Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,021,954 |
C→A |
63.6% |
E298D (GAG→GAT) |
yedI ← |
DUF808 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,021,954 | 0 | C | A | 63.6%
| 112.1
/ 258.5
| 209 | E298D (GAG→GAT) | yedI | DUF808 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/31); new base A (75/58); total (120/89) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.72e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCAT > CP009273/2021807‑2022099
|
gccgccCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTtc > 1:1389587/1‑148 (MQ=255)
ccgccCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTtct < 2:2925311/148‑1 (MQ=255)
cccTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTa > 2:3139923/1‑148 (MQ=255)
ccTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTAc > 2:5499/1‑148 (MQ=255)
ccTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTAc > 2:1600751/1‑148 (MQ=255)
ctctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACg > 1:1559328/1‑148 (MQ=255)
ctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGc < 1:3086960/148‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCa > 1:3186911/1‑148 (MQ=255)
ccGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCAc > 2:523693/1‑148 (MQ=255)
ccGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCAc > 2:966172/1‑148 (MQ=255)
gTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTc < 1:1621479/148‑1 (MQ=255)
aCTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCa > 2:2577211/1‑148 (MQ=255)
aaCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATg > 2:699145/1‑148 (MQ=255)
aaCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATg < 1:1292576/148‑1 (MQ=255)
aaCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATg > 2:1951638/1‑148 (MQ=255)
aaCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATg < 1:445073/148‑1 (MQ=255)
aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc < 2:752143/148‑1 (MQ=255)
aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc > 2:3309621/1‑148 (MQ=255)
aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc > 1:1858419/1‑148 (MQ=255)
aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc > 2:2245683/1‑148 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg > 2:972371/1‑148 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg > 1:2577065/1‑148 (MQ=255)
aaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCga < 2:1624858/148‑1 (MQ=255)
gCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgatg > 1:338999/1‑148 (MQ=255)
cTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgatga > 2:404496/1‑148 (MQ=255)
cATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATa > 1:2895560/1‑148 (MQ=255)
aTACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaa < 1:1041899/148‑1 (MQ=255)
tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa > 1:2284254/1‑148 (MQ=255)
tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa < 2:445295/148‑1 (MQ=255)
aCTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAAt < 1:585059/148‑1 (MQ=255)
cTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATc < 2:1302928/148‑1 (MQ=255)
cGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCa < 1:852917/148‑1 (MQ=255)
ctcctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGa > 1:1969375/1‑148 (MQ=255)
tttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAg < 2:480622/148‑1 (MQ=255)
tttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATGGTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGGTACAGCCAAGAATCAg > 1:2435355/1‑148 (MQ=255)
tttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGACAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCTCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAg < 1:803203/148‑1 (MQ=255)
ttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGa > 2:1323833/1‑148 (MQ=255)
ttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGa < 1:2721296/148‑1 (MQ=255)
tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 2:1389587/148‑1 (MQ=255)
tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 2:3162382/148‑1 (MQ=255)
gTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaaaa < 1:1728514/148‑1 (MQ=255)
gTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaaaa > 2:3515402/1‑148 (MQ=255)
gAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACa < 1:24982/148‑1 (MQ=255)
gAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACa > 2:2830638/1‑148 (MQ=255)
aaaCTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAg > 2:901393/1‑148 (MQ=255)
aCTTGTTCACATTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTc < 2:1834959/148‑1 (MQ=255)
tGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGt > 1:1427196/1‑148 (MQ=255)
tGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGt > 2:2537719/1‑148 (MQ=255)
ttCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTaa < 2:1753537/148‑1 (MQ=255)
tCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAat > 1:101127/1‑148 (MQ=255)
tCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAat < 1:179563/148‑1 (MQ=255)
aCCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAatat > 1:2758683/1‑148 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc > 2:3473230/1‑148 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc < 1:1222671/148‑1 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc > 1:779139/1‑148 (MQ=255)
ttAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcat < 1:254418/148‑1 (MQ=255)
tAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcatc > 2:1667749/1‑148 (MQ=255)
tGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCa > 1:3279029/1‑148 (MQ=255)
tGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCGAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCa > 2:2363931/1‑148 (MQ=255)
aaGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCact > 2:431263/1‑148 (MQ=255)
gATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactac < 2:121879/148‑1 (MQ=255)
gATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactac > 1:1523572/1‑148 (MQ=255)
aTGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactact > 1:2955338/1‑148 (MQ=255)
tGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTg < 1:365047/148‑1 (MQ=255)
ggCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGc > 1:2839437/1‑148 (MQ=255)
aaTTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACtt < 1:3139923/148‑1 (MQ=255)
aaTTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACtt > 1:899835/1‑148 (MQ=255)
ttttGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg < 1:2100506/148‑1 (MQ=255)
tttGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACACCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtgc > 2:524482/1‑148 (MQ=255)
ttGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtgct < 1:2042742/148‑1 (MQ=255)
tGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtgctg > 2:905694/1‑148 (MQ=255)
aataGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCgg > 2:3276531/1‑148 (MQ=255)
aataGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCgg > 2:818750/1‑148 (MQ=255)
gCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGaa > 1:2049049/1‑148 (MQ=255)
ccAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGaaa > 2:1653025/1‑148 (MQ=255)
cAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAAt < 1:896577/148‑1 (MQ=255)
cAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAAt < 1:1542987/148‑1 (MQ=255)
tGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGtt > 1:3009004/1‑148 (MQ=255)
aGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAAt > 1:2471037/1‑148 (MQ=255)
gTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATg < 1:2357019/148‑1 (MQ=255)
tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg > 1:1679128/1‑148 (MQ=255)
tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg > 1:3470586/1‑148 (MQ=255)
tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg > 2:754338/1‑148 (MQ=255)
tAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAATACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGt > 2:153993/1‑148 (MQ=255)
tAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGt > 1:288747/1‑148 (MQ=255)
aaTGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTg < 1:523693/148‑1 (MQ=255)
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CGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTT < SRR19973066.1936813/150‑1 (MQ=60)
AATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTG < SRR19973066.3160872/150‑1 (MQ=60)
AATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTG > SRR19973066.1035728/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGC > SRR19973066.3066420/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGC > SRR19973066.2157289/1‑150 (MQ=60)
TTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCT < SRR19973066.2114966/150‑1 (MQ=60)
TTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGC < SRR19973066.2056959/150‑1 (MQ=60)
TTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGC < SRR19973066.2056964/150‑1 (MQ=60)
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TAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAA > SRR19973066.3415615/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAA > SRR19973066.3136651/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAA > SRR19973066.124206/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAA > SRR19973066.619090/1‑150 (MQ=60)
CCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATG < SRR19973066.2789366/150‑1 (MQ=60)
CCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATG < SRR19973066.2789334/150‑1 (MQ=60)
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CAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGT < SRR19973066.1554023/150‑1 (MQ=60)
AGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTT > SRR19973066.3029033/1‑150 (MQ=60)
GTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTC > SRR19973066.384570/1‑150 (MQ=60)
GTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTC < SRR19973066.2740164/150‑1 (MQ=60)
CGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAAT > SRR19973066.2488120/1‑150 (MQ=60)
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AGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGG > SRR19973066.1691351/1‑150 (MQ=60)
AGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGG > SRR19973066.3493772/1‑150 (MQ=60)
GTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGC < SRR19973066.2373011/150‑1 (MQ=60)
ATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGT > SRR19973066.290822/1‑150 (MQ=60)
TTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTG < SRR19973066.1050761/150‑1 (MQ=60)
AATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGAT < SRR19973066.527534/150‑1 (MQ=60)
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CCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCG < SRR19973066.933162/150‑1 (MQ=60)
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GCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAAT < SRR19973066.704302/150‑1 (MQ=60)
GCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAAT < SRR19973066.907749/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTTCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCA > SRR19973066.1931478/1‑150 (MQ=60)
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TTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCACTTCCATGT > SRR19973066.2103528/1‑150 (MQ=60)
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ATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGTAC > SRR19973066.3314786/1‑150 (MQ=60)
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GGGCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGTAC > CP009273/2021805‑2022103
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |