Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,985,884 |
C→T |
I144I (ATC→ATT) |
ygeH → |
putative transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,985,884 | 0 | C | T | 100.0%
| 797.7
/ NA
| 236 | I144I (ATC→ATT) | ygeH | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (117/119); total (117/119) |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CCGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATCATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGT > CP009273/2985737‑2986030
|
cGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAattatt < 2:919764/150‑1 (MQ=255)
ggAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTAttt < 2:721802/150‑1 (MQ=255)
ggAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTAttt < 2:3081678/150‑1 (MQ=255)
aGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCaaa < 1:2231358/150‑1 (MQ=255)
aGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCaaa > 1:2099743/1‑150 (MQ=255)
aGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCaaa > 1:844865/1‑150 (MQ=255)
ggTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAAt < 2:1427718/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTACATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATaaa < 2:3479760/150‑1 (MQ=255)
tATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTACAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATAAACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATaaa > 2:2605344/1‑150 (MQ=255)
aTCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCTCTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATaaaa < 1:3597436/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATaaaaaa < 2:1721260/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATaaaaaa < 1:2465430/150‑1 (MQ=255)
tttCAGCGGGCAGGTTTTAAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAAt < 2:1822894/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATc < 2:1131831/150‑1 (MQ=255)
aGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGAt > 1:1761294/1‑150 (MQ=255)
aGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGAt < 1:2380170/150‑1 (MQ=255)
cGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATgg < 1:2167240/150‑1 (MQ=255)
gCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtct < 1:1081998/150‑1 (MQ=255)
gCAGGTTTTAAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATAAATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtct < 1:2305204/150‑1 (MQ=255)
catgTTTTCAAAAATAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtctc < 2:2039972/147‑1 (MQ=255)
cAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtctc < 2:3589991/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtctc < 1:1474937/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtctc > 1:1423117/1‑150 (MQ=255)
cAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGtctc > 1:3025186/1‑150 (MQ=255)
aGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTctct < 1:3783477/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCta > 1:2457682/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCtat > 1:720654/1‑150 (MQ=255)
ttttAAAAACTAAAATTAATGAATATAATTCTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCAATACTTCATTGAATACACTGGATCAATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCtata < 2:1968510/150‑1 (MQ=255)
tCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATTGTCTCTATACCt > 1:3612790/1‑150 (MQ=255)
cAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTa > 1:3512168/1‑150 (MQ=255)
cAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTa < 2:368222/150‑1 (MQ=255)
aaCTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATcc > 2:1271502/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATg > 1:2545655/1‑150 (MQ=255)
aTGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGa > 1:2731794/1‑150 (MQ=255)
aGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACaaa > 1:3197703/1‑150 (MQ=255)
aGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACaaa > 2:3104243/1‑150 (MQ=255)
aGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACaaa > 2:1600899/1‑150 (MQ=255)
aataCTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAAtttt < 2:2685167/150‑1 (MQ=255)
aataCTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAAtttt < 2:696602/150‑1 (MQ=255)
ataCTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAAttttt < 1:2839122/150‑1 (MQ=255)
cAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATg > 2:1861996/1‑150 (MQ=255)
cAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATg > 1:657429/1‑150 (MQ=255)
aCTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATc > 1:3131621/1‑150 (MQ=255)
tATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAATTTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATcac > 2:3150952/1‑150 (MQ=255)
tATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATcac > 1:2873950/1‑150 (MQ=255)
tATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATcac > 1:970939/1‑150 (MQ=255)
aTTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATcaca < 2:1710556/150‑1 (MQ=255)
tCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACata < 2:3029274/150‑1 (MQ=255)
aTAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTTATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATAtct > 1:1014214/1‑150 (MQ=255)
aTAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATAtct > 1:2324422/1‑150 (MQ=255)
aTAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATAtct < 2:1103015/150‑1 (MQ=255)
aTAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATAtct > 1:1975790/1‑150 (MQ=255)
tAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATAtctc > 1:1856158/1‑150 (MQ=255)
aGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCa > 2:613689/1‑150 (MQ=255)
aGCTATATACCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCa > 2:870172/1‑150 (MQ=255)
cTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCaaa < 1:1616427/150‑1 (MQ=255)
tataTTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCaaaa > 1:955605/1‑150 (MQ=255)
atatTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAat > 1:583657/1‑150 (MQ=255)
atatTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAat < 1:3339497/150‑1 (MQ=255)
atatTCCCTCTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAat < 2:3760876/150‑1 (MQ=255)
tatTCCCTTTCACTACTTCATCGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAatt > 2:2974118/1‑150 (MQ=255)
tCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAattcat < 2:2099776/150‑1 (MQ=255)
cccTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAattcatt > 2:1705128/1‑150 (MQ=255)
tCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGa > 2:3245246/1‑150 (MQ=255)
cACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAg < 1:2672810/150‑1 (MQ=255)
cACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAg < 2:1961142/150‑1 (MQ=255)
actTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGa > 2:3367661/1‑150 (MQ=255)
ttCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGAtt < 2:3402163/150‑1 (MQ=255)
ttCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGAtt < 1:892917/150‑1 (MQ=255)
ttCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGAtt < 1:1978289/150‑1 (MQ=255)
ttCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGAtt < 1:67543/150‑1 (MQ=255)
ttCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATAAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGAtt < 2:1504085/150‑1 (MQ=255)
cATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCa > 2:2439553/1‑150 (MQ=255)
tGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGc > 2:2633301/1‑150 (MQ=255)
aTACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAg > 1:1174772/1‑150 (MQ=255)
tACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGa > 2:2801455/1‑150 (MQ=255)
cacTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGatt > 2:1353023/1‑150 (MQ=255)
cacTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGatt > 2:3304500/1‑150 (MQ=255)
acTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGatta < 2:2457682/150‑1 (MQ=255)
acTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGatta < 1:1536192/150‑1 (MQ=255)
acTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGatta < 1:3431610/150‑1 (MQ=255)
ggATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTAttt > 1:275885/1‑150 (MQ=255)
gatataTTAATAATTAATCAGTAATTATTGCAAATTATTTAAAATAAAAAAATTGATGTTCTCTATACCTATCCGATGGATGAGACATATTTTTGTAATTATCACATATCTCAAAATTAATTCTTGAGCATATTCAAGCCAGATTATTTc < 1:2605344/145‑1 (MQ=255)
gATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTc > 2:3442867/1‑150 (MQ=255)
ccATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGtt > 2:470352/1‑150 (MQ=255)
cATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTa < 1:1071344/150‑1 (MQ=255)
tAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAg < 1:3060731/150‑1 (MQ=255)
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ATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCT > SRR19973061.2330320/1‑150 (MQ=60)
ATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCT > SRR19973061.1980734/1‑150 (MQ=60)
ATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCT > SRR19973061.1980873/1‑150 (MQ=60)
TAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTC > SRR19973061.1860796/1‑150 (MQ=60)
CTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAA < SRR19973061.1620455/150‑1 (MQ=60)
TATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAA > SRR19973061.958012/1‑150 (MQ=60)
ATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAAT < SRR19973061.3348094/150‑1 (MQ=60)
ATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAAT < SRR19973061.3347656/150‑1 (MQ=60)
ATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAAT > SRR19973061.585177/1‑150 (MQ=60)
ATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATACATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAAT < SRR19973061.3218509/150‑1 (MQ=60)
ATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTC > SRR19973061.1242121/1‑150 (MQ=60)
TCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCAT < SRR19973061.2483849/150‑1 (MQ=60)
TCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCAT < SRR19973061.913861/150‑1 (MQ=60)
CTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCT < SRR19973061.73637/150‑1 (MQ=60)
TTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTT < SRR19973061.168899/150‑1 (MQ=60)
CACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAG > SRR19973061.2027776/1‑150 (MQ=60)
CACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCGATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAG < SRR19973061.2679685/150‑1 (MQ=60)
CTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCA > SRR19973061.14592/1‑150 (MQ=60)
TACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAG > SRR19973061.971524/1‑150 (MQ=60)
TTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATTATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATT < SRR19973061.895223/150‑1 (MQ=60)
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TATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAA > SRR19973061.290447/1‑150 (MQ=60)
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CGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATTAATACTTAATCAGGAATTAGTGCAAATCATTTCAAATAAAAAAATCGATGGTCTCTATACCTATCCGATGGCTGCGACAAATTTTTGTAATGATCACATATCTCAAAATTCATTCTTGAGCAGATTCAAGCCAGATTATTTCGTTACAGGAAGAATAAACCAGAATAATGCAGTGAA > CP009273/2985738‑2986033
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
