Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,828,952 |
C→A |
100% |
T611T (ACG→ACT) |
hypF ← |
carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,828,952 | 0 | C | A | 97.3%
| 486.6
/ 2.6
| 176 | T611T (ACG→ACT) | hypF | carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/3); new base A (88/81); total (91/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828808‑2829096
|
gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 1:182076/1‑148 (MQ=255)
gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 2:2893187/1‑148 (MQ=255)
gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg > 2:1120245/1‑148 (MQ=255)
gccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctgg < 1:2925769/148‑1 (MQ=255)
ccAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGtggctggc > 1:1126651/1‑148 (MQ=255)
aGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGgcgc > 2:1079966/1‑148 (MQ=255)
ttCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGcac > 1:763144/1‑148 (MQ=255)
ccACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGccc > 1:1320652/1‑148 (MQ=255)
aCTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCTCAGCCCAg > 2:3420716/1‑148 (MQ=255)
aCTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAg < 1:19928/148‑1 (MQ=255)
gctgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgc > 2:453158/1‑148 (MQ=255)
gctgcCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgc > 2:1030118/1‑148 (MQ=255)
aGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccgccgc < 1:2557317/148‑1 (MQ=255)
gAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTgccgccgcc < 1:951846/148‑1 (MQ=255)
aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 2:1110688/1‑148 (MQ=255)
aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 1:1056934/1‑148 (MQ=255)
aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 1:1663969/1‑148 (MQ=255)
aGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACt > 1:1207912/1‑148 (MQ=255)
agaTCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGa > 1:2301394/1‑148 (MQ=255)
tCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaa > 2:1510057/1‑148 (MQ=255)
ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa < 1:1349416/148‑1 (MQ=255)
ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa > 1:1451275/1‑148 (MQ=255)
ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa < 1:2731930/148‑1 (MQ=255)
ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa < 2:2249001/148‑1 (MQ=255)
ccAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaa > 1:1451415/1‑148 (MQ=255)
cAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGaaaaaa > 1:327336/1‑148 (MQ=255)
ttGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGc > 1:2472193/1‑148 (MQ=255)
ttGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGc < 2:2576936/148‑1 (MQ=255)
tGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGcc > 2:866441/1‑148 (MQ=255)
gATTGTCCACCCGCGGCTTTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGccc < 2:900544/148‑1 (MQ=255)
aTTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCca < 2:1866263/148‑1 (MQ=255)
aTTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCca > 2:1875097/1‑148 (MQ=255)
aTTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGATTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCca < 2:66912/148‑1 (MQ=255)
ttGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcac > 1:1543099/1‑148 (MQ=255)
ttGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCcac > 1:643390/1‑148 (MQ=255)
ccACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGa > 1:2581842/1‑148 (MQ=255)
cACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGAt < 1:2501068/148‑1 (MQ=255)
aCCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 2:1819541/148‑1 (MQ=255)
aCCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCAAAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATg < 1:571122/148‑1 (MQ=255)
ccGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCca < 2:3108690/139‑1 (MQ=255)
cgcgGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACg > 2:1090131/1‑148 (MQ=255)
cATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAgc > 2:2853716/1‑148 (MQ=255)
cccGGATGGGACACTCCGTGGCATGTGGCTGCGCGCGCCTCCAGAGCACACGCCGCTTCACCTTCATAAATTAATGGGGCTGGCGCACCGCCCCGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGt < 1:6032/147‑1 (MQ=255)
ccGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGtt > 1:2604205/1‑148 (MQ=255)
ccGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGtt < 1:2081371/148‑1 (MQ=255)
cGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTa < 2:447683/148‑1 (MQ=255)
cGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTa < 2:3270862/148‑1 (MQ=255)
ggATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGGGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTaa < 2:1941204/148‑1 (MQ=255)
ggATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTaa < 2:3482867/148‑1 (MQ=255)
gATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAAt < 2:2060293/148‑1 (MQ=255)
tGCGTCACTCCGGGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACACGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGGGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTc < 1:3016646/148‑1 (MQ=255)
tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 1:2463388/148‑1 (MQ=255)
tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 2:2115356/148‑1 (MQ=255)
tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 2:1543099/148‑1 (MQ=255)
tCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGATTCACATTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCTAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCa < 1:3388714/148‑1 (MQ=255)
cggTGGCATGTGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa < 1:1252835/146‑1 (MQ=255)
ccGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCaa > 1:1265877/1‑148 (MQ=255)
cGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAt < 1:2352373/148‑1 (MQ=255)
tGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATgg < 2:3461436/148‑1 (MQ=255)
cctGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACTCGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGccc > 1:885243/3‑148 (MQ=255)
cATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGccc > 1:1020986/1‑148 (MQ=255)
tGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCcgc > 2:2529838/1‑148 (MQ=255)
tGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGc < 1:2577371/148‑1 (MQ=255)
tGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGc > 2:744164/1‑148 (MQ=255)
gAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACg < 2:2892920/148‑1 (MQ=255)
gcgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCt > 2:492986/1‑148 (MQ=255)
gcgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCt > 2:492327/1‑148 (MQ=255)
cgcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACCGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTc < 1:1311759/148‑1 (MQ=255)
gcCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTcc < 2:182076/148‑1 (MQ=255)
tCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGt > 2:135348/1‑148 (MQ=255)
ccAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGtt > 1:1406152/1‑148 (MQ=255)
gagCACACGCCGCTTCACCTTCATAACTTATCGTGGCGGGCGCACAGCCCCGCGCCGCGGCCACTGGATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTg < 1:2505846/148‑1 (MQ=255)
cacaAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTg < 2:1907130/148‑1 (MQ=255)
cacaAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTg < 2:320640/148‑1 (MQ=255)
cacaAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTg > 1:2958782/1‑148 (MQ=255)
cacaAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTg < 2:107155/148‑1 (MQ=255)
caAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTAAATTCCACGCACAATGCCCCGCGCCAGAACGATCAAGTTTTGATGtt > 2:2675338/1‑148 (MQ=255)
aGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGc < 1:3031492/148‑1 (MQ=255)
gCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGca > 1:1604615/1‑148 (MQ=255)
gCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGca > 1:1911353/1‑148 (MQ=255)
gCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGca < 2:2581842/148‑1 (MQ=255)
ccGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGGGCCGCCGCCACGGCATCGAAAACACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcac < 1:318775/148‑1 (MQ=255)
cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca < 2:162842/148‑1 (MQ=255)
cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca > 1:2941598/1‑148 (MQ=255)
cGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGcaca < 2:1254014/148‑1 (MQ=255)
tCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTg > 1:1870339/1‑148 (MQ=255)
tCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCACGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTg < 1:3248859/148‑1 (MQ=255)
cTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGt < 1:1631961/148‑1 (MQ=255)
cTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGt > 2:1245800/1‑148 (MQ=255)
tCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGttt > 1:356224/1‑148 (MQ=255)
tCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGttt < 2:1320652/148‑1 (MQ=255)
tCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGttt < 2:2472203/148‑1 (MQ=255)
aTAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCa > 2:696627/1‑148 (MQ=255)
taccTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCag < 2:3207373/145‑1 (MQ=255)
tAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCag < 2:643390/148‑1 (MQ=255)
aaCTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCaga > 2:848401/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTa > 1:1362703/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTa > 1:1362435/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTa < 1:282161/148‑1 (MQ=255)
tAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTaa > 2:3022696/1‑148 (MQ=255)
|
TGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAA > CP009273/2828808‑2829096
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACCGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT > CP009273/2828803‑2829100
|
ACCGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAA > SRR19973067.1380975/1‑150 (MQ=60)
ACCGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAA < SRR19973067.818247/150‑1 (MQ=60)
ACCGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAA < SRR19973067.2110920/150‑1 (MQ=60)
CGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGT < SRR19973067.1228401/150‑1 (MQ=60)
CGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGT < SRR19973067.3291997/150‑1 (MQ=60)
CGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGT < SRR19973067.3291991/150‑1 (MQ=60)
TGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGC < SRR19973067.2361998/150‑1 (MQ=60)
CTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGG > SRR19973067.183521/1‑150 (MQ=60)
TGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGC > SRR19973067.1134259/1‑150 (MQ=60)
GCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCG < SRR19973067.1431636/150‑1 (MQ=60)
GCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCG < SRR19973067.2944362/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCAC > SRR19973067.768447/1‑150 (MQ=60)
TCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGC > SRR19973067.1757059/1‑150 (MQ=60)
AGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCC > SRR19973067.1329669/1‑150 (MQ=60)
GCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCA < SRR19973067.183921/150‑1 (MQ=60)
CCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAG > SRR19973067.262218/1‑150 (MQ=60)
CACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGT > SRR19973067.1105815/1‑150 (MQ=60)
ACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTG < SRR19973067.20227/150‑1 (MQ=60)
CCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGC > SRR19973067.2423644/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCA < SRR19973067.2574034/150‑1 (MQ=60)
GAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCAC < SRR19973067.958360/150‑1 (MQ=60)
AAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACT > SRR19973067.2521308/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACT > SRR19973067.1675442/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACT > SRR19973067.1064178/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACT > SRR19973067.1215846/1‑150 (MQ=60)
GGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATC < SRR19973067.1350616/150‑1 (MQ=60)
CGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGA > SRR19973067.2316563/1‑150 (MQ=60)
GAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAA > SRR19973067.2572179/1‑150 (MQ=60)
GAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAA > SRR19973067.3039037/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAA > SRR19973067.1461139/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAA > SRR19973067.1460998/1‑150 (MQ=60)
TCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAA > SRR19973067.329571/1‑150 (MQ=60)
CCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAAC < SRR19973067.2206235/150‑1 (MQ=60)
CCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAAC < SRR19973067.2749560/150‑1 (MQ=60)
CCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAAC < SRR19973067.1358642/150‑1 (MQ=60)
AGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGC > SRR19973067.2488450/1‑150 (MQ=60)
AGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGC > SRR19973067.2488440/1‑150 (MQ=60)
GATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCAC > SRR19973067.1553563/1‑150 (MQ=60)
GATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCAC > SRR19973067.647730/1‑150 (MQ=60)
GATTGTCCACCCGCGGCATTGTAACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCAC > SRR19973067.1553540/1‑150 (MQ=60)
GTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGA > SRR19973067.2598658/1‑150 (MQ=60)
CACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGA < SRR19973067.2517490/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACAagatcgg > SRR19973067.3128462/1‑143 (MQ=60)
ACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGAC < SRR19973067.3356271/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCAAAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGAC < SRR19973067.574820/150‑1 (MQ=60)
ACCCGCGGAATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGATTGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGGGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGAC < SRR19973067.73100/150‑1 (MQ=60)
CATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCTGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCTGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGG < SRR19973067.1886663/150‑1 (MQ=60)
ATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGC > SRR19973067.644382/1‑150 (MQ=60)
CACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTT > SRR19973067.2620360/1‑150 (MQ=60)
CACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTT > SRR19973067.2621134/1‑150 (MQ=60)
CCCGGATGGGACACTCCGTGGCATGTGGCTGCGCGCGCCTCCAGAGCACACGCCGCTTCACCTTCATAAATTAATGGGGCTGGCGCACCGCCCCGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTA < SRR19973067.6123/150‑1 (MQ=60)
CCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAA < SRR19973067.2095165/150‑1 (MQ=60)
TGCGTCACTCCGTGGCATGCGGCTGCGCGCGCCTCCCGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCA < SRR19973067.1253352/150‑1 (MQ=60)
TGCGTCACTCCGGGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACACGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGGGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCA < SRR19973067.3035843/150‑1 (MQ=60)
CTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACGCGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAA > SRR19973067.1274675/1‑150 (MQ=60)
CTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAA > SRR19973067.2079066/1‑150 (MQ=60)
CTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAA > SRR19973067.1274468/1‑150 (MQ=60)
TCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAT < SRR19973067.2479579/150‑1 (MQ=60)
TCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGATTCACATTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCTAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAT < SRR19973067.3410256/150‑1 (MQ=60)
CGGTGGCATGTGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATG < SRR19973067.1261300/150‑1 (MQ=60)
CGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGG < SRR19973067.2367727/150‑1 (MQ=60)
GTGGCTTGTGGGTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCCCCTTCATAACTTAACGTGGGTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCAACTGCATGTAAAACACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGC < SRR19973067.2858161/150‑1 (MQ=60)
GGCCTGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACTCGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCC > SRR19973067.891125/1‑150 (MQ=60)
GGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCC > SRR19973067.1027998/1‑150 (MQ=60)
TGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCAC < SRR19973067.2594168/150‑1 (MQ=60)
TGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCAC < SRR19973067.2594181/150‑1 (MQ=60)
GAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCT < SRR19973067.2959771/150‑1 (MQ=60)
GAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCT < SRR19973067.2960476/150‑1 (MQ=60)
CGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACCGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCA < SRR19973067.1320714/150‑1 (MQ=60)
CGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGGGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCA < SRR19973067.1320794/150‑1 (MQ=60)
CTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTT > SRR19973067.1415685/1‑150 (MQ=60)
CTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTT > SRR19973067.1414306/1‑150 (MQ=60)
CAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGAGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTG < SRR19973067.161761/150‑1 (MQ=60)
GAGCACACGCCGCTTCACCTTCATAACTTATCGTGGCGGGCGCACAGCCCCGCGCCGCGGCCACTGGATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCT < SRR19973067.2522289/150‑1 (MQ=60)
AGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTG > SRR19973067.2977478/1‑150 (MQ=60)
CACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACCCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTT > SRR19973067.918447/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCA > SRR19973067.1615628/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCA > SRR19973067.1616096/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCA > SRR19973067.1924392/1‑150 (MQ=60)
AGCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCAC < SRR19973067.3050796/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACA > SRR19973067.2960243/1‑150 (MQ=60)
CCGCTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGGGCCGCCGCCACGGCATCGAAAACACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACAC < SRR19973067.320925/150‑1 (MQ=60)
CTTCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTG > SRR19973067.1883096/1‑150 (MQ=60)
TCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCT < SRR19973067.3225723/150‑1 (MQ=60)
TCACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCACGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCT < SRR19973067.3269196/150‑1 (MQ=60)
CACCTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTG > SRR19973067.540964/1‑150 (MQ=60)
CTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTT < SRR19973067.1643191/150‑1 (MQ=60)
CTTCATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAAAGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTT > SRR19973067.358693/1‑150 (MQ=60)
ATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGA > SRR19973067.836169/1‑150 (MQ=60)
ATAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGA > SRR19973067.1141387/1‑150 (MQ=60)
TAACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAG > SRR19973067.358048/1‑150 (MQ=60)
ACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTA > SRR19973067.1372012/1‑150 (MQ=60)
ACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTA > SRR19973067.1371980/1‑150 (MQ=60)
ACTTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTA > SRR19973067.1371743/1‑150 (MQ=60)
TTAAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAAT < SRR19973067.284015/150‑1 (MQ=60)
AAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTC > SRR19973067.1833571/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTC < SRR19973067.2238668/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCTGGCGCACAGCCCTGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT < SRR19973067.2570420/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT < SRR19973067.135703/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT < SRR19973067.2570416/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT < SRR19973067.2570422/150‑1 (MQ=60)
|
ACCGGTGCCTGCCAGTTCAGCCACTGCTGCCAGAAAGTGGCGAGATCCAGTTGATTGTCCACCCGCGGCATTGTCACCGGATGCGTCACTCCGTGGCATGAGGCTGCGAGCGCCTCCAGAGCACAAGCCGCTTCACCTTCATAACTTAACGTGGCTGGCGCACAGCCCAGTGCCGCCGCCACTGCATCGAAAAAACGCCCACACGATGACGCCAGCGGCGCGTTAATTCCACGCTCAATGGCCCGCGCCAGCACGCTCCAGTTTTGCTGTTGCACACTTGCTGTTTCAGAGTAATTCT > CP009273/2828803‑2829100
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
