Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,792,318 |
C→A |
intergenic (‑464/‑205) |
stpA ← / → alaE |
DNA binding protein, nucleoid‑associated/alanine exporter, alanine‑inducible, stress‑responsive |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,792,318 | 0 | C | A | 100.0%
| 760.9
/ NA
| 225 | intergenic (‑464/‑205) | stpA/alaE | DNA binding protein, nucleoid‑associated/alanine exporter, alanine‑inducible, stress‑responsive |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (96/129); total (96/129) |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TACATTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATCATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGATATACGCTATGCGAAAATGCAGATGGCAATGA > CP009273/2792171‑2792464
|
tACATTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAaataat < 2:947826/150‑1 (MQ=255)
tACATTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAaataat < 1:287629/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTGTCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTTCATACACCGAATTCTCTTCGATTATAGCGTTACCTCACCCCCATACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAatat < 1:1988505/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAatat > 1:1036746/1‑150 (MQ=255)
aTTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATc < 1:3359697/150‑1 (MQ=255)
aTTGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATc < 2:560890/150‑1 (MQ=255)
tGTCTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCgg < 1:131549/150‑1 (MQ=255)
cTGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCAt > 1:1857744/1‑150 (MQ=255)
tGGCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATg > 2:386519/1‑150 (MQ=255)
gCATAAAAAATGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTa < 2:1160903/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATc > 2:1161403/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATc > 2:2816993/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATc > 2:3707195/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATc < 2:2146192/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATcc > 2:522767/1‑150 (MQ=255)
aTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCcac < 1:3012063/150‑1 (MQ=255)
aTGCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCcac < 1:1494931/150‑1 (MQ=255)
gCTGAAAATGACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACaa < 1:3140109/150‑1 (MQ=255)
gACCCAGCTACTACATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACaaaa > 2:272608/1‑150 (MQ=255)
tactacATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGcc > 2:1701229/1‑150 (MQ=255)
actacATACACCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCg > 1:309754/1‑150 (MQ=255)
tacatacaCCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGtt < 2:2532250/150‑1 (MQ=255)
tacatacaCCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGtt < 2:3120466/150‑1 (MQ=255)
tacatacaCCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGtt < 2:2956104/150‑1 (MQ=255)
tacaCCGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACgg > 2:1808557/1‑150 (MQ=255)
ccGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAata < 2:3531916/150‑1 (MQ=255)
cGAATTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAatat < 1:317197/150‑1 (MQ=255)
aaTTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATAttt > 2:1152896/1‑150 (MQ=255)
aTTCTCTACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATAtttt > 1:3532376/1‑150 (MQ=255)
ctctACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATc < 1:2306892/150‑1 (MQ=255)
ctctACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATc > 1:88983/1‑150 (MQ=255)
tctACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCt > 1:2748746/1‑150 (MQ=255)
tctACGCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCt < 1:3482041/150‑1 (MQ=255)
gCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACaaa > 2:1318529/1‑150 (MQ=255)
gCTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACaaa > 1:1768688/1‑150 (MQ=255)
cTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACaaaa > 2:815284/1‑150 (MQ=255)
cTTATAGCGTTACCTCACCCCCAAACTCTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTACAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGACGATTTTATCGACcaaa > 2:3165980/1‑150 (MQ=255)
tataGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAAc < 2:1997320/150‑1 (MQ=255)
ataGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACt < 2:1409733/150‑1 (MQ=255)
ataGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACt < 2:786405/150‑1 (MQ=255)
taGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTg < 1:1466641/150‑1 (MQ=255)
taGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTg < 2:2682064/150‑1 (MQ=255)
taGCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTg < 1:1838929/150‑1 (MQ=255)
gCGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGAc < 1:2946962/150‑1 (MQ=255)
cGTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACt > 1:2095173/1‑150 (MQ=255)
gTTACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACta < 1:329472/150‑1 (MQ=255)
ttACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGACATATCTAATTTATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaa < 2:2968176/150‑1 (MQ=255)
ttACCTCACCCCCAAACTTTAATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaa < 1:2386212/150‑1 (MQ=255)
tACCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaaa > 1:1358227/1‑150 (MQ=255)
aCCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaaat > 1:1732873/1‑150 (MQ=255)
aCCTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaaat > 2:636206/1‑150 (MQ=255)
ccTCACCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACtaaata < 2:1879871/150‑1 (MQ=255)
aCCCCCAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATaaaaa < 1:3643910/150‑1 (MQ=255)
ccccAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAAtt > 1:3786987/1‑150 (MQ=255)
ccAAACTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAAtttt < 2:3097851/150‑1 (MQ=255)
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aaCTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCa < 2:1992487/150‑1 (MQ=255)
cTTTCATTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACt > 2:1621355/1‑150 (MQ=255)
aTTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTg < 1:1006422/150‑1 (MQ=255)
aTTAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTg < 2:1229066/150‑1 (MQ=255)
ttAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGa < 2:1320846/150‑1 (MQ=255)
tAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAt < 1:2488479/150‑1 (MQ=255)
tAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAt < 2:3685948/150‑1 (MQ=255)
tAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAt < 2:3727572/150‑1 (MQ=255)
tAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAt < 1:612860/150‑1 (MQ=255)
tAGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAt < 1:582089/150‑1 (MQ=255)
aGTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGAtt > 1:13624/1‑150 (MQ=255)
gTGATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTa < 2:2444463/150‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGt < 2:121345/150‑1 (MQ=255)
gATATTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGt < 2:121332/150‑1 (MQ=255)
atatTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTc < 2:126009/150‑1 (MQ=255)
atatTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTc < 2:127143/150‑1 (MQ=255)
tatTAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCa < 1:3709642/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAg < 1:1657151/150‑1 (MQ=255)
tAAAGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAg < 1:2591567/150‑1 (MQ=255)
aaaGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGc > 2:1855506/1‑150 (MQ=255)
aaGGTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGcc < 1:2816993/150‑1 (MQ=255)
gTAAGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGc > 2:1751581/1‑150 (MQ=255)
aGGCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGat > 1:275630/1‑150 (MQ=255)
gCCATATCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGatat < 2:3442442/150‑1 (MQ=255)
atatCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGATATACg < 1:3664993/150‑1 (MQ=255)
tatCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATATCCAGCGATATACGc > 2:893619/1‑150 (MQ=255)
tatCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGATATACGc > 1:450873/1‑150 (MQ=255)
atCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGATATACGCt < 1:1266621/150‑1 (MQ=255)
atCTAATTGATTTAATTAAAAATAAATAATATCGGCATGTAAAAATCCACAATGTACAAAAAACGAGCCGTTACGGAATATTTTATCTACAAAAACTGACTAAATAAAAATTTTTCACTAATTGATTAGTCATAGCCAGCGATATACGCt > 1:1156759/1‑150 (MQ=255)
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
