Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,222,970 |
T→A |
100% |
N299Y (AAT→TAT) |
dusC ← |
tRNA‑dihydrouridine synthase C |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,222,970 | 0 | T | A | 97.6%
| 694.7
/ 4.5
| 212 | N299Y (AAT→TAT) | dusC | tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/2); new base A (120/87); total (123/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
AACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAGC > CP009273/2222828‑2223114
|
aaCGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCa < 1:1090474/148‑1 (MQ=255)
aaCGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCa < 2:2888543/148‑1 (MQ=255)
aCGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCaa < 2:192553/148‑1 (MQ=255)
ccTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAacac < 1:3519291/148‑1 (MQ=255)
cTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACAcc > 1:359505/1‑148 (MQ=255)
cGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCg > 2:2161633/1‑148 (MQ=255)
cGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCg > 1:2846226/1‑148 (MQ=255)
cGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCg > 1:2691724/1‑148 (MQ=255)
ggCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGa < 1:1048035/148‑1 (MQ=255)
ggCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGa < 1:859232/148‑1 (MQ=255)
cAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGACTAATTCAACACCCGAAc > 2:3208646/1‑148 (MQ=255)
tGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTg > 2:2010465/1‑148 (MQ=255)
gACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGa < 1:1809991/148‑1 (MQ=255)
aCGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGaa < 2:1022403/148‑1 (MQ=255)
accaAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAaataat < 2:1395221/148‑1 (MQ=255)
caAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCGCTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTc > 1:3327363/1‑148 (MQ=255)
aaaCAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTcc < 1:3061760/148‑1 (MQ=255)
acaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGt > 2:3310602/1‑148 (MQ=255)
acaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGt < 2:275649/148‑1 (MQ=255)
aacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTg < 1:1439014/148‑1 (MQ=255)
acCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGc < 1:1585334/148‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTc < 1:1778558/148‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTc < 1:755366/148‑1 (MQ=255)
tGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACAACACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCa < 2:2346888/148‑1 (MQ=255)
gCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGt > 1:3305327/1‑148 (MQ=255)
ccTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTa > 1:1222849/1‑148 (MQ=255)
tGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCtt > 2:436453/1‑148 (MQ=255)
gATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCttt > 1:2000312/1‑148 (MQ=255)
aaaGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACg > 1:1907216/1‑148 (MQ=255)
gagCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCaa > 2:1422618/1‑148 (MQ=255)
agCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCaaa > 1:2955615/1‑148 (MQ=255)
agCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCaaa > 2:523855/1‑148 (MQ=255)
gCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTAGTCTTTACGCAAAt > 2:305686/1‑148 (MQ=255)
acacATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACt > 1:2371483/1‑148 (MQ=255)
caTTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCaa < 2:2477765/148‑1 (MQ=255)
aTTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAAc > 1:381409/1‑148 (MQ=255)
tGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCa > 1:1660883/1‑148 (MQ=255)
tGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCa > 1:1659566/1‑148 (MQ=255)
tGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCa < 1:3467181/148‑1 (MQ=255)
tGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCa > 1:2322943/1‑148 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACTCAAATAACTCAACCACTg > 2:2801275/1‑148 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 2:682654/148‑1 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 1:1048103/148‑1 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 2:1750746/148‑1 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 2:1646999/148‑1 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg > 1:2608727/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGt > 2:661115/1‑148 (MQ=255)
aaaaCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGttt > 2:2120688/1‑148 (MQ=255)
aCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCCAATAACTCAACCACTGTTTaag > 2:3118246/1‑147 (MQ=255)
aCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAAt < 2:338565/148‑1 (MQ=255)
cATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATc < 1:679172/148‑1 (MQ=255)
cATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATc > 1:1309559/1‑148 (MQ=255)
cACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCcgc > 1:858443/1‑148 (MQ=255)
cTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCgcgc < 2:2846226/148‑1 (MQ=255)
cTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCgcgc > 2:793668/1‑148 (MQ=255)
tATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCa > 2:932155/1‑148 (MQ=255)
aTGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCaa > 1:1188178/1‑148 (MQ=255)
aTGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCaa > 2:2212075/1‑148 (MQ=255)
ttttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTg < 1:1711136/148‑1 (MQ=255)
ttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGat < 1:2342685/148‑1 (MQ=255)
tttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGata < 1:2583607/148‑1 (MQ=255)
ttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACTCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCAGCGCAACGTGatat > 2:3491977/1‑148 (MQ=255)
tAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGAtata > 1:1280078/1‑148 (MQ=255)
gagTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAAc > 1:2629612/1‑148 (MQ=255)
cGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATc > 2:299553/1‑148 (MQ=255)
atatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGc < 2:1222849/148‑1 (MQ=255)
tatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGcc > 2:742852/1‑148 (MQ=255)
tCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCt > 2:1790368/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCt > 2:1558426/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCt > 2:1647196/1‑148 (MQ=255)
ttGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtt > 2:3110971/1‑148 (MQ=255)
ttGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtt > 2:649079/1‑148 (MQ=255)
tGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCttt < 1:2918214/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtttt < 2:1258506/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtttt < 2:2553927/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtttt < 2:2371669/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtttt < 2:770777/148‑1 (MQ=255)
ccTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCACCGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTc > 2:1288672/1‑148 (MQ=255)
ccTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTc > 2:1288449/1‑148 (MQ=255)
ccTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCAGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTc > 2:2070714/1‑148 (MQ=255)
cTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTcc > 1:937720/1‑148 (MQ=255)
tGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCa < 1:2161633/148‑1 (MQ=255)
aaTAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGa > 1:2175848/1‑148 (MQ=255)
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ATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGC > SRR19973067.864395/1‑150 (MQ=60)
ATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGC > SRR19973067.864214/1‑150 (MQ=60)
CACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGC > SRR19973067.851619/1‑150 (MQ=60)
CTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAA > SRR19973067.1195999/1‑150 (MQ=60)
CTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAA > SRR19973067.513194/1‑150 (MQ=60)
GGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTG > SRR19973067.779334/1‑150 (MQ=60)
TTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGAT < SRR19973067.1722877/150‑1 (MQ=60)
TTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATAT < SRR19973067.2358304/150‑1 (MQ=60)
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AATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTT < SRR19973067.1079513/150‑1 (MQ=60)
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ATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCCACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAG < SRR19973067.1107503/150‑1 (MQ=60)
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TTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAGCAACC > CP009273/2222821‑2223118
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
