Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
581,633 |
G→T |
60.1% |
L244L (CTC→CTA) |
envY ← |
porin thermoregulatory transcriptional activator |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 581,633 | 0 | G | T | 60.1%
| 103.3
/ inf
| 313 | L244L (CTC→CTA) | envY | porin thermoregulatory transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/66); new base T (95/93); total (154/159) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
GTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > CP009273/581484‑581782
|
gttgACTTAAAATGTCTTTCTAGGAACGTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCtaga > 1:4128527/1‑150 (MQ=255)
gACTTAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATaa < 1:139102/150‑1 (MQ=255)
gACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATaa > 2:2350717/1‑150 (MQ=255)
aCTTAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAAt < 2:2373321/150‑1 (MQ=255)
cTTAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAAtt > 1:1575944/1‑150 (MQ=255)
tAAAATGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCa < 2:1675814/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCaa < 1:4875702/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCaa < 2:212498/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAAc > 2:4958587/1‑150 (MQ=255)
aaTGTCTTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACg > 1:3950173/1‑150 (MQ=255)
ctttCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTc < 1:2358398/148‑1 (MQ=255)
ctttCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTc > 1:1101167/3‑150 (MQ=255)
cGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTc < 2:4850939/150‑1 (MQ=255)
tAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGcc < 2:2628072/150‑1 (MQ=255)
tAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTATGCCCTTCACCACATCACTATTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGcc > 1:3394076/1‑150 (MQ=255)
aGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCg > 2:2058411/1‑150 (MQ=255)
aaCTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTaa < 1:1223751/150‑1 (MQ=255)
aCTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTaaa > 1:2562491/1‑150 (MQ=255)
cTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTaaaa > 2:4129212/1‑150 (MQ=255)
tCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACg < 2:707073/150‑1 (MQ=255)
tAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGcc < 2:646938/150‑1 (MQ=255)
caGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCt < 1:4526290/149‑1 (MQ=255)
aaGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCt < 2:1387532/150‑1 (MQ=255)
aGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCtt < 2:4003700/150‑1 (MQ=255)
tCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAATACGCCTTaa < 2:1602646/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACaga < 1:504331/150‑1 (MQ=255)
cGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACagag < 1:2938809/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGAt < 2:1062713/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGAt < 2:896972/150‑1 (MQ=255)
aGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAATCGCCTTAAAAACAGAGAtc > 2:5195816/1‑149 (MQ=255)
aGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATa > 2:3811882/1‑150 (MQ=255)
ggTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCTTTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCAATTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACTGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATaa < 2:2010272/150‑1 (MQ=255)
ggTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATaa < 2:859384/150‑1 (MQ=255)
ggTTAGAATCCTGCTGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCAGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACTTCACTTTTTGTCGATGTTTGGCTAGATAATTCATCGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTATAAACAGAGATaa < 2:1310326/150‑1 (MQ=255)
ttCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATTCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAg > 1:937335/1‑150 (MQ=255)
gAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTac < 2:2233284/150‑1 (MQ=255)
aaTCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTacg > 2:3118004/1‑150 (MQ=255)
tCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTacgac < 1:4591772/150‑1 (MQ=255)
tGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGtg < 1:4452376/150‑1 (MQ=255)
aGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGtgctg > 1:151410/1‑150 (MQ=255)
aGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGACTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGtgctg > 1:1690564/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTgctgct < 1:1003923/150‑1 (MQ=255)
ggCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTgctgct < 2:2948291/150‑1 (MQ=255)
gcgcgcCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCta < 2:1450844/150‑1 (MQ=255)
cgcgcCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCtat < 1:2439095/150‑1 (MQ=255)
cgcCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAg > 1:990454/1‑150 (MQ=255)
gcCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGTCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGAAAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGc > 1:4735692/1‑150 (MQ=255)
ccATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGcc > 1:3754424/1‑150 (MQ=255)
cATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCca > 2:4437009/1‑150 (MQ=255)
cATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCca > 1:1558974/1‑150 (MQ=255)
cATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCca > 1:528596/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCcac > 1:1166079/1‑150 (MQ=255)
ttcttcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACAt > 2:2505955/1‑150 (MQ=255)
ttcgtcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACAt < 1:3862134/150‑1 (MQ=255)
ttcCTCTTTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGAGAGATTATTCTACGGTGTCAGGCAGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACTTAAt < 2:4727760/150‑1 (MQ=255)
ttcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAAt < 2:3354226/150‑1 (MQ=255)
tcCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAAtt < 2:4663403/150‑1 (MQ=255)
ccTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTg < 2:1898945/150‑1 (MQ=255)
cTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTgc > 1:3251577/1‑150 (MQ=255)
cTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTgc > 1:3358206/1‑150 (MQ=255)
aTTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGcc > 1:1987444/1‑150 (MQ=255)
ttATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAATACAGATATAATGTACGACTTGCTGCTATAGCCACTTAATTGCGCCAc < 1:5786/150‑1 (MQ=255)
tATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc > 2:2975369/1‑150 (MQ=255)
tATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCAcc > 1:4176165/1‑150 (MQ=255)
cccGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAg < 1:4011938/150‑1 (MQ=255)
cGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTg < 1:4848813/150‑1 (MQ=255)
gTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATAGCGCCACCTGAGTGa > 1:3204000/1‑150 (MQ=255)
tCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGat < 2:84294/150‑1 (MQ=255)
tATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATAtt < 1:5060571/150‑1 (MQ=255)
tATCCGTTTCCGCTTTGCCATTCACCACATCACTTTTTGTAGCTGTTTGGAGAGATAATTCAACGGTGTCAGGACGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCGGTGTGATAtt > 2:1722153/1‑150 (MQ=255)
cGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTg > 1:4746081/1‑150 (MQ=255)
gTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGt > 1:5162552/1‑150 (MQ=255)
tttCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGtt < 1:3114362/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCAt < 2:737283/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCAt > 2:5276005/1‑150 (MQ=255)
ttGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCa < 2:2761968/150‑1 (MQ=255)
ccTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATaa < 1:247732/150‑1 (MQ=255)
cTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAAc < 1:1878356/150‑1 (MQ=255)
tCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACAt < 1:3514920/150‑1 (MQ=255)
tCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACAt > 2:4211212/1‑150 (MQ=255)
caccacATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATc > 2:5044850/1‑150 (MQ=255)
ccacATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTg > 2:4332831/1‑150 (MQ=255)
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TTTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAA > SRR19973062.1937040/1‑150 (MQ=60)
TTTGTCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAAC < SRR19973062.4376282/150‑1 (MQ=60)
TTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAAC < SRR19973062.91649/150‑1 (MQ=60)
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TCGCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCAT < SRR19973062.4971669/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATA > SRR19973062.4509159/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTTTGATAGATAATTCAACTGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATAC < SRR19973062.2294332/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATAC < SRR19973062.3147470/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATAC < SRR19973062.3147102/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATAC < SRR19973062.3801100/150‑1 (MQ=60)
TGGCTAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACT < SRR19973062.4690780/150‑1 (MQ=60)
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GCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCT < SRR19973062.1934188/150‑1 (MQ=60)
GCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCT < SRR19973062.1934202/150‑1 (MQ=60)
CGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTG > SRR19973062.2100235/1‑150 (MQ=60)
CGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTG > SRR19973062.2100537/1‑150 (MQ=60)
GAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > SRR19973062.811174/1‑150 (MQ=60)
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GTTGTTGACTTAAAATGTCGTTCTAGGAACTTCTAAGTCGTGGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCATTTCTTCCTCATTTATGCCCGTCTTATCCGTTTCCGCTTTGCCCTTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGT > CP009273/581484‑581782
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |