Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,819,892 |
C→A |
73.6% |
intergenic (‑10/+320) |
spy ← / ← astE |
periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,819,892 | 0 | C | A | 73.6%
| 347.7
/ 207.4
| 250 | intergenic (‑10/+320) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/43); new base A (70/114); total (93/157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.67e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
CGGACCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAAAAG > CP009273/1819745‑1820041
|
cGGACCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtcct < 1:1522293/150‑1 (MQ=255)
aCCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATAtacttcc > 2:480514/1‑150 (MQ=255)
cGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATccttcctt > 2:2782151/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGTCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTc > 2:483659/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTc > 1:1525465/1‑150 (MQ=255)
aCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCa > 1:282268/1‑150 (MQ=255)
aCTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCa < 1:2915767/150‑1 (MQ=255)
cTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAg < 2:2518024/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGt > 1:4900401/1‑150 (MQ=255)
ttGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGt < 1:44426/150‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGtta < 2:2837211/150‑1 (MQ=255)
ccTTTGTGGTACATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttat > 1:4709096/1‑150 (MQ=255)
cTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttatt > 2:3028236/1‑150 (MQ=255)
tttGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttattt < 1:1036221/150‑1 (MQ=255)
ttGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGttattta < 1:3281086/150‑1 (MQ=255)
tggtgCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATttatta > 1:320828/1‑150 (MQ=255)
gtgCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACg < 2:1551233/150‑1 (MQ=255)
catcatCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGTCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACggat > 1:1879217/1‑148 (MQ=255)
catcatCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCt < 1:4616475/150‑1 (MQ=255)
atcatcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCtt < 1:5145997/150‑1 (MQ=255)
atcatcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCtt < 1:3551380/150‑1 (MQ=255)
atcatcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCtt < 1:2592204/150‑1 (MQ=255)
catcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTc < 2:3822002/150‑1 (MQ=255)
catcGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTc < 1:2379490/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTa < 2:3120404/150‑1 (MQ=255)
ggCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTaa > 2:3394908/1‑150 (MQ=255)
ggCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTaa > 1:3516203/1‑150 (MQ=255)
cTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGt > 1:1479354/1‑150 (MQ=255)
ttCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTa > 1:1147610/1‑150 (MQ=255)
cgcgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGc < 2:3326996/150‑1 (MQ=255)
gcgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCg < 1:3329028/150‑1 (MQ=255)
cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGt < 1:4058365/150‑1 (MQ=255)
aGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCg > 1:1239808/1‑150 (MQ=255)
ctgTGCTGCGGTAGTTGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCAGCGCCAAGAGCCAGTGTAGAGGCAACAATCAGTGAAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCgtgt < 2:2669225/148‑1 (MQ=255)
ggTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGtt < 1:868588/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGa > 2:395533/1‑150 (MQ=255)
gctgcGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGAc < 1:4999969/150‑1 (MQ=255)
ctgcGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACg < 2:1096583/150‑1 (MQ=255)
gTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGAtt < 2:4282563/150‑1 (MQ=255)
tggtgTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACt < 1:1778282/150‑1 (MQ=255)
gtCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTAc > 2:58764/1‑150 (MQ=255)
tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACt < 1:2772588/150‑1 (MQ=255)
tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACt < 1:2125611/150‑1 (MQ=255)
tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACt < 1:3716934/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTg < 2:1641596/150‑1 (MQ=255)
tGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGa < 2:3751467/150‑1 (MQ=255)
gCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACttt < 2:4615371/150‑1 (MQ=255)
tGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGc < 2:1239808/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCaa > 1:2357419/1‑150 (MQ=255)
aGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAAt < 2:2355544/150‑1 (MQ=255)
aGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAAt < 2:4418820/150‑1 (MQ=255)
tAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAAt > 1:518755/1‑150 (MQ=255)
tAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAAt > 1:4460571/1‑150 (MQ=255)
gCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCa < 2:3249159/150‑1 (MQ=255)
cgcCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGc < 1:5081940/150‑1 (MQ=255)
gcCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCa > 1:796825/1‑150 (MQ=255)
cAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAAc < 1:3808203/150‑1 (MQ=255)
aaGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACg > 1:1700607/1‑150 (MQ=255)
aaGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACg > 1:2925579/1‑150 (MQ=255)
gagCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGt < 2:3644344/150‑1 (MQ=255)
gagCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGt < 2:4299125/150‑1 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTa > 2:3360939/1‑150 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTa > 1:420330/1‑150 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTa < 2:1889711/150‑1 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTa < 2:4170454/150‑1 (MQ=255)
agCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTa < 2:3914623/150‑1 (MQ=255)
gCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTaa < 1:2511788/150‑1 (MQ=255)
cAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTaaaa < 2:34905/150‑1 (MQ=255)
tgggTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAAc > 1:3928068/2‑150 (MQ=255)
aGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAAc > 1:1302014/1‑150 (MQ=255)
gTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAAt < 1:462767/150‑1 (MQ=255)
tAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATg < 1:2875401/150‑1 (MQ=255)
agagGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGa > 1:4274264/1‑150 (MQ=255)
agagGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAAtta > 2:2292187/1‑148 (MQ=255)
agagGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGa > 1:3390742/1‑150 (MQ=255)
ggCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAg < 2:148189/150‑1 (MQ=255)
gCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAgt < 2:2785086/150‑1 (MQ=255)
taacaaacaGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAgtg > 2:3475876/2‑150 (MQ=255)
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ATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAA > SRR19973063.4762170/1‑150 (MQ=60)
TATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAA < SRR19973063.1002298/150‑1 (MQ=60)
TATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAA < SRR19973063.997710/150‑1 (MQ=60)
ATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAAA > SRR19973063.3796701/1‑150 (MQ=60)
ATACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGAGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACATTTTCGCCAATTATGTAGAAAAAA > SRR19973063.3796685/1‑150 (MQ=60)
ACTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTTTGGAGAAAAAAAG < SRR19973063.761657/150‑1 (MQ=60)
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CGGACCGAACTTGCCTTTGTGGTGCATCATCGGCTTCGCGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCATATTCTATATCCTTCCTTTCAGTTATTTATTACGGCTTTCTTAAGTAGCGTGCCGTGTTGACGAGATTAACTTTACTGACTTTAGCGTCAATTAATCAGAGCAACGGTAAAACAATGAAAGTGTAAAAAACACTTTTGCGCCAATTATGGAGAAAAAAAG > CP009273/1819745‑1820041
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |