Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
581,633 |
G→T |
53.1% |
L244L (CTC→CTA) |
envY ← |
porin thermoregulatory transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 581,633 | 0 | G | T | 53.1%
| 36.8
/ inf
| 190 | L244L (CTC→CTA) | envY | porin thermoregulatory transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/49); new base T (53/48); total (93/97) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACA > CP009273/581488‑581776
|
ttgACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCgag < 2:2003096/148‑1 (MQ=255)
ttgACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCgag > 2:1118703/1‑148 (MQ=255)
gACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGAt < 2:1145389/148‑1 (MQ=255)
cTTAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATaa < 1:1931334/148‑1 (MQ=255)
ttAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAAt < 1:1361676/148‑1 (MQ=255)
ttAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTACGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAAt < 1:2628867/148‑1 (MQ=255)
tAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGTCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAAtt > 2:1256672/1‑148 (MQ=255)
tAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCATATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAAtt < 2:956588/148‑1 (MQ=255)
aaaTGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTACAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCa > 2:2424962/1‑148 (MQ=255)
taTGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCaa < 1:1865769/147‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCaa < 2:1329021/148‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCaa > 1:2334436/1‑148 (MQ=255)
aaTGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCaa < 2:1329045/148‑1 (MQ=255)
aTGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAAc > 1:3186622/1‑148 (MQ=255)
tGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACg > 2:2581475/1‑148 (MQ=255)
gTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACgg < 2:1398199/148‑1 (MQ=255)
ttCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTc > 2:2528468/1‑148 (MQ=255)
tCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCa < 2:2394433/148‑1 (MQ=255)
ggAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGcc > 2:833946/1‑148 (MQ=255)
ggAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGcc < 1:78042/148‑1 (MQ=255)
aCTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTa > 2:779223/1‑148 (MQ=255)
ttCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTaaa < 1:1065422/148‑1 (MQ=255)
tAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGTGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACg > 1:1129736/1‑148 (MQ=255)
aaGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGc < 2:85845/148‑1 (MQ=255)
aaGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGc < 2:1581109/148‑1 (MQ=255)
aGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGcc < 1:3224895/148‑1 (MQ=255)
gTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCt < 2:2083581/148‑1 (MQ=255)
ggCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTaaaaa > 1:16140/1‑148 (MQ=255)
cGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACag < 1:3137430/148‑1 (MQ=255)
gCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACaga > 2:2710688/1‑148 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 1:968522/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 2:318725/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 2:1869800/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag > 1:3294605/1‑148 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 1:2725529/148‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 1:3541706/148‑1 (MQ=255)
gTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATa > 1:1125815/1‑148 (MQ=255)
ttCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATaa < 1:2102401/148‑1 (MQ=255)
cGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAg < 1:231658/148‑1 (MQ=255)
gAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGt < 1:254865/148‑1 (MQ=255)
aaTCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTa > 2:1814064/1‑148 (MQ=255)
tCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTacg > 2:2752886/1‑148 (MQ=255)
ccTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTacga > 1:388294/1‑148 (MQ=255)
ccTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTacga > 2:373229/1‑148 (MQ=255)
cAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGtg > 2:2899437/1‑148 (MQ=255)
ggCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGtgctg < 2:57162/148‑1 (MQ=255)
cgcCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCtat > 2:2324353/1‑148 (MQ=255)
cATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGc < 2:2106020/148‑1 (MQ=255)
aTTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGcc > 2:690995/1‑148 (MQ=255)
ttcttcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCcac > 1:3355993/1‑148 (MQ=255)
ttcttcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCcac > 2:2227043/1‑148 (MQ=255)
tcttcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCcaca > 2:336178/1‑148 (MQ=255)
ccTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAAt < 2:781528/148‑1 (MQ=255)
cTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAAtt < 1:3463144/148‑1 (MQ=255)
tCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAANTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTg < 1:1805283/148‑1 (MQ=255)
ttATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGcc > 1:533610/1‑148 (MQ=255)
aTGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAc > 2:294876/1‑148 (MQ=255)
tGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc < 1:2799323/148‑1 (MQ=255)
tGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc < 1:3462317/148‑1 (MQ=255)
tGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc > 2:2860383/1‑148 (MQ=255)
tGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc < 2:2907483/148‑1 (MQ=255)
cccGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTg < 2:1502412/148‑1 (MQ=255)
cccGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTg > 2:167414/1‑148 (MQ=255)
cGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAg < 1:250379/148‑1 (MQ=255)
cGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAg > 2:1161745/1‑148 (MQ=255)
tCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTg < 1:437588/148‑1 (MQ=255)
tCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTg > 2:1530750/1‑148 (MQ=255)
cTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGa > 2:1007325/1‑148 (MQ=255)
ttATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGat < 1:1751455/148‑1 (MQ=255)
ttATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGat < 2:128637/148‑1 (MQ=255)
tATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGata < 1:1326423/148‑1 (MQ=255)
aTCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGatat > 1:3106643/1‑148 (MQ=255)
ccGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATAttt < 1:1266703/148‑1 (MQ=255)
ccGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTa > 2:2158726/1‑148 (MQ=255)
cGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTAt > 1:2272382/1‑148 (MQ=255)
cGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTAt > 1:477880/1‑148 (MQ=255)
cGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTAt > 2:3427531/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATcc > 2:1203759/1‑148 (MQ=255)
ttGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCAt > 1:3043933/1‑148 (MQ=255)
ttGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCAt > 1:1126805/1‑148 (MQ=255)
gCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCa < 1:2417620/148‑1 (MQ=255)
cccTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCaa > 1:58106/1‑148 (MQ=255)
cTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATa < 1:1525404/148‑1 (MQ=255)
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TATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATT < SRR19973066.1336038/150‑1 (MQ=60)
CCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTT < SRR19973066.1275852/150‑1 (MQ=60)
CCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTT < SRR19973066.1275774/150‑1 (MQ=60)
CGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTG < SRR19973066.2654660/150‑1 (MQ=60)
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GCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATAC > SRR19973066.73556/1‑150 (MQ=60)
TTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACAC < SRR19973066.1697142/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACT < SRR19973066.1503602/150‑1 (MQ=60)
TAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > SRR19973066.1415331/1‑150 (MQ=60)
TAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > SRR19973066.1242198/1‑150 (MQ=60)
TAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > SRR19973066.1242225/1‑150 (MQ=60)
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GACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > CP009273/581490‑581782
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
