Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,411,273 |
C→A |
I238I (ATC→ATA) |
yfcC → |
putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,411,273 | 0 | C | A | 100.0%
| 665.0
/ NA
| 201 | I238I (ATC→ATA) | yfcC | putative inner membrane transporter, C4‑dicarboxylate anaerobic carrier family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (93/108); total (93/108) |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACTG > CP009273/2411126‑2411419
|
tATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGc < 1:1079452/150‑1 (MQ=255)
ttACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCa > 2:202996/1‑150 (MQ=255)
tACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCAc > 1:919250/1‑150 (MQ=255)
accaccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCAct > 2:733531/1‑150 (MQ=255)
ccaccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCActc < 1:689693/150‑1 (MQ=255)
caccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCActct < 1:3133149/150‑1 (MQ=255)
caccGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCActct < 1:2973751/150‑1 (MQ=255)
cGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGAt > 2:513873/1‑150 (MQ=255)
tCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTg < 2:1920331/150‑1 (MQ=255)
ccTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTgg > 1:2684512/1‑150 (MQ=255)
ccTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTgg < 2:528098/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGc > 2:3136533/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGc > 1:1623000/1‑150 (MQ=255)
ggTGACCTATAGTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCt < 2:3700299/150‑1 (MQ=255)
gTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTTCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTg < 2:2119054/150‑1 (MQ=255)
aCCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATc < 1:2630493/150‑1 (MQ=255)
ccTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCt < 1:692911/150‑1 (MQ=255)
tataTTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCttt < 1:3024751/150‑1 (MQ=255)
atatTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTa > 1:2531952/1‑150 (MQ=255)
ttGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa > 2:2355701/1‑150 (MQ=255)
ttGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa < 2:1080768/150‑1 (MQ=255)
ttGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa < 2:117604/150‑1 (MQ=255)
ttGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCa < 2:3023345/150‑1 (MQ=255)
ccACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATgg > 2:2880436/1‑150 (MQ=255)
cACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGgt < 2:3255327/150‑1 (MQ=255)
aCGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGgtg < 2:1000813/150‑1 (MQ=255)
cAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTAc < 2:653780/150‑1 (MQ=255)
aaaTCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACg > 1:2567957/1‑150 (MQ=255)
aaTCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGc > 2:1734941/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGcc < 1:1348785/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTc > 1:1663027/1‑150 (MQ=255)
ggTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCa < 1:11697/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCAc < 1:1064015/150‑1 (MQ=255)
ttttGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACg < 1:3318344/150‑1 (MQ=255)
ttttGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACg < 2:3604194/150‑1 (MQ=255)
tCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAg < 2:1274693/150‑1 (MQ=255)
gATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATcc < 1:2005233/150‑1 (MQ=255)
aTGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCct > 1:2324148/1‑150 (MQ=255)
tGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCctc < 2:400201/150‑1 (MQ=255)
aCCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCtcttc > 1:1578496/1‑150 (MQ=255)
cccGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCtcttct > 2:623318/1‑150 (MQ=255)
cGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGt > 2:2485094/1‑150 (MQ=255)
cGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGt > 2:1275239/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTc < 1:831093/150‑1 (MQ=255)
tgtgGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGt < 2:1828656/150‑1 (MQ=255)
tgGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGc > 1:3636879/1‑150 (MQ=255)
tgGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGc > 2:1962628/1‑150 (MQ=255)
ggTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCa < 1:3514189/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCAGGa > 2:85609/1‑150 (MQ=255)
gTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAg < 1:2782861/150‑1 (MQ=255)
tGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTc < 2:1401577/150‑1 (MQ=255)
gCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTcc < 2:3297805/150‑1 (MQ=255)
gCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATAGTGGAGTTCGTTATAGCCACACTAATAGGCCAGATCTTTACCAAGATGTACGCCTCACCACTGAAAAAGAATACTCTTAAATCACACGTTAAAGAGTcc > 1:340929/1‑150 (MQ=255)
tCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGa > 2:735777/1‑150 (MQ=255)
aGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGAcc > 2:1014477/1‑150 (MQ=255)
aGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGAcc < 2:2153707/150‑1 (MQ=255)
aGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGAcc < 2:24583/150‑1 (MQ=255)
ggATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGTCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGct > 1:1948033/1‑150 (MQ=255)
gATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGctt < 1:3254072/150‑1 (MQ=255)
gATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGctt < 1:969117/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGcttct > 1:1483410/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGcttct > 2:1473540/1‑150 (MQ=255)
tGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGcttctt > 2:2295964/1‑150 (MQ=255)
gTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGaa > 2:1660316/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGaaa < 2:878667/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAg < 1:623318/150‑1 (MQ=255)
cGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGc > 1:3400049/1‑150 (MQ=255)
ggTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCa < 2:2726468/150‑1 (MQ=255)
ttCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGa < 1:45917/150‑1 (MQ=255)
ttCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGa < 1:332071/150‑1 (MQ=255)
tGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGt < 1:3585549/150‑1 (MQ=255)
gCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTg < 1:742025/150‑1 (MQ=255)
cTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGa > 1:2830045/1‑150 (MQ=255)
ggTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCAGGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGaacaac < 2:1926583/150‑1 (MQ=255)
gTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACg < 2:3495738/150‑1 (MQ=255)
gTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACg < 1:2986621/150‑1 (MQ=255)
tGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTc > 1:483089/1‑150 (MQ=255)
tGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTc > 1:2389686/1‑150 (MQ=255)
gcgcATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTcc < 1:44148/150‑1 (MQ=255)
cgcATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTcca < 2:1592376/150‑2 (MQ=255)
cgcATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCg > 1:1572246/1‑150 (MQ=255)
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TTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCT > SRR19973061.1487131/1‑150 (MQ=60)
GCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTT > SRR19973061.300706/1‑150 (MQ=60)
GGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGT < SRR19973061.235279/150‑1 (MQ=60)
GTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAA > SRR19973061.1689453/1‑150 (MQ=60)
GTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGAACTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAA > SRR19973061.1578864/1‑150 (MQ=60)
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CGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGC > SRR19973061.924173/1‑150 (MQ=60)
GGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCA < SRR19973061.454843/150‑1 (MQ=60)
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TTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGA < SRR19973061.46202/150‑1 (MQ=60)
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TTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGA < SRR19973061.46091/150‑1 (MQ=60)
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GCTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTG < SRR19973061.743969/150‑1 (MQ=60)
CTCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGA > SRR19973061.2837292/1‑150 (MQ=60)
TCCGGGTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAA > SRR19973061.546270/1‑150 (MQ=60)
GTTGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACG < SRR19973061.2994326/150‑1 (MQ=60)
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TGCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTC > SRR19973061.484383/1‑150 (MQ=60)
GCGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCC < SRR19973061.44315/150‑1 (MQ=60)
CGCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCG > SRR19973061.1576150/1‑150 (MQ=60)
GCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGT < SRR19973061.3548494/150‑1 (MQ=60)
GCATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGT > SRR19973061.3065974/1‑150 (MQ=60)
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ATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTT < SRR19973061.1624508/150‑1 (MQ=60)
ATCGTGGAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTT < SRR19973061.2144575/150‑1 (MQ=60)
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GAGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTT < SRR19973061.343170/150‑1 (MQ=60)
AGTGGGTTATAGCCACTCTGATTGTCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGAACGCTTCTTTCATGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTAAATTTG > SRR19973061.3501452/1‑150 (MQ=60)
GGGTTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTG < SRR19973061.1929963/150‑1 (MQ=60)
TTATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACT < SRR19973061.1732983/150‑1 (MQ=60)
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ATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACTGG < SRR19973061.2887825/150‑1 (MQ=60)
ATAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACTGG > SRR19973061.1055708/1‑150 (MQ=60)
TAGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACTGGC > SRR19973061.1265178/1‑150 (MQ=60)
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GTATTACCACCGTCCTGGTGACCTATATTGCCACGCAAATCGGTTTTGCCAGTTCGTGGATGAACCCGTTTTGTGTGGTCGTTGCTCAGGGGATTGCCGGCGTTCCGGTGCTTTCTGGCTCCGGGTTGCGCATCGTGGTGTGGGTTATCGCCACTCTGATTGGCCTGATCTTTACCATGGTGTACGCCTCACGAGTGAAAAAGAATCCTCTTCTGTCACGCGTGCATGAGTCCGACCGCTTCTTTCGTGAAAAGCAGGCTGATGTTGAACAACGTCCGTTTACCTTTGGTGACTGGC > CP009273/2411125‑2411421
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
