Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,764,150 |
G→T |
100% |
D274Y (GAT→TAT) |
ydiK → |
UPF0118 family inner membrane protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,764,150 | 0 | G | T | 99.7%
| 1108.1
/ ‑5.0
| 329 | D274Y (GAT→TAT) | ydiK | UPF0118 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (158/170); total (158/171) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTC > CP009273/1764003‑1764296
|
cAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTAt < 2:3661808/150‑1 (MQ=255)
ggCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATac > 1:1487670/1‑150 (MQ=255)
gCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATacc < 2:4558487/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATacca < 2:4310815/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATacca < 2:4695514/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATacca < 1:2019319/150‑1 (MQ=255)
gTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATaccacc < 2:1772509/150‑1 (MQ=255)
tGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCt > 2:4811932/1‑150 (MQ=255)
gCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTg < 2:2173938/150‑1 (MQ=255)
cTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTgg > 2:3117914/1‑150 (MQ=255)
ttGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTggg < 2:1708919/150‑1 (MQ=255)
tGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTgggg > 2:3828254/1‑150 (MQ=255)
ggCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGa < 1:1758827/150‑1 (MQ=255)
ggCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGa < 1:5113658/150‑1 (MQ=255)
cGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAAc < 1:3992623/150‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACg < 1:1452374/150‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACg < 1:1383893/150‑1 (MQ=255)
ggTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACg < 1:506058/150‑1 (MQ=255)
tATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGt > 1:471687/1‑150 (MQ=255)
aTCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTa > 2:1637854/1‑150 (MQ=255)
ggCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTg > 1:2394110/1‑150 (MQ=255)
tCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAg > 2:2541407/1‑150 (MQ=255)
tCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAg > 2:276407/1‑150 (MQ=255)
gCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAgtg > 2:2733203/1‑150 (MQ=255)
gCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAgtg > 1:2225265/1‑150 (MQ=255)
cGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTTGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGtgtg > 2:1977177/1‑150 (MQ=255)
gTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTgg < 1:3261406/150‑1 (MQ=255)
tATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGa < 1:4539294/150‑1 (MQ=255)
tATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGa > 2:4592701/1‑150 (MQ=255)
aTCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAg > 2:4139169/1‑150 (MQ=255)
aTCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCGGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAg > 2:3580095/1‑150 (MQ=255)
aTCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCGTGTCCAGCTTGGCCCGGTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAg < 2:4374869/150‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCgg > 1:1533010/1‑150 (MQ=255)
ggCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGgt < 1:1920142/150‑1 (MQ=255)
gTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGtgtg > 2:1269771/1‑150 (MQ=255)
aCCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGt > 1:2873788/1‑150 (MQ=255)
ccTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGtt < 2:3006907/150‑1 (MQ=255)
cTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTg < 1:4671277/150‑1 (MQ=255)
cTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACAGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTg > 2:725273/1‑150 (MQ=255)
tATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGc > 1:3540049/1‑150 (MQ=255)
tATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGc < 2:555798/150‑1 (MQ=255)
gCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACg < 2:4001401/150‑1 (MQ=255)
gCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACg < 2:2029113/150‑1 (MQ=255)
aaCGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCt > 2:1404058/1‑150 (MQ=255)
tGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATa < 1:4487077/150‑1 (MQ=255)
tGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATa < 1:4073959/150‑1 (MQ=255)
cTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCGGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAAc > 2:1117370/1‑150 (MQ=255)
tAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACg < 1:3063725/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCAt < 2:1034317/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCAt > 1:2732552/1‑150 (MQ=255)
tgtTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATcc > 1:2525718/1‑150 (MQ=255)
aaTGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGccc < 2:1902015/150‑1 (MQ=255)
gATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAAt > 1:1064619/1‑150 (MQ=255)
tCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGt > 1:1011562/1‑150 (MQ=255)
ccTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGtt < 2:4909830/150‑1 (MQ=255)
ccTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCAACCGCCCAATGtt < 1:4634480/150‑1 (MQ=255)
ctctCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTa > 2:4200994/1‑150 (MQ=255)
cctgcctgGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTc < 1:3112571/150‑1 (MQ=255)
ccTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTc > 1:4849296/1‑150 (MQ=255)
ccTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTc > 1:4253964/1‑150 (MQ=255)
cTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCg < 1:1802622/150‑1 (MQ=255)
tGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGc > 2:4677424/1‑150 (MQ=255)
cTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATg > 1:2686680/1‑150 (MQ=255)
ttGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATgg > 1:3921573/1‑150 (MQ=255)
tGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATggg > 2:4191480/1‑150 (MQ=255)
aGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCg < 1:4001061/150‑1 (MQ=255)
aGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCg > 1:1872374/1‑150 (MQ=255)
aGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCg < 1:4928078/150‑1 (MQ=255)
cTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGAt < 1:2987319/150‑1 (MQ=255)
ttGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGAtt > 1:3767713/1‑150 (MQ=255)
ttGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGAtt < 1:1089347/150‑1 (MQ=255)
ccGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCg > 2:2854844/1‑150 (MQ=255)
gTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCt < 1:3536805/150‑1 (MQ=255)
ttGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTg > 1:884231/1‑150 (MQ=255)
tGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGa < 1:1157885/150‑1 (MQ=255)
ggTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCt < 1:1637844/150‑1 (MQ=255)
cTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGAtt > 2:370952/1‑150 (MQ=255)
gATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATtct < 1:4179835/150‑1 (MQ=255)
aTTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATtctc < 2:1918767/150‑1 (MQ=255)
aTTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATtctc < 1:4984262/150‑1 (MQ=255)
aTTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATtctc < 1:2086067/150‑1 (MQ=255)
ttCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATtctct < 2:3497461/150‑1 (MQ=255)
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TTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGAT < SRR19973063.102896/150‑1 (MQ=60)
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CTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAAC > SRR19973063.2440582/1‑150 (MQ=60)
TAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACG < SRR19973063.3073572/150‑1 (MQ=60)
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TGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGC < SRR19973063.1520424/150‑1 (MQ=60)
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CGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTG < SRR19973063.1521287/150‑1 (MQ=60)
CGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTG > SRR19973063.3696168/1‑150 (MQ=60)
CGAGTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCG < SRR19973063.2962941/150‑1 (MQ=60)
ATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTT < SRR19973063.4917075/150‑1 (MQ=60)
ATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTT < SRR19973063.1098865/150‑1 (MQ=60)
ATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTT < SRR19973063.4209665/150‑1 (MQ=60)
TTATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTA < SRR19973063.1408309/150‑1 (MQ=60)
ATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATT > SRR19973063.1086037/1‑150 (MQ=60)
ATCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGATGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGATAATTCGCATGGGTGCCGAGTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATT > SRR19973063.1086066/1‑150 (MQ=60)
TCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTG < SRR19973063.4584922/150‑1 (MQ=60)
TCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTG < SRR19973063.4434812/150‑1 (MQ=60)
TCTGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTG < SRR19973063.3186293/150‑1 (MQ=60)
TGGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGT < SRR19973063.2988168/150‑1 (MQ=60)
GGCTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTG > SRR19973063.1224569/1‑150 (MQ=60)
CTCTACTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGT < SRR19973063.3155597/150‑1 (MQ=60)
CTGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGAT > SRR19973063.4650203/1‑150 (MQ=60)
TGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATT < SRR19973063.5072719/150‑1 (MQ=60)
TGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATT < SRR19973063.1027765/150‑1 (MQ=60)
TGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATT > SRR19973063.2508726/1‑150 (MQ=60)
TGGACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATT < SRR19973063.5072811/150‑1 (MQ=60)
GACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAAGTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGC < SRR19973063.76327/150‑1 (MQ=60)
ACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCT > SRR19973063.603924/1‑150 (MQ=60)
ACTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCT > SRR19973063.1648010/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTT < SRR19973063.4154859/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTT < SRR19973063.4154796/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTATACAACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGAGGTGTGTTTTGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCAAATTTTAATTCTCATGGGTGCCGTTTTACAGCTGATCCTGATTCTATCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTTCTT < SRR19973063.2866894/150‑1 (MQ=60)
TGGCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTT < SRR19973063.4517582/150‑1 (MQ=60)
GCTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCG < SRR19973063.149583/150‑1 (MQ=60)
CTATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGG < SRR19973063.3649636/150‑1 (MQ=60)
TATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG < SRR19973063.5079924/150‑1 (MQ=60)
TATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG > SRR19973063.533741/1‑150 (MQ=60)
TATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG < SRR19973063.5080168/150‑1 (MQ=60)
TATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG > SRR19973063.645769/1‑150 (MQ=60)
TATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG > SRR19973063.3139226/1‑150 (MQ=60)
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ACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATACCACCTGGGGAACGGTATTGTTAGTGTGGAGCGGTGTGGTTGGCACGCTGGATAACGTCATCCGCCCAATGTTAATTCGCATGGGTGCCGATTTACCGCTGATCCTGATTCTCTCTGGCGTTATTGGTGGTTTGATTGCTTTCGGG > CP009273/1764002‑1764299
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |