/1‑149 (MQ=255)
cgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgc < 1:3685282/149‑1 (MQ=255)
cgcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgc < 1:178345/149‑1 (MQ=255)
gcAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcg < 1:277949/149‑1 (MQ=255)
cAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcgg < 2:1667542/149‑1 (MQ=255)
aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa < 2:3548298/149‑1 (MQ=255)
aaTATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGa < 2:1507185/149‑1 (MQ=255)
tatCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATg > 1:1721202/1‑149 (MQ=255)
atCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGc < 2:2732643/149‑1 (MQ=255)
ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGt < 2:2501872/149‑1 (MQ=255)
ccGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGt < 1:1801833/149‑1 (MQ=255)
tAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTaa > 2:2997209/1‑149 (MQ=255)
aaGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAAcc < 1:3625062/149‑1 (MQ=255)
tgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTTTGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTTGCGGCGATGCCGGGTTATCCATCCAg < 2:1342496/149‑1 (MQ=255)
gATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCATAATATCTTCTTTCTGTATTACTGGCAAGCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTATCCATCCTgg < 2:261426/149‑1 (MQ=255)
gATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTGGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAgg < 2:3769668/149‑1 (MQ=255)
ttAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc < 1:3079391/149‑1 (MQ=255)
ttAGCCCCCCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc > 2:1852170/1‑149 (MQ=255)
tAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCg > 2:131511/1‑149 (MQ=255)
aGCCCCTCCGCTGTAGATCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATTTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCgg < 2:2826558/149‑1 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCggg > 2:226529/1‑149 (MQ=255)
gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCggg > 2:3928286/1‑149 (MQ=255)
cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGc < 2:2444100/149‑1 (MQ=255)
cccTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGc > 1:3303841/1‑149 (MQ=255)
cTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAACTATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAt < 2:4077389/149‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAt > 2:1682194/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCt < 1:3241141/149‑1 (MQ=255)
ccGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCt > 1:3369396/1‑149 (MQ=255)
cGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTa > 2:2782322/1‑149 (MQ=255)
gCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTac > 1:1881633/1‑149 (MQ=255)
gCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTac > 2:3221984/1‑149 (MQ=255)
cTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTacc > 2:2197910/1‑149 (MQ=255)
gTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTaccac > 1:2316533/1‑149 (MQ=255)
gAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGa > 2:2235397/1‑149 (MQ=255)
aaCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGaa < 2:1626845/149‑1 (MQ=255)
aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAg > 1:2008543/1‑149 (MQ=255)
aCGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAg > 1:3903132/1‑149 (MQ=255)
gTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGat > 2:2963218/1‑149 (MQ=255)
tATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatc < 1:2737480/149‑1 (MQ=255)
aTGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatca > 1:341182/1‑149 (MQ=255)
aTGATAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatca > 1:2414196/1‑149 (MQ=255)
ttAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaat < 2:1373962/149‑1 (MQ=255)
tAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaatc < 1:62569/149‑1 (MQ=255)
gTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaatcaa > 2:4113272/1‑149 (MQ=255)
gTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGatcaaatcaa < 1:1476628/149‑1 (MQ=255)
cACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGt < 1:353865/149‑1 (MQ=255)
aCTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTa < 1:1855317/149‑1 (MQ=255)
gCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTg < 2:1532560/149‑1 (MQ=255)
tACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGa > 1:1032898/1‑149 (MQ=255)
tACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATAAAGTATGGCTGGa > 2:3391381/1‑149 (MQ=255)
cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACt < 2:3524257/149‑1 (MQ=255)
cGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACt < 1:1980285/149‑1 (MQ=255)
cgcgGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGc > 1:306941/1‑149 (MQ=255)
cgGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGccc < 1:1645877/149‑1 (MQ=255)
ggTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCt < 2:1866866/149‑1 (MQ=255)
ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt > 2:194301/1‑149 (MQ=255)
ttGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACAGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCt < 1:3790028/149‑1 (MQ=255)
gATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa > 2:3301297/1‑149 (MQ=255)
gATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTa > 2:3850048/1‑149 (MQ=255)
tGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatc < 1:2034852/149‑1 (MQ=255)
tGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatc > 1:1018728/1‑149 (MQ=255)
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tggtggGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTatcaat < 2:2983211/149‑1 (MQ=255)
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TCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCT > SRR19973068.3389853/1‑150 (MQ=60)
TCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCT > SRR19973068.3389868/1‑150 (MQ=60)
CCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTA < SRR19973068.3261062/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTAC > SRR19973068.1894126/1‑150 (MQ=60)
CGCTGTCGAACGTATGTGAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTAC > SRR19973068.1894134/1‑150 (MQ=60)
TGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCAC > SRR19973068.2331474/1‑150 (MQ=60)
TGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCAC > SRR19973068.2331373/1‑150 (MQ=60)
GTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACC > SRR19973068.2823669/1‑150 (MQ=60)
AACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAG > SRR19973068.2021811/1‑150 (MQ=60)
AACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAG > SRR19973068.3926743/1‑150 (MQ=60)
AACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAG > SRR19973068.2021756/1‑150 (MQ=60)
ACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCTGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGA < SRR19973068.3943646/150‑1 (MQ=60)
ACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCTGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGA < SRR19973068.1252132/150‑1 (MQ=60)
TATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCA > SRR19973068.343324/1‑150 (MQ=60)
TATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCA < SRR19973068.2754351/150‑1 (MQ=60)
TATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCA < SRR19973068.1214168/150‑1 (MQ=60)
TATGATAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCA > SRR19973068.2429498/1‑150 (MQ=60)
TGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAA > SRR19973068.577443/1‑150 (MQ=60)
GTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAAT < SRR19973068.637619/150‑1 (MQ=60)
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TTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATC < SRR19973068.3646851/150‑1 (MQ=60)
TTAGTCACTCGTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGGACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATC < SRR19973068.3207085/150‑1 (MQ=60)
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GTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAG < SRR19973068.1486336/150‑1 (MQ=60)
GTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATAAAG > SRR19973068.2844944/1‑150 (MQ=60)
TCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGT < SRR19973068.2075910/150‑1 (MQ=60)
CACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTA < SRR19973068.356168/150‑1 (MQ=60)
ACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAT < SRR19973068.1866649/150‑1 (MQ=60)
ACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAT < SRR19973068.1694466/150‑1 (MQ=60)
ACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAT < SRR19973068.1512469/150‑1 (MQ=60)
ACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTAT < SRR19973068.1867574/150‑1 (MQ=60)
CTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATG < SRR19973068.3389356/150‑1 (MQ=60)
CTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTACTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATG > SRR19973068.3676121/1‑150 (MQ=60)
TTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCT < SRR19973068.3030267/150‑1 (MQ=60)
TGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTG > SRR19973068.428987/1‑150 (MQ=60)
TGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCCGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTATCGGCGATGCCGGGTTAACCAACCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATTGCTG > SRR19973068.3809971/1‑150 (MQ=60)
CTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGA > SRR19973068.1039579/1‑150 (MQ=60)
CTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGA > SRR19973068.1039545/1‑150 (MQ=60)
CGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTA < SRR19973068.1993381/150‑1 (MQ=60)
GGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTAC < SRR19973068.3775730/150‑1 (MQ=60)
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CGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCT < SRR19973068.1656569/150‑1 (MQ=60)
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TATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTC < SRR19973068.394270/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTC < SRR19973068.394231/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTC < SRR19973068.394748/150‑1 (MQ=60)
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CCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCATCTACCACCGAAGATCAAATCAAGTATGGCTGGAACTACGCCCTGCTTATCAATCATGGTCCGTCAACGGAAGCGCTGGTC > CP009273/2198195‑2198491
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |