Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,021,954 |
C→A |
100% |
E298D (GAG→GAT) |
yedI ← |
DUF808 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,021,954 | 0 | C | A | 98.3%
| 567.6
/ 0.9
| 176 | E298D (GAG→GAT) | yedI | DUF808 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (90/83); total (91/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCA > CP009273/2021811‑2022098
|
ctctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACg > 1:2803519/1‑148 (MQ=255)
ctctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACg > 1:1930399/1‑148 (MQ=255)
tctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACgg > 1:550816/1‑148 (MQ=255)
tctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACgg > 1:2984111/1‑148 (MQ=255)
ctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGc < 1:775639/148‑1 (MQ=255)
ctTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGc < 1:928233/148‑1 (MQ=255)
tAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCttt > 1:2796501/1‑148 (MQ=255)
aCCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCa < 2:3076756/148‑1 (MQ=255)
cGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACt > 1:97498/1‑148 (MQ=255)
gTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTc > 1:776520/1‑148 (MQ=255)
aaCTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTccc > 1:3496189/1‑148 (MQ=255)
cTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGcacc > 1:2640539/1‑148 (MQ=255)
tCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGcacca < 2:1305055/148‑1 (MQ=255)
cACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGcaccac > 1:1624177/1‑148 (MQ=255)
aCTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACg < 1:3209946/148‑1 (MQ=255)
aCTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATATTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACg > 2:2959096/1‑148 (MQ=255)
aacATACAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCGAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc < 2:2194270/146‑1 (MQ=255)
aCCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATgc < 2:591878/148‑1 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg < 1:2151136/148‑1 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg > 1:2403443/1‑148 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg < 1:380250/148‑1 (MQ=255)
aaaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGccgccg > 1:1630571/1‑148 (MQ=255)
aaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCga < 1:66009/148‑1 (MQ=255)
aaGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCga < 1:2800087/148‑1 (MQ=255)
cTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgatga > 1:2279148/1‑148 (MQ=255)
tCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCgatgat > 1:1181881/1‑148 (MQ=255)
aTACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaa > 1:1945100/1‑148 (MQ=255)
tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa < 1:831465/148‑1 (MQ=255)
tACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATaaa > 1:1480059/1‑148 (MQ=255)
aCTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAAt > 1:2100269/1‑148 (MQ=255)
aCTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGAGGCCGCCGATGATAAAt < 2:36007/148‑1 (MQ=255)
cTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATc > 1:277357/1‑148 (MQ=255)
cTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATc > 1:3095645/1‑148 (MQ=255)
cctcctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAg > 1:3182994/1‑148 (MQ=255)
ctcctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGa > 1:3007599/1‑148 (MQ=255)
ctcctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGa < 2:2885015/148‑1 (MQ=255)
ctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATc < 2:3336879/148‑1 (MQ=255)
ctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATc > 1:376880/1‑148 (MQ=255)
ctTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATc < 2:1809294/148‑1 (MQ=255)
ctTTTTTAGAGTGTAACTTTTTCAGCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTTCATAATAGCCAGTGCGATTATTAATGTGCCTTACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATc < 2:1809298/148‑1 (MQ=255)
ttttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCa > 1:3415016/1‑148 (MQ=255)
tttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAg < 2:674225/148‑1 (MQ=255)
ttttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGa > 2:234803/1‑148 (MQ=255)
tttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAt < 2:2562173/148‑1 (MQ=255)
ttCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAtt > 2:378518/1‑148 (MQ=255)
cGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTa < 1:3111781/148‑1 (MQ=255)
ttGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaaaa < 2:120808/147‑1 (MQ=255)
gTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaaaa < 2:120800/148‑1 (MQ=255)
gTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTaaaa < 2:2523114/148‑1 (MQ=255)
tGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAAc > 2:943562/1‑148 (MQ=255)
gAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACa < 2:550816/148‑1 (MQ=255)
aCTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTc > 2:3309650/1‑148 (MQ=255)
cTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCg > 1:2558184/1‑148 (MQ=255)
cTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCg > 2:2575322/1‑148 (MQ=255)
tGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGt > 2:2624006/1‑148 (MQ=255)
tGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGt < 2:253785/148‑1 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc > 1:269237/1‑148 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc > 1:2519666/1‑148 (MQ=255)
ccTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatc < 2:25758/148‑1 (MQ=255)
cTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatca < 1:1876632/148‑1 (MQ=255)
tAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcatc > 2:351560/1‑148 (MQ=255)
tAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcatc > 2:351705/1‑148 (MQ=255)
tAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATatcatc > 2:481037/1‑148 (MQ=255)
aGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCg < 1:1365574/148‑1 (MQ=255)
gTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGc < 1:2243790/148‑1 (MQ=255)
aGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCacta < 1:3114731/148‑1 (MQ=255)
gATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCactac > 2:1427676/1‑148 (MQ=255)
tGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTg < 2:2035530/148‑1 (MQ=255)
ggCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGc > 1:819829/1‑148 (MQ=255)
gCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCa < 2:1398589/148‑1 (MQ=255)
ttttGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg < 1:3245569/148‑1 (MQ=255)
ttttGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTtg < 2:2729121/148‑1 (MQ=255)
cATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGcc < 2:3095645/148‑1 (MQ=255)
ataataGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGAGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGccc < 2:1997155/148‑1 (MQ=255)
ccAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGaaa > 1:1009466/1‑148 (MQ=255)
cAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAAt < 2:1706463/148‑1 (MQ=255)
cAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAAt > 2:1505890/1‑148 (MQ=255)
tGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGtt > 1:1016990/1‑148 (MQ=255)
tGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGtt > 1:184112/1‑148 (MQ=255)
tGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGtt > 2:3137456/1‑148 (MQ=255)
cGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCa < 1:250815/148‑1 (MQ=255)
gTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATg < 1:677361/148‑1 (MQ=255)
tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg < 1:1530332/148‑1 (MQ=255)
tATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATgg < 1:2353957/148‑1 (MQ=255)
ttACTGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCg < 2:1811171/148‑1 (MQ=255)
ttAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCg < 2:1811323/148‑1 (MQ=255)
ttAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCg > 1:418757/1‑148 (MQ=255)
tAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGt > 2:1894707/1‑148 (MQ=255)
aaTGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTg < 2:1930399/148‑1 (MQ=255)
aTGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGa > 1:291307/1‑148 (MQ=255)
aTGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGa > 2:2433894/1‑148 (MQ=255)
aTGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGa > 1:109418/1‑148 (MQ=255)
gtgCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATg < 1:2511466/148‑1 (MQ=255)
gtgCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATg < 2:2838410/148‑1 (MQ=255)
ccTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAg > 1:2595686/1‑148 (MQ=255)
ccTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAg < 1:1427676/148‑1 (MQ=255)
cTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAgc > 2:1447217/1‑148 (MQ=255)
cgcATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCaa > 2:2382258/1‑148 (MQ=255)
aTTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTc < 2:2401575/148‑1 (MQ=255)
tttATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCa > 2:2883670/1‑148 (MQ=255)
|
CCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCA > CP009273/2021811‑2022098
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGGCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGTA > CP009273/2021805‑2022102
|
GGGCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTA < SRR19973065.2831877/150‑1 (MQ=60)
GGCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTAT < SRR19973065.2634970/150‑1 (MQ=60)
GCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGACGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATC < SRR19973065.2166968/150‑1 (MQ=60)
CCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCT < SRR19973065.195849/150‑1 (MQ=60)
CGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTA > SRR19973065.963386/1‑150 (MQ=60)
CCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACG > SRR19973065.2820875/1‑150 (MQ=60)
CCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACG > SRR19973065.1943043/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGG > SRR19973065.3002378/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGG > SRR19973065.554358/1‑150 (MQ=60)
CTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTT < SRR19973065.934338/150‑1 (MQ=60)
CTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTT < SRR19973065.780793/150‑1 (MQ=60)
TTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTT > SRR19973065.2813827/1‑150 (MQ=60)
TTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTT > SRR19973065.2813805/1‑150 (MQ=60)
TTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTT < SRR19973065.2939320/150‑1 (MQ=60)
TAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCA > SRR19973065.1486660/1‑150 (MQ=60)
ACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACT > SRR19973065.98398/1‑150 (MQ=60)
CCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTC > SRR19973065.781497/1‑150 (MQ=60)
CCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTC > SRR19973065.781683/1‑150 (MQ=60)
GTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCC > SRR19973065.3517437/1‑150 (MQ=60)
TCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACC > SRR19973065.2656840/1‑150 (MQ=60)
CTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCAC > SRR19973065.1635065/1‑150 (MQ=60)
CACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGA > SRR19973065.906438/1‑150 (MQ=60)
ACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGAT < SRR19973065.3229258/150‑1 (MQ=60)
ATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCG > SRR19973065.1641505/1‑150 (MQ=60)
ATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCG > SRR19973065.2418557/1‑150 (MQ=60)
ATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCG > SRR19973065.2416675/1‑150 (MQ=60)
AAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGAT < SRR19973065.2728374/150‑1 (MQ=60)
AAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGAT < SRR19973065.382914/150‑1 (MQ=60)
AAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGAT < SRR19973065.2164967/150‑1 (MQ=60)
AAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGAT > SRR19973065.3515993/1‑150 (MQ=60)
AAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATG < SRR19973065.2817431/150‑1 (MQ=60)
AAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATG < SRR19973065.2817428/150‑1 (MQ=60)
AAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATG < SRR19973065.66716/150‑1 (MQ=60)
AGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCTGCCGATGA < SRR19973065.491389/150‑1 (MQ=60)
AGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGA > SRR19973065.2293525/1‑150 (MQ=60)
GCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGAT > SRR19973065.1189366/1‑150 (MQ=60)
CTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATA < SRR19973065.1114193/150‑1 (MQ=60)
TCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAA > SRR19973065.1957815/1‑150 (MQ=60)
CATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAA > SRR19973065.1489516/1‑150 (MQ=60)
CATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGAGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATTCCGCCGATGATAAA > SRR19973065.2134937/1‑150 (MQ=60)
ATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAAT > SRR19973065.2113776/1‑150 (MQ=60)
TACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATC > SRR19973065.279210/1‑150 (MQ=60)
TACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATC < SRR19973065.836896/150‑1 (MQ=60)
TACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATC > SRR19973065.3114548/1‑150 (MQ=60)
ACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCC > SRR19973065.388900/1‑150 (MQ=60)
ACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCC < SRR19973065.3261977/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCC > SRR19973065.1554285/1‑150 (MQ=60)
CGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAG > SRR19973065.3202220/1‑150 (MQ=60)
GCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGA < SRR19973065.259732/150‑1 (MQ=60)
GCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGA > SRR19973065.3026019/1‑150 (MQ=60)
TCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATC > SRR19973065.379506/1‑150 (MQ=60)
CCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCA > SRR19973065.3435881/1‑150 (MQ=60)
TTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAT < SRR19973065.1354043/150‑1 (MQ=60)
TTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGAT < SRR19973065.3396875/150‑1 (MQ=60)
CGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAA < SRR19973065.3130748/150‑1 (MQ=60)
CGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAA > SRR19973065.98695/1‑150 (MQ=60)
TGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAG < SRR19973065.2206235/150‑1 (MQ=60)
AACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCG < SRR19973065.1045601/150‑1 (MQ=60)
AACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCG < SRR19973065.2110466/150‑1 (MQ=60)
AACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCG > SRR19973065.2574179/1‑150 (MQ=60)
TGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAA > SRR19973065.681570/1‑150 (MQ=60)
GTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTTCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAAT < SRR19973065.3025772/150‑1 (MQ=60)
CACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATC > SRR19973065.271062/1‑150 (MQ=60)
CACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATC > SRR19973065.2535489/1‑150 (MQ=60)
CTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATC < SRR19973065.1888988/150‑1 (MQ=60)
TTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCG < SRR19973065.743956/150‑1 (MQ=60)
AGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCC < SRR19973065.1374601/150‑1 (MQ=60)
GTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCA < SRR19973065.2258042/150‑1 (MQ=60)
AAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTAC > SRR19973065.1881404/1‑150 (MQ=60)
AGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCTATTATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACT < SRR19973065.3133680/150‑1 (MQ=60)
AGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACT < SRR19973065.3133715/150‑1 (MQ=60)
AGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACT < SRR19973065.801304/150‑1 (MQ=60)
ATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGC > SRR19973065.825218/1‑150 (MQ=60)
AATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTG > SRR19973065.3200018/1‑150 (MQ=60)
ATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGC < SRR19973065.1849565/150‑1 (MQ=60)
TTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCT < SRR19973065.3265155/150‑1 (MQ=60)
GCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCC < SRR19973065.2640243/150‑1 (MQ=60)
AGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAA > SRR19973065.1016160/1‑150 (MQ=60)
AGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTT > SRR19973065.1023729/1‑150 (MQ=60)
AGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTT > SRR19973065.185565/1‑150 (MQ=60)
GTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTC < SRR19973065.381161/150‑1 (MQ=60)
CGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAAT < SRR19973065.252571/150‑1 (MQ=60)
GTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGC < SRR19973065.681879/150‑1 (MQ=60)
TATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCG < SRR19973065.2368600/150‑1 (MQ=60)
TATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCG < SRR19973065.1540412/150‑1 (MQ=60)
TATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCG > SRR19973065.421682/1‑150 (MQ=60)
ATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGT > SRR19973065.1533263/1‑150 (MQ=60)
TAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGA > SRR19973065.293199/1‑150 (MQ=60)
TAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGA > SRR19973065.110408/1‑150 (MQ=60)
TAATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGA > SRR19973065.292096/1‑150 (MQ=60)
AATGTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGAT > SRR19973065.2536124/1‑150 (MQ=60)
GTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCA < SRR19973065.2527247/150‑1 (MQ=60)
GTGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCA < SRR19973065.2527351/150‑1 (MQ=60)
TGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAG > SRR19973065.1920597/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAG > SRR19973065.2611822/1‑150 (MQ=60)
CCTGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCG < SRR19973065.1436972/150‑1 (MQ=60)
TGACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGC > SRR19973065.2491157/1‑150 (MQ=60)
ACCGCGCATTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGC > SRR19973065.3121239/1‑150 (MQ=60)
TTTTATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCAT < SRR19973065.236502/150‑1 (MQ=60)
TATCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGTA < SRR19973065.2409993/150‑1 (MQ=60)
|
GGGCCGCCCTCTTTAACCGTAACTTCCTCACTAACCATAAAGCTCATACTCGCCTCCTTTTTTCGAGTGAAACTTGTTCACCTTAGTTGAAGATGGCGAATTTTGCATAATAGCCAGTGCGAGTATTAATGTGCCTGACCGCGCATTTTCTCTACGGCTTTCACTCCCAGCACCACGATGCCGCCGATGATAAATCCAAGAATCAGATTTAAAACAGTCGGTAATATCATCGCCACTACTGCACTTTGCTGCCCGGCGAAATGTTCAATGGCGTGATGCAGCGGCGCAATTCCATGTA > CP009273/2021805‑2022102
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |