Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,222,970 |
T→A |
100% |
N299Y (AAT→TAT) |
dusC ← |
tRNA‑dihydrouridine synthase C |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,222,970 | 0 | T | A | 100.0%
| 581.6
/ NA
| 175 | N299Y (AAT→TAT) | dusC | tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (95/80); total (95/80) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAG > CP009273/2222825‑2223113
|
gggAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGaataat > 2:1264381/1‑148 (MQ=255)
gggAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGaataat < 2:2682054/148‑1 (MQ=255)
ggAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAataatt > 2:2585335/1‑148 (MQ=255)
gAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTc < 1:698895/148‑1 (MQ=255)
aaCGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCa < 1:129280/148‑1 (MQ=255)
aCGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCaa < 1:2651160/148‑1 (MQ=255)
cGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAac < 1:2727731/148‑1 (MQ=255)
ccTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAacac > 2:1789267/1‑148 (MQ=255)
aaTTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACa > 1:1823734/1‑148 (MQ=255)
aTTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACAt > 2:1628749/1‑148 (MQ=255)
ttttGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATg > 1:3206525/1‑148 (MQ=255)
ttttGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATg < 1:2292328/148‑1 (MQ=255)
tttGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGc < 1:707549/148‑1 (MQ=255)
tttGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGc < 1:707372/148‑1 (MQ=255)
aacaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCg > 1:2090250/1‑148 (MQ=255)
aacaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCg > 1:499763/1‑148 (MQ=255)
aacaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCg < 1:621028/148‑1 (MQ=255)
acaacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGt > 2:3488598/1‑148 (MQ=255)
aacCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTg < 1:2199830/148‑1 (MQ=255)
gTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTc < 1:3442399/148‑1 (MQ=255)
ccTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTa > 1:3416365/1‑148 (MQ=255)
ccTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTa < 2:649124/148‑1 (MQ=255)
ttGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCt > 2:1910854/1‑148 (MQ=255)
ttGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCt < 1:962883/148‑1 (MQ=255)
tGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCtt < 1:3488598/148‑1 (MQ=255)
tGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCtt < 1:1264381/148‑1 (MQ=255)
gATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCttt < 1:1628749/148‑1 (MQ=255)
gATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCttt < 1:1162889/148‑1 (MQ=255)
gATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCttt < 1:952513/148‑1 (MQ=255)
aTAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTa < 2:25621/148‑1 (MQ=255)
aTAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTa < 2:1902052/148‑1 (MQ=255)
aaaGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACg > 2:1820385/1‑148 (MQ=255)
agagCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCa > 1:1151139/1‑148 (MQ=255)
agagCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCa < 1:269180/148‑1 (MQ=255)
gagCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCaa > 1:1053144/1‑148 (MQ=255)
cTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATa < 2:2775011/148‑1 (MQ=255)
cacaTTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTc > 1:1607611/1‑148 (MQ=255)
acaTTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCa > 2:3061172/1‑148 (MQ=255)
ttGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAAcc > 2:2038523/1‑148 (MQ=255)
gTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCAc > 2:321395/1‑148 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 1:2213758/148‑1 (MQ=255)
cAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTg < 2:2127091/148‑1 (MQ=255)
aaaCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTa > 1:928755/1‑148 (MQ=255)
aCATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCAGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAAt > 2:2666402/1‑148 (MQ=255)
cATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATc < 1:509657/148‑1 (MQ=255)
tCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCcg > 2:80738/1‑148 (MQ=255)
tCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCcg > 2:2152985/1‑148 (MQ=255)
cACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCcgc > 2:2253727/1‑148 (MQ=255)
cTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCgcgc > 2:1262294/1‑148 (MQ=255)
cTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCgcgc > 1:2125632/1‑148 (MQ=255)
ggTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACg > 1:2901850/1‑148 (MQ=255)
gTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGt < 2:401239/148‑1 (MQ=255)
tttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGa > 1:2794628/1‑148 (MQ=255)
tttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGa < 1:2849953/148‑1 (MQ=255)
tttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGa < 2:499837/148‑1 (MQ=255)
tttttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGa > 2:3513868/1‑148 (MQ=255)
tttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGata < 1:2725901/148‑1 (MQ=255)
ttAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGatat < 1:1276138/148‑1 (MQ=255)
agTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAAcc > 1:3239982/1‑148 (MQ=255)
agTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAAcc > 1:1894365/1‑148 (MQ=255)
gTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAAccc > 2:2718777/1‑148 (MQ=255)
tttCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCg > 1:2051387/1‑148 (MQ=255)
ctcGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTa < 1:1716784/148‑1 (MQ=255)
atatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGc > 1:1965162/1‑148 (MQ=255)
tatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGcc > 1:1365804/1‑148 (MQ=255)
tatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGcc > 1:1365886/1‑148 (MQ=255)
tatCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGcc > 1:2404718/1‑148 (MQ=255)
atCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGccc > 1:937636/1‑148 (MQ=255)
atCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACGGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGccc > 2:2660693/1‑148 (MQ=255)
tCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCt > 1:3165966/1‑148 (MQ=255)
cAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTg > 1:9972/1‑148 (MQ=255)
aaTTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGc > 1:913464/1‑148 (MQ=255)
aaTTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGc > 1:265710/1‑148 (MQ=255)
aaTTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGc < 1:3329852/148‑1 (MQ=255)
ttGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCtt > 2:2970185/1‑148 (MQ=255)
tGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCttt < 2:1069868/148‑1 (MQ=255)
tGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCa > 1:693764/1‑148 (MQ=255)
tGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCa > 1:693880/1‑148 (MQ=255)
tGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCa < 2:1696706/148‑1 (MQ=255)
tGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCAGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGATTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCa > 1:1020967/1‑148 (MQ=255)
aTAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGAc < 2:2829321/148‑1 (MQ=255)
tAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACg < 1:1856940/148‑1 (MQ=255)
cccTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGt > 1:3040608/1‑148 (MQ=255)
cTTGCAATATCAGGGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGtat < 2:1308713/148‑1 (MQ=255)
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GGGAATAATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAG < SRR19973065.2051584/150‑1 (MQ=60)
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TCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCCCTTGCAATATCAGGGGAATTATTCAACACCCGAACATGCTGAAATAATTCCGTTGCTTCATCGTATTCTTTACGCAAATAACTCAACCACTGTTTAATCCGCGCAACGTGATATAACCCGGTATCGCCCTGCTTTTCCAGACGGGTATATTTTTGCAGCAAAG > CP009273/2222822‑2223113
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
